Doublet Group distance statistics: 53879

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 4, 1, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.016 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.015, 0.026, 0.037, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.026 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.009, 0.023, 0.038, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.023 std_dev=0.015
C2	A	0, 0.004, 0.019, 0.034, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.019 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.008, 0.025, 0.043, 0.051 max_d=0.051 avg_d=0.025 std_dev=0.017
C4	A	0, 0.004, 0.022, 0.040, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.022 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.019, 0.037, 0.056, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.037 std_dev=0.019
N3	A	0, 0.008, 0.027, 0.046, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N9	A	0, 0.007, 0.031, 0.056, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.031 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.008, 0.043, 0.079, 0.128 max_d=0.128 avg_d=0.043 std_dev=0.036
C2'	A	0, 0.120, 0.283, 0.447, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.283 std_dev=0.164
O4'	A	0, 0.105, 0.300, 0.494, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.300 std_dev=0.195
N1	B	0, 0.322, 0.531, 0.741, 0.853 max_d=0.853 avg_d=0.531 std_dev=0.209
N2	B	0, 0.281, 0.491, 0.701, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.491 std_dev=0.210
C2	B	0, 0.219, 0.440, 0.661, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.440 std_dev=0.221
C6	B	0, 0.353, 0.603, 0.852, 1.000 max_d=1.000 avg_d=0.603 std_dev=0.250
N3	B	0, 0.167, 0.423, 0.678, 0.844 max_d=0.844 avg_d=0.423 std_dev=0.256
C3'	A	0, 0.168, 0.428, 0.687, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.428 std_dev=0.259
O2'	A	0, 0.302, 0.563, 0.823, 0.931 max_d=0.931 avg_d=0.563 std_dev=0.261
C4	B	0, 0.200, 0.468, 0.736, 0.885 max_d=0.885 avg_d=0.468 std_dev=0.268
C5	B	0, 0.277, 0.552, 0.827, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.552 std_dev=0.275
O5'	A	0, 0.254, 0.536, 0.817, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.536 std_dev=0.282
C3'	B	0, 0.323, 0.614, 0.905, 1.043 max_d=1.043 avg_d=0.614 std_dev=0.291
C1'	B	0, 0.357, 0.651, 0.945, 0.997 max_d=0.997 avg_d=0.651 std_dev=0.294
C4'	A	0, 0.186, 0.485, 0.785, 1.242 max_d=1.242 avg_d=0.485 std_dev=0.300
O6	B	0, 0.455, 0.757, 1.058, 1.134 max_d=1.134 avg_d=0.757 std_dev=0.302
N9	B	0, 0.246, 0.553, 0.859, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.553 std_dev=0.306
C2'	B	0, 0.445, 0.771, 1.098, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.771 std_dev=0.327
N7	B	0, 0.332, 0.666, 0.999, 1.199 max_d=1.199 avg_d=0.666 std_dev=0.333
O3'	B	0, 0.365, 0.701, 1.037, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.701 std_dev=0.336
C8	B	0, 0.280, 0.632, 0.984, 1.198 max_d=1.198 avg_d=0.632 std_dev=0.352
OP2	B	0, 0.411, 0.794, 1.176, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.794 std_dev=0.382
O4'	B	0, 0.379, 0.766, 1.154, 1.388 max_d=1.388 avg_d=0.766 std_dev=0.387
