Doublet Group distance statistics: 53842

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 1, 3, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.006, 0.014, 0.022, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.020 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.008, 0.022, 0.036, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.022 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.008, 0.024, 0.040, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.024 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.015, 0.033, 0.050, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.033 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.014, 0.033, 0.053, 0.075 max_d=0.075 avg_d=0.033 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.013, 0.039, 0.064, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.039 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.016, 0.044, 0.072, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.044 std_dev=0.028
C6	B	0, 0.125, 0.288, 0.451, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.288 std_dev=0.163
N1	B	0, 0.101, 0.267, 0.433, 0.543 max_d=0.543 avg_d=0.267 std_dev=0.166
C5	B	0, 0.075, 0.269, 0.464, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.269 std_dev=0.195
C4'	A	0, 0.048, 0.245, 0.443, 0.616 max_d=0.616 avg_d=0.245 std_dev=0.197
C3'	A	0, 0.036, 0.242, 0.448, 0.619 max_d=0.619 avg_d=0.242 std_dev=0.206
C1'	B	0, 0.108, 0.319, 0.529, 0.711 max_d=0.711 avg_d=0.319 std_dev=0.210
C2	B	0, 0.128, 0.345, 0.562, 0.672 max_d=0.672 avg_d=0.345 std_dev=0.217
O3'	A	0, 0.072, 0.293, 0.514, 0.725 max_d=0.725 avg_d=0.293 std_dev=0.221
C3'	B	0, 0.097, 0.319, 0.540, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.319 std_dev=0.221
O4'	B	0, 0.175, 0.400, 0.625, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.400 std_dev=0.225
C2'	B	0, 0.059, 0.292, 0.524, 0.770 max_d=0.770 avg_d=0.292 std_dev=0.232
C4	B	0, 0.048, 0.281, 0.514, 0.841 max_d=0.841 avg_d=0.281 std_dev=0.233
N3	B	0, 0.112, 0.353, 0.594, 0.783 max_d=0.783 avg_d=0.353 std_dev=0.241
C4'	B	0, 0.146, 0.390, 0.634, 0.773 max_d=0.773 avg_d=0.390 std_dev=0.244
O4'	A	0, -0.026, 0.218, 0.462, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.218 std_dev=0.244
O5'	B	0, 0.156, 0.409, 0.661, 0.861 max_d=0.861 avg_d=0.409 std_dev=0.252
O3'	B	0, 0.104, 0.371, 0.639, 0.824 max_d=0.824 avg_d=0.371 std_dev=0.267
O2'	B	0, 0.099, 0.370, 0.641, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.370 std_dev=0.271
C5'	B	0, 0.208, 0.496, 0.785, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.496 std_dev=0.288
O4	B	0, 0.106, 0.412, 0.717, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.412 std_dev=0.305
O2	B	0, 0.194, 0.503, 0.813, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.503 std_dev=0.310
C2'	A	0, -0.063, 0.267, 0.597, 1.065 max_d=1.065 avg_d=0.267 std_dev=0.330
P	A	0, 0.105, 0.436, 0.768, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.436 std_dev=0.331
OP2	A	0, 0.158, 0.499, 0.840, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.499 std_dev=0.341
C5'	A	0, 0.064, 0.430, 0.796, 1.141 max_d=1.141 avg_d=0.430 std_dev=0.366
OP1	A	0, 0.240, 0.640, 1.041, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.640 std_dev=0.401
P	B	0, 0.085, 0.505, 0.924, 1.332 max_d=1.332 avg_d=0.505 std_dev=0.419
O5'	A	0, 0.084, 0.539, 0.994, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.539 std_dev=0.455
OP2	B	0, 0.051, 0.544, 1.036, 1.641 max_d=1.641 avg_d=0.544 std_dev=0.493
OP1	B	0, 0.124, 0.660, 1.197, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.660 std_dev=0.537
O2'	A	0, -0.132, 0.503, 1.138, 2.075 max_d=2.075 avg_d=0.503 std_dev=0.635

