Doublet Group distance statistics: 53833

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 8, 21, 12, 10, 3, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.011, 0.020, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C2	A	0, -0.002, 0.011, 0.024, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.011 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.002, 0.017, 0.031, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.017 std_dev=0.014
C5	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.000, 0.017, 0.035, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.017 std_dev=0.017
C1'	A	0, -0.002, 0.016, 0.035, 0.093 max_d=0.093 avg_d=0.016 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.002, 0.021, 0.040, 0.086 max_d=0.086 avg_d=0.021 std_dev=0.019
C4	A	0, -0.001, 0.020, 0.041, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.020 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.002, 0.035, 0.069, 0.127 max_d=0.127 avg_d=0.035 std_dev=0.034
C8	A	0, 0.003, 0.040, 0.078, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.040 std_dev=0.038
N6	A	0, -0.001, 0.038, 0.078, 0.181 max_d=0.181 avg_d=0.038 std_dev=0.039
O4'	A	0, -0.009, 0.082, 0.174, 0.430 max_d=0.430 avg_d=0.082 std_dev=0.092
C2'	A	0, -0.024, 0.105, 0.235, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.105 std_dev=0.129
N1	B	0, 0.144, 0.278, 0.412, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.278 std_dev=0.134
C4'	A	0, 0.021, 0.157, 0.292, 0.747 max_d=0.747 avg_d=0.157 std_dev=0.135
C6	B	0, 0.124, 0.268, 0.412, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.268 std_dev=0.144
C5'	A	0, 0.107, 0.254, 0.400, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.254 std_dev=0.147
C1'	B	0, 0.173, 0.323, 0.473, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.323 std_dev=0.150
C5	B	0, 0.126, 0.290, 0.454, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.290 std_dev=0.164
C2	B	0, 0.159, 0.330, 0.502, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.330 std_dev=0.171
O5'	A	0, 0.132, 0.308, 0.483, 1.002 max_d=1.002 avg_d=0.308 std_dev=0.176
C4	B	0, 0.135, 0.318, 0.502, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.318 std_dev=0.183
O5'	B	0, 0.213, 0.407, 0.600, 1.068 max_d=1.068 avg_d=0.407 std_dev=0.194
N3	B	0, 0.145, 0.340, 0.535, 0.801 max_d=0.801 avg_d=0.340 std_dev=0.195
C3'	A	0, -0.034, 0.174, 0.383, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.174 std_dev=0.208
O2	B	0, 0.200, 0.411, 0.622, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.411 std_dev=0.211
O4'	B	0, 0.147, 0.359, 0.571, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.359 std_dev=0.212
P	A	0, 0.214, 0.432, 0.650, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.432 std_dev=0.218
O3'	B	0, 0.299, 0.519, 0.739, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.519 std_dev=0.220
C3'	B	0, 0.219, 0.446, 0.674, 1.172 max_d=1.172 avg_d=0.446 std_dev=0.227
C2'	B	0, 0.135, 0.366, 0.597, 1.306 max_d=1.306 avg_d=0.366 std_dev=0.231
O4	B	0, 0.148, 0.382, 0.616, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.382 std_dev=0.234
OP2	A	0, 0.277, 0.520, 0.763, 1.125 max_d=1.125 avg_d=0.520 std_dev=0.243
C4'	B	0, 0.173, 0.421, 0.669, 1.312 max_d=1.312 avg_d=0.421 std_dev=0.248
OP1	A	0, 0.242, 0.512, 0.781, 1.348 max_d=1.348 avg_d=0.512 std_dev=0.269
P	B	0, 0.188, 0.485, 0.782, 1.333 max_d=1.333 avg_d=0.485 std_dev=0.297
O2'	A	0, -0.111, 0.218, 0.547, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.218 std_dev=0.329
O2'	B	0, 0.072, 0.401, 0.731, 1.873 max_d=1.873 avg_d=0.401 std_dev=0.329
OP1	B	0, 0.449, 0.791, 1.134, 1.498 max_d=1.498 avg_d=0.791 std_dev=0.342
