Doublet Group distance statistics: 53847

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.005, 0.010, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.010 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C2	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.003, 0.010, 0.018, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.010 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.010, 0.018, 0.027, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.018 std_dev=0.009
C8	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N7	A	0, 0.005, 0.016, 0.027, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N6	A	0, 0.008, 0.026, 0.044, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.026 std_dev=0.018
O4'	A	0, -0.063, 0.148, 0.358, 0.603 max_d=0.603 avg_d=0.148 std_dev=0.211
O5'	A	0, 0.050, 0.262, 0.474, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.262 std_dev=0.212
P	A	0, 0.077, 0.290, 0.502, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.290 std_dev=0.212
C2'	A	0, -0.082, 0.150, 0.382, 0.661 max_d=0.661 avg_d=0.150 std_dev=0.232
OP2	A	0, 0.090, 0.326, 0.563, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.326 std_dev=0.236
C5	B	0, 0.008, 0.246, 0.484, 0.617 max_d=0.617 avg_d=0.246 std_dev=0.238
OP1	A	0, 0.067, 0.336, 0.605, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.336 std_dev=0.269
C6	B	0, -0.017, 0.261, 0.539, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.261 std_dev=0.278
O4	B	0, 0.016, 0.303, 0.589, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.303 std_dev=0.286
C4	B	0, -0.014, 0.286, 0.586, 0.848 max_d=0.848 avg_d=0.286 std_dev=0.300
C5'	A	0, -0.016, 0.317, 0.650, 0.985 max_d=0.985 avg_d=0.317 std_dev=0.333
C4'	A	0, -0.097, 0.291, 0.680, 1.136 max_d=1.136 avg_d=0.291 std_dev=0.388
N1	B	0, -0.093, 0.316, 0.724, 1.144 max_d=1.144 avg_d=0.316 std_dev=0.409
N3	B	0, -0.069, 0.351, 0.771, 1.197 max_d=1.197 avg_d=0.351 std_dev=0.420
C1'	B	0, -0.083, 0.397, 0.876, 1.359 max_d=1.359 avg_d=0.397 std_dev=0.479
C2	B	0, -0.118, 0.376, 0.870, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.376 std_dev=0.494
O2'	A	0, -0.209, 0.290, 0.788, 1.400 max_d=1.400 avg_d=0.290 std_dev=0.498
C2'	B	0, -0.089, 0.418, 0.924, 1.396 max_d=1.396 avg_d=0.418 std_dev=0.507
C3'	B	0, -0.083, 0.445, 0.974, 1.505 max_d=1.505 avg_d=0.445 std_dev=0.528
C3'	A	0, -0.167, 0.366, 0.898, 1.538 max_d=1.538 avg_d=0.366 std_dev=0.532
O3'	B	0, -0.099, 0.520, 1.138, 1.736 max_d=1.736 avg_d=0.520 std_dev=0.618
O2	B	0, -0.154, 0.478, 1.111, 1.791 max_d=1.791 avg_d=0.478 std_dev=0.632
O4'	B	0, -0.238, 0.597, 1.432, 2.414 max_d=2.414 avg_d=0.597 std_dev=0.835
