Doublet Group distance statistics: 53811

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.000, 0.009, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.000, 0.018, 0.035, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N4	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.000, 0.019, 0.038, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.019 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.000, 0.020, 0.041, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N1	A	0, 0.000, 0.023, 0.047, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.023
C6	A	0, 0.000, 0.026, 0.053, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.026 std_dev=0.026
O2	A	0, 0.000, 0.030, 0.060, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.030 std_dev=0.030
N3	A	0, 0.000, 0.033, 0.066, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.033 std_dev=0.033
O4'	A	0, 0.000, 0.125, 0.250, 0.250 max_d=0.250 avg_d=0.125 std_dev=0.125
C2'	A	0, 0.000, 0.158, 0.316, 0.316 max_d=0.316 avg_d=0.158 std_dev=0.158
C5	B	0, 0.000, 0.232, 0.464, 0.464 max_d=0.464 avg_d=0.232 std_dev=0.232
C4'	A	0, 0.000, 0.279, 0.559, 0.559 max_d=0.559 avg_d=0.279 std_dev=0.279
C4	B	0, 0.000, 0.312, 0.624, 0.624 max_d=0.624 avg_d=0.312 std_dev=0.312
C6	B	0, 0.000, 0.371, 0.743, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.371 std_dev=0.371
C3'	B	0, 0.000, 0.435, 0.870, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.435 std_dev=0.435
C5'	A	0, 0.000, 0.450, 0.900, 0.900 max_d=0.900 avg_d=0.450 std_dev=0.450
N7	B	0, 0.000, 0.476, 0.952, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.476 std_dev=0.476
N1	B	0, 0.000, 0.478, 0.957, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.478 std_dev=0.478
N3	B	0, 0.000, 0.489, 0.979, 0.979 max_d=0.979 avg_d=0.489 std_dev=0.489
N9	B	0, 0.000, 0.516, 1.032, 1.032 max_d=1.032 avg_d=0.516 std_dev=0.516
C2	B	0, 0.000, 0.522, 1.045, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.522 std_dev=0.522
C2'	B	0, 0.000, 0.566, 1.132, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.566 std_dev=0.566
C8	B	0, 0.000, 0.568, 1.136, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.568 std_dev=0.568
O2'	A	0, 0.000, 0.633, 1.267, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.633 std_dev=0.633
O6	B	0, 0.000, 0.653, 1.307, 1.307 max_d=1.307 avg_d=0.653 std_dev=0.653
N2	B	0, 0.000, 0.773, 1.547, 1.547 max_d=1.547 avg_d=0.773 std_dev=0.773
C1'	B	0, 0.000, 0.846, 1.692, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.846 std_dev=0.846
OP1	A	0, 0.000, 0.862, 1.725, 1.725 max_d=1.725 avg_d=0.862 std_dev=0.862
C3'	A	0, 0.000, 0.872, 1.745, 1.745 max_d=1.745 avg_d=0.872 std_dev=0.872
O5'	A	0, 0.000, 1.228, 2.456, 2.456 max_d=2.456 avg_d=1.228 std_dev=1.228
O3'	B	0, 0.000, 1.569, 3.139, 3.139 max_d=3.139 avg_d=1.569 std_dev=1.569
