Doublet Group distance statistics: 53868

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 15, 10, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, -0.001, 0.008, 0.018, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.008 std_dev=0.010
C2	A	0, -0.003, 0.008, 0.018, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.008 std_dev=0.011
N3	A	0, -0.003, 0.011, 0.025, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.011 std_dev=0.014
N1	A	0, -0.004, 0.012, 0.027, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.012 std_dev=0.016
C5	A	0, -0.005, 0.012, 0.029, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.012 std_dev=0.017
C1'	A	0, -0.004, 0.013, 0.031, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.013 std_dev=0.018
C4	A	0, -0.006, 0.014, 0.035, 0.118 max_d=0.118 avg_d=0.014 std_dev=0.021
N9	A	0, -0.007, 0.017, 0.040, 0.136 max_d=0.136 avg_d=0.017 std_dev=0.024
N6	A	0, -0.008, 0.026, 0.060, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.026 std_dev=0.034
N7	A	0, -0.014, 0.024, 0.063, 0.220 max_d=0.220 avg_d=0.024 std_dev=0.039
C8	A	0, -0.016, 0.028, 0.073, 0.255 max_d=0.255 avg_d=0.028 std_dev=0.045
C5	B	0, 0.092, 0.198, 0.303, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.198 std_dev=0.105
C4	B	0, 0.071, 0.195, 0.319, 0.776 max_d=0.776 avg_d=0.195 std_dev=0.124
C6	B	0, 0.059, 0.222, 0.385, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.222 std_dev=0.163
N3	B	0, 0.052, 0.241, 0.431, 1.047 max_d=1.047 avg_d=0.241 std_dev=0.189
N1	B	0, 0.057, 0.252, 0.447, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.252 std_dev=0.195
C2	B	0, 0.052, 0.265, 0.478, 1.017 max_d=1.017 avg_d=0.265 std_dev=0.213
O3'	A	0, -0.070, 0.159, 0.387, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.159 std_dev=0.228
N7	B	0, 0.017, 0.246, 0.474, 1.073 max_d=1.073 avg_d=0.246 std_dev=0.229
N9	B	0, 0.003, 0.232, 0.462, 1.295 max_d=1.295 avg_d=0.232 std_dev=0.229
O4'	A	0, -0.079, 0.153, 0.386, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.153 std_dev=0.233
C3'	A	0, -0.092, 0.162, 0.417, 1.278 max_d=1.278 avg_d=0.162 std_dev=0.254
C8	B	0, -0.013, 0.257, 0.527, 1.385 max_d=1.385 avg_d=0.257 std_dev=0.270
O6	B	0, 0.006, 0.277, 0.548, 1.500 max_d=1.500 avg_d=0.277 std_dev=0.271
C2'	A	0, -0.141, 0.168, 0.476, 1.496 max_d=1.496 avg_d=0.168 std_dev=0.308
C4'	A	0, -0.133, 0.182, 0.498, 1.378 max_d=1.378 avg_d=0.182 std_dev=0.315
N2	B	0, -0.004, 0.343, 0.691, 1.601 max_d=1.601 avg_d=0.343 std_dev=0.348
C1'	B	0, -0.075, 0.282, 0.640, 1.860 max_d=1.860 avg_d=0.282 std_dev=0.358
O5'	A	0, -0.156, 0.259, 0.675, 2.364 max_d=2.364 avg_d=0.259 std_dev=0.416
O2'	A	0, -0.257, 0.294, 0.844, 2.722 max_d=2.722 avg_d=0.294 std_dev=0.551
C5'	A	0, -0.274, 0.311, 0.896, 2.503 max_d=2.503 avg_d=0.311 std_dev=0.585
P	A	0, -0.245, 0.351, 0.946, 3.197 max_d=3.197 avg_d=0.351 std_dev=0.596
OP2	A	0, -0.271, 0.407, 1.085, 3.625 max_d=3.625 avg_d=0.407 std_dev=0.678