C5'	B	0, 0.032, 0.440, 0.848, 2.352 max_d=2.352 avg_d=0.440 std_dev=0.408
O3'	A	0, -0.190, 0.312, 0.814, 2.276 max_d=2.276 avg_d=0.312 std_dev=0.502
OP2	B	0, 0.329, 0.884, 1.439, 2.490 max_d=2.490 avg_d=0.884 std_dev=0.555

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.20	0.00	0.09	0.06	0.16	0.08
C2	0.04	0.00	0.06	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.09	0.33	0.07	0.14	0.13	0.16	0.12
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.02	0.03	0.10	0.03	0.07	0.05	0.06	0.04	0.06	0.02	0.00	0.04	0.02	0.19	0.20	0.28	0.21
C3'	0.02	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.06	0.02	0.05	0.12	0.04	0.06	0.07	0.11	0.05	0.02	0.01	0.02	0.08	0.09	0.15	0.07
C4	0.02	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.23	0.04	0.14	0.11	0.17	0.11
C4'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.05	0.07	0.04	0.05	0.02	0.08	0.03	0.01	0.01	0.05	0.09	0.02
C5	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.17	0.03	0.16	0.13	0.19	0.13
C5'	0.03	0.07	0.10	0.02	0.05	0.01	0.06	0.00	0.06	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.04	0.04	0.11	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.05	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.21	0.04	0.16	0.15	0.19	0.14
C8	0.02	0.01	0.07	0.12	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.21	0.07	0.04	0.16	0.12	0.20	0.13
N1	0.03	0.01	0.05	0.04	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.28	0.05	0.16	0.15	0.17	0.13
N3	0.04	0.01	0.06	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.09	0.33	0.07	0.13	0.11	0.16	0.10
N6	0.03	0.02	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.14	0.17	0.04	0.17	0.17	0.20	0.16
N7	0.02	0.01	0.06	0.11	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.20	0.08	0.03	0.18	0.14	0.21	0.15
N9	0.00	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.15	0.01	0.13	0.09	0.17	0.10
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.06	0.08	0.12	0.04	0.10	0.21	0.07	0.09	0.14	0.20	0.09	0.00	0.06	0.04	0.18	0.19	0.36	0.24
O3'	0.20	0.33	0.04	0.01	0.23	0.03	0.17	0.11	0.21	0.07	0.28	0.33	0.17	0.08	0.15	0.06	0.00	0.13	0.16	0.18	0.30	0.20
O4'	0.00	0.07	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.05	0.07	0.04	0.03	0.01	0.04	0.13	0.00	0.10	0.09	0.12	0.08
O5'	0.09	0.14	0.19	0.08	0.14	0.01	0.16	0.01	0.16	0.16	0.16	0.13	0.17	0.18	0.13	0.18	0.16	0.10	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.13	0.20	0.09	0.11	0.05	0.13	0.05	0.15	0.12	0.15	0.11	0.17	0.14	0.09	0.19	0.18	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.16	0.28	0.15	0.17	0.09	0.19	0.07	0.19	0.20	0.17	0.16	0.20	0.21	0.17	0.36	0.30	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.12	0.21	0.07	0.11	0.02	0.13	0.01	0.14	0.13	0.13	0.10	0.16	0.15	0.10	0.24	0.20	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.15	0.19	0.14	0.16	0.15	0.14	0.21	0.14	0.12	0.18	0.18	0.32	0.16	0.19	0.17	0.14	0.13	0.28	0.12
C2	0.18	0.20	0.18	0.17	0.11	0.16	0.19	0.16	0.18	0.16	0.18	0.25	0.24	0.20	0.10	0.16	0.13	0.17	0.20	0.13
C2'	0.11	0.17	0.20	0.15	0.22	0.17	0.17	0.23	0.12	0.13	0.21	0.18	0.32	0.16	0.26	0.21	0.14	0.12	0.35	0.13
C3'	0.14	0.17	0.19	0.19	0.18	0.23	0.15	0.30	0.12	0.14	0.18	0.19	0.29	0.19	0.22	0.24	0.19	0.22	0.53	0.18
C4	0.14	0.18	0.16	0.15	0.11	0.16	0.14	0.20	0.15	0.12	0.18	0.23	0.27	0.17	0.13	0.16	0.13	0.19	0.22	0.12
C4'	0.12	0.16	0.17	0.15	0.17	0.20	0.14	0.28	0.13	0.12	0.18	0.19	0.31	0.15	0.21	0.21	0.16	0.18	0.43	0.15
C5	0.13	0.16	0.16	0.17	0.11	0.18	0.15	0.22	0.15	0.11	0.15	0.23	0.25	0.17	0.13	0.16	0.14	0.27	0.30	0.15
C5'	0.10	0.15	0.17	0.12	0.16	0.18	0.14	0.28	0.13	0.11	0.17	0.18	0.33	0.13	0.20	0.19	0.15	0.18	0.36	0.13
C6	0.15	0.13	0.18	0.19	0.12	0.17	0.17	0.20	0.16	0.12	0.12	0.23	0.23	0.20	0.15	0.15	0.13	0.27	0.32	0.16
