Doublet Group distance statistics: 53883

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 2, 0, 1, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.010, 0.016, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.010 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.005, 0.015, 0.024, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.005, 0.018, 0.031, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.018 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.006, 0.020, 0.034, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.020 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.008, 0.023, 0.038, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.023 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.010, 0.026, 0.043, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.026 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.008, 0.026, 0.045, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.026 std_dev=0.019
C1'	A	0, 0.000, 0.021, 0.042, 0.067 max_d=0.067 avg_d=0.021 std_dev=0.021
C8	A	0, 0.011, 0.032, 0.054, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.032 std_dev=0.021
C2'	A	0, 0.371, 0.634, 0.897, 0.990 max_d=0.990 avg_d=0.634 std_dev=0.263
C4	B	0, 0.297, 0.570, 0.844, 0.945 max_d=0.945 avg_d=0.570 std_dev=0.274
N3	B	0, 0.145, 0.444, 0.743, 0.937 max_d=0.937 avg_d=0.444 std_dev=0.299
O4'	A	0, 0.242, 0.552, 0.861, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.552 std_dev=0.310
C2	B	0, 0.318, 0.629, 0.941, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.629 std_dev=0.312
O2'	B	0, 0.522, 0.863, 1.203, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.863 std_dev=0.341
N1	B	0, 0.413, 0.789, 1.165, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.789 std_dev=0.376
O2'	A	0, 0.724, 1.172, 1.620, 1.442 max_d=1.442 avg_d=1.172 std_dev=0.448
N9	B	0, 0.433, 0.881, 1.330, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.881 std_dev=0.449
C4'	A	0, 0.558, 1.012, 1.466, 1.650 max_d=1.650 avg_d=1.012 std_dev=0.454
N2	B	0, 0.526, 0.997, 1.469, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.997 std_dev=0.472
C6	B	0, 0.392, 0.871, 1.351, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.871 std_dev=0.479
C1'	B	0, 0.609, 1.101, 1.594, 1.589 max_d=1.589 avg_d=1.101 std_dev=0.492
C5	B	0, 0.257, 0.757, 1.256, 1.241 max_d=1.241 avg_d=0.757 std_dev=0.500
C3'	A	0, 0.198, 0.752, 1.306, 1.695 max_d=1.695 avg_d=0.752 std_dev=0.554
O6	B	0, 0.642, 1.245, 1.849, 1.767 max_d=1.767 avg_d=1.245 std_dev=0.604
C5'	A	0, 1.003, 1.647, 2.291, 2.109 max_d=2.109 avg_d=1.647 std_dev=0.644
C8	B	0, 0.527, 1.188, 1.850, 1.860 max_d=1.860 avg_d=1.188 std_dev=0.662
N7	B	0, 0.501, 1.166, 1.832, 1.777 max_d=1.777 avg_d=1.166 std_dev=0.666
C2'	B	0, 0.417, 1.122, 1.826, 1.723 max_d=1.723 avg_d=1.122 std_dev=0.704
O5'	A	0, 0.972, 1.717, 2.463, 2.378 max_d=2.378 avg_d=1.717 std_dev=0.745
O4'	B	0, 1.217, 2.023, 2.830, 2.602 max_d=2.602 avg_d=2.023 std_dev=0.806
O3'	A	0, 0.218, 1.082, 1.945, 2.574 max_d=2.574 avg_d=1.082 std_dev=0.863
