Doublet Group distance statistics: 53866

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 2, 4, 17, 12, 2, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.009, 0.014, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.017, 0.025, 0.033, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.025 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.025, 0.036, 0.046, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.036 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.021, 0.033, 0.044, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.033 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.023, 0.037, 0.050, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.037 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.022, 0.036, 0.050, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.036 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.029, 0.045, 0.060, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.045 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.028, 0.045, 0.062, 0.097 max_d=0.097 avg_d=0.045 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.025, 0.043, 0.060, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.043 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.020, 0.041, 0.063, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.041 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.030, 0.053, 0.077, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.053 std_dev=0.024
C3'	A	0, 0.194, 0.304, 0.414, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.304 std_dev=0.110
O4'	A	0, 0.155, 0.291, 0.427, 0.495 max_d=0.495 avg_d=0.291 std_dev=0.136
C4	B	0, 0.304, 0.447, 0.591, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.447 std_dev=0.144
C5	B	0, 0.348, 0.511, 0.674, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.511 std_dev=0.163
O3'	A	0, 0.340, 0.503, 0.667, 0.964 max_d=0.964 avg_d=0.503 std_dev=0.164
C2'	A	0, 0.042, 0.207, 0.373, 1.025 max_d=1.025 avg_d=0.207 std_dev=0.166
N9	B	0, 0.389, 0.555, 0.720, 0.999 max_d=0.999 avg_d=0.555 std_dev=0.166
N3	B	0, 0.211, 0.384, 0.557, 0.903 max_d=0.903 avg_d=0.384 std_dev=0.173
C4'	A	0, 0.262, 0.437, 0.613, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.437 std_dev=0.176
C6	B	0, 0.370, 0.557, 0.743, 1.027 max_d=1.027 avg_d=0.557 std_dev=0.186
N7	B	0, 0.419, 0.610, 0.800, 1.149 max_d=1.149 avg_d=0.610 std_dev=0.191
C8	B	0, 0.440, 0.636, 0.833, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.636 std_dev=0.196
C1'	B	0, 0.474, 0.676, 0.877, 1.074 max_d=1.074 avg_d=0.676 std_dev=0.202
N1	B	0, 0.331, 0.534, 0.738, 0.988 max_d=0.988 avg_d=0.534 std_dev=0.203
C2	B	0, 0.246, 0.457, 0.668, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.457 std_dev=0.211
C2'	B	0, 0.498, 0.723, 0.949, 1.079 max_d=1.079 avg_d=0.723 std_dev=0.225
OP2	B	0, 0.540, 0.767, 0.995, 1.351 max_d=1.351 avg_d=0.767 std_dev=0.227
O4'	B	0, 0.554, 0.783, 1.013, 1.324 max_d=1.324 avg_d=0.783 std_dev=0.229
O6	B	0, 0.446, 0.676, 0.906, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.676 std_dev=0.230
