Doublet Group distance statistics: 53844

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 2, 0, 4, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.011, 0.020, 0.029, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.020 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.010, 0.021, 0.032, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.021 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.010, 0.021, 0.033, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.021 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.006, 0.017, 0.029, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.013 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.016, 0.031, 0.046, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.031 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.017, 0.034, 0.050, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.034 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.024, 0.042, 0.060, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.042 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.022, 0.041, 0.060, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.041 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.023, 0.046, 0.070, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.046 std_dev=0.023
C2'	A	0, 0.088, 0.185, 0.281, 0.355 max_d=0.355 avg_d=0.185 std_dev=0.097
O4'	A	0, 0.082, 0.200, 0.317, 0.359 max_d=0.359 avg_d=0.200 std_dev=0.117
C3'	A	0, 0.142, 0.266, 0.391, 0.413 max_d=0.413 avg_d=0.266 std_dev=0.124
C4'	A	0, 0.109, 0.236, 0.364, 0.401 max_d=0.401 avg_d=0.236 std_dev=0.127
O2'	A	0, 0.146, 0.316, 0.486, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.316 std_dev=0.170
C2	B	0, 0.149, 0.342, 0.534, 0.582 max_d=0.582 avg_d=0.342 std_dev=0.193
N3	B	0, 0.124, 0.318, 0.513, 0.609 max_d=0.609 avg_d=0.318 std_dev=0.195
C4	B	0, 0.162, 0.359, 0.557, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.359 std_dev=0.197
O3'	A	0, 0.243, 0.452, 0.661, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.452 std_dev=0.209
O4	B	0, 0.219, 0.444, 0.670, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.444 std_dev=0.225
C2'	B	0, 0.201, 0.427, 0.654, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.427 std_dev=0.226
C5	B	0, 0.200, 0.430, 0.661, 0.891 max_d=0.891 avg_d=0.430 std_dev=0.230
O2	B	0, 0.180, 0.412, 0.645, 0.815 max_d=0.815 avg_d=0.412 std_dev=0.232
N1	B	0, 0.080, 0.323, 0.566, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.323 std_dev=0.243
C6	B	0, 0.137, 0.398, 0.660, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.398 std_dev=0.261
C1'	B	0, 0.153, 0.424, 0.695, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.424 std_dev=0.271
C5'	A	0, 0.169, 0.444, 0.720, 0.878 max_d=0.878 avg_d=0.444 std_dev=0.275