OP2	A	0, 0.818, 1.772, 2.726, 2.770 max_d=2.770 avg_d=1.772 std_dev=0.954
C4'	B	0, 1.532, 2.883, 4.235, 3.938 max_d=3.938 avg_d=2.883 std_dev=1.351
P	A	0, 1.031, 2.406, 3.781, 3.650 max_d=3.650 avg_d=2.406 std_dev=1.375
C3'	B	0, 1.154, 2.674, 4.193, 3.909 max_d=3.909 avg_d=2.674 std_dev=1.520
O5'	B	0, 2.558, 4.154, 5.749, 5.126 max_d=5.126 avg_d=4.154 std_dev=1.596
C5'	B	0, 2.185, 3.799, 5.412, 4.946 max_d=4.946 avg_d=3.799 std_dev=1.613
OP1	A	0, 1.537, 3.302, 5.067, 4.699 max_d=4.699 avg_d=3.302 std_dev=1.765
O3'	B	0, 1.384, 3.275, 5.166, 4.923 max_d=4.923 avg_d=3.275 std_dev=1.891
P	B	0, 3.371, 5.633, 7.896, 7.719 max_d=7.719 avg_d=5.633 std_dev=2.262
OP2	B	0, 3.608, 6.250, 8.892, 9.235 max_d=9.235 avg_d=6.250 std_dev=2.642
OP1	B	0, 4.063, 6.762, 9.462, 9.105 max_d=9.105 avg_d=6.762 std_dev=2.700

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.05	0.03	0.01	0.03	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.29	0.00	0.07	0.40	0.12	0.12
C2	0.04	0.00	0.36	0.33	0.00	0.06	0.01	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.11	0.14	0.23	0.33	1.07	0.15	0.55
C2'	0.00	0.36	0.00	0.00	0.19	0.01	0.08	0.15	0.16	0.19	0.28	0.37	0.10	0.11	0.02	0.00	0.03	0.03	0.35	0.25	0.64	0.39
C3'	0.01	0.33	0.00	0.00	0.31	0.00	0.37	0.01	0.40	0.28	0.38	0.28	0.43	0.35	0.23	0.02	0.01	0.02	0.06	0.33	0.24	0.16
C4	0.02	0.00	0.19	0.31	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.16	0.08	0.12	0.34	1.10	0.14	0.55
C4'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.05	0.00	0.14	0.00	0.11	0.25	0.04	0.08	0.16	0.24	0.10	0.29	0.03	0.00	0.01	0.13	0.17	0.02
C5	0.02	0.01	0.08	0.37	0.00	0.14	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.31	0.12	0.05	0.50	1.51	0.27	0.80
C5'	0.05	0.05	0.15	0.01	0.11	0.00	0.23	0.00	0.22	0.33	0.12	0.05	0.29	0.36	0.14	0.14	0.18	0.00	0.00	0.22	0.39	0.00
C6	0.03	0.00	0.16	0.40	0.01	0.11	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.28	0.13	0.10	0.53	1.59	0.31	0.86
C8	0.01	0.00	0.19	0.28	0.00	0.25	0.00	0.33	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.41	0.12	0.15	0.46	1.42	0.21	0.72
N1	0.03	0.00	0.28	0.38	0.01	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.10	0.18	0.45	1.37	0.25	0.73
N3	0.04	0.00	0.37	0.28	0.00	0.08	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.17	0.23	0.24	0.87	0.09	0.42
N6	0.02	0.00	0.10	0.43	0.01	0.16	0.01	0.29	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.36	0.19	0.06	0.63	1.84	0.41	1.02
N7	0.01	0.01	0.11	0.35	0.00	0.24	0.00	0.36	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.44	0.18	0.08	0.58	1.74	0.33	0.92
N9	0.01	0.00	0.02	0.23	0.00	0.10	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.22	0.07	0.01	0.27	0.96	0.09	0.45
O2'	0.01	0.11	0.00	0.02	0.16	0.29	0.31	0.14	0.28	0.41	0.17	0.12	0.36	0.44	0.22	0.00	0.06	0.21	0.24	0.26	0.59	0.34
O3'	0.29	0.14	0.03	0.01	0.08	0.03	0.12	0.18	0.13	0.12	0.10	0.17	0.19	0.18	0.07	0.06	0.00	0.17	0.17	0.35	0.11	0.06
O4'	0.00	0.23	0.03	0.02	0.12	0.00	0.05	0.00	0.10	0.15	0.18	0.23	0.06	0.08	0.01	0.21	0.17	0.00	0.06	0.43	0.21	0.19
