Doublet Group distance statistics: 53812

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N1	A	0, 0.000, 0.030, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.030 std_dev=0.030
N3	A	0, 0.000, 0.030, 0.061, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.030 std_dev=0.030
C4	A	0, 0.000, 0.035, 0.069, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.035 std_dev=0.035
C2	A	0, 0.000, 0.035, 0.070, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.035 std_dev=0.035
C1'	A	0, 0.000, 0.039, 0.078, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.039 std_dev=0.039
N4	A	0, 0.000, 0.056, 0.112, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.056 std_dev=0.056
O2	A	0, 0.000, 0.091, 0.183, 0.183 max_d=0.183 avg_d=0.091 std_dev=0.091
O4'	A	0, 0.000, 0.263, 0.526, 0.526 max_d=0.526 avg_d=0.263 std_dev=0.263
C4	B	0, 0.000, 0.387, 0.773, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.387 std_dev=0.387
C2'	A	0, 0.000, 0.392, 0.784, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.392 std_dev=0.392
C1'	B	0, 0.000, 0.404, 0.808, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.404 std_dev=0.404
C4'	A	0, 0.000, 0.422, 0.843, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.422 std_dev=0.422
N9	B	0, 0.000, 0.430, 0.861, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.430 std_dev=0.430
C2'	B	0, 0.000, 0.453, 0.906, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.453 std_dev=0.453
N3	B	0, 0.000, 0.551, 1.102, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.551 std_dev=0.551
O2'	B	0, 0.000, 0.580, 1.159, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.580 std_dev=0.580
O5'	A	0, 0.000, 0.618, 1.237, 1.237 max_d=1.237 avg_d=0.618 std_dev=0.618
O4'	B	0, 0.000, 0.661, 1.323, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.661 std_dev=0.661
C3'	A	0, 0.000, 0.683, 1.365, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.683 std_dev=0.683
C5	B	0, 0.000, 0.695, 1.390, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.695 std_dev=0.695
O2'	A	0, 0.000, 0.707, 1.414, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.707 std_dev=0.707
C5'	A	0, 0.000, 0.753, 1.506, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.753 std_dev=0.753
P	A	0, 0.000, 0.831, 1.662, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.831 std_dev=0.831
C2	B	0, 0.000, 0.846, 1.691, 1.691 max_d=1.691 avg_d=0.846 std_dev=0.846
C8	B	0, 0.000, 0.861, 1.723, 1.723 max_d=1.723 avg_d=0.861 std_dev=0.861
OP2	A	0, 0.000, 0.872, 1.743, 1.743 max_d=1.743 avg_d=0.872 std_dev=0.872
C6	B	0, 0.000, 0.913, 1.827, 1.827 max_d=1.827 avg_d=0.913 std_dev=0.913
OP1	A	0, 0.000, 0.928, 1.855, 1.855 max_d=1.855 avg_d=0.928 std_dev=0.928
N1	B	0, 0.000, 0.939, 1.878, 1.878 max_d=1.878 avg_d=0.939 std_dev=0.939
N7	B	0, 0.000, 0.974, 1.949, 1.949 max_d=1.949 avg_d=0.974 std_dev=0.974
