Doublet Group distance statistics: 53880

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 2, 0, 2, 2, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.015, 0.025, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.011, 0.023, 0.034, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.023 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.011, 0.023, 0.034, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.023 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.009, 0.023, 0.036, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.023 std_dev=0.013
N1	A	0, 0.021, 0.036, 0.051, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.036 std_dev=0.015
N3	A	0, 0.028, 0.046, 0.063, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.046 std_dev=0.018
C4	A	0, 0.021, 0.038, 0.056, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.038 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.035, 0.060, 0.085, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.060 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.024, 0.049, 0.074, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.049 std_dev=0.025
N7	A	0, 0.045, 0.085, 0.124, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.085 std_dev=0.039
O4'	A	0, 0.044, 0.091, 0.138, 0.157 max_d=0.157 avg_d=0.091 std_dev=0.047
C8	A	0, 0.073, 0.125, 0.178, 0.186 max_d=0.186 avg_d=0.125 std_dev=0.053
C4'	A	0, 0.070, 0.161, 0.252, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.161 std_dev=0.091
C2'	A	0, 0.066, 0.163, 0.260, 0.332 max_d=0.332 avg_d=0.163 std_dev=0.097
C3'	A	0, 0.079, 0.198, 0.318, 0.383 max_d=0.383 avg_d=0.198 std_dev=0.120
O2'	A	0, 0.141, 0.286, 0.432, 0.524 max_d=0.524 avg_d=0.286 std_dev=0.146
C5'	A	0, 0.091, 0.253, 0.414, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.253 std_dev=0.161
P	A	0, 0.082, 0.259, 0.435, 0.564 max_d=0.564 avg_d=0.259 std_dev=0.177
O3'	A	0, 0.120, 0.322, 0.524, 0.726 max_d=0.726 avg_d=0.322 std_dev=0.202
OP1	A	0, 0.106, 0.356, 0.605, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.356 std_dev=0.249
C2	B	0, 0.328, 0.614, 0.899, 1.050 max_d=1.050 avg_d=0.614 std_dev=0.286
C6	B	0, 0.286, 0.574, 0.861, 1.058 max_d=1.058 avg_d=0.574 std_dev=0.288
N1	B	0, 0.289, 0.579, 0.869, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.579 std_dev=0.290
C5	B	0, 0.353, 0.648, 0.943, 1.133 max_d=1.133 avg_d=0.648 std_dev=0.295
N3	B	0, 0.345, 0.644, 0.942, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.644 std_dev=0.299
O6	B	0, 0.266, 0.565, 0.864, 1.072 max_d=1.072 avg_d=0.565 std_dev=0.299
C4	B	0, 0.360, 0.664, 0.967, 1.109 max_d=1.109 avg_d=0.664 std_dev=0.304
O2'	B	0, 0.400, 0.706, 1.012, 1.138 max_d=1.138 avg_d=0.706 std_dev=0.306
N2	B	0, 0.405, 0.714, 1.022, 1.143 max_d=1.143 avg_d=0.714 std_dev=0.308
O5'	A	0, 0.033, 0.354, 0.675, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.354 std_dev=0.321
N7	B	0, 0.416, 0.745, 1.073, 1.268 max_d=1.268 avg_d=0.745 std_dev=0.328