O5'	0.07	0.33	0.35	0.06	0.34	0.01	0.50	0.00	0.53	0.46	0.45	0.24	0.63	0.58	0.27	0.24	0.17	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.40	1.07	0.25	0.33	1.10	0.13	1.51	0.22	1.59	1.42	1.37	0.87	1.84	1.74	0.96	0.26	0.35	0.43	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.15	0.64	0.24	0.14	0.17	0.27	0.39	0.31	0.21	0.25	0.09	0.41	0.33	0.09	0.59	0.11	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.55	0.39	0.16	0.55	0.02	0.80	0.00	0.86	0.72	0.73	0.42	1.02	0.92	0.45	0.34	0.06	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.31	0.13	0.67	1.14	0.10	0.77	0.31	0.73	0.44	0.15	0.28	0.13	0.13	0.41	0.11	0.16	1.25	0.35	0.47	0.65	0.51	0.70	0.53
C2	0.39	0.29	0.68	0.81	0.29	0.48	0.14	0.49	0.10	0.22	0.15	0.31	0.36	0.12	0.32	0.22	0.49	0.27	0.35	0.27	1.01	0.48	0.53
C2'	0.15	0.14	0.32	0.90	0.08	0.59	0.14	0.60	0.16	0.17	0.12	0.18	0.14	0.27	0.09	0.34	1.04	0.25	0.63	0.25	0.64	1.16	0.81
C3'	0.92	0.57	1.11	1.82	0.65	1.50	0.46	1.49	0.33	0.66	0.41	0.58	0.68	0.43	0.77	0.49	2.04	1.06	0.73	0.21	0.79	0.63	0.62
C4	0.37	0.15	0.71	0.92	0.14	0.59	0.16	0.56	0.30	0.07	0.16	0.20	0.24	0.22	0.21	0.19	0.72	0.31	0.34	0.50	0.71	0.41	0.41
C4'	0.93	0.36	1.26	1.97	0.49	1.64	0.25	1.64	0.14	0.53	0.18	0.38	0.53	0.23	0.68	0.63	2.28	1.12	0.82	0.29	0.82	0.51	0.69
C5	0.36	0.16	0.69	0.74	0.14	0.49	0.17	0.45	0.29	0.09	0.14	0.23	0.27	0.25	0.19	0.23	0.44	0.28	0.25	0.44	0.82	0.40	0.43
C5'	1.23	0.56	1.54	2.33	0.71	2.08	0.43	2.09	0.23	0.74	0.33	0.59	0.76	0.40	0.92	0.91	2.76	1.51	1.16	0.15	0.98	0.69	0.95
C6	0.36	0.28	0.64	0.59	0.23	0.37	0.09	0.36	0.16	0.13	0.10	0.35	0.38	0.13	0.25	0.27	0.20	0.24	0.25	0.30	1.08	0.54	0.58
C8	0.30	0.10	0.70	0.94	0.09	0.66	0.35	0.57	0.41	0.27	0.24	0.14	0.13	0.50	0.05	0.17	0.88	0.33	0.32	0.56	0.41	0.29	0.29
N1	0.37	0.34	0.64	0.65	0.30	0.38	0.14	0.39	0.07	0.20	0.16	0.39	0.40	0.11	0.30	0.26	0.25	0.24	0.30	0.20	1.15	0.52	0.60
N3	0.38	0.21	0.70	0.93	0.22	0.58	0.10	0.57	0.21	0.17	0.15	0.24	0.29	0.10	0.28	0.19	0.72	0.30	0.38	0.43	0.81	0.50	0.47
N6	0.34	0.32	0.57	0.39	0.23	0.26	0.14	0.25	0.16	0.15	0.15	0.42	0.40	0.16	0.24	0.33	0.25	0.22	0.23	0.25	1.24	0.75	0.71
N7	0.32	0.12	0.70	0.73	0.10	0.53	0.31	0.45	0.37	0.24	0.21	0.18	0.18	0.42	0.11	0.24	0.50	0.30	0.23	0.49	0.63	0.37	0.35
N9	0.33	0.11	0.70	1.03	0.07	0.69	0.28	0.63	0.39	0.13	0.23	0.14	0.16	0.39	0.12	0.16	0.98	0.33	0.38	0.58	0.50	0.45	0.39
O2'	0.59	0.67	0.32	0.40	0.75	0.33	0.89	0.45	0.86	0.87	0.74	0.60	0.66	1.04	0.73	0.77	0.59	0.63	1.18	0.91	1.11	1.85	1.43
O3'	0.93	0.39	1.14	1.97	0.56	1.64	0.39	1.72	0.24	0.72	0.26	0.38	0.54	0.45	0.75	0.55	2.22	1.13	0.93	0.29	0.97	0.65	0.75
O4'	0.64	0.14	1.05	1.59	0.20	1.24	0.15	1.20	0.33	0.18	0.21	0.17	0.27	0.18	0.36	0.47	1.80	0.75	0.53	0.57	0.64	0.47	0.52
O5'	1.42	0.84	1.68	2.44	0.93	2.21	0.61	2.12	0.44	0.84	0.60	0.89	1.01	0.51	1.10	1.04	2.85	1.70	1.18	0.21	0.94	0.68	0.95
OP1	2.31	1.74	2.59	3.02	1.66	2.92	1.15	2.55	0.99	1.22	1.33	1.91	1.94	0.83	1.77	2.41	3.63	2.49	1.54	0.61	1.31	1.17	1.34
OP2	0.85	0.41	0.98	1.77	0.39	1.76	0.11	1.67	0.06	0.19	0.18	0.49	0.53	0.11	0.49	0.67	2.61	1.23	0.68	0.21	0.50	0.26	0.45