O4'	B	0, -0.298, 0.393, 1.083, 3.668 max_d=3.668 avg_d=0.393 std_dev=0.691
OP1	A	0, -0.335, 0.415, 1.165, 3.629 max_d=3.629 avg_d=0.415 std_dev=0.750
O3'	B	0, -0.329, 0.459, 1.246, 3.373 max_d=3.373 avg_d=0.459 std_dev=0.788
C2'	B	0, -0.463, 0.436, 1.334, 4.157 max_d=4.157 avg_d=0.436 std_dev=0.899
C3'	B	0, -0.488, 0.490, 1.468, 4.691 max_d=4.691 avg_d=0.490 std_dev=0.978
C4'	B	0, -0.493, 0.502, 1.498, 4.989 max_d=4.989 avg_d=0.502 std_dev=0.996
O2'	B	0, -0.629, 0.496, 1.621, 5.031 max_d=5.031 avg_d=0.496 std_dev=1.125
C5'	B	0, -0.855, 0.667, 2.189, 7.606 max_d=7.606 avg_d=0.667 std_dev=1.522
O5'	B	0, -1.091, 0.706, 2.503, 9.459 max_d=9.459 avg_d=0.706 std_dev=1.797
P	B	0, -1.474, 0.824, 3.123, 12.521 max_d=12.521 avg_d=0.824 std_dev=2.299
OP2	B	0, -1.584, 0.867, 3.317, 13.481 max_d=13.481 avg_d=0.867 std_dev=2.450
OP1	B	0, -1.562, 0.909, 3.380, 13.579 max_d=13.579 avg_d=0.909 std_dev=2.471

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.11	0.00	0.11	0.10	0.17	0.16
C2	0.03	0.00	0.20	0.10	0.01	0.07	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.24	0.07	0.13	0.16	0.18	0.35	0.28
C2'	0.00	0.20	0.00	0.00	0.10	0.01	0.04	0.07	0.08	0.11	0.15	0.20	0.04	0.06	0.01	0.00	0.02	0.02	0.26	0.33	0.21	0.20
C3'	0.01	0.10	0.00	0.00	0.08	0.00	0.08	0.02	0.09	0.06	0.10	0.10	0.09	0.07	0.06	0.02	0.01	0.01	0.19	0.38	0.19	0.20
C4	0.02	0.01	0.10	0.08	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.06	0.07	0.18	0.21	0.35	0.30
C4'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.07	0.06	0.07	0.04	0.05	0.02	0.11	0.03	0.00	0.01	0.14	0.14	0.04
C5	0.01	0.00	0.04	0.08	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.05	0.04	0.21	0.31	0.44	0.38
C5'	0.02	0.08	0.07	0.02	0.05	0.00	0.07	0.00	0.07	0.12	0.07	0.07	0.08	0.11	0.06	0.06	0.05	0.02	0.00	0.15	0.18	0.01
C6	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.08	0.05	0.06	0.21	0.32	0.46	0.39
C8	0.01	0.01	0.11	0.06	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.20	0.05	0.07	0.24	0.33	0.40	0.38
N1	0.03	0.00	0.15	0.10	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.06	0.10	0.19	0.26	0.42	0.34
N3	0.03	0.00	0.20	0.10	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.24	0.08	0.12	0.14	0.14	0.31	0.25
N6	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.09	0.05	0.05	0.23	0.39	0.51	0.43
N7	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.18	0.04	0.04	0.25	0.39	0.48	0.43
N9	0.00	0.01	0.01	0.06	0.00	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.06	0.01	0.18	0.21	0.31	0.28
O2'	0.01	0.24	0.00	0.02	0.09	0.11	0.08	0.06	0.08	0.20	0.15	0.24	0.09	0.18	0.07	0.00	0.05	0.07	0.16	0.30	0.27	0.18
O3'	0.11	0.07	0.02	0.01	0.06	0.03	0.05	0.05	0.05	0.05	0.06	0.08	0.05	0.04	0.06	0.05	0.00	0.09	0.12	0.39	0.20	0.18
O4'	0.00	0.13	0.02	0.01	0.07	0.00	0.04	0.02	0.06	0.07	0.10	0.12	0.05	0.04	0.01	0.07	0.09	0.00	0.10	0.14	0.28	0.24
