Doublet Group distance statistics: 53832

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 7, 26, 54, 39, 13, 7, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.029, 0.035, 0.041, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.035 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.021, 0.031, 0.041, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.031 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.034, 0.044, 0.054, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.044 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.055, 0.065, 0.075, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.065 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.034, 0.047, 0.060, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.047 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.024, 0.040, 0.056, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.040 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.046, 0.065, 0.084, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.065 std_dev=0.019
C4	A	0, 0.017, 0.036, 0.055, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.036 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.060, 0.081, 0.102, 0.200 max_d=0.200 avg_d=0.081 std_dev=0.021
N9	A	0, 0.020, 0.050, 0.080, 0.167 max_d=0.167 avg_d=0.050 std_dev=0.030
C8	A	0, 0.030, 0.060, 0.091, 0.182 max_d=0.182 avg_d=0.060 std_dev=0.030
N1	B	0, 0.296, 0.442, 0.587, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.442 std_dev=0.146
C6	B	0, 0.322, 0.481, 0.641, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.481 std_dev=0.160
C2	B	0, 0.282, 0.443, 0.605, 0.924 max_d=0.924 avg_d=0.443 std_dev=0.162
N3	B	0, 0.224, 0.393, 0.562, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.393 std_dev=0.169
O5'	B	0, 0.444, 0.634, 0.823, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.634 std_dev=0.189
C4	B	0, 0.237, 0.436, 0.634, 1.353 max_d=1.353 avg_d=0.436 std_dev=0.198
C3'	B	0, 0.263, 0.465, 0.667, 1.225 max_d=1.225 avg_d=0.465 std_dev=0.202
O2	B	0, 0.384, 0.597, 0.809, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.597 std_dev=0.213
C5	B	0, 0.277, 0.494, 0.712, 1.223 max_d=1.223 avg_d=0.494 std_dev=0.217
P	B	0, 0.492, 0.709, 0.927, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.709 std_dev=0.218
C5'	B	0, 0.393, 0.625, 0.856, 1.492 max_d=1.492 avg_d=0.625 std_dev=0.231
C2'	B	0, 0.252, 0.486, 0.720, 1.094 max_d=1.094 avg_d=0.486 std_dev=0.234
C4'	B	0, 0.310, 0.550, 0.789, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.550 std_dev=0.239
C1'	B	0, 0.256, 0.500, 0.743, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.500 std_dev=0.244
O4'	B	0, 0.325, 0.573, 0.820, 1.267 max_d=1.267 avg_d=0.573 std_dev=0.247
O4	B	0, 0.319, 0.567, 0.816, 1.837 max_d=1.837 avg_d=0.567 std_dev=0.248
OP2	B	0, 0.423, 0.705, 0.986, 2.364 max_d=2.364 avg_d=0.705 std_dev=0.282
O3'	B	0, 0.221, 0.515, 0.809, 2.780 max_d=2.780 avg_d=0.515 std_dev=0.294
O4'	A	0, -0.092, 0.210, 0.511, 2.655 max_d=2.655 avg_d=0.210 std_dev=0.302
C3'	A	0, -0.015, 0.295, 0.606, 2.407 max_d=2.407 avg_d=0.295 std_dev=0.310
O2'	B	0, 0.363, 0.702, 1.041, 1.856 max_d=1.856 avg_d=0.702 std_dev=0.339
C4'	A	0, -0.090, 0.258, 0.607, 3.014 max_d=3.014 avg_d=0.258 std_dev=0.349
C2'	A	0, -0.105, 0.254, 0.612, 2.800 max_d=2.800 avg_d=0.254 std_dev=0.359
OP1	B	0, 0.450, 0.853, 1.256, 3.275 max_d=3.275 avg_d=0.853 std_dev=0.403
O3'	A	0, -0.041, 0.418, 0.876, 3.039 max_d=3.039 avg_d=0.418 std_dev=0.458
C5'	A	0, -0.265, 0.399, 1.063, 5.913 max_d=5.913 avg_d=0.399 std_dev=0.664
O2'	A	0, -0.204, 0.472, 1.148, 4.695 max_d=4.695 avg_d=0.472 std_dev=0.676
O5'	A	0, -0.284, 0.490, 1.263, 7.075 max_d=7.075 avg_d=0.490 std_dev=0.773
P	A	0, -0.559, 0.547, 1.653, 10.040 max_d=10.040 avg_d=0.547 std_dev=1.106
