Doublet Group distance statistics: 53840

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 7, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.008, 0.024, 0.039, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.011, 0.028, 0.045, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.028 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.014, 0.032, 0.050, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.032 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.022, 0.044, 0.066, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.044 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.010, 0.033, 0.056, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.033 std_dev=0.023
N3	A	0, 0.023, 0.049, 0.075, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.049 std_dev=0.026
N1	A	0, 0.019, 0.045, 0.071, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.045 std_dev=0.026
C2	A	0, 0.023, 0.053, 0.083, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.053 std_dev=0.030
C1'	A	0, 0.028, 0.066, 0.104, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.066 std_dev=0.038
C4	B	0, 0.218, 0.347, 0.477, 0.534 max_d=0.534 avg_d=0.347 std_dev=0.130
C6	B	0, 0.201, 0.341, 0.481, 0.569 max_d=0.569 avg_d=0.341 std_dev=0.140
O4'	A	0, 0.036, 0.192, 0.348, 0.553 max_d=0.553 avg_d=0.192 std_dev=0.156
N1	B	0, 0.266, 0.423, 0.579, 0.640 max_d=0.640 avg_d=0.423 std_dev=0.157
C5	B	0, 0.151, 0.308, 0.465, 0.582 max_d=0.582 avg_d=0.308 std_dev=0.157
N3	B	0, 0.199, 0.378, 0.558, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.378 std_dev=0.179
C2	B	0, 0.253, 0.440, 0.626, 0.708 max_d=0.708 avg_d=0.440 std_dev=0.186
O4	B	0, 0.215, 0.404, 0.593, 0.665 max_d=0.665 avg_d=0.404 std_dev=0.189
C1'	B	0, 0.338, 0.554, 0.770, 0.869 max_d=0.869 avg_d=0.554 std_dev=0.216
O4'	B	0, 0.382, 0.603, 0.825, 0.862 max_d=0.862 avg_d=0.603 std_dev=0.222
C2'	A	0, 0.044, 0.275, 0.505, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.275 std_dev=0.231
C4'	A	0, 0.056, 0.303, 0.551, 0.905 max_d=0.905 avg_d=0.303 std_dev=0.248
O2	B	0, 0.294, 0.548, 0.802, 0.989 max_d=0.989 avg_d=0.548 std_dev=0.254
C4'	B	0, 0.370, 0.656, 0.941, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.656 std_dev=0.285
C2'	B	0, 0.298, 0.585, 0.872, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.585 std_dev=0.287
C3'	B	0, 0.279, 0.592, 0.905, 1.101 max_d=1.101 avg_d=0.592 std_dev=0.313
C5'	B	0, 0.360, 0.674, 0.989, 1.258 max_d=1.258 avg_d=0.674 std_dev=0.314
O2'	B	0, 0.368, 0.729, 1.090, 1.416 max_d=1.416 avg_d=0.729 std_dev=0.361
C3'	A	0, 0.015, 0.379, 0.743, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.379 std_dev=0.364
P	B	0, 0.270, 0.658, 1.045, 1.457 max_d=1.457 avg_d=0.658 std_dev=0.388
