Doublet Group distance statistics: 53850

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.022 std_dev=0.013
C6	A	0, 0.015, 0.035, 0.056, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.035 std_dev=0.020
C4	A	0, 0.012, 0.034, 0.055, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.034 std_dev=0.021
N1	A	0, 0.017, 0.040, 0.064, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.040 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.018, 0.043, 0.069, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.043 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.018, 0.047, 0.076, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.047 std_dev=0.029
C2	A	0, 0.017, 0.053, 0.088, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.053 std_dev=0.036
N9	A	0, 0.015, 0.055, 0.094, 0.098 max_d=0.098 avg_d=0.055 std_dev=0.039
C1'	A	0, 0.022, 0.065, 0.109, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.065 std_dev=0.043
N3	A	0, 0.028, 0.074, 0.120, 0.119 max_d=0.119 avg_d=0.074 std_dev=0.046
N6	A	0, 0.044, 0.108, 0.171, 0.158 max_d=0.158 avg_d=0.108 std_dev=0.064
O2	B	0, 0.090, 0.229, 0.367, 0.348 max_d=0.348 avg_d=0.229 std_dev=0.138
P	A	0, 0.154, 0.387, 0.620, 0.598 max_d=0.598 avg_d=0.387 std_dev=0.233
C2	B	0, 0.079, 0.329, 0.579, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.329 std_dev=0.250
O2'	B	0, 0.212, 0.516, 0.820, 0.772 max_d=0.772 avg_d=0.516 std_dev=0.304
N1	B	0, 0.046, 0.402, 0.758, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.402 std_dev=0.356
O4'	A	0, 0.106, 0.474, 0.841, 0.902 max_d=0.902 avg_d=0.474 std_dev=0.368
N3	B	0, 0.084, 0.468, 0.853, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.468 std_dev=0.384
C2'	B	0, 0.104, 0.499, 0.894, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.499 std_dev=0.395
C1'	B	0, 0.092, 0.491, 0.891, 0.942 max_d=0.942 avg_d=0.491 std_dev=0.400
C4'	A	0, 0.125, 0.550, 0.976, 0.996 max_d=0.996 avg_d=0.550 std_dev=0.425
O5'	A	0, 0.153, 0.604, 1.055, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.604 std_dev=0.451
C6	B	0, 0.050, 0.528, 1.005, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.528 std_dev=0.477
C2'	A	0, 0.037, 0.522, 1.007, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.522 std_dev=0.485
C4	B	0, 0.066, 0.561, 1.055, 1.063 max_d=1.063 avg_d=0.561 std_dev=0.494
C3'	A	0, 0.104, 0.600, 1.095, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.600 std_dev=0.496
C5	B	0, 0.055, 0.579, 1.104, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.579 std_dev=0.524
O4'	B	0, 0.131, 0.698, 1.264, 1.314 max_d=1.314 avg_d=0.698 std_dev=0.566
O5'	B	0, 0.406, 0.975, 1.544, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.975 std_dev=0.569
C5'	A	0, 0.164, 0.736, 1.309, 1.386 max_d=1.386 avg_d=0.736 std_dev=0.573
O4	B	0, 0.117, 0.696, 1.274, 1.308 max_d=1.308 avg_d=0.696 std_dev=0.578