C8	0.11	0.17	0.13	0.15	0.15	0.21	0.15	0.30	0.14	0.12	0.18	0.22	0.30	0.14	0.17	0.22	0.17	0.29	0.31	0.16
N1	0.17	0.16	0.18	0.18	0.12	0.17	0.19	0.17	0.17	0.14	0.13	0.24	0.23	0.21	0.15	0.15	0.13	0.22	0.25	0.15
N3	0.16	0.20	0.17	0.16	0.12	0.15	0.16	0.17	0.17	0.15	0.20	0.24	0.26	0.18	0.13	0.15	0.13	0.15	0.21	0.12
N6	0.16	0.12	0.21	0.22	0.16	0.19	0.19	0.22	0.17	0.12	0.13	0.20	0.22	0.22	0.19	0.16	0.15	0.33	0.39	0.18
N7	0.13	0.17	0.15	0.19	0.14	0.21	0.15	0.29	0.15	0.12	0.18	0.23	0.27	0.15	0.16	0.20	0.17	0.34	0.38	0.18
N9	0.11	0.16	0.16	0.14	0.13	0.16	0.13	0.23	0.13	0.11	0.18	0.20	0.30	0.15	0.16	0.17	0.13	0.19	0.23	0.13
O2'	0.28	0.13	0.44	0.40	0.19	0.32	0.13	0.32	0.16	0.18	0.14	0.15	0.50	0.40	0.28	0.26	0.36	0.33	0.47	0.33
O3'	0.17	0.23	0.23	0.19	0.33	0.22	0.31	0.29	0.25	0.21	0.28	0.22	0.33	0.18	0.38	0.21	0.22	0.40	0.72	0.32
O4'	0.11	0.16	0.16	0.14	0.15	0.18	0.15	0.26	0.14	0.12	0.17	0.19	0.30	0.14	0.19	0.19	0.14	0.15	0.32	0.12
O5'	0.11	0.16	0.21	0.13	0.16	0.16	0.15	0.29	0.14	0.12	0.18	0.20	0.40	0.15	0.20	0.16	0.15	0.21	0.29	0.15
OP1	0.09	0.15	0.17	0.12	0.15	0.17	0.14	0.29	0.13	0.10	0.17	0.20	0.35	0.13	0.18	0.17	0.19	0.23	0.28	0.18
OP2	0.20	0.21	0.28	0.20	0.23	0.21	0.23	0.32	0.23	0.20	0.23	0.23	0.43	0.20	0.25	0.22	0.27	0.30	0.27	0.23
P	0.10	0.16	0.18	0.12	0.16	0.18	0.15	0.31	0.14	0.11	0.18	0.20	0.36	0.13	0.19	0.18	0.20	0.25	0.23	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.08	0.02	0.00	0.08	0.25	0.41	0.16
C2	0.02	0.00	0.08	0.04	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.09	0.01	0.07	0.10	0.19	0.26	0.13
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.08	0.05	0.10	0.03	0.07	0.15	0.01	0.03	0.05	0.01	0.23	0.44	0.67	0.38
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.01	0.04	0.06	0.02	0.01	0.04	0.01	0.15	0.44	0.69	0.33
C4	0.02	0.00	0.05	0.04	0.00	0.04	0.01	0.08	0.02	0.02	0.01	0.01	0.10	0.08	0.00	0.04	0.10	0.13	0.26	0.16
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.03	0.08	0.02	0.01	0.04	0.00	0.02	0.23	0.41	0.11
C5	0.02	0.01	0.08	0.04	0.01	0.06	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.07	0.02	0.08	0.10	0.13	0.28	0.17
C5'	0.03	0.07	0.05	0.02	0.08	0.01	0.09	0.00	0.08	0.05	0.07	0.08	0.04	0.05	0.08	0.01	0.01	0.06	0.22	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.04	0.02	0.06	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.07	0.02	0.10	0.10	0.13	0.21	0.13
N1	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.02	0.01	0.10	0.18	0.26	0.13
N3	0.02	0.00	0.07	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.09	0.01	0.05	0.10	0.15	0.21	0.13
O2	0.04	0.00	0.15	0.06	0.01	0.08	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.22	0.11	0.02	0.12	0.11	0.24	0.32	0.15
O2'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.10	0.02	0.15	0.04	0.16	0.06	0.10	0.22	0.00	0.05	0.10	0.02	0.23	0.52	0.80	0.44
O3'	0.08	0.09	0.03	0.01	0.08	0.01	0.07	0.05	0.07	0.08	0.09	0.11	0.05	0.00	0.08	0.06	0.08	0.44	0.73	0.28
O4	0.02	0.01	0.05	0.04	0.00	0.04	0.02	0.08	0.02	0.02	0.01	0.02	0.10	0.08	0.00	0.04	0.11	0.14	0.32	0.18
O4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.10	0.01	0.05	0.12	0.02	0.06	0.04	0.00	0.08	0.14	0.28	0.09
O5'	0.08	0.10	0.23	0.15	0.10	0.02	0.10	0.01	0.10	0.10	0.10	0.11	0.23	0.08	0.11	0.08	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.25	0.19	0.44	0.44	0.13	0.23	0.13	0.06	0.13	0.18	0.15	0.24	0.52	0.44	0.14	0.14	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.41	0.26	0.67	0.69	0.26	0.41	0.28	0.22	0.21	0.26	0.21	0.32	0.80	0.73	0.32	0.28	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.13	0.38	0.33	0.16	0.11	0.17	0.02	0.13	0.13	0.13	0.15	0.44	0.28	0.18	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00