C3'	B	0, 0.510, 0.750, 0.990, 1.182 max_d=1.182 avg_d=0.750 std_dev=0.240
O5'	B	0, 0.533, 0.787, 1.041, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.787 std_dev=0.254
C4'	B	0, 0.579, 0.842, 1.105, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.842 std_dev=0.263
P	B	0, 0.584, 0.851, 1.117, 1.449 max_d=1.449 avg_d=0.851 std_dev=0.266
OP1	B	0, 0.645, 0.913, 1.180, 1.620 max_d=1.620 avg_d=0.913 std_dev=0.267
N2	B	0, 0.277, 0.549, 0.821, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.549 std_dev=0.272
O3'	B	0, 0.604, 0.878, 1.152, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.878 std_dev=0.274
C5'	A	0, 0.449, 0.733, 1.017, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.733 std_dev=0.284
C5'	B	0, 0.559, 0.847, 1.134, 1.557 max_d=1.557 avg_d=0.847 std_dev=0.288
O2'	B	0, 0.668, 0.959, 1.250, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.959 std_dev=0.291
O2'	A	0, 0.192, 0.493, 0.794, 1.899 max_d=1.899 avg_d=0.493 std_dev=0.301
O5'	A	0, 1.165, 2.466, 3.766, 3.510 max_d=3.510 avg_d=2.466 std_dev=1.300
OP2	A	0, 1.327, 2.685, 4.043, 3.872 max_d=3.872 avg_d=2.685 std_dev=1.358
P	A	0, 1.470, 3.072, 4.674, 4.341 max_d=4.341 avg_d=3.072 std_dev=1.602
OP1	A	0, 1.860, 3.875, 5.890, 5.368 max_d=5.368 avg_d=3.875 std_dev=2.015

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.15	0.00	0.31	0.96	0.24	0.47
C2	0.03	0.00	0.14	0.07	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.17	0.20	0.07	0.37	1.25	0.46	0.69
C2'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.07	0.02	0.03	0.10	0.06	0.09	0.10	0.15	0.05	0.06	0.02	0.00	0.03	0.03	0.59	0.99	0.26	0.61
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.05	0.05	0.06	0.07	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.38	0.57	0.06	0.32
C4	0.02	0.01	0.07	0.04	0.00	0.02	0.00	0.09	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.09	0.16	0.03	0.43	1.37	0.51	0.75
C4'	0.02	0.06	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.10	0.04	0.07	0.05	0.09	0.03	0.06	0.03	0.01	0.02	0.35	0.07	0.07
C5	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.14	0.02	0.53	1.63	0.69	0.92
C5'	0.03	0.05	0.10	0.01	0.09	0.01	0.15	0.00	0.14	0.20	0.09	0.04	0.18	0.21	0.11	0.05	0.05	0.02	0.01	0.28	0.07	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01	0.03	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.15	0.03	0.52	1.62	0.72	0.93
C8	0.01	0.02	0.09	0.05	0.01	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.10	0.07	0.61	1.73	0.72	0.97
N1	0.02	0.00	0.10	0.06	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.18	0.05	0.44	1.44	0.60	0.82
N3	0.03	0.00	0.15	0.07	0.01	0.07	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.20	0.07	0.33	1.15	0.38	0.61
N6	0.02	0.01	0.05	0.05	0.01	0.05	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.14	0.03	0.57	1.75	0.84	1.03
N7	0.01	0.02	0.06	0.05	0.01	0.09	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.17	0.11	0.05	0.62	1.84	0.83	1.05
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.13	0.01	0.46	1.35	0.48	0.73
O2'	0.02	0.17	0.00	0.01	0.09	0.06	0.12	0.05	0.11	0.17	0.12	0.17	0.13	0.17	0.09	0.00	0.05	0.04	0.61	1.03	0.27	0.65
