Doublet Group distance statistics: 53846

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 1, 3, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.010, 0.017, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.017 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.012, 0.023, 0.035, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.010, 0.028, 0.045, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.028 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.016, 0.033, 0.051, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.033 std_dev=0.018
C1'	A	0, 0.018, 0.036, 0.055, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.036 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.024, 0.042, 0.061, 0.066 max_d=0.066 avg_d=0.042 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.013, 0.032, 0.051, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.032 std_dev=0.019
C8	A	0, 0.025, 0.048, 0.070, 0.083 max_d=0.083 avg_d=0.048 std_dev=0.022
N6	A	0, 0.020, 0.044, 0.068, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.044 std_dev=0.024
C2'	A	0, 0.048, 0.213, 0.378, 0.610 max_d=0.610 avg_d=0.213 std_dev=0.165
O4'	A	0, 0.124, 0.299, 0.474, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.299 std_dev=0.175
C3'	A	0, 0.054, 0.249, 0.445, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.249 std_dev=0.196
N1	B	0, 0.293, 0.501, 0.709, 0.723 max_d=0.723 avg_d=0.501 std_dev=0.208
C4'	A	0, 0.082, 0.290, 0.497, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.290 std_dev=0.208
O3'	A	0, 0.307, 0.519, 0.732, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.519 std_dev=0.213
C2'	B	0, 0.258, 0.491, 0.724, 0.892 max_d=0.892 avg_d=0.491 std_dev=0.233
C1'	B	0, 0.299, 0.539, 0.779, 0.881 max_d=0.881 avg_d=0.539 std_dev=0.240
C2	B	0, 0.339, 0.589, 0.839, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.589 std_dev=0.250
C6	B	0, 0.360, 0.615, 0.870, 0.870 max_d=0.870 avg_d=0.615 std_dev=0.255
N3	B	0, 0.356, 0.616, 0.876, 0.932 max_d=0.932 avg_d=0.616 std_dev=0.260
O2'	A	0, 0.202, 0.468, 0.735, 1.044 max_d=1.044 avg_d=0.468 std_dev=0.266
O2'	B	0, 0.280, 0.568, 0.856, 1.098 max_d=1.098 avg_d=0.568 std_dev=0.288
C3'	B	0, 0.360, 0.650, 0.940, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.650 std_dev=0.290
OP2	B	0, 0.314, 0.608, 0.901, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.608 std_dev=0.293
C4	B	0, 0.391, 0.693, 0.995, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.693 std_dev=0.302
O2	B	0, 0.442, 0.763, 1.083, 1.083 max_d=1.083 avg_d=0.763 std_dev=0.320
C5	B	0, 0.427, 0.748, 1.068, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.748 std_dev=0.320
O4'	B	0, 0.331, 0.667, 1.004, 1.049 max_d=1.049 avg_d=0.667 std_dev=0.336
O5'	B	0, 0.350, 0.697, 1.044, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.697 std_dev=0.347
O3'	B	0, 0.419, 0.771, 1.123, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.771 std_dev=0.352
C5'	A	0, 0.366, 0.732, 1.099, 1.328 max_d=1.328 avg_d=0.732 std_dev=0.367
O4	B	0, 0.452, 0.823, 1.194, 1.185 max_d=1.185 avg_d=0.823 std_dev=0.371
C4'	B	0, 0.381, 0.758, 1.135, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.758 std_dev=0.377
P	B	0, 0.391, 0.769, 1.148, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.769 std_dev=0.378
O5'	A	0, 0.195, 0.585, 0.974, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.585 std_dev=0.390
C5'	B	0, 0.400, 0.832, 1.265, 1.319 max_d=1.319 avg_d=0.832 std_dev=0.432
OP1	B	0, 0.610, 1.117, 1.624, 1.700 max_d=1.700 avg_d=1.117 std_dev=0.507
P	A	0, 0.065, 0.613, 1.161, 1.960 max_d=1.960 avg_d=0.613 std_dev=0.548
OP1	A	0, 0.108, 0.708, 1.308, 2.146 max_d=2.146 avg_d=0.708 std_dev=0.600
OP2	A	0, 0.097, 0.738, 1.379, 2.254 max_d=2.254 avg_d=0.738 std_dev=0.641