C3'	B	0, 0.084, 0.706, 1.329, 1.375 max_d=1.375 avg_d=0.706 std_dev=0.622
OP2	A	0, 0.278, 0.933, 1.588, 1.548 max_d=1.548 avg_d=0.933 std_dev=0.655
O3'	B	0, 0.169, 0.882, 1.595, 1.626 max_d=1.626 avg_d=0.882 std_dev=0.713
OP1	A	0, 0.212, 0.946, 1.681, 1.728 max_d=1.728 avg_d=0.946 std_dev=0.734
O3'	A	0, 0.155, 0.902, 1.649, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.902 std_dev=0.747
C4'	B	0, 0.096, 0.875, 1.654, 1.685 max_d=1.685 avg_d=0.875 std_dev=0.779
O2'	A	0, 0.109, 0.972, 1.834, 1.838 max_d=1.838 avg_d=0.972 std_dev=0.863
OP2	B	0, 0.469, 1.350, 2.230, 2.186 max_d=2.186 avg_d=1.350 std_dev=0.880
P	B	0, 0.134, 1.047, 1.960, 2.013 max_d=2.013 avg_d=1.047 std_dev=0.913
C5'	B	0, 0.086, 1.111, 2.136, 2.142 max_d=2.142 avg_d=1.111 std_dev=1.025
OP1	B	0, 0.512, 1.751, 2.990, 3.065 max_d=3.065 avg_d=1.751 std_dev=1.239

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.07	0.02	0.05	0.13	0.07	0.02	0.10	0.13	0.06	0.02	0.01	0.03	0.22	0.00	0.25	0.38	0.34	0.28
C2	0.13	0.00	0.24	0.11	0.04	0.08	0.02	0.26	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.06	0.33	0.20	0.12	0.29	0.15	0.49	0.23
C2'	0.01	0.24	0.00	0.01	0.12	0.02	0.07	0.24	0.11	0.10	0.18	0.24	0.08	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.47	0.88	0.55	0.62
C3'	0.01	0.11	0.01	0.00	0.10	0.01	0.13	0.03	0.13	0.16	0.12	0.11	0.15	0.15	0.10	0.01	0.01	0.02	0.08	0.60	0.04	0.25
C4	0.07	0.04	0.12	0.10	0.00	0.05	0.01	0.25	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.09	0.14	0.06	0.31	0.27	0.51	0.27
C4'	0.02	0.08	0.02	0.01	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.06	0.06	0.08	0.05	0.04	0.03	0.18	0.01	0.01	0.02	0.15	0.04	0.09
C5	0.05	0.02	0.07	0.13	0.01	0.04	0.00	0.27	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.08	0.08	0.01	0.33	0.28	0.61	0.29
C5'	0.13	0.26	0.24	0.03	0.25	0.01	0.27	0.00	0.29	0.20	0.28	0.23	0.30	0.26	0.21	0.05	0.18	0.02	0.01	0.15	0.06	0.03
C6	0.07	0.01	0.11	0.13	0.01	0.05	0.00	0.29	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.02	0.03	0.05	0.10	0.04	0.33	0.23	0.65	0.29
C8	0.02	0.02	0.10	0.16	0.02	0.06	0.01	0.20	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.32	0.06	0.10	0.29	0.39	0.55	0.30
N1	0.10	0.01	0.18	0.12	0.02	0.06	0.01	0.28	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.04	0.20	0.16	0.08	0.32	0.17	0.59	0.26
N3	0.13	0.01	0.24	0.11	0.02	0.08	0.02	0.23	0.03	0.02	0.03	0.00	0.04	0.03	0.05	0.34	0.20	0.13	0.27	0.18	0.43	0.22
N6	0.06	0.02	0.08	0.15	0.01	0.05	0.01	0.30	0.01	0.02	0.02	0.04	0.00	0.02	0.03	0.07	0.07	0.01	0.33	0.24	0.70	0.29
N7	0.02	0.01	0.07	0.15	0.03	0.04	0.02	0.26	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.29	0.05	0.06	0.32	0.35	0.65	0.31
N9	0.01	0.06	0.03	0.10	0.02	0.03	0.03	0.21	0.03	0.01	0.04	0.05	0.03	0.01	0.00	0.09	0.10	0.01	0.29	0.35	0.47	0.28