O3'	A	0, 0.000, 1.098, 2.196, 2.196 max_d=2.196 avg_d=1.098 std_dev=1.098
C4'	B	0, 0.000, 1.195, 2.390, 2.390 max_d=2.390 avg_d=1.195 std_dev=1.195
N2	B	0, 0.000, 1.208, 2.417, 2.417 max_d=2.417 avg_d=1.208 std_dev=1.208
O6	B	0, 0.000, 1.251, 2.503, 2.503 max_d=2.503 avg_d=1.251 std_dev=1.251
C3'	B	0, 0.000, 1.377, 2.753, 2.753 max_d=2.753 avg_d=1.377 std_dev=1.377
P	B	0, 0.000, 1.407, 2.814, 2.814 max_d=2.814 avg_d=1.407 std_dev=1.407
OP2	B	0, 0.000, 1.443, 2.886, 2.886 max_d=2.886 avg_d=1.443 std_dev=1.443
O5'	B	0, 0.000, 1.501, 3.002, 3.002 max_d=3.002 avg_d=1.501 std_dev=1.501
C5'	B	0, 0.000, 1.517, 3.034, 3.034 max_d=3.034 avg_d=1.517 std_dev=1.517
OP1	B	0, 0.000, 1.703, 3.407, 3.407 max_d=3.407 avg_d=1.703 std_dev=1.703
O3'	B	0, 0.000, 1.925, 3.851, 3.851 max_d=3.851 avg_d=1.925 std_dev=1.925

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.03	0.04	0.09	0.02	0.03	0.01	0.11	0.07	0.16	0.12
C2	0.04	0.00	0.13	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.26	0.08	0.02	0.05	0.05	0.12	0.07
C2'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.04	0.02	0.05	0.02	0.09	0.01	0.10	0.05	0.25	0.00	0.01	0.01	0.03	0.02	0.07	0.03
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.14	0.00	0.24	0.01	0.25	0.09	0.04	0.14	0.17	0.01	0.00	0.01	0.11	0.12	0.11	0.11
C4	0.03	0.03	0.04	0.14	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.17	0.13	0.00	0.06	0.03	0.01	0.03
C4'	0.01	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.11	0.04	0.04	0.08	0.10	0.09	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01
C5	0.00	0.02	0.05	0.24	0.00	0.12	0.00	0.13	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.03	0.27	0.01	0.08	0.04	0.02	0.03
C5'	0.02	0.02	0.02	0.01	0.11	0.01	0.13	0.00	0.09	0.03	0.08	0.12	0.06	0.07	0.05	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00
C6	0.02	0.00	0.09	0.25	0.00	0.11	0.00	0.09	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.26	0.03	0.01	0.02	0.11	0.05
N1	0.00	0.01	0.01	0.09	0.02	0.04	0.02	0.03	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.08	0.06	0.00	0.06	0.06	0.14	0.09
N3	0.03	0.01	0.10	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.26	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.01
N4	0.04	0.03	0.05	0.14	0.01	0.08	0.01	0.12	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.19	0.14	0.01	0.09	0.06	0.03	0.06
O2	0.09	0.01	0.25	0.17	0.03	0.10	0.03	0.06	0.03	0.04	0.02	0.03	0.00	0.41	0.28	0.01	0.12	0.11	0.17	0.12
O2'	0.02	0.26	0.00	0.01	0.17	0.09	0.03	0.07	0.03	0.08	0.26	0.19	0.41	0.00	0.03	0.06	0.03	0.13	0.02	0.04
O3'	0.03	0.08	0.01	0.00	0.13	0.01	0.27	0.05	0.26	0.06	0.01	0.14	0.28	0.03	0.00	0.01	0.22	0.32	0.29	0.27
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.06	0.01	0.00	0.18	0.12	0.21	0.17