O3'	0.15	0.20	0.03	0.01	0.16	0.03	0.14	0.05	0.15	0.10	0.18	0.20	0.14	0.11	0.13	0.05	0.00	0.11	0.19	0.36	0.12	0.16
O4'	0.00	0.07	0.03	0.01	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.07	0.05	0.07	0.03	0.05	0.01	0.04	0.11	0.00	0.07	0.66	0.14	0.22
O5'	0.31	0.37	0.59	0.38	0.43	0.02	0.53	0.01	0.52	0.61	0.44	0.33	0.57	0.62	0.46	0.61	0.19	0.07	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.96	1.25	0.99	0.57	1.37	0.35	1.63	0.28	1.62	1.73	1.44	1.15	1.75	1.84	1.35	1.03	0.36	0.66	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.24	0.46	0.26	0.06	0.51	0.07	0.69	0.07	0.72	0.72	0.60	0.38	0.84	0.83	0.48	0.27	0.12	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.47	0.69	0.61	0.32	0.75	0.07	0.92	0.02	0.93	0.97	0.82	0.61	1.03	1.05	0.73	0.65	0.16	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.23	0.14	0.25	0.21	0.16	0.21	0.16	0.19	0.15	0.24	0.15	0.15	0.14	0.21	0.20	0.27	0.19	0.22	0.23	0.16	0.15	0.13	0.16
C2	0.16	0.18	0.17	0.12	0.16	0.13	0.16	0.12	0.18	0.17	0.19	0.19	0.17	0.17	0.16	0.20	0.11	0.15	0.11	0.18	0.14	0.14	0.12
C2'	0.24	0.15	0.23	0.21	0.19	0.24	0.21	0.23	0.20	0.28	0.17	0.14	0.15	0.27	0.23	0.23	0.19	0.26	0.28	0.23	0.15	0.16	0.20
C3'	0.33	0.19	0.34	0.33	0.24	0.36	0.24	0.37	0.21	0.33	0.19	0.17	0.20	0.28	0.30	0.34	0.31	0.36	0.44	0.22	0.34	0.29	0.37
C4	0.19	0.17	0.20	0.14	0.15	0.14	0.15	0.12	0.15	0.20	0.16	0.18	0.16	0.18	0.18	0.23	0.12	0.17	0.11	0.14	0.12	0.11	0.10
C4'	0.43	0.20	0.46	0.47	0.27	0.47	0.25	0.46	0.20	0.37	0.18	0.18	0.24	0.30	0.35	0.49	0.48	0.45	0.52	0.19	0.41	0.30	0.41
C5	0.15	0.18	0.16	0.11	0.13	0.12	0.11	0.10	0.12	0.14	0.16	0.20	0.16	0.11	0.14	0.20	0.11	0.14	0.08	0.11	0.12	0.11	0.08
C5'	0.62	0.33	0.64	0.67	0.42	0.68	0.38	0.65	0.32	0.52	0.30	0.31	0.39	0.43	0.52	0.67	0.70	0.65	0.69	0.29	0.51	0.38	0.54
C6	0.13	0.19	0.14	0.11	0.12	0.11	0.09	0.10	0.12	0.11	0.18	0.21	0.16	0.10	0.12	0.17	0.11	0.12	0.10	0.11	0.13	0.12	0.10
C8	0.20	0.16	0.22	0.15	0.13	0.15	0.12	0.13	0.11	0.18	0.14	0.18	0.14	0.15	0.17	0.26	0.13	0.18	0.13	0.11	0.10	0.11	0.09
N1	0.13	0.18	0.14	0.10	0.13	0.11	0.12	0.10	0.14	0.13	0.18	0.20	0.16	0.12	0.13	0.17	0.10	0.13	0.11	0.13	0.13	0.13	0.11
N3	0.19	0.18	0.20	0.14	0.17	0.15	0.18	0.13	0.18	0.21	0.18	0.18	0.16	0.21	0.19	0.22	0.13	0.18	0.12	0.19	0.14	0.13	0.12
N6	0.12	0.22	0.13	0.13	0.13	0.12	0.11	0.11	0.15	0.11	0.21	0.25	0.17	0.11	0.11	0.16	0.14	0.12	0.13	0.15	0.15	0.13	0.12
N7	0.16	0.18	0.17	0.12	0.12	0.12	0.09	0.10	0.11	0.13	0.15	0.21	0.16	0.10	0.14	0.22	0.12	0.14	0.09	0.10	0.12	0.11	0.08
N9	0.21	0.15	0.23	0.16	0.15	0.17	0.15	0.14	0.14	0.22	0.15	0.17	0.15	0.19	0.19	0.25	0.14	0.19	0.15	0.14	0.11	0.11	0.11
O2'	0.34	0.24	0.31	0.34	0.28	0.38	0.26	0.39	0.23	0.34	0.22	0.23	0.26	0.30	0.32	0.30	0.31	0.39	0.39	0.23	0.33	0.29	0.34
O3'	0.23	0.13	0.26	0.27	0.13	0.29	0.14	0.32	0.14	0.20	0.14	0.14	0.12	0.16	0.18	0.28	0.28	0.27	0.35	0.16	0.40	0.26	0.34
O4'	0.34	0.17	0.38	0.36	0.20	0.35	0.19	0.32	0.16	0.30	0.16	0.18	0.19	0.24	0.28	0.41	0.36	0.34	0.37	0.16	0.27	0.21	0.28
O5'	1.59	1.03	1.56	1.71	1.24	1.77	1.15	1.74	1.00	1.41	0.96	0.95	1.16	1.22	1.43	1.54	1.66	1.71	1.72	0.91	1.36	1.19	1.47
