Doublet Group distance statistics: 53885

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 2, 2, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.003, 0.006, 0.009, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.006 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.004, 0.009, 0.013, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.003, 0.009, 0.016, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C5	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N3	A	0, -0.001, 0.008, 0.017, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.008 std_dev=0.009
N6	A	0, 0.012, 0.022, 0.033, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.022 std_dev=0.010
N9	A	0, 0.005, 0.021, 0.037, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.021 std_dev=0.016
N7	A	0, 0.011, 0.028, 0.045, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.028 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.017, 0.034, 0.052, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.034 std_dev=0.017
O4'	A	0, 0.239, 0.408, 0.577, 0.562 max_d=0.562 avg_d=0.408 std_dev=0.169
C2'	A	0, 0.286, 0.484, 0.681, 0.653 max_d=0.653 avg_d=0.484 std_dev=0.198
C4	B	0, 0.341, 0.612, 0.883, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.612 std_dev=0.271
N9	B	0, 0.395, 0.667, 0.939, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.667 std_dev=0.272
C5	B	0, 0.298, 0.591, 0.884, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.591 std_dev=0.293
C6	B	0, 0.445, 0.775, 1.106, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.775 std_dev=0.331
N1	B	0, 0.508, 0.847, 1.187, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.847 std_dev=0.340
C8	B	0, 0.176, 0.562, 0.949, 1.208 max_d=1.208 avg_d=0.562 std_dev=0.386
C2	B	0, 0.402, 0.811, 1.220, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.811 std_dev=0.409
C1'	B	0, 0.527, 0.938, 1.349, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.938 std_dev=0.411
C4'	A	0, 0.662, 1.083, 1.504, 1.398 max_d=1.398 avg_d=1.083 std_dev=0.421
O6	B	0, 0.540, 0.966, 1.391, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.966 std_dev=0.425
C5'	A	0, 0.680, 1.111, 1.542, 1.386 max_d=1.386 avg_d=1.111 std_dev=0.431
O2'	A	0, 0.702, 1.144, 1.586, 1.438 max_d=1.438 avg_d=1.144 std_dev=0.442
N7	B	0, 0.092, 0.534, 0.977, 1.284 max_d=1.284 avg_d=0.534 std_dev=0.442
N3	B	0, 0.270, 0.716, 1.162, 1.244 max_d=1.244 avg_d=0.716 std_dev=0.446
OP1	A	0, 0.728, 1.186, 1.645, 1.527 max_d=1.527 avg_d=1.186 std_dev=0.458
N2	B	0, 0.526, 1.024, 1.522, 1.612 max_d=1.612 avg_d=1.024 std_dev=0.498
O4'	B	0, 0.698, 1.225, 1.751, 1.648 max_d=1.648 avg_d=1.225 std_dev=0.526
C3'	A	0, 0.880, 1.439, 1.999, 1.886 max_d=1.886 avg_d=1.439 std_dev=0.560
C2'	B	0, 0.733, 1.308, 1.884, 2.004 max_d=2.004 avg_d=1.308 std_dev=0.576
C3'	B	0, 0.802, 1.445, 2.088, 2.023 max_d=2.023 avg_d=1.445 std_dev=0.643
P	A	0, 1.054, 1.718, 2.382, 2.202 max_d=2.202 avg_d=1.718 std_dev=0.664
C4'	B	0, 0.926, 1.623, 2.319, 2.200 max_d=2.200 avg_d=1.623 std_dev=0.697