C4'	B	0, -0.231, 0.673, 1.576, 2.616 max_d=2.616 avg_d=0.673 std_dev=0.904
O3'	A	0, -0.339, 0.650, 1.638, 2.835 max_d=2.835 avg_d=0.650 std_dev=0.989
O2'	B	0, -0.368, 0.802, 1.972, 3.316 max_d=3.316 avg_d=0.802 std_dev=1.170
O5'	B	0, -0.522, 0.894, 2.310, 4.025 max_d=4.025 avg_d=0.894 std_dev=1.416
C5'	B	0, -0.525, 0.982, 2.489, 4.303 max_d=4.303 avg_d=0.982 std_dev=1.507
OP2	B	0, -0.723, 1.210, 3.144, 5.493 max_d=5.493 avg_d=1.210 std_dev=1.934
P	B	0, -0.770, 1.218, 3.207, 5.627 max_d=5.627 avg_d=1.218 std_dev=1.989
OP1	B	0, -0.978, 1.463, 3.904, 6.885 max_d=6.885 avg_d=1.463 std_dev=2.441

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.23	0.00	0.15	0.10	0.22	0.17
C2	0.01	0.00	0.17	0.20	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.16	0.13	0.08	0.06	0.05	0.14	0.11
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.10	0.01	0.06	0.17	0.09	0.07	0.14	0.17	0.06	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.37	0.30	0.44	0.38
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.22	0.00	0.30	0.01	0.31	0.29	0.27	0.16	0.34	0.33	0.20	0.02	0.01	0.01	0.03	0.08	0.09	0.04
C4	0.01	0.00	0.10	0.22	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.18	0.06	0.05	0.06	0.05	0.15	0.12
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.09	0.00	0.08	0.13	0.06	0.02	0.10	0.13	0.07	0.27	0.02	0.00	0.01	0.07	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.06	0.30	0.00	0.09	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.24	0.12	0.03	0.07	0.06	0.11	0.10
C5'	0.07	0.05	0.17	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.05	0.05	0.06	0.07	0.04	0.08	0.18	0.01	0.00	0.07	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.31	0.01	0.08	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.26	0.12	0.05	0.08	0.06	0.10	0.09
C8	0.01	0.01	0.07	0.29	0.01	0.13	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.21	0.18	0.06	0.06	0.06	0.15	0.11
N1	0.02	0.00	0.14	0.27	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.21	0.07	0.07	0.06	0.05	0.11	0.10
N3	0.01	0.00	0.17	0.16	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.12	0.18	0.08	0.08	0.06	0.16	0.13
N6	0.03	0.02	0.06	0.34	0.02	0.10	0.02	0.06	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.29	0.19	0.05	0.10	0.08	0.09	0.09
N7	0.01	0.01	0.03	0.33	0.01	0.13	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.25	0.23	0.03	0.10	0.07	0.10	0.09
N9	0.00	0.01	0.01	0.20	0.00	0.07	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.16	0.04	0.01	0.07	0.07	0.18	0.14
O2'	0.01	0.16	0.01	0.02	0.18	0.27	0.24	0.08	0.26	0.21	0.21	0.12	0.29	0.25	0.16	0.00	0.02	0.19	0.25	0.18	0.49	0.30