C4'	B	0, 0.000, 1.657, 3.313, 3.313 max_d=3.313 avg_d=1.657 std_dev=1.657
O3'	A	0, 0.000, 1.671, 3.341, 3.341 max_d=3.341 avg_d=1.671 std_dev=1.671
O4'	B	0, 0.000, 1.698, 3.396, 3.396 max_d=3.396 avg_d=1.698 std_dev=1.698
P	A	0, 0.000, 1.819, 3.638, 3.638 max_d=3.638 avg_d=1.819 std_dev=1.819
O2'	B	0, 0.000, 1.864, 3.729, 3.729 max_d=3.729 avg_d=1.864 std_dev=1.864
C5'	B	0, 0.000, 2.533, 5.066, 5.066 max_d=5.066 avg_d=2.533 std_dev=2.533
O5'	B	0, 0.000, 2.713, 5.427, 5.427 max_d=5.427 avg_d=2.713 std_dev=2.713
OP2	A	0, 0.000, 3.021, 6.042, 6.042 max_d=6.042 avg_d=3.021 std_dev=3.021
P	B	0, 0.000, 4.075, 8.151, 8.151 max_d=8.151 avg_d=4.075 std_dev=4.075
OP1	B	0, 0.000, 4.839, 9.678, 9.678 max_d=9.678 avg_d=4.839 std_dev=4.839
OP2	B	0, 0.000, 4.851, 9.702, 9.702 max_d=9.702 avg_d=4.851 std_dev=4.851

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.20	0.00	0.02	0.11	0.07	0.00
C2	0.02	0.00	0.02	0.12	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.28	0.10	0.01	0.08	0.04	0.38	0.11
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.06	0.02	0.07	0.11	0.07	0.03	0.03	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.27	0.17	0.34	0.28
C3'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.31	0.01	0.38	0.02	0.35	0.19	0.19	0.33	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.09	0.20	0.03
C4	0.01	0.01	0.06	0.31	0.00	0.10	0.01	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.23	0.16	0.01	0.29	0.08	0.88	0.35
C4'	0.00	0.05	0.02	0.01	0.10	0.00	0.13	0.01	0.13	0.07	0.06	0.11	0.02	0.26	0.01	0.00	0.02	0.04	0.10	0.02
C5	0.02	0.01	0.07	0.38	0.01	0.13	0.00	0.12	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.13	0.26	0.02	0.40	0.13	1.03	0.46
C5'	0.04	0.01	0.11	0.02	0.08	0.01	0.12	0.00	0.12	0.03	0.02	0.10	0.02	0.14	0.19	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01
C6	0.00	0.01	0.07	0.35	0.02	0.13	0.00	0.12	0.00	0.00	0.04	0.01	0.00	0.07	0.21	0.02	0.37	0.09	0.82	0.39
N1	0.01	0.00	0.03	0.19	0.00	0.07	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.14	0.00	0.00	0.15	0.02	0.43	0.17
N3	0.00	0.00	0.03	0.19	0.01	0.06	0.02	0.02	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00	0.30	0.00	0.01	0.15	0.01	0.58	0.19
N4	0.02	0.01	0.07	0.33	0.01	0.11	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.25	0.20	0.01	0.33	0.12	1.02	0.41
O2	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.35	0.27	0.04	0.03	0.09	0.14	0.01
O2'	0.01	0.28	0.00	0.02	0.23	0.26	0.13	0.14	0.07	0.14	0.30	0.25	0.35	0.00	0.01	0.17	0.16	0.01	0.38	0.18
O3'	0.20	0.10	0.01	0.02	0.16	0.01	0.26	0.19	0.21	0.00	0.00	0.20	0.27	0.01	0.00	0.11	0.16	0.42	0.07	0.20
O4'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.17	0.11	0.00	0.09	0.11	0.16	0.10
O5'	0.02	0.08	0.27	0.03	0.29	0.02	0.40	0.01	0.37	0.15	0.15	0.33	0.03	0.16	0.16	0.09	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.11	0.04	0.17	0.09	0.08	0.04	0.13	0.08	0.09	0.02	0.01	0.12	0.09	0.01	0.42	0.11	0.01	0.00	0.02	0.02