O5'	0.11	0.05	0.03	0.11	0.06	0.02	0.08	0.01	0.01	0.06	0.02	0.09	0.12	0.03	0.22	0.18	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.07	0.05	0.02	0.12	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.06	0.01	0.06	0.11	0.13	0.32	0.12	0.01	0.00	0.02	0.02
OP2	0.16	0.12	0.07	0.11	0.01	0.02	0.02	0.02	0.11	0.14	0.04	0.03	0.17	0.02	0.29	0.21	0.01	0.02	0.00	0.00
P	0.12	0.07	0.03	0.11	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.09	0.01	0.06	0.12	0.04	0.27	0.17	0.00	0.02	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.54	0.12	0.17	0.17	0.11	0.13	0.18	0.34	0.32	0.52	0.65	0.39	0.16	0.10	0.21	0.14	0.13	0.26	0.33	0.12	0.05	0.04
C2	0.17	0.56	0.17	0.15	0.05	0.06	0.11	0.15	0.11	0.47	0.45	0.77	0.38	0.43	0.20	0.12	0.29	0.09	0.31	0.02	0.07	0.17	0.09
C2'	0.05	0.62	0.01	0.14	0.33	0.11	0.29	0.23	0.45	0.19	0.60	0.69	0.51	0.00	0.05	0.10	0.14	0.09	0.31	0.42	0.02	0.08	0.12
C3'	0.18	0.62	0.25	0.04	0.42	0.08	0.38	0.05	0.50	0.04	0.61	0.67	0.54	0.17	0.23	0.14	0.19	0.15	0.11	0.49	0.08	0.01	0.01
C4	0.22	0.58	0.24	0.35	0.02	0.23	0.23	0.38	0.05	0.60	0.50	0.84	0.33	0.63	0.27	0.03	0.09	0.20	0.57	0.08	0.22	0.48	0.36
C4'	0.08	0.62	0.18	0.02	0.37	0.05	0.37	0.01	0.53	0.01	0.64	0.68	0.50	0.16	0.16	0.01	0.16	0.07	0.02	0.55	0.28	0.16	0.12
C5	0.25	0.60	0.24	0.45	0.04	0.34	0.08	0.50	0.28	0.58	0.61	0.79	0.34	0.54	0.25	0.04	0.08	0.27	0.67	0.25	0.34	0.58	0.48
C5'	0.20	0.70	0.34	0.10	0.48	0.13	0.51	0.06	0.67	0.18	0.75	0.76	0.58	0.33	0.29	0.20	0.19	0.17	0.09	0.71	0.31	0.26	0.18
C6	0.25	0.59	0.21	0.41	0.10	0.33	0.04	0.46	0.37	0.51	0.62	0.73	0.36	0.39	0.22	0.10	0.08	0.27	0.60	0.37	0.26	0.48	0.42
N1	0.21	0.57	0.18	0.26	0.11	0.18	0.03	0.28	0.29	0.46	0.55	0.72	0.38	0.34	0.19	0.15	0.11	0.18	0.41	0.26	0.03	0.24	0.20
N3	0.18	0.56	0.21	0.21	0.03	0.11	0.24	0.23	0.03	0.55	0.41	0.84	0.35	0.58	0.25	0.07	0.26	0.12	0.42	0.17	0.05	0.31	0.20
N4	0.21	0.52	0.25	0.38	0.07	0.25	0.31	0.41	0.08	0.60	0.41	0.83	0.28	0.67	0.28	0.02	0.08	0.20	0.61	0.28	0.28	0.54	0.41
O2	0.10	0.48	0.11	0.02	0.06	0.11	0.09	0.05	0.05	0.36	0.33	0.68	0.36	0.34	0.13	0.16	0.49	0.04	0.10	0.04	0.29	0.03	0.12
O2'	0.04	0.64	0.05	0.06	0.35	0.08	0.28	0.19	0.43	0.13	0.59	0.73	0.55	0.03	0.07	0.24	0.24	0.08	0.24	0.40	0.02	0.04	0.07
O3'	0.29	0.59	0.36	0.16	0.43	0.21	0.38	0.05	0.46	0.13	0.56	0.64	0.54	0.20	0.30	0.18	0.22	0.28	0.00	0.43	0.02	0.00	0.00
O4'	0.05	0.60	0.03	0.07	0.29	0.03	0.28	0.08	0.48	0.13	0.62	0.69	0.45	0.03	0.04	0.11	0.16	0.03	0.12	0.50	0.25	0.09	0.07
O5'	0.13	0.73	0.24	0.08	0.45	0.04	0.48	0.17	0.69	0.07	0.79	0.80	0.58	0.25	0.22	0.21	0.04	0.06	0.20	0.75	0.04	0.13	0.16
OP1	0.21	0.77	0.37	0.05	0.54	0.05	0.63	0.19	0.83	0.28	0.87	0.81	0.62	0.48	0.34	0.33	0.07	0.09	0.12	0.95	0.18	0.04	0.17
OP2	0.20	0.85	0.32	0.13	0.55	0.09	0.61	0.28	0.86	0.18	0.94	0.92	0.67	0.37	0.31	0.42	0.04	0.07	0.32	0.98	0.31	0.34	0.33
P	0.18	0.79	0.31	0.08	0.51	0.04	0.57	0.20	0.79	0.17	0.87	0.85	0.62	0.36	0.29	0.32	0.01	0.08	0.20	0.89	0.14	0.16	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.30	0.00	0.01	0.05	0.09	0.23	0.16
