Doublet Group distance statistics: 53869

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 8, 5, 2, 0, 3, 5, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.001, 0.013, 0.025, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.013 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.007, 0.020, 0.034, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.009, 0.027, 0.045, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.027 std_dev=0.018
N1	A	0, 0.005, 0.024, 0.043, 0.108 max_d=0.108 avg_d=0.024 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.002, 0.023, 0.044, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.023 std_dev=0.021
C1'	A	0, -0.002, 0.019, 0.041, 0.099 max_d=0.099 avg_d=0.019 std_dev=0.021
C2	A	0, -0.007, 0.016, 0.039, 0.105 max_d=0.105 avg_d=0.016 std_dev=0.023
N7	A	0, 0.001, 0.026, 0.051, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.026 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.004, 0.030, 0.056, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.030 std_dev=0.026
N6	A	0, 0.004, 0.033, 0.062, 0.114 max_d=0.114 avg_d=0.033 std_dev=0.029
O3'	A	0, 0.132, 0.297, 0.461, 0.764 max_d=0.764 avg_d=0.297 std_dev=0.164
C6	B	0, 0.122, 0.389, 0.657, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.389 std_dev=0.268
C5	B	0, 0.064, 0.331, 0.599, 1.231 max_d=1.231 avg_d=0.331 std_dev=0.268
C3'	A	0, 0.024, 0.299, 0.574, 1.330 max_d=1.330 avg_d=0.299 std_dev=0.275
O4'	A	0, -0.061, 0.214, 0.489, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.214 std_dev=0.275
N1	B	0, 0.170, 0.447, 0.724, 1.339 max_d=1.339 avg_d=0.447 std_dev=0.277
N7	B	0, 0.097, 0.380, 0.662, 1.132 max_d=1.132 avg_d=0.380 std_dev=0.283
C2	B	0, 0.177, 0.464, 0.750, 1.371 max_d=1.371 avg_d=0.464 std_dev=0.287
C4	B	0, 0.056, 0.352, 0.647, 1.288 max_d=1.288 avg_d=0.352 std_dev=0.296
N3	B	0, 0.131, 0.429, 0.726, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.429 std_dev=0.298
C2'	A	0, -0.064, 0.240, 0.543, 1.392 max_d=1.392 avg_d=0.240 std_dev=0.303
O6	B	0, 0.159, 0.465, 0.770, 1.276 max_d=1.276 avg_d=0.465 std_dev=0.305
C8	B	0, 0.107, 0.425, 0.742, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.425 std_dev=0.318
C4'	A	0, -0.025, 0.297, 0.618, 1.558 max_d=1.558 avg_d=0.297 std_dev=0.321
N2	B	0, 0.262, 0.584, 0.906, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.584 std_dev=0.322
N9	B	0, 0.083, 0.408, 0.733, 1.254 max_d=1.254 avg_d=0.408 std_dev=0.325
C1'	B	0, 0.177, 0.539, 0.901, 1.365 max_d=1.365 avg_d=0.539 std_dev=0.362
O5'	A	0, 0.189, 0.561, 0.932, 1.484 max_d=1.484 avg_d=0.561 std_dev=0.372
C2'	B	0, 0.219, 0.593, 0.967, 1.347 max_d=1.347 avg_d=0.593 std_dev=0.374
O4'	B	0, 0.222, 0.606, 0.991, 1.464 max_d=1.464 avg_d=0.606 std_dev=0.384
P	A	0, 0.244, 0.633, 1.023, 1.622 max_d=1.622 avg_d=0.633 std_dev=0.389
C3'	B	0, 0.223, 0.616, 1.009, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.616 std_dev=0.393
O2'	B	0, 0.245, 0.656, 1.068, 1.420 max_d=1.420 avg_d=0.656 std_dev=0.411
OP2	A	0, 0.271, 0.686, 1.101, 1.849 max_d=1.849 avg_d=0.686 std_dev=0.415