C2'	B	0, 0.377, 0.709, 1.040, 1.183 max_d=1.183 avg_d=0.709 std_dev=0.332
N9	B	0, 0.432, 0.777, 1.123, 1.224 max_d=1.224 avg_d=0.777 std_dev=0.345
OP2	A	0, 0.066, 0.413, 0.761, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.413 std_dev=0.348
C8	B	0, 0.465, 0.826, 1.188, 1.320 max_d=1.320 avg_d=0.826 std_dev=0.361
C1'	B	0, 0.462, 0.838, 1.213, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.838 std_dev=0.375
C3'	B	0, 0.349, 0.732, 1.114, 1.238 max_d=1.238 avg_d=0.732 std_dev=0.382
O3'	B	0, 0.292, 0.718, 1.143, 1.402 max_d=1.402 avg_d=0.718 std_dev=0.425
O4'	B	0, 0.505, 0.942, 1.379, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.942 std_dev=0.437
C4'	B	0, 0.480, 0.919, 1.358, 1.379 max_d=1.379 avg_d=0.919 std_dev=0.439
O5'	B	0, 0.518, 0.995, 1.472, 1.604 max_d=1.604 avg_d=0.995 std_dev=0.477
C5'	B	0, 0.527, 1.013, 1.498, 1.571 max_d=1.571 avg_d=1.013 std_dev=0.485
OP2	B	0, 0.574, 1.073, 1.572, 1.788 max_d=1.788 avg_d=1.073 std_dev=0.499
P	B	0, 0.643, 1.193, 1.743, 2.004 max_d=2.004 avg_d=1.193 std_dev=0.550
OP1	B	0, 0.709, 1.323, 1.937, 2.218 max_d=2.218 avg_d=1.323 std_dev=0.614

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.16	0.27	0.10
C2	0.03	0.00	0.06	0.06	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.10	0.10	0.03	0.08	0.12	0.22	0.09
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.04	0.05	0.05	0.07	0.04	0.05	0.03	0.01	0.03	0.01	0.12	0.19	0.26	0.10
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.04	0.00	0.06	0.02	0.05	0.08	0.05	0.06	0.06	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.21	0.22	0.25	0.10
C4	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.06	0.06	0.02	0.07	0.11	0.23	0.09
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.06	0.01	0.03	0.04	0.06	0.02	0.06	0.03	0.00	0.01	0.23	0.26	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.03	0.10	0.10	0.21	0.08
C5'	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.00	0.07	0.00	0.07	0.09	0.05	0.02	0.09	0.10	0.04	0.05	0.04	0.02	0.01	0.27	0.26	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.06	0.06	0.03	0.10	0.10	0.20	0.07
C8	0.02	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.01	0.09	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.08	0.03	0.11	0.09	0.22	0.08
N1	0.02	0.02	0.05	0.05	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.03	0.09	0.10	0.21	0.08
N3	0.03	0.01	0.07	0.06	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.10	0.10	0.03	0.07	0.13	0.24	0.10
N6	0.02	0.02	0.04	0.06	0.02	0.04	0.01	0.09	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.05	0.07	0.04	0.12	0.11	0.21	0.08
N7	0.01	0.01	0.05	0.08	0.01	0.06	0.00	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.12	0.11	0.21	0.08
N9	0.01	0.01	0.03	0.04	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.04	0.02	0.06	0.12	0.24	0.09
O2'	0.03	0.10	0.01	0.02	0.06	0.06	0.05	0.05	0.06	0.03	0.08	0.10	0.05	0.03	0.03	0.00	0.06	0.06	0.08	0.20	0.27	0.09
O3'	0.02	0.10	0.03	0.01	0.06	0.03	0.06	0.04	0.06	0.08	0.07	0.10	0.07	0.09	0.04	0.06	0.00	0.02	0.23	0.25	0.23	0.08