C3'	B	0, 0.201, 0.481, 0.762, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.481 std_dev=0.281
O2'	B	0, 0.238, 0.534, 0.830, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.534 std_dev=0.296
OP2	A	0, 0.306, 0.624, 0.943, 1.168 max_d=1.168 avg_d=0.624 std_dev=0.319
O3'	B	0, 0.288, 0.633, 0.978, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.633 std_dev=0.345
P	A	0, 0.302, 0.659, 1.015, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.659 std_dev=0.356
O4'	B	0, 0.164, 0.528, 0.893, 1.269 max_d=1.269 avg_d=0.528 std_dev=0.365
OP2	B	0, 0.274, 0.651, 1.028, 1.335 max_d=1.335 avg_d=0.651 std_dev=0.377
O5'	B	0, 0.182, 0.575, 0.969, 1.404 max_d=1.404 avg_d=0.575 std_dev=0.393
OP1	A	0, 0.286, 0.684, 1.082, 1.387 max_d=1.387 avg_d=0.684 std_dev=0.398
C4'	B	0, 0.158, 0.565, 0.971, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.565 std_dev=0.406
P	B	0, 0.159, 0.610, 1.062, 1.593 max_d=1.593 avg_d=0.610 std_dev=0.451
O5'	A	0, 0.222, 0.759, 1.297, 1.781 max_d=1.781 avg_d=0.759 std_dev=0.537
C5'	B	0, 0.119, 0.678, 1.236, 1.950 max_d=1.950 avg_d=0.678 std_dev=0.558
OP1	B	0, 0.128, 0.717, 1.305, 2.032 max_d=2.032 avg_d=0.717 std_dev=0.589

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.04	0.10	0.00	0.32	0.41	0.18	0.21
C2	0.04	0.00	0.12	0.10	0.01	0.17	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.18	0.12	0.17	0.59	0.40	0.20	0.35
C2'	0.01	0.12	0.00	0.00	0.07	0.01	0.05	0.08	0.07	0.05	0.10	0.12	0.06	0.05	0.03	0.01	0.03	0.02	0.37	0.42	0.24	0.25
C3'	0.03	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.03	0.06	0.04	0.09	0.10	0.06	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.12	0.38	0.25	0.13
C4	0.02	0.01	0.07	0.06	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.10	0.10	0.52	0.42	0.16	0.31
C4'	0.01	0.17	0.01	0.01	0.09	0.00	0.07	0.00	0.10	0.03	0.14	0.16	0.09	0.02	0.02	0.01	0.05	0.00	0.02	0.33	0.29	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.07	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.11	0.07	0.52	0.43	0.16	0.32
C5'	0.04	0.29	0.08	0.03	0.17	0.00	0.16	0.00	0.21	0.08	0.26	0.26	0.20	0.10	0.09	0.08	0.05	0.03	0.01	0.37	0.39	0.03
C6	0.02	0.00	0.07	0.06	0.01	0.10	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.11	0.10	0.56	0.42	0.18	0.34
C8	0.02	0.01	0.05	0.04	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.14	0.12	0.05	0.41	0.43	0.17	0.27
N1	0.03	0.00	0.10	0.09	0.01	0.14	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.11	0.14	0.58	0.41	0.20	0.36
N3	0.04	0.01	0.12	0.10	0.00	0.16	0.01	0.26	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.17	0.12	0.18	0.56	0.41	0.17	0.33
N6	0.02	0.01	0.06	0.06	0.01	0.09	0.01	0.20	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.03	0.02	0.12	0.11	0.09	0.56	0.42	0.18	0.35