O5'	B	0, 0.193, 0.609, 1.025, 1.661 max_d=1.661 avg_d=0.609 std_dev=0.416
C4'	B	0, 0.235, 0.667, 1.098, 1.502 max_d=1.502 avg_d=0.667 std_dev=0.431
OP1	A	0, 0.254, 0.687, 1.121, 1.599 max_d=1.599 avg_d=0.687 std_dev=0.433
O3'	B	0, 0.239, 0.705, 1.172, 1.733 max_d=1.733 avg_d=0.705 std_dev=0.466
C5'	B	0, 0.226, 0.699, 1.173, 1.851 max_d=1.851 avg_d=0.699 std_dev=0.474
OP2	B	0, 0.133, 0.628, 1.123, 2.100 max_d=2.100 avg_d=0.628 std_dev=0.495
O2'	A	0, -0.096, 0.403, 0.901, 2.355 max_d=2.355 avg_d=0.403 std_dev=0.498
P	B	0, 0.188, 0.689, 1.189, 2.062 max_d=2.062 avg_d=0.689 std_dev=0.501
C5'	A	0, -0.049, 0.516, 1.082, 2.586 max_d=2.586 avg_d=0.516 std_dev=0.566
OP1	B	0, 0.296, 0.885, 1.475, 2.549 max_d=2.549 avg_d=0.885 std_dev=0.589

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.05	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.09	0.00	0.20	0.28	0.10	0.10
C2	0.05	0.00	0.21	0.14	0.02	0.06	0.01	0.06	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.29	0.13	0.09	0.25	0.29	0.13	0.15
C2'	0.01	0.21	0.00	0.01	0.11	0.02	0.06	0.08	0.10	0.09	0.17	0.21	0.07	0.06	0.02	0.00	0.02	0.01	0.39	0.22	0.32	0.25
C3'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.07	0.01	0.04	0.01	0.06	0.06	0.11	0.13	0.05	0.04	0.02	0.02	0.01	0.01	0.23	0.17	0.26	0.13
C4	0.02	0.02	0.11	0.07	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.08	0.05	0.26	0.30	0.13	0.15
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.05	0.06	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.22	0.11	0.06
C5	0.01	0.01	0.06	0.04	0.00	0.02	0.00	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.07	0.07	0.03	0.29	0.30	0.17	0.19
C5'	0.04	0.06	0.08	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.08	0.10	0.07	0.06	0.10	0.11	0.06	0.07	0.04	0.01	0.01	0.11	0.22	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.06	0.01	0.02	0.01	0.08	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.12	0.08	0.04	0.29	0.29	0.17	0.19
C8	0.01	0.03	0.09	0.06	0.01	0.04	0.01	0.10	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.00	0.00	0.13	0.08	0.06	0.30	0.30	0.16	0.19
N1	0.05	0.01	0.17	0.11	0.02	0.05	0.01	0.07	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.22	0.11	0.07	0.27	0.30	0.15	0.17
N3	0.05	0.01	0.21	0.13	0.01	0.06	0.01	0.06	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.29	0.12	0.09	0.23	0.29	0.12	0.14
N6	0.02	0.02	0.07	0.05	0.01	0.03	0.02	0.10	0.01	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.09	0.07	0.04	0.31	0.29	0.20	0.22
N7	0.01	0.02	0.06	0.04	0.01	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.10	0.07	0.03	0.31	0.29	0.19	0.21
N9	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.07	0.01	0.26	0.30	0.13	0.14
O2'	0.01	0.29	0.00	0.02	0.13	0.02	0.07	0.07	0.12	0.13	0.22	0.29	0.09	0.10	0.03	0.00	0.05	0.02	0.40	0.24	0.33	0.28
O3'	0.09	0.13	0.02	0.01	0.08	0.02	0.07	0.04	0.08	0.08	0.11	0.12	0.07	0.07	0.07	0.05	0.00	0.07	0.12	0.20	0.18	0.06
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.06	0.07	0.09	0.04	0.03	0.01	0.02	0.07	0.00	0.08	0.34	0.08	0.16