C4'	B	0, 0.339, 0.727, 1.116, 1.265 max_d=1.265 avg_d=0.727 std_dev=0.388
P	B	0, 0.213, 0.613, 1.012, 1.148 max_d=1.148 avg_d=0.613 std_dev=0.400
O3'	A	0, 0.078, 0.535, 0.992, 1.774 max_d=1.774 avg_d=0.535 std_dev=0.457
OP1	B	0, 0.449, 0.919, 1.388, 1.832 max_d=1.832 avg_d=0.919 std_dev=0.469
O5'	B	0, 0.527, 0.998, 1.469, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.998 std_dev=0.471
OP2	A	0, 0.338, 0.815, 1.291, 1.653 max_d=1.653 avg_d=0.815 std_dev=0.476
P	A	0, 0.087, 0.572, 1.057, 1.417 max_d=1.417 avg_d=0.572 std_dev=0.485
C5'	A	0, 0.340, 0.849, 1.358, 2.114 max_d=2.114 avg_d=0.849 std_dev=0.509
O2'	B	0, 0.583, 1.096, 1.609, 2.101 max_d=2.101 avg_d=1.096 std_dev=0.513
OP1	A	0, 0.174, 0.803, 1.432, 1.850 max_d=1.850 avg_d=0.803 std_dev=0.629
C5'	B	0, 0.213, 0.924, 1.635, 2.334 max_d=2.334 avg_d=0.924 std_dev=0.711

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.09	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.20	0.01	0.13	0.15	0.24	0.14
C2	0.04	0.00	0.08	0.02	0.02	0.16	0.02	0.29	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.23	0.29	0.19	0.23	0.21	0.36	0.18
C2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.04	0.03	0.03	0.10	0.03	0.10	0.05	0.09	0.04	0.08	0.02	0.01	0.06	0.02	0.30	0.23	0.25	0.25
C3'	0.02	0.02	0.01	0.00	0.04	0.01	0.09	0.02	0.09	0.15	0.05	0.03	0.12	0.15	0.07	0.02	0.01	0.02	0.29	0.30	0.28	0.27
C4	0.02	0.02	0.04	0.04	0.00	0.10	0.01	0.26	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.15	0.19	0.09	0.22	0.20	0.38	0.20
C4'	0.01	0.16	0.03	0.01	0.10	0.00	0.14	0.01	0.15	0.18	0.16	0.14	0.17	0.18	0.10	0.03	0.04	0.01	0.01	0.11	0.15	0.03
C5	0.02	0.02	0.03	0.09	0.01	0.14	0.00	0.35	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.16	0.12	0.04	0.27	0.25	0.45	0.25
C5'	0.09	0.29	0.10	0.02	0.26	0.01	0.35	0.00	0.36	0.37	0.34	0.24	0.41	0.40	0.24	0.09	0.05	0.03	0.01	0.10	0.23	0.02
C6	0.02	0.01	0.03	0.09	0.01	0.15	0.01	0.36	0.00	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.18	0.15	0.08	0.29	0.25	0.46	0.26
C8	0.03	0.03	0.10	0.15	0.02	0.18	0.02	0.37	0.03	0.00	0.05	0.02	0.05	0.01	0.01	0.22	0.09	0.11	0.28	0.30	0.45	0.28
N1	0.03	0.01	0.05	0.05	0.03	0.16	0.03	0.34	0.01	0.05	0.00	0.02	0.02	0.03	0.04	0.20	0.23	0.15	0.26	0.23	0.40	0.21
N3	0.04	0.01	0.09	0.03	0.01	0.14	0.01	0.24	0.02	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.23	0.30	0.18	0.20	0.20	0.34	0.17
N6	0.02	0.02	0.04	0.12	0.02	0.17	0.02	0.41	0.00	0.05	0.02	0.02	0.00	0.05	0.03	0.18	0.11	0.05	0.33	0.30	0.53	0.32
N7	0.02	0.02	0.08	0.15	0.01	0.18	0.01	0.40	0.02	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.21	0.08	0.06	0.31	0.30	0.49	0.31
N9	0.01	0.03	0.02	0.07	0.01	0.10	0.02	0.24	0.02	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.00	0.11	0.12	0.01	0.20	0.21	0.36	0.21
O2'	0.02	0.23	0.01	0.02	0.15	0.03	0.16	0.09	0.18	0.22	0.20	0.23	0.18	0.21	0.11	0.00	0.06	0.07	0.33	0.27	0.33	0.29
O3'	0.20	0.29	0.06	0.01	0.19	0.04	0.12	0.05	0.15	0.09	0.23	0.30	0.11	0.08	0.12	0.06	0.00	0.13	0.23	0.47	0.38	0.33
O4'	0.01	0.19	0.02	0.02	0.09	0.01	0.04	0.03	0.08	0.11	0.15	0.18	0.05	0.06	0.01	0.07	0.13	0.00	0.17	0.10	0.30	0.19
