Doublet Group distance statistics: 53845

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 2, 0, 3, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.013 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.021 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.010, 0.032, 0.053, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.032 std_dev=0.022
N1	A	0, 0.008, 0.030, 0.052, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.030 std_dev=0.022
N3	A	0, 0.007, 0.030, 0.053, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.030 std_dev=0.023
C5	A	0, -0.002, 0.022, 0.046, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.022 std_dev=0.024
C4	A	0, 0.001, 0.032, 0.064, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.032 std_dev=0.032
N9	A	0, -0.003, 0.036, 0.075, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.036 std_dev=0.039
N6	A	0, 0.006, 0.051, 0.096, 0.151 max_d=0.151 avg_d=0.051 std_dev=0.045
N7	A	0, -0.008, 0.043, 0.095, 0.173 max_d=0.173 avg_d=0.043 std_dev=0.052
C8	A	0, -0.015, 0.052, 0.119, 0.223 max_d=0.223 avg_d=0.052 std_dev=0.067
N1	B	0, 0.321, 0.566, 0.811, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.566 std_dev=0.245
C1'	B	0, 0.426, 0.694, 0.961, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.694 std_dev=0.268
O2'	A	0, 0.059, 0.338, 0.618, 0.977 max_d=0.977 avg_d=0.338 std_dev=0.280
C3'	B	0, 0.453, 0.734, 1.014, 0.910 max_d=0.910 avg_d=0.734 std_dev=0.281
P	B	0, 0.145, 0.432, 0.719, 0.887 max_d=0.887 avg_d=0.432 std_dev=0.287
C2'	B	0, 0.397, 0.688, 0.979, 0.904 max_d=0.904 avg_d=0.688 std_dev=0.291
C6	B	0, 0.449, 0.746, 1.044, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.746 std_dev=0.298
C2	B	0, 0.235, 0.537, 0.838, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.537 std_dev=0.301
C5	B	0, 0.461, 0.769, 1.078, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.769 std_dev=0.309
O2	B	0, 0.389, 0.711, 1.032, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.711 std_dev=0.321
N3	B	0, 0.330, 0.656, 0.983, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.656 std_dev=0.327
C4	B	0, 0.360, 0.694, 1.028, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.694 std_dev=0.334
O3'	B	0, 0.530, 0.865, 1.200, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.865 std_dev=0.335
C4'	B	0, 0.446, 0.782, 1.117, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.782 std_dev=0.335
OP2	B	0, 0.184, 0.520, 0.857, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.520 std_dev=0.336
OP1	B	0, 0.248, 0.587, 0.925, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.587 std_dev=0.338
O4'	B	0, 0.420, 0.759, 1.098, 1.313 max_d=1.313 avg_d=0.759 std_dev=0.339
C2'	A	0, -0.071, 0.272, 0.615, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.272 std_dev=0.343
O2'	B	0, 0.462, 0.830, 1.197, 1.090 max_d=1.090 avg_d=0.830 std_dev=0.367
O4'	A	0, -0.154, 0.232, 0.618, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.232 std_dev=0.386
O5'	B	0, 0.173, 0.562, 0.950, 1.438 max_d=1.438 avg_d=0.562 std_dev=0.389
O4	B	0, 0.486, 0.876, 1.267, 1.305 max_d=1.305 avg_d=0.876 std_dev=0.391
C5'	B	0, 0.308, 0.744, 1.180, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.744 std_dev=0.436
C3'	A	0, -0.102, 0.474, 1.050, 1.956 max_d=1.956 avg_d=0.474 std_dev=0.576
C4'	A	0, -0.127, 0.455, 1.037, 1.966 max_d=1.966 avg_d=0.455 std_dev=0.582
C5'	A	0, -0.137, 0.725, 1.588, 2.963 max_d=2.963 avg_d=0.725 std_dev=0.863
O3'	A	0, -0.123, 0.783, 1.689, 3.114 max_d=3.114 avg_d=0.783 std_dev=0.906
OP1	A	0, 0.172, 1.193, 2.213, 3.716 max_d=3.716 avg_d=1.193 std_dev=1.021
O5'	A	0, -0.257, 0.787, 1.832, 3.514 max_d=3.514 avg_d=0.787 std_dev=1.044