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.13	0.08	0.20	0.06
C2	0.03	0.00	0.08	0.07	0.01	0.05	0.02	0.12	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.17	0.13	0.09	0.26	0.15	0.47	0.25
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.05	0.03	0.06	0.06	0.07	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.13	0.18	0.06
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.04	0.07	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.25	0.07	0.12
C4	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.07	0.06	0.24	0.15	0.46	0.24
C4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.06	0.05	0.07	0.08	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.19	0.05	0.11
C5	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.06	0.00	0.16	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.08	0.05	0.05	0.27	0.25	0.58	0.34
C5'	0.04	0.12	0.05	0.01	0.12	0.01	0.16	0.00	0.17	0.15	0.15	0.10	0.18	0.18	0.10	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.01	0.17	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.11	0.07	0.06	0.29	0.27	0.62	0.36
C8	0.03	0.03	0.06	0.07	0.01	0.07	0.01	0.15	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.06	0.05	0.04	0.23	0.24	0.51	0.30
N1	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01	0.06	0.01	0.15	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.14	0.10	0.08	0.29	0.22	0.57	0.32
N3	0.03	0.01	0.07	0.07	0.01	0.05	0.02	0.10	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.15	0.12	0.09	0.24	0.11	0.40	0.20
N6	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.07	0.02	0.18	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.11	0.06	0.06	0.29	0.33	0.68	0.41
N7	0.02	0.03	0.04	0.05	0.01	0.08	0.01	0.18	0.02	0.00	0.02	0.02	0.04	0.00	0.01	0.05	0.04	0.04	0.26	0.31	0.62	0.37
N9	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.20	0.12	0.39	0.20
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.09	0.02	0.08	0.04	0.11	0.06	0.14	0.15	0.11	0.05	0.02	0.00	0.03	0.02	0.11	0.19	0.17	0.04
O3'	0.04	0.13	0.01	0.01	0.07	0.02	0.05	0.02	0.07	0.05	0.10	0.12	0.06	0.04	0.03	0.03	0.00	0.05	0.04	0.40	0.17	0.25
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.06	0.04	0.08	0.09	0.06	0.04	0.02	0.02	0.05	0.00	0.10	0.07	0.14	0.08
O5'	0.13	0.26	0.13	0.03	0.24	0.01	0.27	0.01	0.29	0.23	0.29	0.24	0.29	0.26	0.20	0.11	0.04	0.10	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.08	0.15	0.13	0.25	0.15	0.19	0.25	0.02	0.27	0.24	0.22	0.11	0.33	0.31	0.12	0.19	0.40	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.20	0.47	0.18	0.07	0.46	0.05	0.58	0.04	0.62	0.51	0.57	0.40	0.68	0.62	0.39	0.17	0.17	0.14	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.25	0.06	0.12	0.24	0.11	0.34	0.01	0.36	0.30	0.32	0.20	0.41	0.37	0.20	0.04	0.25	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.15	0.17	0.14	0.15	0.15	0.19	0.14	0.21	0.17	0.15	0.15	0.18	0.11	0.18	0.18	0.14	0.19	0.18	0.17
C2	0.19	0.17	0.18	0.13	0.17	0.14	0.22	0.11	0.23	0.19	0.17	0.18	0.18	0.11	0.17	0.18	0.09	0.13	0.13	0.11
C2'	0.24	0.19	0.23	0.19	0.19	0.21	0.24	0.19	0.26	0.23	0.18	0.19	0.23	0.15	0.19	0.25	0.18	0.21	0.20	0.20
C3'	0.22	0.20	0.21	0.17	0.21	0.20	0.24	0.20	0.25	0.22	0.19	0.19	0.21	0.14	0.22	0.24	0.20	0.25	0.24	0.23
C4	0.16	0.13	0.16	0.11	0.14	0.12	0.16	0.10	0.19	0.15	0.15	0.14	0.17	0.08	0.20	0.15	0.09	0.13	0.13	0.11
C4'	0.14	0.13	0.13	0.13	0.15	0.16	0.16	0.19	0.17	0.14	0.15	0.14	0.13	0.13	0.19	0.17	0.20	0.27	0.26	0.25
C5	0.13	0.13	0.15	0.10	0.19	0.10	0.11	0.08	0.12	0.11	0.18	0.15	0.16	0.08	0.26	0.12	0.09	0.12	0.12	0.11
C5'	0.09	0.07	0.09	0.13	0.11	0.16	0.10	0.22	0.11	0.06	0.11	0.08	0.10	0.17	0.17	0.14	0.22	0.31	0.28	0.27
C6	0.11	0.14	0.13	0.08	0.18	0.07	0.10	0.07	0.10	0.09	0.19	0.16	0.14	0.07	0.24	0.09	0.10	0.14	0.14	0.12