OP2	0.07	0.38	0.34	0.20	0.88	0.10	1.03	0.13	0.82	0.43	0.58	1.02	0.14	0.38	0.07	0.16	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.00	0.11	0.28	0.03	0.35	0.02	0.46	0.01	0.39	0.17	0.19	0.41	0.01	0.18	0.20	0.10	0.01	0.02	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.53	0.01	0.25	0.13	0.20	0.56	0.04	0.05	0.13	0.24	0.14	0.04	0.22	0.09	0.33	0.45	0.66	0.88	0.87	0.24	1.51	1.17	1.27
C2	0.37	0.22	0.30	0.03	0.21	0.40	0.03	0.09	0.10	0.12	0.00	0.26	0.33	0.01	0.23	0.51	0.41	0.67	0.79	0.24	1.62	0.84	1.13
C2'	0.44	0.14	0.28	0.02	0.09	0.22	0.06	0.48	0.23	0.15	0.27	0.21	0.10	0.00	0.23	0.25	0.69	0.56	1.37	0.32	2.17	1.84	1.93
C3'	0.02	0.46	0.74	0.42	0.33	0.18	0.41	0.90	0.51	0.25	0.53	0.47	0.34	0.36	0.21	0.70	0.33	0.15	1.76	0.56	2.15	2.21	2.20
C4	0.18	0.23	0.34	0.02	0.17	0.45	0.07	0.46	0.04	0.05	0.14	0.23	0.24	0.01	0.13	0.74	0.10	0.62	0.33	0.05	0.99	0.06	0.47
C4'	0.40	0.20	0.37	0.03	0.03	0.48	0.07	0.13	0.22	0.16	0.28	0.29	0.02	0.02	0.19	0.54	0.67	0.76	0.97	0.29	1.20	1.45	1.32
C5	0.25	0.13	0.37	0.01	0.19	0.61	0.13	0.67	0.06	0.18	0.08	0.10	0.19	0.12	0.21	0.88	0.10	0.82	0.15	0.01	0.63	0.13	0.23
C5'	0.57	0.05	0.16	0.26	0.18	0.76	0.10	0.20	0.05	0.33	0.12	0.15	0.11	0.19	0.35	0.40	0.86	0.97	0.52	0.11	0.47	1.00	0.75
C6	0.39	0.08	0.36	0.06	0.22	0.67	0.11	0.52	0.00	0.24	0.00	0.03	0.20	0.14	0.29	0.80	0.30	0.96	0.36	0.06	0.81	0.25	0.50
N1	0.45	0.11	0.30	0.08	0.23	0.55	0.07	0.22	0.07	0.21	0.05	0.09	0.28	0.08	0.30	0.59	0.46	0.85	0.70	0.17	1.34	0.76	0.99
N3	0.26	0.28	0.30	0.00	0.19	0.38	0.02	0.22	0.05	0.05	0.11	0.32	0.31	0.05	0.17	0.57	0.25	0.58	0.61	0.20	1.42	0.49	0.87
N4	0.05	0.25	0.34	0.06	0.12	0.38	0.06	0.53	0.13	0.05	0.23	0.27	0.20	0.07	0.03	0.76	0.06	0.48	0.18	0.08	0.83	0.22	0.27
O2	0.39	0.23	0.26	0.04	0.20	0.33	0.00	0.10	0.14	0.11	0.03	0.32	0.34	0.03	0.24	0.39	0.50	0.60	0.99	0.31	1.96	1.20	1.44
O2'	0.53	0.24	0.20	0.02	0.35	0.11	0.24	0.65	0.12	0.35	0.11	0.20	0.39	0.25	0.41	0.11	0.67	0.53	1.54	0.02	2.57	2.27	2.28
O3'	0.36	0.61	1.07	0.87	0.53	0.71	0.55	1.52	0.59	0.46	0.61	0.61	0.57	0.51	0.47	0.94	0.11	0.30	2.34	0.61	2.80	3.08	2.97
O4'	0.63	0.02	0.17	0.27	0.27	0.84	0.13	0.36	0.04	0.37	0.09	0.07	0.23	0.21	0.42	0.48	0.76	1.12	0.54	0.13	0.91	0.84	0.84
O5'	0.55	0.06	0.17	0.26	0.18	0.68	0.07	0.15	0.04	0.22	0.04	0.04	0.19	0.10	0.30	0.42	0.90	0.89	0.51	0.11	0.40	0.84	0.66
OP1	0.47	0.02	0.03	0.39	0.18	0.81	0.16	0.47	0.04	0.36	0.03	0.11	0.08	0.26	0.33	0.26	0.78	0.81	0.22	0.03	0.75	0.21	0.22
OP2	0.03	0.11	0.48	0.03	0.23	0.25	0.39	0.04	0.41	0.42	0.27	0.03	0.06	0.48	0.25	0.79	0.58	0.27	0.33	0.49	0.11	0.54	0.31
P	0.57	0.12	0.06	0.50	0.23	0.82	0.13	0.40	0.03	0.27	0.03	0.10	0.23	0.16	0.34	0.25	1.12	0.88	0.00	0.03	0.32	0.36	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.24	0.02	0.48	0.16	0.27