N7	0.02	0.01	0.05	0.04	0.01	0.02	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.13	0.12	0.03	0.47	0.44	0.16	0.30
N9	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.11	0.03	0.43	0.43	0.16	0.27
O2'	0.04	0.18	0.01	0.01	0.12	0.01	0.11	0.08	0.12	0.14	0.16	0.17	0.12	0.13	0.09	0.00	0.07	0.02	0.34	0.41	0.28	0.26
O3'	0.10	0.12	0.03	0.01	0.10	0.05	0.11	0.05	0.11	0.12	0.11	0.12	0.11	0.12	0.11	0.07	0.00	0.08	0.11	0.32	0.27	0.09
O4'	0.00	0.17	0.02	0.02	0.10	0.00	0.07	0.03	0.10	0.05	0.14	0.18	0.09	0.03	0.03	0.02	0.08	0.00	0.23	0.38	0.19	0.13
O5'	0.32	0.59	0.37	0.12	0.52	0.02	0.52	0.01	0.56	0.41	0.58	0.56	0.56	0.47	0.43	0.34	0.11	0.23	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.41	0.40	0.42	0.38	0.42	0.33	0.43	0.37	0.42	0.43	0.41	0.41	0.42	0.44	0.43	0.41	0.32	0.38	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.18	0.20	0.24	0.25	0.16	0.29	0.16	0.39	0.18	0.17	0.20	0.17	0.18	0.16	0.16	0.28	0.27	0.19	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.21	0.35	0.25	0.13	0.31	0.03	0.32	0.03	0.34	0.27	0.36	0.33	0.35	0.30	0.27	0.26	0.09	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.09	0.13	0.15	0.15	0.10	0.12	0.14	0.10	0.09	0.13	0.12	0.23	0.18	0.22	0.09	0.17	0.07	0.26	0.10
C2	0.12	0.05	0.22	0.23	0.20	0.21	0.21	0.27	0.12	0.03	0.12	0.08	0.32	0.28	0.25	0.14	0.23	0.08	0.23	0.13
C2'	0.16	0.08	0.17	0.15	0.15	0.12	0.15	0.16	0.13	0.10	0.12	0.12	0.31	0.19	0.22	0.11	0.20	0.12	0.31	0.16
C3'	0.13	0.14	0.08	0.08	0.18	0.05	0.14	0.08	0.11	0.11	0.18	0.18	0.23	0.11	0.24	0.10	0.21	0.14	0.28	0.15
C4	0.18	0.08	0.22	0.23	0.12	0.21	0.12	0.26	0.12	0.12	0.07	0.11	0.30	0.26	0.20	0.16	0.17	0.06	0.26	0.09
C4'	0.18	0.18	0.14	0.16	0.19	0.15	0.17	0.13	0.16	0.17	0.19	0.20	0.21	0.14	0.22	0.17	0.27	0.24	0.28	0.21
C5	0.23	0.13	0.27	0.27	0.07	0.28	0.12	0.34	0.19	0.19	0.08	0.15	0.31	0.29	0.14	0.22	0.14	0.16	0.31	0.15
C5'	0.19	0.14	0.21	0.23	0.18	0.19	0.20	0.18	0.21	0.18	0.15	0.14	0.26	0.23	0.19	0.18	0.30	0.30	0.30	0.25
C6	0.23	0.12	0.29	0.30	0.10	0.32	0.12	0.40	0.18	0.18	0.08	0.14	0.33	0.31	0.17	0.25	0.15	0.19	0.31	0.17
C8	0.21	0.16	0.23	0.24	0.08	0.23	0.15	0.28	0.19	0.19	0.11	0.16	0.29	0.25	0.07	0.19	0.13	0.15	0.32	0.16
N1	0.19	0.06	0.27	0.28	0.15	0.29	0.16	0.37	0.10	0.10	0.08	0.10	0.33	0.31	0.21	0.21	0.18	0.10	0.25	0.11
N3	0.12	0.08	0.19	0.20	0.21	0.17	0.20	0.22	0.13	0.07	0.14	0.10	0.30	0.25	0.26	0.12	0.23	0.08	0.23	0.11
N6	0.28	0.16	0.31	0.34	0.12	0.38	0.16	0.48	0.23	0.22	0.12	0.17	0.34	0.35	0.16	0.31	0.19	0.32	0.37	0.27
N7	0.25	0.18	0.27	0.27	0.12	0.28	0.19	0.35	0.23	0.22	0.14	0.18	0.31	0.28	0.09	0.24	0.14	0.21	0.35	0.20
N9	0.17	0.10	0.20	0.21	0.09	0.18	0.11	0.23	0.13	0.14	0.07	0.13	0.27	0.24	0.17	0.14	0.15	0.07	0.28	0.10
O2'	0.18	0.07	0.22	0.21	0.17	0.18	0.18	0.23	0.17	0.12	0.11	0.10	0.36	0.25	0.24	0.14	0.23	0.17	0.35	0.20