O2'	0.03	0.33	0.01	0.01	0.09	0.18	0.08	0.05	0.05	0.32	0.20	0.34	0.07	0.29	0.09	0.00	0.04	0.10	0.41	0.94	0.64	0.64
O3'	0.22	0.20	0.01	0.01	0.14	0.01	0.08	0.18	0.10	0.06	0.16	0.20	0.07	0.05	0.10	0.04	0.00	0.18	0.19	0.33	0.41	0.07
O4'	0.00	0.12	0.01	0.02	0.06	0.01	0.01	0.02	0.04	0.10	0.08	0.13	0.01	0.06	0.01	0.10	0.18	0.00	0.05	0.04	0.07	0.05
O5'	0.25	0.29	0.47	0.08	0.31	0.02	0.33	0.01	0.33	0.29	0.32	0.27	0.33	0.32	0.29	0.41	0.19	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.38	0.15	0.88	0.60	0.27	0.15	0.28	0.15	0.23	0.39	0.17	0.18	0.24	0.35	0.35	0.94	0.33	0.04	0.01	0.00	0.03	0.01
OP2	0.34	0.49	0.55	0.04	0.51	0.04	0.61	0.06	0.65	0.55	0.59	0.43	0.70	0.65	0.47	0.64	0.41	0.07	0.01	0.03	0.00	0.03
P	0.28	0.23	0.62	0.25	0.27	0.09	0.29	0.03	0.29	0.30	0.26	0.22	0.29	0.31	0.28	0.64	0.07	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.10	0.08	0.20	0.21	0.32	0.07	0.53	0.05	0.03	0.19	0.11	0.21	0.09	0.33	0.22	0.62	0.88	0.86	0.81
C2	0.07	0.05	0.10	0.12	0.16	0.21	0.30	0.40	0.25	0.12	0.04	0.15	0.13	0.06	0.15	0.17	0.59	0.79	0.78	0.68
C2'	0.15	0.03	0.07	0.21	0.06	0.41	0.06	0.62	0.14	0.12	0.04	0.04	0.22	0.11	0.17	0.33	0.67	0.81	0.82	0.83
C3'	0.33	0.10	0.31	0.51	0.09	0.68	0.09	0.93	0.24	0.24	0.05	0.11	0.13	0.40	0.26	0.54	0.94	1.27	1.20	1.22
C4	0.05	0.12	0.07	0.14	0.12	0.23	0.06	0.42	0.11	0.04	0.17	0.15	0.19	0.04	0.20	0.16	0.56	0.82	0.79	0.70
C4'	0.12	0.08	0.12	0.28	0.18	0.45	0.03	0.71	0.09	0.06	0.18	0.10	0.24	0.15	0.31	0.32	0.74	1.18	1.11	1.08
C5	0.04	0.14	0.04	0.08	0.13	0.13	0.02	0.28	0.03	0.04	0.17	0.17	0.20	0.08	0.17	0.07	0.41	0.72	0.67	0.56
C5'	0.19	0.34	0.23	0.09	0.39	0.17	0.27	0.43	0.20	0.23	0.40	0.35	0.53	0.19	0.49	0.06	0.43	1.04	0.92	0.87
C6	0.06	0.10	0.04	0.04	0.05	0.06	0.12	0.20	0.09	0.02	0.07	0.17	0.15	0.15	0.04	0.03	0.36	0.65	0.60	0.48
C8	0.04	0.18	0.04	0.14	0.30	0.21	0.24	0.37	0.13	0.10	0.26	0.16	0.23	0.05	0.37	0.10	0.44	0.84	0.76	0.68
N1	0.04	0.05	0.07	0.06	0.19	0.12	0.27	0.28	0.21	0.10	0.04	0.16	0.13	0.13	0.20	0.09	0.46	0.70	0.67	0.56
N3	0.07	0.09	0.09	0.15	0.03	0.26	0.21	0.47	0.20	0.09	0.12	0.17	0.18	0.04	0.08	0.20	0.64	0.85	0.84	0.75
N6	0.12	0.10	0.03	0.07	0.06	0.08	0.07	0.08	0.04	0.04	0.04	0.17	0.11	0.22	0.07	0.09	0.21	0.55	0.49	0.35
N7	0.08	0.19	0.03	0.07	0.26	0.10	0.21	0.24	0.15	0.13	0.24	0.16	0.23	0.05	0.29	0.02	0.31	0.72	0.61	0.52
N9	0.06	0.13	0.08	0.18	0.22	0.28	0.09	0.47	0.05	0.04	0.21	0.13	0.20	0.07	0.33	0.19	0.58	0.87	0.85	0.77
O2'	0.20	0.23	0.29	0.18	0.24	0.06	0.21	0.17	0.20	0.20	0.24	0.23	0.48	0.24	0.26	0.10	0.32	0.24	0.17	0.26
O3'	0.28	0.07	0.29	0.56	0.31	0.74	0.08	1.04	0.14	0.13	0.25	0.07	0.13	0.45	0.53	0.54	1.05	1.41	1.23	1.34
O4'	0.10	0.13	0.13	0.28	0.24	0.39	0.07	0.63	0.07	0.04	0.24	0.15	0.21	0.15	0.39	0.26	0.70	1.14	1.08	1.01
O5'	0.31	0.45	0.32	0.14	0.55	0.06	0.46	0.26	0.38	0.37	0.52	0.43	0.59	0.24	0.63	0.12	0.23	0.93	0.73	0.69