O3'	0.23	0.13	0.01	0.01	0.06	0.02	0.12	0.18	0.12	0.18	0.07	0.18	0.19	0.23	0.04	0.02	0.00	0.18	0.18	0.45	0.34	0.30
O4'	0.00	0.08	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.05	0.06	0.07	0.08	0.05	0.03	0.01	0.19	0.18	0.00	0.01	0.03	0.06	0.04
O5'	0.15	0.06	0.37	0.03	0.06	0.01	0.07	0.00	0.08	0.06	0.06	0.08	0.10	0.10	0.07	0.25	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.10	0.05	0.30	0.08	0.05	0.07	0.06	0.07	0.06	0.06	0.05	0.06	0.08	0.07	0.07	0.18	0.45	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.14	0.44	0.09	0.15	0.03	0.11	0.02	0.10	0.15	0.11	0.16	0.09	0.10	0.18	0.49	0.34	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.17	0.11	0.38	0.04	0.12	0.01	0.10	0.01	0.09	0.11	0.10	0.13	0.09	0.09	0.14	0.30	0.30	0.04	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.35	0.41	0.18	0.35	0.30	0.11	0.24	0.19	0.27	0.34	0.39	0.47	0.65	0.24	0.25	0.28	0.44	0.72	0.79	0.62
C2	0.46	0.47	0.13	0.40	0.13	0.14	0.13	0.20	0.26	0.42	0.33	0.55	0.54	0.25	0.06	0.39	0.43	0.62	0.69	0.54
C2'	0.19	0.22	0.19	0.45	0.20	0.18	0.18	0.18	0.18	0.19	0.21	0.25	0.43	0.34	0.19	0.18	0.37	0.55	0.60	0.48
C3'	0.25	0.21	0.32	0.69	0.28	0.45	0.35	0.54	0.32	0.26	0.21	0.20	0.29	0.54	0.29	0.27	0.78	1.03	1.12	0.96
C4	0.39	0.43	0.17	0.38	0.26	0.14	0.22	0.31	0.29	0.38	0.38	0.48	0.73	0.26	0.13	0.24	0.55	0.83	0.90	0.73
C4'	0.19	0.23	0.16	0.50	0.17	0.28	0.17	0.44	0.16	0.19	0.21	0.30	0.57	0.35	0.16	0.15	0.69	1.03	1.11	0.93
C5	0.37	0.37	0.25	0.40	0.22	0.26	0.21	0.51	0.29	0.35	0.30	0.40	0.90	0.30	0.14	0.11	0.74	1.06	1.13	0.97
C5'	0.22	0.27	0.20	0.44	0.20	0.30	0.18	0.49	0.19	0.22	0.25	0.32	0.72	0.32	0.18	0.16	0.71	1.11	1.17	0.99
C6	0.40	0.35	0.24	0.43	0.15	0.30	0.17	0.58	0.28	0.36	0.25	0.38	0.95	0.33	0.12	0.10	0.81	1.08	1.13	1.00
C8	0.33	0.36	0.28	0.36	0.27	0.24	0.24	0.47	0.27	0.32	0.33	0.39	0.89	0.28	0.22	0.11	0.69	1.06	1.13	0.96
N1	0.46	0.39	0.12	0.43	0.11	0.19	0.13	0.39	0.25	0.40	0.24	0.45	0.74	0.29	0.11	0.25	0.61	0.82	0.86	0.74
N3	0.43	0.49	0.15	0.37	0.22	0.13	0.18	0.17	0.28	0.41	0.41	0.56	0.56	0.24	0.07	0.39	0.40	0.62	0.70	0.53
N6	0.36	0.28	0.36	0.45	0.15	0.45	0.18	0.82	0.25	0.31	0.20	0.30	1.15	0.38	0.15	0.13	1.03	1.36	1.36	1.27
N7	0.32	0.33	0.32	0.38	0.23	0.32	0.22	0.61	0.27	0.31	0.29	0.36	0.99	0.31	0.18	0.08	0.82	1.21	1.29	1.11
N9	0.35	0.41	0.20	0.37	0.29	0.15	0.24	0.31	0.28	0.35	0.38	0.45	0.75	0.26	0.22	0.21	0.55	0.86	0.93	0.76
O2'	0.63	0.68	0.43	0.20	0.66	0.52	0.61	0.53	0.61	0.64	0.69	0.69	0.74	0.27	0.66	0.74	0.32	0.18	0.14	0.26
O3'	0.22	0.22	0.27	0.54	0.28	0.31	0.36	0.39	0.30	0.23	0.22	0.28	0.36	0.34	0.32	0.20	0.65	0.92	1.06	0.86
O4'	0.35	0.40	0.20	0.36	0.25	0.15	0.20	0.32	0.25	0.33	0.36	0.47	0.76	0.23	0.19	0.22	0.58	0.95	1.03	0.83