P	1.75	1.14	1.98	2.71	1.16	2.59	0.78	2.41	0.62	0.93	0.84	1.24	1.33	0.58	1.31	1.56	3.40	2.07	1.39	0.34	1.04	0.98	1.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.05	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.32	0.00	0.18	0.01	0.57	0.42	0.27
C2	0.03	0.00	0.13	0.04	0.00	0.27	0.00	0.27	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.50	0.31	0.11	0.01	1.18	0.34	0.44
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.18	0.09	0.06	0.12	0.15	0.12	0.04	0.03	0.01	0.03	0.02	0.63	0.09	0.32	0.15	0.34
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.16	0.00	0.33	0.01	0.29	0.51	0.14	0.13	0.05	0.50	0.25	0.02	0.01	0.02	0.37	0.38	0.48	0.25	0.21
C4	0.02	0.00	0.08	0.16	0.00	0.06	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.22	0.16	0.13	0.01	0.88	0.18	0.28
C4'	0.01	0.27	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.05	0.33	0.15	0.39	0.27	0.28	0.10	0.30	0.03	0.00	0.01	0.10	0.16	0.81	0.32
C5	0.02	0.00	0.07	0.33	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.28	0.03	0.08	0.16	0.01	0.78	0.30	0.23
C5'	0.05	0.27	0.18	0.01	0.08	0.00	0.14	0.00	0.11	0.36	0.16	0.39	0.26	0.34	0.10	0.12	0.19	0.02	0.00	0.18	0.26	0.41	0.01
C6	0.02	0.00	0.09	0.29	0.00	0.05	0.00	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.25	0.06	0.14	0.15	0.01	0.92	0.32	0.27
C8	0.01	0.01	0.06	0.51	0.00	0.33	0.01	0.36	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.43	0.32	0.14	0.22	0.02	0.40	0.41	0.23
N1	0.03	0.00	0.12	0.14	0.00	0.15	0.00	0.16	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.30	0.24	0.12	0.01	1.10	0.22	0.35
N2	0.04	0.00	0.15	0.13	0.01	0.39	0.00	0.39	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.68	0.37	0.12	0.01	1.31	0.49	0.53
N3	0.03	0.00	0.12	0.05	0.00	0.27	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.53	0.30	0.12	0.01	1.10	0.39	0.43
N7	0.01	0.01	0.04	0.50	0.01	0.28	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.43	0.31	0.06	0.21	0.02	0.53	0.55	0.27
N9	0.01	0.01	0.03	0.25	0.00	0.10	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.22	0.07	0.01	0.16	0.01	0.63	0.13	0.20
O2'	0.01	0.09	0.01	0.02	0.15	0.30	0.28	0.12	0.25	0.43	0.14	0.16	0.09	0.43	0.22	0.00	0.06	0.22	0.33	0.30	0.21	0.49	0.17
O3'	0.32	0.50	0.03	0.01	0.22	0.03	0.03	0.19	0.06	0.32	0.30	0.68	0.53	0.31	0.07	0.06	0.00	0.22	0.14	0.08	0.40	0.67	0.06
O4'	0.00	0.31	0.02	0.02	0.16	0.00	0.08	0.02	0.14	0.14	0.24	0.37	0.30	0.06	0.01	0.22	0.22	0.00	0.12	0.10	0.83	0.79	0.59
O5'	0.18	0.11	0.63	0.37	0.13	0.01	0.16	0.00	0.15	0.22	0.12	0.12	0.12	0.21	0.16	0.33	0.14	0.12	0.00	0.17	0.02	0.01	0.00
O6	0.01	0.01	0.09	0.38	0.01	0.10	0.01	0.18	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.30	0.08	0.10	0.17	0.00	0.88	0.46	0.27
OP1	0.57	1.18	0.32	0.48	0.88	0.16	0.78	0.26	0.92	0.40	1.10	1.31	1.10	0.53	0.63	0.21	0.40	0.83	0.02	0.88	0.00	0.00	0.00
OP2	0.42	0.34	0.15	0.25	0.18	0.81	0.30	0.41	0.32	0.41	0.22	0.49	0.39	0.55	0.13	0.49	0.67	0.79	0.01	0.46	0.00	0.00	0.00
P	0.27	0.44	0.34	0.21	0.28	0.32	0.23	0.01	0.27	0.23	0.35	0.53	0.43	0.27	0.20	0.17	0.06	0.59	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00