OP1	2.57	2.20	2.64	2.46	2.30	2.38	2.14	2.09	2.02	2.23	2.07	2.15	2.32	2.08	2.40	2.72	2.39	2.48	2.01	1.88	1.35	1.40	1.63
OP2	1.62	1.22	1.64	1.62	1.29	1.66	1.15	1.47	1.06	1.25	1.11	1.22	1.33	1.11	1.40	1.82	1.78	1.63	1.32	0.95	0.84	0.73	1.00
P	2.03	1.51	2.06	2.09	1.67	2.09	1.53	1.89	1.39	1.71	1.41	1.46	1.65	1.53	1.83	2.12	2.18	2.07	1.78	1.28	1.25	1.17	1.45

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.03	0.09	0.08	0.04
C2	0.04	0.00	0.10	0.10	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.13	0.03	0.12	0.02	0.11	0.10	0.07
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.01	0.05	0.05	0.07	0.13	0.10	0.04	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.04	0.10	0.09	0.05
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.07	0.01	0.06	0.01	0.07	0.04	0.09	0.13	0.10	0.05	0.04	0.02	0.01	0.01	0.06	0.06	0.11	0.08	0.06
C4	0.02	0.01	0.05	0.07	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.12	0.02	0.11	0.09	0.07
C4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.05	0.03	0.05	0.04	0.05	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.04	0.10	0.04	0.02
C5	0.02	0.01	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.13	0.01	0.11	0.10	0.08
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.07	0.05	0.05	0.04	0.08	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.07	0.11	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.13	0.01	0.10	0.11	0.08
C8	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.05	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.05	0.03	0.13	0.01	0.11	0.09	0.08
N1	0.04	0.00	0.07	0.09	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.10	0.02	0.12	0.01	0.10	0.10	0.07
N2	0.05	0.00	0.13	0.13	0.01	0.05	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.14	0.16	0.04	0.12	0.02	0.12	0.09	0.07
N3	0.04	0.00	0.10	0.10	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.12	0.03	0.12	0.02	0.12	0.09	0.07
N7	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.03	0.14	0.02	0.11	0.11	0.09
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.11	0.02	0.11	0.09	0.06
O2'	0.02	0.10	0.00	0.02	0.05	0.04	0.03	0.04	0.05	0.04	0.08	0.14	0.10	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.03	0.04	0.10	0.07	0.03
O3'	0.02	0.13	0.02	0.01	0.08	0.02	0.06	0.03	0.08	0.05	0.10	0.16	0.12	0.05	0.04	0.04	0.00	0.02	0.11	0.07	0.13	0.10	0.09
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.08	0.02	0.10	0.08	0.05
O5'	0.06	0.12	0.04	0.06	0.12	0.01	0.13	0.01	0.13	0.13	0.12	0.12	0.12	0.14	0.11	0.03	0.11	0.08	0.00	0.13	0.02	0.02	0.00
O6	0.03	0.02	0.04	0.06	0.02	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.04	0.07	0.02	0.13	0.00	0.10	0.12	0.09
OP1	0.09	0.11	0.10	0.11	0.11	0.10	0.11	0.11	0.10	0.11	0.10	0.12	0.12	0.11	0.11	0.10	0.13	0.10	0.02	0.10	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.10	0.09	0.08	0.09	0.04	0.10	0.02	0.11	0.09	0.10	0.09	0.09	0.11	0.09	0.07	0.10	0.08	0.02	0.12	0.01	0.00	0.01
P	0.04	0.07	0.05	0.06	0.07	0.02	0.08	0.02	0.08	0.08	0.07	0.07	0.07	0.09	0.06	0.03	0.09	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00