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.07	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.02	0.22	0.01	0.16	0.23	0.09	0.09
C2	0.03	0.00	0.16	0.06	0.01	0.05	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.24	0.25	0.13	0.24	0.25	0.20	0.19
C2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.07	0.03	0.04	0.17	0.05	0.15	0.11	0.17	0.05	0.12	0.04	0.01	0.05	0.02	0.31	0.27	0.31	0.30
C3'	0.03	0.06	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.04	0.06	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.15	0.13	0.04
C4	0.02	0.01	0.07	0.03	0.00	0.03	0.00	0.16	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.23	0.07	0.26	0.24	0.19	0.19
C4'	0.02	0.05	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04	0.07	0.05	0.02	0.09	0.04	0.01	0.03	0.21	0.09	0.05
C5	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.05	0.00	0.21	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.22	0.04	0.31	0.27	0.25	0.24
C5'	0.07	0.15	0.17	0.01	0.16	0.01	0.21	0.00	0.21	0.21	0.19	0.13	0.24	0.22	0.15	0.10	0.15	0.02	0.01	0.10	0.09	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.03	0.01	0.05	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.09	0.23	0.06	0.31	0.28	0.27	0.25
C8	0.01	0.02	0.15	0.05	0.01	0.04	0.01	0.21	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.23	0.18	0.08	0.32	0.24	0.23	0.23
N1	0.03	0.01	0.11	0.04	0.02	0.05	0.01	0.19	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.15	0.24	0.11	0.28	0.27	0.24	0.23
N3	0.03	0.00	0.17	0.06	0.00	0.04	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.26	0.25	0.12	0.22	0.24	0.17	0.16
N6	0.03	0.01	0.05	0.03	0.01	0.07	0.01	0.24	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.11	0.22	0.05	0.34	0.31	0.30	0.29
N7	0.01	0.01	0.12	0.04	0.01	0.05	0.00	0.22	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.21	0.19	0.05	0.33	0.27	0.27	0.27
N9	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.08	0.20	0.01	0.25	0.23	0.17	0.17
O2'	0.02	0.24	0.01	0.01	0.09	0.09	0.10	0.10	0.09	0.23	0.15	0.26	0.11	0.21	0.08	0.00	0.08	0.05	0.32	0.31	0.35	0.37
O3'	0.22	0.25	0.05	0.01	0.23	0.04	0.22	0.15	0.23	0.18	0.24	0.25	0.22	0.19	0.20	0.08	0.00	0.18	0.12	0.19	0.18	0.11
O4'	0.01	0.13	0.02	0.01	0.07	0.01	0.04	0.02	0.06	0.08	0.11	0.12	0.05	0.05	0.01	0.05	0.18	0.00	0.10	0.35	0.11	0.16
O5'	0.16	0.24	0.31	0.02	0.26	0.03	0.31	0.01	0.31	0.32	0.28	0.22	0.34	0.33	0.25	0.32	0.12	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.23	0.25	0.27	0.15	0.24	0.21	0.27	0.10	0.28	0.24	0.27	0.24	0.31	0.27	0.23	0.31	0.19	0.35	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.20	0.31	0.13	0.19	0.09	0.25	0.09	0.27	0.23	0.24	0.17	0.30	0.27	0.17	0.35	0.18	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.19	0.30	0.04	0.19	0.05	0.24	0.02	0.25	0.23	0.23	0.16	0.29	0.27	0.17	0.37	0.11	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.17	0.10	0.07	0.27	0.10	0.28	0.12	0.21	0.15	0.22	0.17	0.10	0.09	0.31	0.13	0.13	0.21	0.19	0.17
C2	0.15	0.22	0.16	0.11	0.20	0.10	0.13	0.09	0.12	0.16	0.26	0.25	0.17	0.15	0.25	0.11	0.11	0.21	0.23	0.17
C2'	0.25	0.22	0.27	0.30	0.27	0.29	0.30	0.28	0.28	0.24	0.23	0.21	0.28	0.36	0.29	0.28	0.29	0.29	0.26	0.29
C3'	0.08	0.13	0.09	0.06	0.23	0.10	0.24	0.18	0.16	0.11	0.17	0.15	0.11	0.10	0.28	0.14	0.15	0.20	0.29	0.18
C4	0.15	0.21	0.15	0.12	0.22	0.11	0.18	0.09	0.16	0.16	0.24	0.21	0.16	0.15	0.23	0.12	0.09	0.16	0.13	0.11
C4'	0.10	0.13	0.11	0.10	0.20	0.15	0.22	0.22	0.16	0.11	0.16	0.17	0.13	0.05	0.25	0.15	0.17	0.21	0.26	0.18
C5	0.19	0.21	0.20	0.16	0.13	0.15	0.12	0.12	0.15	0.18	0.20	0.23	0.21	0.19	0.10	0.15	0.10	0.15	0.16	0.11
C5'	0.05	0.07	0.11	0.05	0.21	0.12	0.25	0.23	0.19	0.08	0.13	0.09	0.15	0.04	0.26	0.09	0.16	0.26	0.29	0.22
C6	0.20	0.23	0.21	0.17	0.10	0.15	0.10	0.12	0.12	0.18	0.20	0.27	0.23	0.20	0.11	0.16	0.10	0.16	0.23	0.15
C8	0.16	0.16	0.17	0.16	0.15	0.15	0.20	0.13	0.21	0.17	0.16	0.18	0.17	0.19	0.13	0.14	0.12	0.19	0.09	0.12