O5'	0.20	0.25	0.39	0.23	0.26	0.01	0.29	0.01	0.29	0.30	0.27	0.23	0.31	0.31	0.26	0.40	0.12	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.28	0.29	0.22	0.17	0.30	0.22	0.30	0.11	0.29	0.30	0.30	0.29	0.29	0.29	0.30	0.24	0.20	0.34	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.13	0.32	0.26	0.13	0.11	0.17	0.22	0.17	0.16	0.15	0.12	0.20	0.19	0.13	0.33	0.18	0.08	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.10	0.15	0.25	0.13	0.15	0.06	0.19	0.02	0.19	0.19	0.17	0.14	0.22	0.21	0.14	0.28	0.06	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.14	0.09	0.08	0.12	0.11	0.17	0.13	0.20	0.20	0.18	0.15	0.11	0.22	0.13	0.11	0.07	0.13	0.16	0.26	0.17	0.21	0.17
C2	0.19	0.17	0.16	0.15	0.17	0.16	0.19	0.15	0.18	0.23	0.18	0.18	0.16	0.23	0.20	0.16	0.13	0.20	0.16	0.20	0.24	0.23	0.20
C2'	0.17	0.18	0.15	0.20	0.17	0.24	0.21	0.25	0.24	0.23	0.22	0.18	0.15	0.24	0.18	0.15	0.22	0.24	0.26	0.29	0.19	0.24	0.22
C3'	0.13	0.18	0.12	0.09	0.17	0.11	0.21	0.15	0.24	0.20	0.22	0.18	0.16	0.23	0.15	0.12	0.12	0.14	0.18	0.28	0.20	0.25	0.19
C4	0.17	0.13	0.14	0.15	0.13	0.16	0.14	0.14	0.14	0.23	0.15	0.14	0.12	0.21	0.18	0.14	0.14	0.18	0.14	0.18	0.18	0.17	0.15
C4'	0.22	0.19	0.24	0.21	0.19	0.20	0.19	0.21	0.20	0.22	0.19	0.19	0.19	0.21	0.21	0.24	0.19	0.20	0.20	0.24	0.28	0.24	0.23
C5	0.21	0.12	0.19	0.20	0.18	0.20	0.18	0.17	0.12	0.26	0.12	0.14	0.14	0.24	0.22	0.18	0.19	0.22	0.16	0.13	0.17	0.17	0.16
C5'	0.31	0.21	0.30	0.31	0.25	0.33	0.24	0.35	0.22	0.31	0.20	0.20	0.23	0.27	0.29	0.28	0.25	0.33	0.33	0.23	0.40	0.32	0.35
C6	0.23	0.17	0.21	0.21	0.22	0.21	0.22	0.17	0.17	0.27	0.15	0.16	0.19	0.26	0.24	0.21	0.20	0.23	0.16	0.16	0.18	0.20	0.17
C8	0.18	0.13	0.16	0.20	0.14	0.20	0.16	0.19	0.16	0.26	0.16	0.15	0.11	0.23	0.20	0.14	0.20	0.20	0.19	0.20	0.19	0.19	0.19
N1	0.22	0.19	0.19	0.18	0.21	0.19	0.23	0.16	0.20	0.26	0.18	0.19	0.19	0.26	0.23	0.19	0.17	0.22	0.17	0.20	0.22	0.23	0.19
N3	0.16	0.15	0.13	0.13	0.14	0.14	0.15	0.13	0.16	0.21	0.17	0.16	0.13	0.20	0.17	0.14	0.11	0.17	0.14	0.20	0.22	0.19	0.17
N6	0.27	0.21	0.25	0.24	0.26	0.24	0.26	0.20	0.22	0.28	0.19	0.20	0.24	0.27	0.27	0.25	0.25	0.26	0.17	0.21	0.18	0.21	0.17
N7	0.23	0.12	0.21	0.24	0.17	0.23	0.17	0.20	0.14	0.27	0.13	0.14	0.13	0.23	0.24	0.19	0.23	0.23	0.18	0.15	0.18	0.17	0.17
N9	0.14	0.13	0.12	0.14	0.11	0.15	0.14	0.14	0.17	0.22	0.16	0.15	0.10	0.21	0.15	0.12	0.12	0.16	0.15	0.22	0.17	0.17	0.16
O2'	0.39	0.28	0.30	0.36	0.33	0.44	0.35	0.46	0.34	0.45	0.30	0.25	0.29	0.42	0.38	0.29	0.32	0.48	0.49	0.38	0.33	0.45	0.44
O3'	0.13	0.18	0.11	0.10	0.17	0.14	0.22	0.18	0.25	0.22	0.22	0.17	0.15	0.25	0.16	0.11	0.13	0.17	0.22	0.31	0.25	0.31	0.24
O4'	0.23	0.18	0.26	0.22	0.17	0.20	0.15	0.18	0.17	0.20	0.17	0.20	0.19	0.18	0.19	0.29	0.21	0.20	0.17	0.21	0.24	0.20	0.18
O5'	0.15	0.24	0.14	0.11	0.24	0.14	0.30	0.22	0.32	0.28	0.29	0.21	0.20	0.32	0.22	0.14	0.01	0.16	0.26	0.37	0.27	0.32	0.26
OP1	0.17	0.19	0.18	0.08	0.16	0.09	0.16	0.06	0.18	0.16	0.20	0.21	0.18	0.16	0.15	0.27	0.01	0.13	0.09	0.17	0.16	0.16	0.12
OP2	0.07	0.15	0.12	0.02	0.07	0.05	0.09	0.16	0.11	0.12	0.12	0.20	0.14	0.14	0.05	0.21	0.02	0.03	0.21	0.15	0.29	0.30	0.26