OP1	0.61	0.65	0.61	0.50	0.78	0.46	0.80	0.37	0.74	0.65	0.70	0.59	0.72	0.52	0.83	0.55	0.46	0.31	0.23	0.14
OP2	0.76	0.82	0.82	0.64	0.85	0.48	0.81	0.26	0.79	0.78	0.84	0.80	1.05	0.72	0.88	0.59	0.37	0.51	0.27	0.20
P	0.42	0.50	0.44	0.29	0.61	0.18	0.58	0.05	0.52	0.47	0.56	0.47	0.64	0.35	0.68	0.29	0.11	0.62	0.38	0.36

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.02	0.02	0.02	0.01	0.13	0.26	0.21	0.05
C2	0.03	0.00	0.05	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.02	0.01	0.01	0.06	0.03	0.02	0.01	0.23	0.23	0.21	0.05
C2'	0.01	0.05	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.03	0.08	0.00	0.04	0.11	0.01	0.01	0.04	0.01	0.07	0.32	0.22	0.10
C3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.38	0.19	0.10
C4	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.07	0.00	0.13	0.02	0.02	0.01	0.03	0.08	0.02	0.01	0.06	0.32	0.17	0.20	0.07
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.00	0.08	0.01	0.07	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.07	0.01	0.02	0.29	0.17	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.02	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.00	0.02	0.02	0.15	0.04	0.02	0.07	0.33	0.17	0.21	0.08
C5'	0.02	0.05	0.03	0.02	0.13	0.01	0.16	0.00	0.13	0.06	0.08	0.03	0.02	0.03	0.14	0.01	0.01	0.24	0.16	0.01
C6	0.02	0.01	0.08	0.02	0.02	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.03	0.01	0.14	0.04	0.02	0.07	0.29	0.18	0.22	0.07
N1	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.01	0.00	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.01	0.22	0.22	0.22	0.05
N3	0.04	0.01	0.04	0.04	0.01	0.05	0.02	0.08	0.03	0.04	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.04	0.29	0.20	0.20	0.06
O2	0.05	0.01	0.11	0.06	0.03	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.03	0.00	0.17	0.06	0.05	0.03	0.19	0.25	0.22	0.04
O2'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.08	0.02	0.15	0.02	0.14	0.01	0.02	0.17	0.00	0.03	0.10	0.02	0.08	0.37	0.24	0.13
O3'	0.02	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.04	0.03	0.04	0.02	0.02	0.06	0.03	0.00	0.03	0.03	0.12	0.41	0.18	0.10
O4	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.07	0.02	0.14	0.02	0.02	0.03	0.05	0.10	0.03	0.00	0.06	0.32	0.16	0.22	0.07
O4'	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.07	0.01	0.07	0.01	0.04	0.03	0.02	0.03	0.06	0.00	0.15	0.23	0.18	0.06
O5'	0.13	0.23	0.07	0.11	0.32	0.02	0.33	0.01	0.29	0.22	0.29	0.19	0.08	0.12	0.32	0.15	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.26	0.23	0.32	0.38	0.17	0.29	0.17	0.24	0.18	0.22	0.20	0.25	0.37	0.41	0.16	0.23	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.21	0.21	0.22	0.19	0.20	0.17	0.21	0.16	0.22	0.22	0.20	0.22	0.24	0.18	0.22	0.18	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.05	0.10	0.10	0.07	0.03	0.08	0.01	0.07	0.05	0.06	0.04	0.13	0.10	0.07	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00