C5'	B	0, 1.153, 1.912, 2.671, 2.438 max_d=2.438 avg_d=1.912 std_dev=0.759
O5'	A	0, 1.246, 2.020, 2.794, 2.562 max_d=2.562 avg_d=2.020 std_dev=0.774
O3'	B	0, 1.012, 1.870, 2.729, 2.803 max_d=2.803 avg_d=1.870 std_dev=0.859
O2'	B	0, 0.851, 1.843, 2.836, 3.296 max_d=3.296 avg_d=1.843 std_dev=0.992
O3'	A	0, 1.581, 2.586, 3.591, 3.342 max_d=3.342 avg_d=2.586 std_dev=1.005
OP2	A	0, 2.019, 3.269, 4.519, 3.983 max_d=3.983 avg_d=3.269 std_dev=1.250
O5'	B	0, 1.416, 3.012, 4.608, 4.363 max_d=4.363 avg_d=3.012 std_dev=1.596
OP2	B	0, 1.586, 3.228, 4.870, 5.065 max_d=5.065 avg_d=3.228 std_dev=1.642
P	B	0, 1.693, 3.376, 5.060, 4.929 max_d=4.929 avg_d=3.376 std_dev=1.683
OP1	B	0, 2.207, 4.743, 7.278, 7.063 max_d=7.063 avg_d=4.743 std_dev=2.535

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.03	0.14	0.06	0.02
C2	0.02	0.00	0.08	0.09	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.13	0.03	0.06	0.14	0.15	0.06
C2'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.02	0.05	0.04	0.06	0.04	0.07	0.08	0.06	0.05	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.18	0.05	0.05
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.10	0.00	0.13	0.01	0.13	0.13	0.12	0.08	0.15	0.15	0.09	0.01	0.01	0.02	0.08	0.06	0.13	0.05
C4	0.01	0.01	0.05	0.10	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.03	0.07	0.14	0.15	0.06
C4'	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.03	0.05	0.02	0.02	0.03	0.05	0.02	0.10	0.03	0.00	0.01	0.06	0.03	0.01
C5	0.00	0.01	0.05	0.13	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.14	0.03	0.10	0.14	0.20	0.09
C5'	0.01	0.03	0.04	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.06	0.04	0.03	0.05	0.06	0.03	0.07	0.05	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.06	0.13	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.16	0.03	0.10	0.14	0.21	0.10
C8	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.13	0.03	0.11	0.15	0.18	0.09
N1	0.01	0.00	0.07	0.12	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.14	0.03	0.08	0.14	0.18	0.08
N3	0.02	0.01	0.08	0.08	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.12	0.03	0.06	0.14	0.13	0.05
N6	0.01	0.01	0.06	0.15	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.09	0.18	0.04	0.11	0.14	0.24	0.12
N7	0.01	0.01	0.05	0.15	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.16	0.03	0.12	0.14	0.22	0.11
N9	0.00	0.01	0.03	0.09	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.02	0.07	0.14	0.13	0.05
O2'	0.01	0.08	0.00	0.01	0.06	0.10	0.08	0.07	0.08	0.07	0.08	0.07	0.09	0.08	0.05	0.00	0.04	0.08	0.07	0.15	0.08	0.04
O3'	0.07	0.13	0.01	0.01	0.11	0.03	0.14	0.05	0.16	0.13	0.14	0.12	0.18	0.16	0.08	0.04	0.00	0.05	0.11	0.12	0.19	0.11
O4'	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.03	0.04	0.03	0.02	0.08	0.05	0.00	0.04	0.12	0.05	0.03