O5'	A	0, -0.012, 0.384, 0.780, 1.431 max_d=1.431 avg_d=0.384 std_dev=0.396
O5'	B	0, 0.282, 0.686, 1.090, 1.610 max_d=1.610 avg_d=0.686 std_dev=0.404
O3'	B	0, 0.302, 0.714, 1.126, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.714 std_dev=0.412
OP1	B	0, 0.301, 0.719, 1.137, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.719 std_dev=0.418
O2'	A	0, 0.028, 0.468, 0.909, 1.461 max_d=1.461 avg_d=0.468 std_dev=0.440
C5'	A	0, -0.001, 0.517, 1.034, 1.623 max_d=1.623 avg_d=0.517 std_dev=0.517
OP2	B	0, 0.134, 0.701, 1.268, 2.271 max_d=2.271 avg_d=0.701 std_dev=0.567
O3'	A	0, -0.111, 0.465, 1.041, 2.332 max_d=2.332 avg_d=0.465 std_dev=0.576
P	A	0, -0.094, 0.564, 1.222, 2.511 max_d=2.511 avg_d=0.564 std_dev=0.658
OP2	A	0, 0.003, 0.725, 1.446, 2.935 max_d=2.935 avg_d=0.725 std_dev=0.722
OP1	A	0, -0.030, 0.733, 1.495, 3.001 max_d=3.001 avg_d=0.733 std_dev=0.762

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.02	0.06	0.06	0.04	0.01	0.01	0.02	0.13	0.01	0.11	0.11	0.16	0.11
C2	0.06	0.00	0.17	0.13	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.35	0.27	0.07	0.10	0.10	0.18	0.10
C2'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.09	0.01	0.06	0.11	0.09	0.07	0.14	0.16	0.08	0.05	0.02	0.00	0.04	0.02	0.22	0.26	0.32	0.25
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.07	0.00	0.10	0.02	0.10	0.18	0.11	0.13	0.12	0.17	0.08	0.03	0.01	0.01	0.11	0.18	0.17	0.14
C4	0.03	0.01	0.09	0.07	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.23	0.13	0.04	0.09	0.09	0.17	0.11
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.06	0.05	0.06	0.05	0.06	0.03	0.15	0.03	0.00	0.02	0.05	0.04	0.02
C5	0.03	0.01	0.06	0.10	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.22	0.06	0.04	0.08	0.11	0.18	0.12
C5'	0.04	0.05	0.11	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.04	0.06	0.04	0.06	0.07	0.06	0.03	0.06	0.05	0.02	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.04	0.01	0.09	0.10	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.28	0.11	0.04	0.08	0.12	0.19	0.13
C8	0.02	0.01	0.07	0.18	0.01	0.06	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.13	0.11	0.04	0.07	0.10	0.16	0.13
N1	0.06	0.00	0.14	0.11	0.02	0.05	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.33	0.20	0.06	0.09	0.11	0.19	0.12
N3	0.06	0.00	0.16	0.13	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.32	0.27	0.07	0.10	0.10	0.17	0.10
N6	0.04	0.01	0.08	0.12	0.02	0.05	0.01	0.07	0.00	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.03	0.27	0.07	0.04	0.10	0.16	0.22	0.16
N7	0.01	0.01	0.05	0.17	0.01	0.06	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.17	0.09	0.04	0.07	0.12	0.17	0.13
N9	0.01	0.02	0.02	0.08	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.11	0.06	0.02	0.09	0.09	0.16	0.11