P	0.06	0.11	0.09	0.01	0.07	0.03	0.10	0.09	0.12	0.11	0.12	0.14	0.09	0.13	0.06	0.16	0.01	0.02	0.12	0.15	0.16	0.17	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.02	0.04	0.06	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.06	0.03	0.06	0.09	0.06
C2	0.05	0.00	0.12	0.09	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.15	0.12	0.03	0.11	0.01	0.14	0.23	0.16
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.06	0.01	0.05	0.02	0.07	0.05	0.10	0.14	0.11	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.07	0.08	0.09	0.07
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.08	0.09	0.08	0.11	0.08	0.09	0.04	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.09	0.09	0.07
C4	0.02	0.01	0.06	0.05	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.07	0.07	0.02	0.11	0.02	0.13	0.20	0.14
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.07	0.04	0.05	0.04	0.08	0.03	0.05	0.02	0.01	0.01	0.09	0.06	0.03	0.03
C5	0.01	0.02	0.05	0.07	0.01	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.08	0.03	0.14	0.02	0.19	0.26	0.20
C5'	0.03	0.06	0.02	0.02	0.07	0.01	0.12	0.00	0.13	0.12	0.10	0.05	0.05	0.14	0.07	0.05	0.05	0.02	0.01	0.17	0.06	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.07	0.08	0.01	0.06	0.01	0.13	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.02	0.08	0.10	0.04	0.16	0.01	0.22	0.30	0.23
C8	0.02	0.01	0.05	0.09	0.01	0.07	0.01	0.12	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.10	0.03	0.13	0.04	0.15	0.18	0.16
N1	0.04	0.01	0.10	0.08	0.02	0.04	0.01	0.10	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.13	0.11	0.03	0.14	0.01	0.19	0.28	0.20
N2	0.06	0.01	0.14	0.11	0.02	0.05	0.02	0.05	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.03	0.02	0.19	0.16	0.04	0.10	0.02	0.12	0.22	0.15
N3	0.05	0.01	0.11	0.08	0.01	0.04	0.01	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.14	0.11	0.03	0.10	0.02	0.11	0.19	0.12
N7	0.01	0.02	0.04	0.09	0.01	0.08	0.01	0.14	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.03	0.11	0.03	0.16	0.05	0.21	0.26	0.21
N9	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.07	0.02	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.10	0.03	0.10	0.15	0.11
O2'	0.01	0.15	0.00	0.01	0.07	0.05	0.05	0.05	0.08	0.04	0.13	0.19	0.14	0.03	0.02	0.00	0.04	0.03	0.04	0.07	0.08	0.07	0.05
O3'	0.02	0.12	0.02	0.01	0.07	0.02	0.08	0.05	0.10	0.10	0.11	0.16	0.11	0.11	0.04	0.04	0.00	0.02	0.12	0.13	0.12	0.13	0.12
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.03	0.03	0.04	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.00	0.06	0.06	0.06	0.07	0.06
O5'	0.06	0.11	0.05	0.07	0.11	0.01	0.14	0.01	0.16	0.13	0.14	0.10	0.10	0.16	0.10	0.04	0.12	0.06	0.00	0.19	0.02	0.01	0.01
O6	0.03	0.01	0.07	0.11	0.02	0.09	0.02	0.17	0.01	0.04	0.01	0.02	0.02	0.05	0.03	0.07	0.13	0.06	0.19	0.00	0.28	0.36	0.28
OP1	0.06	0.14	0.08	0.09	0.13	0.06	0.19	0.06	0.22	0.15	0.19	0.12	0.11	0.21	0.10	0.08	0.12	0.06	0.02	0.28	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.23	0.09	0.09	0.20	0.03	0.26	0.02	0.30	0.18	0.28	0.22	0.19	0.26	0.15	0.07	0.13	0.07	0.01	0.36	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.16	0.07	0.07	0.14	0.03	0.20	0.02	0.23	0.16	0.20	0.15	0.12	0.21	0.11	0.05	0.12	0.06	0.01	0.28	0.01	0.01	0.00