O3'	0.18	0.23	0.09	0.08	0.25	0.10	0.20	0.10	0.16	0.17	0.26	0.28	0.22	0.08	0.31	0.17	0.26	0.20	0.32	0.21
O4'	0.14	0.13	0.12	0.17	0.17	0.13	0.15	0.12	0.13	0.13	0.15	0.14	0.17	0.18	0.21	0.13	0.25	0.19	0.26	0.17
O5'	0.32	0.16	0.42	0.46	0.17	0.36	0.27	0.40	0.31	0.27	0.13	0.17	0.36	0.46	0.16	0.32	0.32	0.35	0.51	0.35
OP1	0.24	0.23	0.26	0.25	0.25	0.19	0.26	0.21	0.26	0.24	0.24	0.23	0.19	0.23	0.26	0.24	0.17	0.16	0.40	0.21
OP2	0.07	0.18	0.12	0.22	0.23	0.15	0.19	0.19	0.15	0.11	0.23	0.21	0.14	0.29	0.28	0.07	0.11	0.13	0.28	0.11
P	0.18	0.09	0.25	0.27	0.12	0.20	0.16	0.23	0.17	0.14	0.11	0.12	0.21	0.28	0.15	0.19	0.14	0.16	0.37	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.06	0.03	0.00	0.08	0.12	0.21	0.07
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.06	0.01	0.06	0.10	0.12	0.28	0.13
C2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.08	0.03	0.13	0.03	0.14	0.05	0.05	0.14	0.01	0.04	0.08	0.02	0.18	0.17	0.23	0.14
C3'	0.02	0.07	0.01	0.00	0.06	0.01	0.10	0.03	0.10	0.04	0.06	0.10	0.04	0.01	0.07	0.02	0.25	0.20	0.19	0.17
C4	0.02	0.01	0.08	0.06	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.07	0.01	0.05	0.16	0.19	0.34	0.21
C4'	0.02	0.03	0.03	0.01	0.06	0.00	0.08	0.01	0.08	0.04	0.04	0.04	0.09	0.06	0.07	0.01	0.03	0.13	0.19	0.04
C5	0.02	0.01	0.13	0.10	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.10	0.01	0.07	0.18	0.19	0.33	0.20
C5'	0.03	0.06	0.03	0.03	0.12	0.01	0.14	0.00	0.13	0.07	0.09	0.05	0.09	0.05	0.13	0.04	0.02	0.14	0.21	0.04
C6	0.02	0.01	0.14	0.10	0.01	0.08	0.00	0.13	0.00	0.01	0.02	0.01	0.13	0.11	0.01	0.07	0.16	0.15	0.28	0.15
N1	0.02	0.01	0.05	0.04	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.01	0.03	0.10	0.11	0.26	0.11
N3	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.01	0.06	0.13	0.15	0.32	0.18
O2	0.03	0.00	0.14	0.10	0.01	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.13	0.09	0.02	0.10	0.09	0.11	0.26	0.11
O2'	0.03	0.05	0.01	0.04	0.08	0.09	0.13	0.09	0.13	0.06	0.05	0.13	0.00	0.12	0.09	0.07	0.11	0.17	0.21	0.11
O3'	0.06	0.06	0.04	0.01	0.07	0.06	0.10	0.05	0.11	0.06	0.06	0.09	0.12	0.00	0.08	0.05	0.23	0.23	0.15	0.16
O4	0.03	0.01	0.08	0.07	0.01	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.08	0.00	0.06	0.17	0.22	0.36	0.23
O4'	0.00	0.06	0.02	0.02	0.05	0.01	0.07	0.04	0.07	0.03	0.06	0.10	0.07	0.05	0.06	0.00	0.16	0.16	0.22	0.13
O5'	0.08	0.10	0.18	0.25	0.16	0.03	0.18	0.02	0.16	0.10	0.13	0.09	0.11	0.23	0.17	0.16	0.00	0.03	0.03	0.01
OP1	0.12	0.12	0.17	0.20	0.19	0.13	0.19	0.14	0.15	0.11	0.15	0.11	0.17	0.23	0.22	0.16	0.03	0.00	0.02	0.01
OP2	0.21	0.28	0.23	0.19	0.34	0.19	0.33	0.21	0.28	0.26	0.32	0.26	0.21	0.15	0.36	0.22	0.03	0.02	0.00	0.00
P	0.07	0.13	0.14	0.17	0.21	0.04	0.20	0.04	0.15	0.11	0.18	0.11	0.11	0.16	0.23	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00