O5'	0.25	0.32	0.25	0.42	0.27	0.31	0.21	0.52	0.22	0.26	0.32	0.37	0.79	0.34	0.28	0.16	0.72	1.14	1.18	1.02
OP1	0.17	0.21	0.26	0.40	0.19	0.38	0.17	0.60	0.18	0.18	0.21	0.24	0.81	0.34	0.20	0.23	0.75	1.18	1.17	1.06
OP2	0.28	0.36	0.42	0.30	0.35	0.34	0.29	0.60	0.28	0.30	0.37	0.38	0.99	0.28	0.38	0.19	0.74	1.23	1.22	1.10
P	0.27	0.34	0.36	0.34	0.30	0.32	0.25	0.56	0.26	0.28	0.34	0.37	0.94	0.29	0.31	0.17	0.74	1.21	1.21	1.08

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.04	0.01	0.25	0.03	0.00	0.08	0.07	0.15	0.10
C2	0.03	0.00	0.23	0.21	0.01	0.10	0.01	0.20	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.07	0.02	0.23	0.11	0.09	0.11	0.10
C2'	0.00	0.23	0.00	0.01	0.05	0.01	0.12	0.15	0.18	0.02	0.18	0.37	0.01	0.02	0.07	0.01	0.33	0.37	0.41	0.34
C3'	0.01	0.21	0.01	0.00	0.35	0.00	0.37	0.01	0.32	0.21	0.28	0.16	0.02	0.01	0.37	0.02	0.05	0.13	0.07	0.05
C4	0.02	0.01	0.05	0.35	0.00	0.13	0.01	0.14	0.01	0.02	0.01	0.03	0.25	0.19	0.01	0.04	0.25	0.26	0.28	0.25
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.13	0.00	0.28	0.00	0.31	0.08	0.04	0.26	0.27	0.02	0.14	0.00	0.01	0.04	0.07	0.05
C5	0.02	0.01	0.12	0.37	0.01	0.28	0.00	0.34	0.00	0.01	0.01	0.02	0.48	0.24	0.02	0.17	0.43	0.46	0.48	0.47
C5'	0.04	0.20	0.15	0.01	0.14	0.00	0.34	0.00	0.35	0.05	0.14	0.39	0.11	0.17	0.15	0.00	0.00	0.06	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.18	0.32	0.01	0.31	0.00	0.35	0.00	0.00	0.01	0.01	0.50	0.18	0.02	0.24	0.40	0.39	0.39	0.42
N1	0.01	0.01	0.02	0.21	0.02	0.08	0.01	0.05	0.00	0.00	0.02	0.01	0.16	0.03	0.02	0.01	0.08	0.08	0.15	0.11
N3	0.02	0.00	0.18	0.28	0.01	0.04	0.01	0.14	0.01	0.02	0.00	0.02	0.06	0.08	0.02	0.17	0.10	0.06	0.08	0.03
O2	0.04	0.01	0.37	0.16	0.03	0.26	0.02	0.39	0.01	0.01	0.02	0.00	0.42	0.18	0.04	0.40	0.26	0.27	0.23	0.28
O2'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.25	0.27	0.48	0.11	0.50	0.16	0.06	0.42	0.00	0.03	0.26	0.18	0.21	0.27	0.43	0.26
O3'	0.25	0.07	0.02	0.01	0.19	0.02	0.24	0.17	0.18	0.03	0.08	0.18	0.03	0.00	0.23	0.17	0.22	0.30	0.26	0.24
O4	0.03	0.02	0.07	0.37	0.01	0.14	0.02	0.15	0.02	0.02	0.02	0.04	0.26	0.23	0.00	0.04	0.28	0.31	0.33	0.28
O4'	0.00	0.23	0.01	0.02	0.04	0.00	0.17	0.00	0.24	0.01	0.17	0.40	0.18	0.17	0.04	0.00	0.05	0.10	0.18	0.15
O5'	0.08	0.11	0.33	0.05	0.25	0.01	0.43	0.00	0.40	0.08	0.10	0.26	0.21	0.22	0.28	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.07	0.09	0.37	0.13	0.26	0.04	0.46	0.06	0.39	0.08	0.06	0.27	0.27	0.30	0.31	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.15	0.11	0.41	0.07	0.28	0.07	0.48	0.02	0.39	0.15	0.08	0.23	0.43	0.26	0.33	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.10	0.34	0.05	0.25	0.05	0.47	0.01	0.42	0.11	0.03	0.28	0.26	0.24	0.28	0.15	0.01	0.00	0.00	0.00