O2'	0.02	0.35	0.00	0.03	0.23	0.15	0.22	0.06	0.28	0.13	0.33	0.32	0.27	0.17	0.11	0.00	0.09	0.09	0.17	0.25	0.35	0.23
O3'	0.13	0.27	0.04	0.01	0.13	0.03	0.06	0.05	0.11	0.11	0.20	0.27	0.07	0.09	0.06	0.09	0.00	0.11	0.13	0.22	0.20	0.16
O4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.04	0.06	0.07	0.04	0.04	0.02	0.09	0.11	0.00	0.10	0.09	0.09	0.09
O5'	0.11	0.10	0.22	0.11	0.09	0.02	0.08	0.01	0.08	0.07	0.09	0.10	0.10	0.07	0.09	0.17	0.13	0.10	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.10	0.26	0.18	0.09	0.05	0.11	0.06	0.12	0.10	0.11	0.10	0.16	0.12	0.09	0.25	0.22	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.16	0.18	0.32	0.17	0.17	0.04	0.18	0.02	0.19	0.16	0.19	0.17	0.22	0.17	0.16	0.35	0.20	0.09	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.11	0.10	0.25	0.14	0.11	0.02	0.12	0.01	0.13	0.13	0.12	0.10	0.16	0.13	0.11	0.23	0.16	0.09	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.28	0.28	0.32	0.30	0.09	0.27	0.12	0.26	0.17	0.24	0.21	0.36	0.35	0.33	0.10	0.23	0.37	0.35	0.37	0.27
C2	0.25	0.22	0.32	0.34	0.21	0.30	0.15	0.30	0.15	0.19	0.23	0.28	0.33	0.39	0.28	0.24	0.31	0.39	0.48	0.31
C2'	0.39	0.42	0.42	0.39	0.23	0.36	0.21	0.34	0.27	0.35	0.36	0.50	0.45	0.41	0.16	0.34	0.47	0.38	0.37	0.33
C3'	0.39	0.41	0.41	0.37	0.25	0.36	0.22	0.36	0.27	0.35	0.37	0.50	0.45	0.39	0.20	0.34	0.42	0.43	0.45	0.36
C4	0.23	0.21	0.28	0.29	0.09	0.25	0.07	0.25	0.12	0.18	0.15	0.27	0.30	0.32	0.21	0.20	0.34	0.36	0.39	0.27
C4'	0.32	0.35	0.34	0.32	0.22	0.30	0.21	0.31	0.24	0.30	0.31	0.42	0.37	0.33	0.18	0.29	0.43	0.40	0.40	0.34
C5	0.18	0.19	0.23	0.25	0.13	0.23	0.08	0.24	0.10	0.15	0.17	0.23	0.23	0.29	0.22	0.18	0.34	0.37	0.37	0.27
C5'	0.37	0.41	0.36	0.35	0.35	0.36	0.33	0.37	0.33	0.37	0.41	0.46	0.38	0.35	0.34	0.35	0.55	0.45	0.43	0.41
C6	0.17	0.20	0.21	0.25	0.20	0.24	0.14	0.25	0.11	0.15	0.21	0.24	0.21	0.29	0.26	0.18	0.31	0.38	0.43	0.28
C8	0.21	0.23	0.25	0.25	0.12	0.23	0.10	0.24	0.14	0.19	0.21	0.28	0.26	0.28	0.14	0.18	0.38	0.37	0.33	0.28
N1	0.20	0.24	0.25	0.29	0.23	0.27	0.18	0.28	0.15	0.18	0.26	0.29	0.24	0.34	0.28	0.21	0.30	0.39	0.49	0.32
N3	0.27	0.21	0.33	0.33	0.14	0.30	0.11	0.29	0.14	0.20	0.15	0.29	0.36	0.37	0.25	0.24	0.33	0.37	0.44	0.29
N6	0.19	0.22	0.20	0.24	0.21	0.24	0.17	0.26	0.13	0.18	0.22	0.24	0.20	0.27	0.25	0.21	0.31	0.38	0.41	0.28
N7	0.18	0.20	0.22	0.24	0.13	0.22	0.09	0.24	0.12	0.16	0.19	0.23	0.22	0.27	0.19	0.18	0.38	0.37	0.33	0.28
N9	0.24	0.24	0.29	0.28	0.06	0.24	0.09	0.24	0.14	0.20	0.18	0.30	0.31	0.31	0.12	0.20	0.37	0.36	0.36	0.27
O2'	0.52	0.53	0.58	0.53	0.37	0.49	0.37	0.43	0.41	0.49	0.47	0.62	0.62	0.56	0.36	0.47	0.66	0.42	0.31	0.40
O3'	0.37	0.37	0.42	0.36	0.18	0.33	0.18	0.32	0.22	0.31	0.29	0.48	0.50	0.40	0.18	0.31	0.40	0.38	0.42	0.32
O4'	0.25	0.27	0.28	0.27	0.12	0.24	0.13	0.24	0.16	0.22	0.23	0.35	0.32	0.29	0.07	0.22	0.38	0.35	0.35	0.28