O5'	0.11	0.16	0.26	0.19	0.18	0.01	0.21	0.00	0.21	0.24	0.19	0.14	0.23	0.25	0.18	0.16	0.12	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.10	0.18	0.33	0.38	0.21	0.14	0.31	0.15	0.32	0.33	0.26	0.14	0.39	0.39	0.21	0.30	0.39	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.17	0.35	0.21	0.19	0.35	0.14	0.44	0.18	0.46	0.40	0.42	0.31	0.51	0.48	0.31	0.27	0.20	0.28	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.16	0.28	0.20	0.20	0.30	0.04	0.38	0.01	0.39	0.38	0.34	0.25	0.43	0.43	0.28	0.18	0.18	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.21	0.20	0.39	0.38	0.13	0.20	0.12	0.27	0.18	0.27	0.23	0.24	0.14	0.22	0.19	0.66	0.36	0.08	0.43	0.22	0.48	0.40	0.38
C2	0.09	0.27	0.27	0.40	0.11	0.37	0.10	0.59	0.11	0.14	0.21	0.37	0.21	0.18	0.08	0.24	0.31	0.29	0.32	0.17	0.42	0.67	0.51
C2'	0.35	0.26	0.54	0.42	0.14	0.26	0.14	0.25	0.31	0.38	0.36	0.31	0.14	0.25	0.28	0.79	0.39	0.21	0.75	0.45	0.81	0.72	0.71
C3'	0.23	0.34	0.48	0.46	0.21	0.32	0.25	0.40	0.39	0.22	0.42	0.37	0.25	0.19	0.20	0.69	0.40	0.20	0.71	0.50	0.86	0.84	0.76
C4	0.10	0.23	0.24	0.36	0.10	0.27	0.09	0.41	0.13	0.16	0.22	0.28	0.18	0.16	0.10	0.41	0.32	0.20	0.07	0.12	0.06	0.28	0.15
C4'	0.14	0.28	0.39	0.44	0.18	0.34	0.22	0.48	0.32	0.13	0.33	0.30	0.21	0.16	0.13	0.66	0.37	0.23	0.54	0.38	0.72	0.71	0.61
C5	0.09	0.20	0.28	0.41	0.10	0.35	0.07	0.52	0.09	0.11	0.16	0.24	0.17	0.12	0.08	0.37	0.33	0.29	0.16	0.08	0.18	0.45	0.32
C5'	0.13	0.34	0.30	0.43	0.27	0.44	0.35	0.64	0.42	0.21	0.40	0.34	0.28	0.32	0.20	0.59	0.35	0.38	0.56	0.49	0.82	0.84	0.70
C6	0.14	0.21	0.36	0.46	0.11	0.47	0.09	0.71	0.08	0.10	0.12	0.27	0.20	0.13	0.10	0.28	0.34	0.39	0.44	0.13	0.50	0.81	0.64
C8	0.15	0.17	0.37	0.42	0.11	0.27	0.11	0.39	0.17	0.15	0.19	0.19	0.14	0.11	0.13	0.66	0.37	0.17	0.27	0.19	0.35	0.33	0.26
N1	0.13	0.25	0.35	0.46	0.11	0.46	0.10	0.73	0.11	0.11	0.16	0.35	0.22	0.15	0.09	0.24	0.33	0.37	0.49	0.18	0.60	0.90	0.71
N3	0.09	0.26	0.22	0.35	0.11	0.27	0.10	0.44	0.13	0.17	0.24	0.34	0.19	0.20	0.10	0.34	0.30	0.21	0.13	0.14	0.15	0.36	0.24
N6	0.20	0.14	0.47	0.54	0.12	0.59	0.11	0.88	0.11	0.13	0.08	0.19	0.18	0.13	0.14	0.34	0.37	0.49	0.66	0.16	0.72	1.07	0.89
N7	0.11	0.16	0.31	0.43	0.10	0.34	0.10	0.47	0.12	0.11	0.15	0.17	0.14	0.12	0.09	0.51	0.36	0.27	0.12	0.12	0.14	0.33	0.21
N9	0.16	0.20	0.32	0.38	0.11	0.22	0.10	0.32	0.17	0.20	0.22	0.24	0.15	0.16	0.14	0.58	0.35	0.13	0.25	0.19	0.29	0.24	0.19
O2'	0.61	0.15	0.71	0.54	0.37	0.50	0.34	0.48	0.19	0.72	0.20	0.17	0.24	0.61	0.57	0.91	0.52	0.54	1.02	0.28	0.99	0.91	0.95
O3'	0.29	0.24	0.52	0.46	0.19	0.31	0.20	0.37	0.27	0.31	0.30	0.28	0.19	0.25	0.26	0.72	0.40	0.21	0.76	0.36	0.86	0.85	0.78
O4'	0.14	0.22	0.37	0.46	0.14	0.35	0.15	0.49	0.22	0.13	0.25	0.24	0.17	0.12	0.13	0.64	0.41	0.23	0.40	0.26	0.54	0.53	0.44
O5'	0.21	0.33	0.36	0.23	0.28	0.22	0.34	0.41	0.40	0.27	0.38	0.32	0.27	0.34	0.24	0.74	0.16	0.25	0.45	0.46	0.73	0.71	0.57
OP1	0.31	0.44	0.14	0.42	0.39	0.55	0.41	0.74	0.44	0.35	0.45	0.45	0.41	0.39	0.35	0.42	0.48	0.52	0.57	0.45	0.90	0.89	0.73
OP2	0.39	0.59	0.13	0.35	0.55	0.53	0.60	0.71	0.64	0.52	0.63	0.58	0.54	0.60	0.49	0.44	0.36	0.58	0.55	0.67	0.88	0.91	0.74