O5'	0.03	0.06	0.01	0.08	0.07	0.01	0.10	0.01	0.10	0.11	0.08	0.06	0.11	0.12	0.07	0.07	0.11	0.04	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.14	0.14	0.18	0.06	0.14	0.06	0.14	0.06	0.14	0.15	0.14	0.14	0.14	0.14	0.14	0.15	0.12	0.12	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.15	0.05	0.13	0.15	0.03	0.20	0.02	0.21	0.18	0.18	0.13	0.24	0.22	0.13	0.08	0.19	0.05	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.06	0.05	0.05	0.06	0.01	0.09	0.02	0.10	0.09	0.08	0.05	0.12	0.11	0.05	0.04	0.11	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.14	0.08	0.30	0.26	0.18	0.16	0.31	0.18	0.34	0.31	0.20	0.21	0.09	0.37	0.20	0.13	0.24	0.14	0.73	0.44	0.64	1.24	0.71
C2	0.26	0.22	0.17	0.24	0.16	0.20	0.09	0.23	0.08	0.18	0.16	0.28	0.22	0.14	0.19	0.58	0.36	0.24	0.87	0.08	0.89	1.13	0.81
C2'	0.18	0.20	0.41	0.30	0.25	0.21	0.42	0.18	0.54	0.35	0.45	0.14	0.14	0.45	0.23	0.27	0.23	0.17	0.59	0.67	0.41	1.09	0.55
C3'	0.23	0.20	0.38	0.30	0.32	0.23	0.53	0.26	0.65	0.47	0.47	0.24	0.20	0.60	0.31	0.26	0.25	0.22	0.67	0.84	0.47	1.24	0.65
C4	0.19	0.13	0.21	0.25	0.15	0.19	0.21	0.26	0.13	0.30	0.08	0.28	0.07	0.30	0.22	0.45	0.32	0.19	0.91	0.16	0.88	1.35	0.88
C4'	0.18	0.13	0.33	0.28	0.25	0.19	0.41	0.22	0.48	0.39	0.31	0.22	0.15	0.49	0.25	0.15	0.23	0.17	0.71	0.64	0.56	1.30	0.70
C5	0.25	0.25	0.28	0.29	0.12	0.25	0.15	0.37	0.10	0.36	0.28	0.38	0.11	0.31	0.25	0.73	0.40	0.23	1.10	0.12	1.10	1.56	1.08
C5'	0.21	0.19	0.31	0.29	0.25	0.21	0.40	0.26	0.43	0.42	0.23	0.38	0.20	0.51	0.27	0.19	0.26	0.19	0.79	0.61	0.64	1.41	0.79
C6	0.34	0.24	0.41	0.34	0.08	0.32	0.08	0.44	0.25	0.33	0.34	0.31	0.09	0.21	0.26	0.99	0.47	0.29	1.22	0.32	1.26	1.60	1.19
C8	0.19	0.29	0.23	0.26	0.15	0.20	0.24	0.32	0.14	0.38	0.20	0.50	0.17	0.40	0.23	0.49	0.33	0.18	0.99	0.22	0.95	1.55	0.99
N1	0.36	0.18	0.35	0.31	0.11	0.30	0.05	0.36	0.17	0.21	0.22	0.23	0.15	0.13	0.23	1.00	0.46	0.30	1.10	0.23	1.15	1.35	1.03
N3	0.17	0.20	0.23	0.24	0.17	0.16	0.19	0.19	0.17	0.23	0.17	0.27	0.17	0.22	0.18	0.30	0.28	0.18	0.78	0.17	0.76	1.13	0.73
N6	0.39	0.31	0.60	0.42	0.06	0.42	0.18	0.56	0.45	0.35	0.47	0.36	0.12	0.18	0.26	1.20	0.53	0.33	1.42	0.57	1.53	1.84	1.42
N7	0.24	0.36	0.30	0.29	0.13	0.25	0.18	0.40	0.15	0.40	0.38	0.52	0.18	0.38	0.25	0.70	0.39	0.22	1.13	0.14	1.12	1.68	1.13
N9	0.16	0.13	0.23	0.25	0.16	0.17	0.26	0.25	0.22	0.33	0.03	0.34	0.10	0.37	0.21	0.33	0.29	0.16	0.87	0.30	0.81	1.37	0.85
O2'	0.16	0.34	0.53	0.36	0.24	0.24	0.40	0.15	0.56	0.27	0.54	0.33	0.18	0.39	0.18	0.44	0.15	0.12	0.43	0.68	0.26	0.91	0.39
O3'	0.21	0.31	0.42	0.30	0.38	0.21	0.64	0.26	0.82	0.52	0.68	0.15	0.22	0.69	0.34	0.39	0.22	0.22	0.60	1.05	0.34	1.18	0.58
O4'	0.14	0.08	0.27	0.26	0.18	0.17	0.30	0.20	0.32	0.33	0.15	0.24	0.10	0.39	0.21	0.17	0.24	0.14	0.78	0.44	0.70	1.34	0.77
O5'	0.27	0.37	0.31	0.31	0.29	0.26	0.40	0.32	0.39	0.46	0.28	0.61	0.32	0.54	0.32	0.30	0.31	0.26	0.86	0.55	0.73	1.50	0.87
OP1	0.25	0.38	0.32	0.34	0.25	0.26	0.35	0.32	0.32	0.44	0.25	0.65	0.33	0.51	0.28	0.28	0.32	0.22	0.87	0.48	0.71	1.56	0.88
OP2	0.37	0.57	0.35	0.34	0.39	0.36	0.45	0.47	0.43	0.55	0.51	0.80	0.46	0.60	0.41	0.52	0.37	0.38	1.02	0.51	0.95	1.69	1.07
P	0.27	0.42	0.29	0.30	0.28	0.27	0.37	0.37	0.33	0.47	0.32	0.67	0.34	0.53	0.31	0.38	0.33	0.27	0.94	0.45	0.85	1.62	0.98