C2	0.00	0.00	0.36	0.34	0.01	0.44	0.00	0.84	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.14	0.05	0.24	1.48	0.03	2.54	1.58	1.90
C2'	0.00	0.36	0.00	0.01	0.18	0.00	0.08	0.03	0.17	0.19	0.29	0.44	0.36	0.10	0.01	0.00	0.03	0.02	0.23	0.12	0.29	0.16	0.27
C3'	0.00	0.34	0.01	0.00	0.14	0.01	0.05	0.03	0.14	0.17	0.26	0.42	0.32	0.11	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.10	0.11	0.17	0.03
C4	0.00	0.01	0.18	0.14	0.00	0.17	0.00	0.27	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.01	0.12	0.78	0.02	1.45	0.64	0.96
C4'	0.01	0.44	0.00	0.01	0.17	0.00	0.05	0.02	0.15	0.22	0.32	0.56	0.42	0.15	0.02	0.00	0.05	0.00	0.03	0.10	0.07	0.15	0.00
C5	0.00	0.00	0.08	0.05	0.00	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.01	0.05	0.52	0.02	1.30	0.30	0.72
C5'	0.03	0.84	0.03	0.03	0.27	0.02	0.02	0.00	0.22	0.52	0.59	1.13	0.77	0.39	0.10	0.03	0.07	0.01	0.02	0.11	0.24	0.15	0.06
C6	0.02	0.01	0.17	0.14	0.02	0.15	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.12	0.01	0.10	0.79	0.01	1.75	0.63	1.07
C8	0.01	0.01	0.19	0.17	0.01	0.22	0.00	0.52	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.18	0.01	0.33	0.50	0.11
N1	0.02	0.01	0.29	0.26	0.02	0.32	0.02	0.59	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.15	0.02	0.19	1.22	0.03	2.31	1.23	1.61
N2	0.01	0.01	0.44	0.42	0.01	0.56	0.01	1.13	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.15	0.09	0.28	1.83	0.05	3.11	2.15	2.40
N3	0.00	0.00	0.36	0.32	0.00	0.42	0.00	0.77	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.13	0.05	0.24	1.35	0.03	2.13	1.35	1.63
N7	0.01	0.02	0.10	0.11	0.01	0.15	0.01	0.39	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.05	0.01	0.01	0.67	0.35	0.12
N9	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.10	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.29	0.02	0.76	0.10	0.38
O2'	0.00	0.14	0.00	0.03	0.09	0.00	0.08	0.03	0.12	0.01	0.15	0.15	0.13	0.02	0.04	0.00	0.08	0.01	0.21	0.11	0.20	0.16	0.27
O3'	0.02	0.05	0.03	0.01	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.06	0.02	0.09	0.05	0.04	0.02	0.08	0.00	0.01	0.02	0.02	0.29	0.17	0.07
O4'	0.01	0.24	0.02	0.00	0.12	0.00	0.05	0.01	0.10	0.09	0.19	0.28	0.24	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.22	0.08	0.49	0.20	0.22
O5'	0.24	1.48	0.23	0.05	0.78	0.03	0.52	0.02	0.79	0.18	1.22	1.83	1.35	0.01	0.29	0.21	0.02	0.22	0.00	0.66	0.00	0.00	0.01
O6	0.02	0.03	0.12	0.10	0.02	0.10	0.02	0.11	0.01	0.01	0.03	0.05	0.03	0.01	0.02	0.11	0.02	0.08	0.66	0.00	1.67	0.45	0.95
OP1	0.48	2.54	0.29	0.11	1.45	0.07	1.30	0.24	1.75	0.33	2.31	3.11	2.13	0.67	0.76	0.20	0.29	0.49	0.00	1.67	0.00	0.01	0.00
OP2	0.16	1.58	0.16	0.17	0.64	0.15	0.30	0.15	0.63	0.50	1.23	2.15	1.35	0.35	0.10	0.16	0.17	0.20	0.00	0.45	0.01	0.00	0.01
P	0.27	1.90	0.27	0.03	0.96	0.00	0.72	0.06	1.07	0.11	1.61	2.40	1.63	0.12	0.38	0.27	0.07	0.22	0.01	0.95	0.00	0.01	0.00