OP1	A	0, -0.527, 0.641, 1.809, 10.396 max_d=10.396 avg_d=0.641 std_dev=1.168
OP2	A	0, -0.637, 0.669, 1.974, 11.555 max_d=11.555 avg_d=0.669 std_dev=1.305

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.21	0.00	0.14	0.35	0.11	0.14
C2	0.02	0.00	0.16	0.13	0.01	0.16	0.01	0.29	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.25	0.14	0.35	0.51	0.34	0.35
C2'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.07	0.01	0.04	0.13	0.06	0.11	0.11	0.16	0.06	0.08	0.02	0.00	0.03	0.02	0.30	0.28	0.29	0.25
C3'	0.02	0.13	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.02	0.11	0.13	0.12	0.13	0.11	0.13	0.07	0.02	0.01	0.01	0.12	0.20	0.20	0.10
C4	0.01	0.01	0.07	0.09	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.18	0.07	0.18	0.39	0.12	0.12
C4'	0.01	0.16	0.01	0.00	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.11	0.12	0.15	0.06	0.08	0.03	0.14	0.03	0.00	0.02	0.18	0.09	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.10	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.14	0.04	0.19	0.44	0.18	0.18
C5'	0.05	0.29	0.13	0.02	0.13	0.01	0.11	0.00	0.15	0.21	0.23	0.27	0.14	0.18	0.09	0.04	0.12	0.01	0.01	0.09	0.13	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.07	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.16	0.07	0.20	0.41	0.16	0.14
C8	0.01	0.02	0.11	0.13	0.01	0.11	0.01	0.21	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.19	0.10	0.08	0.33	0.63	0.38	0.41
N1	0.02	0.00	0.11	0.12	0.01	0.12	0.01	0.23	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.21	0.11	0.28	0.45	0.24	0.24
N3	0.02	0.00	0.16	0.13	0.00	0.15	0.01	0.27	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.26	0.14	0.32	0.45	0.29	0.30
N6	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.06	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.21	0.14	0.05	0.21	0.44	0.21	0.18
N7	0.01	0.01	0.08	0.13	0.01	0.08	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.21	0.10	0.05	0.30	0.60	0.37	0.38
N9	0.00	0.01	0.02	0.07	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.11	0.14	0.01	0.18	0.43	0.16	0.19
O2'	0.01	0.19	0.00	0.02	0.14	0.14	0.18	0.04	0.19	0.19	0.18	0.18	0.21	0.21	0.11	0.00	0.05	0.08	0.27	0.27	0.29	0.25
O3'	0.21	0.25	0.03	0.01	0.18	0.03	0.14	0.12	0.16	0.10	0.21	0.26	0.14	0.10	0.14	0.05	0.00	0.16	0.17	0.22	0.22	0.17
O4'	0.00	0.14	0.02	0.01	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.08	0.11	0.14	0.05	0.05	0.01	0.08	0.16	0.00	0.08	0.35	0.12	0.17
O5'	0.14	0.35	0.30	0.12	0.18	0.02	0.19	0.01	0.20	0.33	0.28	0.32	0.21	0.30	0.18	0.27	0.17	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.35	0.51	0.28	0.20	0.39	0.18	0.44	0.09	0.41	0.63	0.45	0.45	0.44	0.60	0.43	0.27	0.22	0.35	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.34	0.29	0.20	0.12	0.09	0.18	0.13	0.16	0.38	0.24	0.29	0.21	0.37	0.16	0.29	0.22	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.35	0.25	0.10	0.12	0.05	0.18	0.02	0.14	0.41	0.24	0.30	0.18	0.38	0.19	0.25	0.17	0.17	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.14	0.12	0.14	0.20	0.15	0.26	0.20	0.23	0.15	0.16	0.14	0.16	0.19	0.22	0.16	0.16	0.24	0.28	0.15
C2	0.11	0.15	0.12	0.11	0.13	0.11	0.14	0.18	0.13	0.12	0.16	0.19	0.18	0.11	0.17	0.11	0.17	0.37	0.38	0.21
C2'	0.29	0.21	0.30	0.34	0.22	0.35	0.28	0.38	0.30	0.26	0.20	0.21	0.31	0.37	0.22	0.33	0.37	0.32	0.55	0.37
C3'	0.23	0.22	0.23	0.19	0.25	0.24	0.29	0.30	0.28	0.23	0.23	0.22	0.25	0.20	0.26	0.26	0.30	0.28	0.49	0.34
C4	0.11	0.13	0.12	0.12	0.16	0.10	0.20	0.16	0.17	0.12	0.15	0.16	0.18	0.13	0.20	0.10	0.12	0.28	0.30	0.12
C4'	0.14	0.15	0.13	0.13	0.24	0.19	0.29	0.27	0.25	0.16	0.18	0.16	0.19	0.22	0.27	0.20	0.24	0.33	0.27	0.29
C5	0.14	0.14	0.15	0.14	0.14	0.12	0.18	0.15	0.17	0.13	0.13	0.18	0.22	0.14	0.20	0.12	0.14	0.27	0.29	0.13
C5'	0.19	0.14	0.27	0.32	0.24	0.31	0.28	0.34	0.21	0.14	0.16	0.18	0.35	0.47	0.31	0.23	0.24	0.34	0.27	0.28