P	A	0, 0.003, 1.053, 2.103, 3.729 max_d=3.729 avg_d=1.053 std_dev=1.050
OP2	A	0, 0.033, 1.176, 2.319, 4.075 max_d=4.075 avg_d=1.176 std_dev=1.143

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.15	0.38	0.32	0.24
C2	0.03	0.00	0.27	0.18	0.00	0.11	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.25	0.28	0.22	0.50	0.71	0.86	0.66
C2'	0.00	0.27	0.00	0.00	0.16	0.02	0.12	0.01	0.18	0.07	0.24	0.25	0.16	0.02	0.03	0.01	0.05	0.01	0.02	0.36	0.16	0.15
C3'	0.01	0.18	0.00	0.00	0.11	0.00	0.09	0.01	0.13	0.05	0.17	0.16	0.11	0.04	0.04	0.02	0.02	0.02	0.14	0.26	0.11	0.09
C4	0.01	0.00	0.16	0.11	0.00	0.07	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.16	0.12	0.38	0.67	0.70	0.55
C4'	0.01	0.11	0.02	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.09	0.03	0.11	0.09	0.10	0.04	0.02	0.06	0.02	0.00	0.01	0.10	0.04	0.02
C5	0.01	0.01	0.12	0.09	0.00	0.07	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.09	0.14	0.08	0.40	0.79	0.81	0.63
C5'	0.04	0.29	0.01	0.01	0.21	0.01	0.23	0.00	0.28	0.08	0.31	0.24	0.30	0.15	0.11	0.07	0.04	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03
C6	0.01	0.00	0.18	0.13	0.01	0.09	0.01	0.28	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.20	0.13	0.47	0.84	0.93	0.72
C8	0.01	0.01	0.07	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.07	0.06	0.11	0.17	0.67	0.45	0.39
N1	0.03	0.00	0.24	0.17	0.01	0.11	0.01	0.31	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.26	0.19	0.51	0.80	0.94	0.73
N3	0.03	0.00	0.25	0.16	0.00	0.09	0.00	0.24	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.23	0.24	0.20	0.43	0.63	0.74	0.57
N6	0.01	0.01	0.16	0.11	0.01	0.10	0.01	0.30	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.14	0.18	0.12	0.47	0.90	0.97	0.76
N7	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.06	0.03	0.27	0.80	0.68	0.55
N9	0.00	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01	0.25	0.58	0.50	0.40
O2'	0.01	0.25	0.01	0.02	0.13	0.06	0.09	0.07	0.16	0.07	0.22	0.23	0.14	0.02	0.02	0.00	0.07	0.02	0.04	0.23	0.12	0.07
O3'	0.03	0.28	0.05	0.02	0.16	0.02	0.14	0.04	0.20	0.06	0.26	0.24	0.18	0.06	0.06	0.07	0.00	0.02	0.24	0.23	0.25	0.18
O4'	0.00	0.22	0.01	0.02	0.12	0.00	0.08	0.02	0.13	0.11	0.19	0.20	0.12	0.03	0.01	0.02	0.02	0.00	0.14	0.20	0.20	0.14
O5'	0.15	0.50	0.02	0.14	0.38	0.01	0.40	0.01	0.47	0.17	0.51	0.43	0.47	0.27	0.25	0.04	0.24	0.14	0.00	0.03	0.02	0.01
OP1	0.38	0.71	0.36	0.26	0.67	0.10	0.79	0.03	0.84	0.67	0.80	0.63	0.90	0.80	0.58	0.23	0.23	0.20	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.32	0.86	0.16	0.11	0.70	0.04	0.81	0.02	0.93	0.45	0.94	0.74	0.97	0.68	0.50	0.12	0.25	0.20	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.66	0.15	0.09	0.55	0.02	0.63	0.03	0.72	0.39	0.73	0.57	0.76	0.55	0.40	0.07	0.18	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.09	0.09	0.14	0.06	0.12	0.11	0.14	0.11	0.08	0.09	0.13	0.06	0.19	0.05	0.12	0.15	0.10	0.18	0.17
C2	0.07	0.18	0.08	0.16	0.16	0.13	0.15	0.17	0.13	0.09	0.22	0.25	0.05	0.21	0.19	0.10	0.17	0.14	0.18	0.17
C2'	0.35	0.37	0.37	0.37	0.35	0.33	0.31	0.31	0.32	0.35	0.37	0.39	0.37	0.41	0.34	0.32	0.29	0.16	0.23	0.26
C3'	0.44	0.46	0.39	0.38	0.52	0.39	0.50	0.38	0.47	0.46	0.49	0.45	0.38	0.38	0.56	0.43	0.38	0.23	0.38	0.37
C4	0.07	0.14	0.06	0.13	0.09	0.12	0.11	0.14	0.10	0.07	0.16	0.19	0.04	0.18	0.14	0.13	0.14	0.10	0.18	0.16
C4'	0.19	0.18	0.12	0.13	0.29	0.18	0.32	0.20	0.27	0.21	0.21	0.16	0.10	0.13	0.34	0.22	0.22	0.15	0.34	0.28
C5	0.10	0.15	0.07	0.12	0.08	0.13	0.13	0.16	0.13	0.09	0.16	0.20	0.06	0.18	0.10	0.16	0.16	0.11	0.21	0.18
C5'	0.16	0.17	0.14	0.09	0.28	0.12	0.32	0.11	0.25	0.18	0.19	0.19	0.16	0.09	0.35	0.20	0.13	0.09	0.33	0.22
C6	0.08	0.14	0.08	0.14	0.08	0.15	0.15	0.19	0.15	0.07	0.15	0.22	0.07	0.19	0.12	0.16	0.20	0.14	0.23	0.21