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.10	0.01	0.01	0.04	0.04	0.04	0.01	0.00	0.03	0.29	0.00	0.41	0.01	0.27	0.41	0.24
C2	0.04	0.00	0.18	0.10	0.01	0.05	0.01	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.35	0.11	0.42	0.01	0.09	0.61	0.19
C2'	0.00	0.18	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.25	0.04	0.21	0.11	0.24	0.19	0.18	0.06	0.00	0.03	0.02	0.79	0.07	0.86	0.84	0.72
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.11	0.00	0.15	0.02	0.15	0.18	0.13	0.08	0.08	0.18	0.12	0.02	0.01	0.04	0.42	0.16	0.62	0.20	0.33
C4	0.02	0.01	0.06	0.11	0.00	0.02	0.01	0.16	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.24	0.05	0.53	0.01	0.25	0.67	0.32
C4'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.02	0.08	0.04	0.07	0.05	0.06	0.03	0.30	0.01	0.01	0.02	0.02	0.16	0.21	0.07
C5	0.01	0.01	0.06	0.15	0.01	0.03	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.34	0.15	0.02	0.65	0.01	0.38	0.84	0.46
C5'	0.10	0.16	0.25	0.02	0.16	0.00	0.18	0.00	0.18	0.17	0.17	0.16	0.15	0.18	0.15	0.07	0.22	0.02	0.01	0.19	0.29	0.39	0.02
C6	0.01	0.01	0.04	0.15	0.01	0.02	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.30	0.18	0.03	0.62	0.00	0.31	0.85	0.43
C8	0.01	0.00	0.21	0.18	0.00	0.08	0.01	0.17	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.47	0.05	0.11	0.78	0.02	0.60	0.87	0.61
N1	0.04	0.00	0.11	0.13	0.02	0.04	0.01	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.13	0.27	0.07	0.51	0.01	0.16	0.73	0.29
N2	0.04	0.00	0.24	0.08	0.01	0.07	0.01	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.42	0.14	0.33	0.02	0.12	0.54	0.12
N3	0.04	0.00	0.19	0.08	0.00	0.05	0.01	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.35	0.11	0.40	0.02	0.10	0.55	0.18
N7	0.01	0.01	0.18	0.18	0.00	0.06	0.00	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.50	0.06	0.08	0.78	0.02	0.59	0.98	0.64
N9	0.00	0.01	0.06	0.12	0.00	0.03	0.00	0.15	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.22	0.17	0.03	0.59	0.01	0.36	0.64	0.38
O2'	0.03	0.09	0.00	0.02	0.15	0.30	0.34	0.07	0.30	0.47	0.13	0.22	0.13	0.50	0.22	0.00	0.06	0.18	0.60	0.39	0.77	0.93	0.65
O3'	0.29	0.35	0.03	0.01	0.24	0.01	0.15	0.22	0.18	0.05	0.27	0.42	0.35	0.06	0.17	0.06	0.00	0.21	0.16	0.15	0.36	0.17	0.14
O4'	0.00	0.11	0.02	0.04	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.11	0.07	0.14	0.11	0.08	0.03	0.18	0.21	0.00	0.09	0.02	0.14	0.25	0.23
O5'	0.41	0.42	0.79	0.42	0.53	0.02	0.65	0.01	0.62	0.78	0.51	0.33	0.40	0.78	0.59	0.60	0.16	0.09	0.00	0.68	0.02	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.07	0.16	0.01	0.02	0.01	0.19	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.39	0.15	0.02	0.68	0.00	0.39	0.94	0.51
OP1	0.27	0.09	0.86	0.62	0.25	0.16	0.38	0.29	0.31	0.60	0.16	0.12	0.10	0.59	0.36	0.77	0.36	0.14	0.02	0.39	0.00	0.01	0.01
OP2	0.41	0.61	0.84	0.20	0.67	0.21	0.84	0.39	0.85	0.87	0.73	0.54	0.55	0.98	0.64	0.93	0.17	0.25	0.02	0.94	0.01	0.00	0.01
P	0.24	0.19	0.72	0.33	0.32	0.07	0.46	0.02	0.43	0.61	0.29	0.12	0.18	0.64	0.38	0.65	0.14	0.23	0.00	0.51	0.01	0.01	0.00