C8	0.16	0.14	0.19	0.18	0.19	0.17	0.13	0.16	0.13	0.13	0.18	0.15	0.20	0.17	0.28	0.17	0.16	0.17	0.16	0.16
N1	0.15	0.13	0.16	0.12	0.12	0.12	0.13	0.10	0.16	0.14	0.15	0.16	0.16	0.12	0.16	0.14	0.10	0.14	0.14	0.12
N3	0.19	0.17	0.17	0.12	0.18	0.13	0.23	0.11	0.24	0.19	0.17	0.17	0.18	0.08	0.18	0.18	0.09	0.13	0.13	0.11
N6	0.08	0.18	0.10	0.07	0.23	0.05	0.15	0.09	0.08	0.10	0.24	0.20	0.13	0.08	0.27	0.05	0.13	0.18	0.17	0.16
N7	0.16	0.17	0.20	0.17	0.24	0.15	0.17	0.14	0.13	0.14	0.22	0.17	0.21	0.15	0.32	0.16	0.14	0.13	0.13	0.13
N9	0.15	0.12	0.17	0.13	0.14	0.13	0.13	0.12	0.16	0.13	0.14	0.13	0.17	0.11	0.21	0.16	0.12	0.16	0.15	0.14
O2'	0.35	0.30	0.33	0.28	0.30	0.31	0.37	0.27	0.39	0.34	0.27	0.28	0.33	0.23	0.26	0.37	0.23	0.21	0.20	0.21
O3'	0.28	0.27	0.25	0.19	0.29	0.22	0.32	0.19	0.32	0.28	0.26	0.26	0.25	0.15	0.29	0.28	0.18	0.22	0.22	0.21
O4'	0.13	0.12	0.13	0.14	0.14	0.15	0.14	0.18	0.16	0.12	0.15	0.13	0.13	0.14	0.19	0.16	0.19	0.26	0.25	0.24
O5'	0.18	0.22	0.17	0.09	0.22	0.09	0.20	0.09	0.21	0.20	0.23	0.24	0.16	0.04	0.24	0.16	0.11	0.19	0.14	0.14
OP1	0.17	0.17	0.20	0.19	0.15	0.16	0.13	0.14	0.16	0.17	0.17	0.19	0.21	0.22	0.20	0.14	0.14	0.24	0.10	0.15
OP2	0.54	0.55	0.56	0.53	0.47	0.49	0.47	0.44	0.51	0.54	0.51	0.57	0.56	0.53	0.44	0.50	0.45	0.47	0.38	0.42
P	0.28	0.29	0.29	0.25	0.25	0.22	0.24	0.18	0.27	0.28	0.28	0.31	0.29	0.26	0.26	0.24	0.19	0.24	0.13	0.18

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.04	0.01	0.05	0.08	0.05	0.03
C2	0.02	0.00	0.04	0.08	0.02	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.08	0.03	0.02	0.12	0.12	0.10	0.10
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.05	0.01	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.07	0.00	0.01	0.06	0.01	0.03	0.08	0.07	0.04
C3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.12	0.00	0.11	0.01	0.09	0.06	0.10	0.08	0.02	0.00	0.14	0.00	0.03	0.09	0.06	0.05
C4	0.03	0.02	0.05	0.12	0.00	0.09	0.01	0.13	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.14	0.01	0.04	0.21	0.21	0.20	0.21
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.10	0.04	0.05	0.04	0.04	0.01	0.11	0.00	0.02	0.08	0.05	0.03
C5	0.03	0.01	0.04	0.11	0.01	0.11	0.00	0.16	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.13	0.02	0.06	0.22	0.21	0.18	0.22
C5'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.13	0.01	0.16	0.00	0.13	0.07	0.08	0.05	0.04	0.02	0.16	0.01	0.01	0.09	0.03	0.02
C6	0.03	0.02	0.03	0.09	0.01	0.10	0.01	0.13	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.10	0.02	0.06	0.18	0.16	0.10	0.15
N1	0.01	0.01	0.02	0.06	0.02	0.04	0.02	0.07	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.06	0.03	0.01	0.11	0.11	0.07	0.09
N3	0.01	0.00	0.04	0.10	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.11	0.03	0.01	0.16	0.16	0.15	0.16
O2	0.04	0.01	0.07	0.08	0.02	0.04	0.01	0.05	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.09	0.03	0.04	0.10	0.11	0.09	0.08
O2'	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.03	0.04	0.02	0.02	0.02	0.04	0.00	0.03	0.04	0.03	0.04	0.11	0.08	0.06
O3'	0.01	0.08	0.01	0.00	0.14	0.01	0.13	0.02	0.10	0.06	0.11	0.09	0.03	0.00	0.16	0.01	0.04	0.12	0.07	0.07
O4	0.04	0.03	0.06	0.14	0.01	0.11	0.02	0.16	0.02	0.03	0.03	0.03	0.04	0.16	0.00	0.05	0.24	0.25	0.26	0.26
O4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.05	0.00	0.06	0.09	0.05	0.04
O5'	0.05	0.12	0.03	0.03	0.21	0.02	0.22	0.01	0.18	0.11	0.16	0.10	0.04	0.04	0.24	0.06	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.08	0.12	0.08	0.09	0.21	0.08	0.21	0.09	0.16	0.11	0.16	0.11	0.11	0.12	0.25	0.09	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.05	0.10	0.07	0.06	0.20	0.05	0.18	0.03	0.10	0.07	0.15	0.09	0.08	0.07	0.26	0.05	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.03	0.10	0.04	0.05	0.21	0.03	0.22	0.02	0.15	0.09	0.16	0.08	0.06	0.07	0.26	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00