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.02	0.06	0.02	0.00	0.12	0.17	0.30	0.12
O5'	0.04	0.08	0.12	0.21	0.07	0.01	0.10	0.01	0.10	0.11	0.09	0.07	0.12	0.12	0.06	0.08	0.23	0.12	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.16	0.12	0.19	0.22	0.11	0.23	0.10	0.27	0.10	0.09	0.10	0.13	0.11	0.11	0.12	0.20	0.25	0.17	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.27	0.22	0.26	0.25	0.23	0.26	0.21	0.26	0.20	0.22	0.21	0.24	0.21	0.21	0.24	0.27	0.23	0.30	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.09	0.10	0.10	0.09	0.05	0.08	0.01	0.07	0.08	0.08	0.10	0.08	0.08	0.09	0.09	0.08	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.14	0.13	0.12	0.14	0.14	0.15	0.15	0.16	0.16	0.15	0.15	0.13	0.16	0.14	0.15	0.10	0.14	0.17	0.20	0.23	0.24	0.20
C2	0.21	0.14	0.19	0.17	0.18	0.19	0.16	0.19	0.14	0.20	0.14	0.12	0.17	0.17	0.20	0.22	0.17	0.20	0.19	0.15	0.22	0.22	0.20
C2'	0.15	0.17	0.14	0.12	0.15	0.14	0.15	0.15	0.16	0.14	0.18	0.19	0.16	0.15	0.14	0.16	0.12	0.14	0.16	0.19	0.20	0.23	0.19
C3'	0.10	0.15	0.09	0.08	0.11	0.09	0.11	0.12	0.14	0.11	0.16	0.17	0.13	0.11	0.10	0.11	0.07	0.10	0.14	0.16	0.20	0.23	0.19
C4	0.15	0.11	0.14	0.13	0.13	0.14	0.14	0.15	0.14	0.16	0.13	0.11	0.12	0.15	0.15	0.16	0.11	0.15	0.17	0.17	0.21	0.22	0.19
C4'	0.10	0.13	0.09	0.09	0.10	0.10	0.12	0.12	0.14	0.12	0.15	0.15	0.11	0.13	0.10	0.11	0.07	0.10	0.15	0.17	0.22	0.23	0.20
C5	0.13	0.07	0.12	0.12	0.10	0.13	0.10	0.14	0.09	0.15	0.10	0.09	0.07	0.13	0.13	0.14	0.11	0.13	0.16	0.13	0.21	0.21	0.18
C5'	0.13	0.14	0.11	0.12	0.12	0.13	0.14	0.16	0.15	0.15	0.15	0.15	0.12	0.16	0.13	0.12	0.12	0.13	0.18	0.18	0.26	0.26	0.23
C6	0.16	0.05	0.14	0.14	0.12	0.15	0.11	0.16	0.06	0.18	0.08	0.09	0.08	0.15	0.16	0.16	0.14	0.16	0.18	0.09	0.21	0.21	0.19
C8	0.11	0.10	0.11	0.12	0.09	0.13	0.11	0.14	0.13	0.13	0.13	0.11	0.08	0.13	0.11	0.13	0.10	0.11	0.16	0.18	0.22	0.23	0.19
N1	0.21	0.07	0.18	0.17	0.16	0.18	0.14	0.18	0.10	0.20	0.09	0.06	0.14	0.16	0.20	0.21	0.17	0.20	0.19	0.11	0.22	0.21	0.20
N3	0.19	0.15	0.17	0.15	0.17	0.16	0.16	0.17	0.16	0.18	0.16	0.14	0.17	0.17	0.18	0.20	0.14	0.18	0.18	0.18	0.21	0.22	0.19
N6	0.17	0.12	0.13	0.13	0.14	0.14	0.13	0.15	0.11	0.20	0.13	0.15	0.11	0.17	0.18	0.14	0.14	0.16	0.18	0.11	0.22	0.20	0.19
N7	0.11	0.09	0.11	0.12	0.08	0.12	0.09	0.14	0.12	0.12	0.13	0.11	0.07	0.11	0.10	0.13	0.11	0.11	0.16	0.16	0.21	0.22	0.18
N9	0.13	0.11	0.12	0.12	0.12	0.13	0.13	0.15	0.14	0.15	0.13	0.12	0.11	0.15	0.13	0.15	0.10	0.13	0.17	0.18	0.22	0.23	0.19
O2'	0.18	0.22	0.18	0.16	0.18	0.17	0.17	0.17	0.19	0.16	0.22	0.26	0.21	0.16	0.17	0.20	0.15	0.17	0.18	0.19	0.22	0.24	0.20
O3'	0.11	0.17	0.10	0.08	0.12	0.09	0.10	0.11	0.13	0.09	0.17	0.20	0.15	0.10	0.10	0.12	0.07	0.10	0.12	0.13	0.19	0.22	0.18
O4'	0.13	0.13	0.12	0.12	0.13	0.14	0.15	0.15	0.17	0.15	0.16	0.14	0.12	0.16	0.14	0.15	0.10	0.14	0.17	0.21	0.24	0.24	0.20
O5'	0.15	0.19	0.12	0.14	0.17	0.17	0.19	0.20	0.23	0.18	0.22	0.20	0.16	0.20	0.16	0.13	0.13	0.17	0.22	0.29	0.31	0.31	0.27