C2	0.00	0.00	0.28	0.20	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.02	0.02	0.04	0.19	0.14	0.04	0.02	0.28	0.30	0.28
C2'	0.01	0.28	0.00	0.01	0.12	0.00	0.00	0.11	0.06	0.22	0.17	0.35	0.28	0.17	0.03	0.01	0.04	0.03	0.19	0.00	0.16	0.39	0.29
C3'	0.02	0.20	0.01	0.00	0.17	0.01	0.18	0.02	0.20	0.10	0.21	0.19	0.17	0.14	0.12	0.00	0.00	0.01	0.07	0.20	0.11	0.00	0.01
C4	0.01	0.02	0.12	0.17	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.18	0.08	0.08	0.01	0.17	0.24	0.19
C4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.04	0.04	0.22	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.09	0.07
C5	0.04	0.02	0.00	0.18	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.30	0.12	0.07	0.10	0.02	0.16	0.21	0.16
C5'	0.02	0.01	0.11	0.02	0.03	0.01	0.05	0.00	0.03	0.10	0.00	0.03	0.01	0.08	0.06	0.10	0.16	0.01	0.01	0.03	0.09	0.01	0.01
C6	0.03	0.00	0.06	0.20	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.26	0.11	0.10	0.08	0.01	0.22	0.25	0.21
C8	0.05	0.02	0.22	0.10	0.00	0.07	0.01	0.10	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.41	0.09	0.03	0.14	0.05	0.01	0.12	0.03
N1	0.02	0.00	0.17	0.21	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.04	0.12	0.15	0.14	0.05	0.02	0.28	0.30	0.27
N2	0.01	0.00	0.35	0.19	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.17	0.22	0.15	0.02	0.03	0.31	0.32	0.31
N3	0.01	0.00	0.28	0.17	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.23	0.13	0.04	0.01	0.24	0.28	0.25
N7	0.06	0.02	0.17	0.14	0.01	0.04	0.00	0.08	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.44	0.08	0.03	0.13	0.04	0.07	0.14	0.07
N9	0.01	0.02	0.03	0.12	0.01	0.04	0.03	0.06	0.04	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.21	0.17	0.01	0.09	0.05	0.08	0.19	0.12
O2'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.14	0.22	0.30	0.10	0.26	0.41	0.12	0.17	0.08	0.44	0.21	0.00	0.01	0.14	0.08	0.33	0.03	0.35	0.15
O3'	0.30	0.19	0.04	0.00	0.18	0.01	0.12	0.16	0.11	0.09	0.15	0.22	0.23	0.08	0.17	0.01	0.00	0.18	0.17	0.08	0.27	0.05	0.08
O4'	0.00	0.14	0.03	0.01	0.08	0.00	0.07	0.01	0.10	0.03	0.14	0.15	0.13	0.03	0.01	0.14	0.18	0.00	0.02	0.11	0.09	0.18	0.14
O5'	0.01	0.04	0.19	0.07	0.08	0.01	0.10	0.01	0.08	0.14	0.05	0.02	0.04	0.13	0.09	0.08	0.17	0.02	0.00	0.07	0.02	0.00	0.00
O6	0.05	0.02	0.00	0.20	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.05	0.02	0.03	0.01	0.04	0.05	0.33	0.08	0.11	0.07	0.00	0.24	0.26	0.21
OP1	0.09	0.28	0.16	0.11	0.17	0.02	0.16	0.09	0.22	0.01	0.28	0.31	0.24	0.07	0.08	0.03	0.27	0.09	0.02	0.24	0.00	0.01	0.01
OP2	0.23	0.30	0.39	0.00	0.24	0.09	0.21	0.01	0.25	0.12	0.30	0.32	0.28	0.14	0.19	0.35	0.05	0.18	0.00	0.26	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.28	0.29	0.01	0.19	0.07	0.16	0.01	0.21	0.03	0.27	0.31	0.25	0.07	0.12	0.15	0.08	0.14	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00