C8	0.11	0.14	0.08	0.12	0.10	0.12	0.13	0.14	0.13	0.12	0.15	0.18	0.07	0.18	0.08	0.17	0.14	0.10	0.20	0.16
N1	0.07	0.17	0.07	0.15	0.13	0.15	0.17	0.19	0.16	0.07	0.19	0.25	0.06	0.20	0.16	0.12	0.19	0.15	0.21	0.20
N3	0.06	0.14	0.07	0.14	0.14	0.11	0.12	0.14	0.10	0.07	0.19	0.20	0.04	0.19	0.19	0.09	0.14	0.11	0.16	0.16
N6	0.13	0.13	0.11	0.16	0.08	0.19	0.19	0.24	0.19	0.10	0.12	0.20	0.12	0.21	0.11	0.21	0.26	0.17	0.29	0.26
N7	0.13	0.15	0.08	0.12	0.10	0.13	0.14	0.15	0.15	0.12	0.16	0.19	0.08	0.19	0.08	0.19	0.16	0.11	0.23	0.18
N9	0.09	0.12	0.07	0.13	0.07	0.12	0.11	0.14	0.11	0.08	0.13	0.16	0.05	0.18	0.08	0.14	0.14	0.10	0.18	0.16
O2'	0.28	0.30	0.33	0.34	0.23	0.27	0.20	0.25	0.22	0.27	0.28	0.34	0.32	0.39	0.20	0.24	0.24	0.13	0.17	0.20
O3'	0.63	0.68	0.56	0.52	0.71	0.55	0.65	0.51	0.63	0.65	0.71	0.69	0.57	0.51	0.76	0.60	0.49	0.29	0.45	0.47
O4'	0.10	0.15	0.09	0.06	0.08	0.09	0.16	0.12	0.13	0.09	0.13	0.23	0.12	0.07	0.08	0.14	0.15	0.14	0.30	0.23
O5'	0.18	0.20	0.26	0.22	0.22	0.15	0.29	0.10	0.21	0.16	0.16	0.28	0.30	0.25	0.30	0.20	0.10	0.10	0.36	0.22
OP1	0.50	0.43	0.62	0.64	0.25	0.56	0.26	0.52	0.35	0.43	0.34	0.49	0.63	0.67	0.15	0.50	0.50	0.63	0.28	0.39
OP2	0.51	0.50	0.69	0.67	0.21	0.51	0.17	0.41	0.27	0.43	0.40	0.62	0.72	0.73	0.14	0.45	0.35	0.34	0.17	0.14
P	0.38	0.36	0.51	0.49	0.16	0.39	0.16	0.31	0.20	0.31	0.27	0.45	0.54	0.54	0.15	0.35	0.27	0.32	0.13	0.12

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.06	0.14	0.09
C2	0.01	0.00	0.08	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.10	0.07	0.01	0.02	0.08	0.07	0.11	0.07
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.09	0.01	0.05	0.17	0.00	0.01	0.04	0.01	0.04	0.12	0.05	0.04
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.10	0.00	0.17	0.01	0.18	0.05	0.03	0.15	0.02	0.01	0.11	0.01	0.06	0.17	0.07	0.07
C4	0.02	0.01	0.03	0.10	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.11	0.01	0.02	0.18	0.13	0.11	0.13
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.07	0.00	0.10	0.00	0.10	0.03	0.03	0.06	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.10	0.07	0.04
C5	0.01	0.01	0.08	0.17	0.00	0.10	0.00	0.17	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.20	0.01	0.02	0.22	0.15	0.09	0.14
C5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.13	0.00	0.17	0.00	0.16	0.07	0.08	0.04	0.04	0.02	0.15	0.01	0.01	0.10	0.03	0.01
C6	0.00	0.02	0.09	0.18	0.01	0.10	0.01	0.16	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.19	0.01	0.02	0.20	0.12	0.06	0.09
N1	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.09	0.07	0.10	0.06
N3	0.01	0.00	0.05	0.03	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.08	0.03	0.01	0.02	0.12	0.10	0.10	0.09
O2	0.01	0.01	0.17	0.15	0.01	0.06	0.01	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.19	0.19	0.01	0.03	0.06	0.07	0.13	0.08
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.03	0.04	0.04	0.04	0.05	0.02	0.08	0.19	0.00	0.04	0.04	0.04	0.04	0.14	0.05	0.04
O3'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.11	0.01	0.20	0.02	0.19	0.05	0.03	0.19	0.04	0.00	0.13	0.01	0.08	0.26	0.15	0.13
O4	0.02	0.01	0.04	0.11	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.03	0.19	0.15	0.13	0.16
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.05	0.09	0.22	0.15
O5'	0.03	0.08	0.04	0.06	0.18	0.01	0.22	0.01	0.20	0.09	0.12	0.06	0.04	0.08	0.19	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.06	0.07	0.12	0.17	0.13	0.10	0.15	0.10	0.12	0.07	0.10	0.07	0.14	0.26	0.15	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.14	0.11	0.05	0.07	0.11	0.07	0.09	0.03	0.06	0.10	0.10	0.13	0.05	0.15	0.13	0.22	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.07	0.04	0.07	0.13	0.04	0.14	0.01	0.09	0.06	0.09	0.08	0.04	0.13	0.16	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00