O5'	0.42	0.46	0.41	0.39	0.43	0.41	0.40	0.41	0.41	0.43	0.47	0.49	0.41	0.39	0.42	0.42	0.62	0.48	0.46	0.46
OP1	0.49	0.51	0.45	0.45	0.53	0.50	0.53	0.51	0.52	0.50	0.52	0.51	0.45	0.43	0.53	0.52	0.76	0.57	0.59	0.59
OP2	0.55	0.55	0.51	0.51	0.57	0.56	0.58	0.57	0.57	0.56	0.55	0.54	0.50	0.48	0.56	0.58	0.81	0.61	0.64	0.63
P	0.47	0.50	0.44	0.44	0.50	0.47	0.49	0.49	0.48	0.48	0.51	0.51	0.44	0.42	0.50	0.49	0.72	0.55	0.54	0.55

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.16	0.08	0.31	0.06
C2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.06	0.02	0.03	0.23	0.15	0.35	0.13
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.05	0.02	0.06	0.01	0.05	0.10	0.00	0.01	0.04	0.01	0.05	0.13	0.44	0.17
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.10	0.00	0.14	0.02	0.14	0.06	0.07	0.07	0.02	0.01	0.11	0.01	0.09	0.16	0.48	0.23
C4	0.02	0.01	0.03	0.10	0.00	0.07	0.01	0.16	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.11	0.01	0.02	0.29	0.26	0.37	0.22
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.09	0.04	0.04	0.04	0.05	0.02	0.08	0.00	0.03	0.08	0.30	0.08
C5	0.02	0.01	0.05	0.14	0.01	0.10	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.16	0.01	0.03	0.29	0.27	0.36	0.23
C5'	0.03	0.09	0.02	0.02	0.16	0.01	0.18	0.00	0.16	0.09	0.12	0.07	0.05	0.04	0.17	0.02	0.01	0.18	0.21	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.14	0.01	0.09	0.00	0.16	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.15	0.01	0.04	0.27	0.19	0.35	0.17
N1	0.01	0.01	0.01	0.06	0.02	0.04	0.01	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.22	0.13	0.34	0.12
N3	0.02	0.00	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.12	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.07	0.02	0.03	0.26	0.20	0.36	0.18
O2	0.04	0.01	0.10	0.07	0.02	0.04	0.02	0.07	0.02	0.02	0.01	0.00	0.14	0.10	0.03	0.06	0.20	0.12	0.35	0.11
O2'	0.01	0.09	0.00	0.02	0.05	0.05	0.04	0.05	0.05	0.02	0.08	0.14	0.00	0.03	0.06	0.05	0.08	0.12	0.44	0.19
O3'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.11	0.02	0.16	0.04	0.15	0.05	0.07	0.10	0.03	0.00	0.12	0.02	0.26	0.27	0.54	0.35
O4	0.02	0.02	0.04	0.11	0.01	0.08	0.01	0.17	0.01	0.02	0.02	0.03	0.06	0.12	0.00	0.02	0.30	0.30	0.37	0.25
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.03	0.06	0.05	0.02	0.02	0.00	0.18	0.15	0.21	0.08
O5'	0.16	0.23	0.05	0.09	0.29	0.03	0.29	0.01	0.27	0.22	0.26	0.20	0.08	0.26	0.30	0.18	0.00	0.01	0.03	0.00
OP1	0.08	0.15	0.13	0.16	0.26	0.08	0.27	0.18	0.19	0.13	0.20	0.12	0.12	0.27	0.30	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.35	0.44	0.48	0.37	0.30	0.36	0.21	0.35	0.34	0.36	0.35	0.44	0.54	0.37	0.21	0.03	0.01	0.00	0.00
P	0.06	0.13	0.17	0.23	0.22	0.08	0.23	0.02	0.17	0.12	0.18	0.11	0.19	0.35	0.25	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00