P	0.32	0.52	0.14	0.37	0.46	0.51	0.51	0.69	0.56	0.41	0.55	0.52	0.47	0.48	0.39	0.48	0.39	0.53	0.48	0.58	0.79	0.79	0.64

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.00	0.22	0.02	0.33	0.15	0.17
C2	0.01	0.00	0.31	0.24	0.01	0.23	0.01	0.48	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.05	0.21	0.39	0.00	0.45	0.67	0.47
C2'	0.00	0.31	0.00	0.00	0.16	0.00	0.09	0.08	0.15	0.14	0.24	0.37	0.29	0.06	0.02	0.00	0.01	0.01	0.34	0.12	0.56	0.31	0.37
C3'	0.01	0.24	0.00	0.00	0.15	0.00	0.17	0.01	0.20	0.15	0.23	0.29	0.22	0.16	0.09	0.01	0.00	0.01	0.17	0.21	0.47	0.12	0.23
C4	0.01	0.01	0.16	0.15	0.00	0.09	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.11	0.20	0.01	0.16	0.19	0.08
C4'	0.01	0.23	0.00	0.00	0.09	0.00	0.05	0.00	0.08	0.15	0.16	0.30	0.22	0.12	0.04	0.11	0.02	0.00	0.01	0.07	0.23	0.16	0.02
C5	0.01	0.01	0.09	0.17	0.00	0.05	0.00	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.05	0.05	0.25	0.01	0.19	0.18	0.13
C5'	0.02	0.48	0.08	0.01	0.20	0.00	0.12	0.00	0.20	0.20	0.36	0.63	0.43	0.15	0.04	0.04	0.07	0.01	0.01	0.17	0.18	0.23	0.01
C6	0.01	0.00	0.15	0.20	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.09	0.21	0.00	0.10	0.23	0.08
C8	0.01	0.01	0.14	0.15	0.00	0.15	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.24	0.04	0.12	0.47	0.01	0.52	0.52	0.47
N1	0.01	0.00	0.24	0.23	0.01	0.16	0.01	0.36	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.05	0.16	0.28	0.00	0.30	0.50	0.31
N2	0.02	0.00	0.37	0.29	0.01	0.30	0.01	0.63	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.31	0.06	0.26	0.58	0.01	0.71	1.00	0.75
N3	0.01	0.00	0.29	0.22	0.00	0.22	0.00	0.43	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.06	0.21	0.33	0.01	0.35	0.53	0.37
N7	0.01	0.01	0.06	0.16	0.00	0.12	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.20	0.06	0.06	0.41	0.01	0.44	0.45	0.40
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.05	0.01	0.28	0.01	0.31	0.21	0.21
O2'	0.01	0.22	0.00	0.01	0.06	0.11	0.07	0.04	0.05	0.24	0.13	0.31	0.21	0.20	0.08	0.00	0.03	0.07	0.23	0.06	0.52	0.34	0.32
O3'	0.13	0.05	0.01	0.00	0.04	0.02	0.05	0.07	0.07	0.04	0.05	0.06	0.06	0.06	0.05	0.03	0.00	0.09	0.06	0.09	0.35	0.09	0.11
O4'	0.00	0.21	0.01	0.01	0.11	0.00	0.05	0.01	0.09	0.12	0.16	0.26	0.21	0.06	0.01	0.07	0.09	0.00	0.14	0.06	0.21	0.25	0.13
O5'	0.22	0.39	0.34	0.17	0.20	0.01	0.25	0.01	0.21	0.47	0.28	0.58	0.33	0.41	0.28	0.23	0.06	0.14	0.00	0.22	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.00	0.12	0.21	0.01	0.07	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.06	0.22	0.00	0.10	0.21	0.09
OP1	0.33	0.45	0.56	0.47	0.16	0.23	0.19	0.18	0.10	0.52	0.30	0.71	0.35	0.44	0.31	0.52	0.35	0.21	0.01	0.10	0.00	0.00	0.00
OP2	0.15	0.67	0.31	0.12	0.19	0.16	0.18	0.23	0.23	0.52	0.50	1.00	0.53	0.45	0.21	0.34	0.09	0.25	0.01	0.21	0.00	0.00	0.01
P	0.17	0.47	0.37	0.23	0.08	0.02	0.13	0.01	0.08	0.47	0.31	0.75	0.37	0.40	0.21	0.32	0.11	0.13	0.00	0.09	0.00	0.01	0.00