O5'	0.13	0.23	0.30	0.29	0.22	0.01	0.27	0.01	0.29	0.28	0.26	0.20	0.33	0.31	0.20	0.33	0.23	0.17	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.15	0.21	0.23	0.30	0.20	0.11	0.25	0.10	0.25	0.30	0.23	0.20	0.30	0.30	0.21	0.27	0.47	0.10	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.24	0.36	0.25	0.28	0.38	0.15	0.45	0.23	0.46	0.45	0.40	0.34	0.53	0.49	0.36	0.33	0.38	0.30	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.14	0.18	0.25	0.27	0.20	0.03	0.25	0.02	0.26	0.28	0.21	0.17	0.32	0.31	0.21	0.29	0.33	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.27	0.19	0.24	0.43	0.25	0.45	0.24	0.56	0.20	0.29	0.18	0.18	0.23	0.27	0.28	0.24	0.47	0.36	0.41	0.22	0.45	0.46	0.40
C2	0.20	0.18	0.19	0.33	0.17	0.22	0.11	0.29	0.11	0.14	0.11	0.20	0.22	0.12	0.18	0.17	0.38	0.20	0.25	0.18	0.26	0.29	0.19
C2'	0.30	0.20	0.28	0.49	0.23	0.53	0.22	0.66	0.23	0.31	0.22	0.20	0.21	0.27	0.28	0.26	0.53	0.43	0.49	0.29	0.56	0.54	0.49
C3'	0.19	0.18	0.18	0.32	0.18	0.38	0.19	0.52	0.20	0.21	0.19	0.18	0.18	0.21	0.19	0.26	0.38	0.30	0.39	0.23	0.47	0.44	0.39
C4	0.22	0.17	0.21	0.39	0.20	0.32	0.15	0.39	0.13	0.18	0.12	0.16	0.21	0.16	0.21	0.20	0.42	0.23	0.29	0.18	0.31	0.34	0.25
C4'	0.20	0.15	0.24	0.22	0.17	0.27	0.17	0.39	0.16	0.22	0.15	0.16	0.16	0.21	0.19	0.40	0.27	0.20	0.30	0.18	0.37	0.39	0.32
C5	0.21	0.13	0.19	0.36	0.16	0.27	0.11	0.32	0.13	0.15	0.11	0.14	0.18	0.12	0.19	0.21	0.41	0.18	0.24	0.18	0.27	0.30	0.20
C5'	0.40	0.27	0.47	0.24	0.33	0.23	0.35	0.27	0.30	0.45	0.27	0.26	0.29	0.43	0.38	0.63	0.23	0.25	0.43	0.29	0.45	0.51	0.45
C6	0.22	0.13	0.16	0.30	0.14	0.17	0.11	0.22	0.14	0.14	0.14	0.15	0.18	0.12	0.18	0.19	0.37	0.18	0.20	0.19	0.24	0.26	0.14
C8	0.25	0.13	0.23	0.43	0.19	0.42	0.14	0.51	0.12	0.22	0.10	0.13	0.18	0.18	0.23	0.27	0.46	0.31	0.32	0.18	0.36	0.37	0.30
N1	0.21	0.12	0.17	0.30	0.14	0.18	0.07	0.24	0.10	0.13	0.09	0.15	0.19	0.09	0.17	0.18	0.36	0.21	0.23	0.17	0.25	0.26	0.16
N3	0.21	0.21	0.20	0.36	0.20	0.28	0.17	0.36	0.16	0.18	0.16	0.21	0.23	0.17	0.20	0.17	0.41	0.21	0.28	0.19	0.29	0.33	0.23
N6	0.28	0.18	0.12	0.22	0.20	0.10	0.18	0.11	0.19	0.22	0.19	0.20	0.20	0.20	0.24	0.23	0.32	0.24	0.18	0.22	0.24	0.25	0.13
N7	0.23	0.13	0.21	0.39	0.17	0.34	0.14	0.40	0.15	0.19	0.12	0.14	0.18	0.17	0.21	0.27	0.44	0.23	0.25	0.20	0.29	0.30	0.22
N9	0.25	0.16	0.23	0.42	0.22	0.40	0.19	0.49	0.14	0.24	0.12	0.15	0.21	0.21	0.25	0.23	0.45	0.31	0.34	0.18	0.37	0.39	0.32
O2'	0.56	0.34	0.50	0.71	0.43	0.78	0.41	0.91	0.36	0.60	0.36	0.34	0.38	0.54	0.53	0.43	0.73	0.70	0.77	0.42	0.83	0.83	0.79
O3'	0.32	0.39	0.26	0.40	0.36	0.47	0.37	0.60	0.39	0.35	0.40	0.40	0.36	0.37	0.34	0.29	0.43	0.42	0.50	0.40	0.57	0.55	0.51
O4'	0.26	0.20	0.25	0.37	0.22	0.39	0.20	0.51	0.19	0.26	0.20	0.20	0.21	0.23	0.25	0.34	0.42	0.31	0.32	0.24	0.37	0.41	0.33
O5'	0.19	0.19	0.24	0.10	0.22	0.21	0.29	0.41	0.30	0.33	0.25	0.17	0.17	0.36	0.24	0.43	0.20	0.22	0.20	0.36	0.26	0.25	0.18
OP1	0.46	0.28	0.50	0.37	0.38	0.40	0.41	0.46	0.36	0.54	0.30	0.23	0.32	0.50	0.46	0.61	0.33	0.47	0.41	0.38	0.49	0.56	0.48
OP2	0.61	0.56	0.69	0.50	0.61	0.42	0.60	0.39	0.56	0.65	0.56	0.54	0.58	0.62	0.63	0.75	0.41	0.52	0.28	0.54	0.22	0.29	0.22
P	0.37	0.28	0.44	0.26	0.35	0.26	0.37	0.35	0.35	0.45	0.31	0.25	0.30	0.44	0.39	0.58	0.25	0.33	0.20	0.37	0.26	0.31	0.22