N1	0.18	0.23	0.19	0.15	0.14	0.13	0.10	0.10	0.11	0.17	0.23	0.28	0.21	0.18	0.15	0.13	0.11	0.20	0.26	0.18
N3	0.13	0.21	0.14	0.10	0.25	0.09	0.17	0.09	0.14	0.15	0.26	0.22	0.15	0.13	0.30	0.11	0.10	0.19	0.16	0.14
N6	0.23	0.22	0.24	0.20	0.11	0.19	0.12	0.16	0.13	0.19	0.14	0.30	0.27	0.23	0.21	0.20	0.13	0.16	0.25	0.16
N7	0.21	0.18	0.22	0.19	0.08	0.18	0.13	0.15	0.18	0.19	0.14	0.19	0.23	0.22	0.05	0.18	0.12	0.16	0.11	0.10
N9	0.13	0.18	0.14	0.11	0.22	0.11	0.23	0.10	0.20	0.16	0.21	0.18	0.14	0.14	0.23	0.12	0.10	0.17	0.09	0.11
O2'	0.57	0.51	0.52	0.55	0.55	0.61	0.63	0.63	0.63	0.57	0.51	0.48	0.50	0.54	0.54	0.63	0.67	0.61	0.70	0.70
O3'	0.07	0.20	0.10	0.07	0.38	0.10	0.35	0.19	0.22	0.15	0.29	0.17	0.12	0.13	0.48	0.12	0.13	0.19	0.35	0.17
O4'	0.20	0.20	0.20	0.22	0.20	0.24	0.21	0.26	0.17	0.18	0.19	0.26	0.21	0.16	0.24	0.23	0.18	0.15	0.16	0.11
O5'	0.08	0.09	0.13	0.06	0.23	0.12	0.27	0.23	0.22	0.12	0.15	0.07	0.15	0.02	0.27	0.09	0.15	0.24	0.26	0.21
OP1	0.17	0.16	0.19	0.05	0.19	0.06	0.20	0.06	0.20	0.15	0.18	0.19	0.30	0.02	0.22	0.11	0.07	0.18	0.18	0.13
OP2	0.07	0.11	0.10	0.02	0.17	0.04	0.22	0.12	0.19	0.10	0.12	0.19	0.15	0.02	0.20	0.02	0.10	0.31	0.25	0.21
P	0.07	0.09	0.11	0.01	0.16	0.04	0.22	0.10	0.19	0.10	0.11	0.15	0.16	0.01	0.19	0.02	0.07	0.23	0.20	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.03	0.06	0.01	0.02	0.03	0.01	0.06	0.05	0.16	0.11
C2	0.03	0.00	0.09	0.05	0.02	0.02	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.07	0.02	0.04	0.08	0.10	0.21	0.14
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.09	0.01	0.11	0.02	0.07	0.18	0.01	0.02	0.06	0.01	0.04	0.09	0.09	0.05
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.09	0.01	0.15	0.01	0.14	0.04	0.04	0.13	0.01	0.01	0.10	0.01	0.06	0.13	0.09	0.08
C4	0.03	0.02	0.05	0.09	0.00	0.08	0.01	0.15	0.01	0.02	0.00	0.02	0.05	0.11	0.00	0.05	0.15	0.19	0.26	0.20
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.08	0.00	0.11	0.01	0.09	0.03	0.05	0.06	0.02	0.02	0.10	0.01	0.02	0.05	0.05	0.03
C5	0.03	0.01	0.09	0.15	0.01	0.11	0.00	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.18	0.02	0.05	0.15	0.18	0.24	0.18
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.15	0.01	0.16	0.00	0.11	0.06	0.11	0.05	0.02	0.01	0.18	0.02	0.01	0.05	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.11	0.14	0.01	0.09	0.00	0.11	0.00	0.01	0.02	0.01	0.08	0.16	0.02	0.05	0.10	0.12	0.20	0.14
N1	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.02	0.07	0.09	0.19	0.13
N3	0.03	0.01	0.07	0.04	0.00	0.05	0.01	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.06	0.02	0.04	0.11	0.14	0.24	0.17
O2	0.06	0.01	0.18	0.13	0.02	0.06	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.00	0.22	0.17	0.02	0.05	0.08	0.09	0.21	0.14
O2'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.05	0.02	0.07	0.02	0.08	0.02	0.10	0.22	0.00	0.04	0.06	0.03	0.03	0.10	0.07	0.03
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.11	0.02	0.18	0.01	0.16	0.04	0.06	0.17	0.04	0.00	0.13	0.02	0.10	0.25	0.18	0.17
O4	0.03	0.02	0.06	0.10	0.00	0.10	0.02	0.18	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.13	0.00	0.06	0.18	0.23	0.30	0.23
O4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.05	0.03	0.02	0.06	0.00	0.08	0.10	0.18	0.15
O5'	0.06	0.08	0.04	0.06	0.15	0.02	0.15	0.01	0.10	0.07	0.11	0.08	0.03	0.10	0.18	0.08	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.05	0.10	0.09	0.13	0.19	0.05	0.18	0.05	0.12	0.09	0.14	0.09	0.10	0.25	0.23	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.21	0.09	0.09	0.26	0.05	0.24	0.02	0.20	0.19	0.24	0.21	0.07	0.18	0.30	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.11	0.14	0.05	0.08	0.20	0.03	0.18	0.02	0.14	0.13	0.17	0.14	0.03	0.17	0.23	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00