C6	0.15	0.16	0.16	0.14	0.10	0.13	0.15	0.16	0.14	0.14	0.13	0.22	0.23	0.14	0.18	0.13	0.16	0.31	0.33	0.17
C8	0.17	0.15	0.16	0.17	0.19	0.17	0.25	0.19	0.25	0.18	0.17	0.17	0.21	0.18	0.21	0.17	0.18	0.24	0.24	0.16
N1	0.13	0.16	0.14	0.12	0.10	0.11	0.14	0.17	0.13	0.12	0.15	0.21	0.21	0.12	0.15	0.11	0.18	0.36	0.37	0.21
N3	0.10	0.14	0.11	0.11	0.16	0.11	0.17	0.18	0.15	0.11	0.16	0.17	0.17	0.13	0.20	0.11	0.15	0.33	0.35	0.17
N6	0.20	0.19	0.21	0.18	0.13	0.17	0.16	0.18	0.16	0.17	0.13	0.26	0.27	0.17	0.21	0.17	0.19	0.31	0.32	0.19
N7	0.18	0.16	0.19	0.18	0.18	0.17	0.22	0.18	0.22	0.17	0.16	0.18	0.24	0.18	0.21	0.17	0.17	0.24	0.24	0.15
N9	0.12	0.14	0.12	0.13	0.19	0.12	0.24	0.17	0.22	0.14	0.16	0.15	0.17	0.16	0.21	0.13	0.13	0.24	0.26	0.12
O2'	0.53	0.49	0.45	0.47	0.51	0.54	0.60	0.57	0.61	0.54	0.48	0.46	0.43	0.42	0.47	0.59	0.63	0.54	0.87	0.66
O3'	0.28	0.20	0.28	0.24	0.23	0.33	0.29	0.41	0.29	0.25	0.20	0.21	0.29	0.20	0.26	0.35	0.42	0.45	0.56	0.50
O4'	0.18	0.20	0.13	0.17	0.28	0.22	0.35	0.28	0.31	0.22	0.22	0.20	0.17	0.23	0.30	0.24	0.25	0.37	0.18	0.27
O5'	0.39	0.23	0.51	0.56	0.18	0.50	0.22	0.45	0.24	0.27	0.16	0.30	0.58	0.71	0.24	0.38	0.38	0.32	0.34	0.31
OP1	0.59	0.48	0.79	0.74	0.36	0.61	0.33	0.47	0.34	0.46	0.40	0.58	0.90	0.91	0.44	0.50	0.33	0.25	0.27	0.20
OP2	0.51	0.32	0.68	0.69	0.16	0.63	0.20	0.56	0.23	0.33	0.20	0.45	0.85	0.91	0.25	0.49	0.43	0.46	0.35	0.39
P	0.56	0.35	0.74	0.77	0.13	0.68	0.15	0.56	0.25	0.38	0.21	0.46	0.86	0.98	0.21	0.54	0.40	0.27	0.29	0.25

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.05	0.02	0.00	0.08	0.18	0.13	0.09
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.07	0.01	0.03	0.15	0.29	0.22	0.16
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.06	0.02	0.05	0.10	0.00	0.01	0.05	0.01	0.11	0.17	0.09	0.11
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.09	0.00	0.10	0.02	0.10	0.05	0.08	0.09	0.02	0.01	0.09	0.01	0.10	0.13	0.06	0.08
C4	0.02	0.01	0.04	0.09	0.00	0.06	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.07	0.01	0.03	0.21	0.38	0.34	0.24
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.04	0.07	0.02	0.06	0.00	0.02	0.07	0.13	0.03
C5	0.02	0.01	0.05	0.10	0.01	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.07	0.10	0.01	0.04	0.22	0.38	0.33	0.24
C5'	0.03	0.06	0.04	0.02	0.11	0.01	0.12	0.00	0.10	0.06	0.09	0.06	0.05	0.05	0.12	0.02	0.01	0.11	0.16	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.10	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01	0.06	0.09	0.02	0.04	0.19	0.32	0.23	0.18
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03	0.02	0.01	0.14	0.27	0.18	0.14
N3	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.07	0.01	0.03	0.19	0.34	0.29	0.21
O2	0.04	0.01	0.10	0.09	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.10	0.13	0.02	0.06	0.13	0.26	0.19	0.14
O2'	0.02	0.07	0.00	0.02	0.08	0.07	0.07	0.05	0.06	0.04	0.08	0.10	0.00	0.04	0.09	0.06	0.07	0.14	0.10	0.09
O3'	0.05	0.07	0.01	0.01	0.07	0.02	0.10	0.05	0.09	0.03	0.07	0.13	0.04	0.00	0.09	0.04	0.11	0.20	0.10	0.11
O4	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.06	0.01	0.12	0.02	0.02	0.01	0.02	0.09	0.09	0.00	0.04	0.23	0.41	0.39	0.26
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.03	0.06	0.06	0.04	0.04	0.00	0.06	0.14	0.18	0.09
O5'	0.08	0.15	0.11	0.10	0.21	0.02	0.22	0.01	0.19	0.14	0.19	0.13	0.07	0.11	0.23	0.06	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.18	0.29	0.17	0.13	0.38	0.07	0.38	0.11	0.32	0.27	0.34	0.26	0.14	0.20	0.41	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.13	0.22	0.09	0.06	0.34	0.13	0.33	0.16	0.23	0.18	0.29	0.19	0.10	0.10	0.39	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.16	0.11	0.08	0.24	0.03	0.24	0.02	0.18	0.14	0.21	0.14	0.09	0.11	0.26	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00