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.06	0.03	0.02	0.05	0.07	0.05	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.22	0.03	0.22	0.33	0.20
C2	0.05	0.00	0.26	0.23	0.02	0.07	0.02	0.19	0.02	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.04	0.28	0.26	0.12	0.24	0.03	0.21	0.33	0.20
C2'	0.01	0.26	0.00	0.01	0.13	0.02	0.08	0.03	0.13	0.13	0.21	0.32	0.26	0.08	0.02	0.01	0.02	0.01	0.14	0.11	0.19	0.24	0.12
C3'	0.02	0.23	0.01	0.00	0.13	0.01	0.11	0.03	0.14	0.11	0.19	0.27	0.21	0.09	0.07	0.04	0.01	0.02	0.25	0.13	0.25	0.19	0.20
C4	0.02	0.02	0.13	0.13	0.00	0.05	0.01	0.18	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.13	0.13	0.07	0.26	0.02	0.22	0.33	0.21
C4'	0.01	0.07	0.02	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.07	0.11	0.06	0.09	0.06	0.11	0.05	0.14	0.04	0.00	0.03	0.08	0.15	0.20	0.06
C5	0.02	0.02	0.08	0.11	0.01	0.08	0.00	0.24	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.02	0.10	0.11	0.05	0.29	0.01	0.24	0.32	0.22
C5'	0.06	0.19	0.03	0.03	0.18	0.01	0.24	0.00	0.25	0.23	0.22	0.18	0.16	0.26	0.16	0.12	0.10	0.03	0.02	0.27	0.23	0.18	0.03
C6	0.03	0.02	0.13	0.14	0.01	0.07	0.01	0.25	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.15	0.17	0.06	0.29	0.01	0.24	0.31	0.22
C8	0.02	0.04	0.13	0.11	0.01	0.11	0.01	0.23	0.02	0.00	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.12	0.11	0.06	0.31	0.02	0.26	0.33	0.24
N1	0.05	0.01	0.21	0.19	0.02	0.06	0.02	0.22	0.01	0.03	0.00	0.02	0.02	0.02	0.03	0.23	0.23	0.10	0.26	0.02	0.22	0.32	0.21
N2	0.07	0.01	0.32	0.27	0.03	0.09	0.03	0.18	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.03	0.04	0.36	0.32	0.14	0.24	0.04	0.20	0.33	0.20
N3	0.05	0.01	0.26	0.21	0.01	0.06	0.02	0.16	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.27	0.22	0.11	0.24	0.02	0.21	0.34	0.20
N7	0.02	0.03	0.08	0.09	0.01	0.11	0.00	0.26	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.11	0.09	0.05	0.32	0.01	0.26	0.32	0.24
N9	0.01	0.04	0.02	0.07	0.01	0.05	0.02	0.16	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.00	0.04	0.04	0.02	0.26	0.02	0.24	0.34	0.21
O2'	0.03	0.28	0.01	0.04	0.13	0.14	0.10	0.12	0.15	0.12	0.23	0.36	0.27	0.11	0.04	0.00	0.06	0.09	0.10	0.14	0.20	0.19	0.11
O3'	0.03	0.26	0.02	0.01	0.13	0.04	0.11	0.10	0.17	0.11	0.23	0.32	0.22	0.09	0.04	0.06	0.00	0.04	0.35	0.17	0.31	0.17	0.27
O4'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.03	0.06	0.06	0.10	0.14	0.11	0.05	0.02	0.09	0.04	0.00	0.33	0.05	0.30	0.43	0.29
O5'	0.22	0.24	0.14	0.25	0.26	0.03	0.29	0.02	0.29	0.31	0.26	0.24	0.24	0.32	0.26	0.10	0.35	0.33	0.00	0.32	0.01	0.02	0.02
O6	0.03	0.03	0.11	0.13	0.02	0.08	0.01	0.27	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.01	0.02	0.14	0.17	0.05	0.32	0.00	0.26	0.30	0.24
OP1	0.22	0.21	0.19	0.25	0.22	0.15	0.24	0.23	0.24	0.26	0.22	0.20	0.21	0.26	0.24	0.20	0.31	0.30	0.01	0.26	0.00	0.01	0.01
OP2	0.33	0.33	0.24	0.19	0.33	0.20	0.32	0.18	0.31	0.33	0.32	0.33	0.34	0.32	0.34	0.19	0.17	0.43	0.02	0.30	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.20	0.12	0.20	0.21	0.06	0.22	0.03	0.22	0.24	0.21	0.20	0.20	0.24	0.21	0.11	0.27	0.29	0.02	0.24	0.01	0.01	0.00