OP1	0.10	0.20	0.11	0.12	0.13	0.14	0.14	0.19	0.21	0.12	0.23	0.22	0.15	0.12	0.11	0.11	0.10	0.12	0.21	0.25	0.33	0.31	0.27
OP2	0.28	0.28	0.27	0.30	0.26	0.29	0.27	0.30	0.29	0.29	0.30	0.28	0.26	0.28	0.27	0.26	0.32	0.29	0.31	0.32	0.35	0.33	0.33
P	0.11	0.16	0.11	0.12	0.12	0.12	0.13	0.14	0.17	0.12	0.18	0.17	0.13	0.13	0.11	0.11	0.14	0.12	0.16	0.22	0.26	0.24	0.21

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.03	0.08	0.05
C2	0.02	0.00	0.11	0.11	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.10	0.14	0.02	0.06	0.02	0.07	0.13	0.08
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.03	0.09	0.13	0.10	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.06	0.06	0.04	0.04
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.06	0.00	0.06	0.01	0.08	0.05	0.10	0.13	0.09	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.04	0.08	0.08	0.04	0.05
C4	0.01	0.01	0.06	0.06	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.01	0.05	0.01	0.07	0.13	0.08
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03	0.01	0.04	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.04	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.07	0.01	0.09	0.15	0.11
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.05	0.06	0.03	0.03	0.02	0.07	0.03	0.04	0.04	0.01	0.01	0.06	0.04	0.03	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.08	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.02	0.07	0.01	0.10	0.16	0.11
C8	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.05	0.02	0.07	0.02	0.08	0.13	0.10
N1	0.02	0.01	0.09	0.10	0.01	0.04	0.01	0.03	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.08	0.12	0.03	0.06	0.01	0.09	0.15	0.10
N2	0.03	0.01	0.13	0.13	0.01	0.05	0.01	0.03	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.17	0.02	0.06	0.03	0.07	0.13	0.08
N3	0.02	0.01	0.10	0.09	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.11	0.02	0.05	0.02	0.06	0.12	0.08
N7	0.01	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.05	0.02	0.08	0.02	0.11	0.15	0.12
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.05	0.01	0.06	0.11	0.08
O2'	0.03	0.10	0.01	0.02	0.05	0.04	0.04	0.04	0.06	0.03	0.08	0.12	0.09	0.02	0.03	0.00	0.07	0.03	0.02	0.05	0.06	0.05	0.02
O3'	0.02	0.14	0.02	0.01	0.07	0.03	0.06	0.04	0.09	0.05	0.12	0.17	0.11	0.05	0.03	0.07	0.00	0.02	0.05	0.09	0.11	0.07	0.07
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.05	0.02	0.05	0.10	0.07
O5'	0.03	0.06	0.03	0.04	0.05	0.02	0.07	0.01	0.07	0.07	0.06	0.06	0.05	0.08	0.05	0.02	0.05	0.05	0.00	0.09	0.02	0.03	0.01
O6	0.01	0.02	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.05	0.09	0.02	0.09	0.00	0.12	0.17	0.13
OP1	0.03	0.07	0.06	0.08	0.07	0.03	0.09	0.04	0.10	0.08	0.09	0.07	0.06	0.11	0.06	0.06	0.11	0.05	0.02	0.12	0.00	0.01	0.01
OP2	0.08	0.13	0.04	0.04	0.13	0.04	0.15	0.03	0.16	0.13	0.15	0.13	0.12	0.15	0.11	0.05	0.07	0.10	0.03	0.17	0.01	0.00	0.01
P	0.05	0.08	0.04	0.05	0.08	0.02	0.11	0.01	0.11	0.10	0.10	0.08	0.08	0.12	0.08	0.02	0.07	0.07	0.01	0.13	0.01	0.01	0.00