Doublet Group distance statistics: 53888

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.001, 0.005, 0.010, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.005 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.001, 0.010, 0.019, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.001, 0.012, 0.023, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.012 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.000, 0.012, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.012 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.002, 0.016, 0.030, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.014
N1	A	0, -0.002, 0.013, 0.029, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.013 std_dev=0.016
C4	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.020 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.009, 0.030, 0.051, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.030 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.002, 0.025, 0.048, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.025 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.003, 0.026, 0.050, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.026 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.001, 0.037, 0.073, 0.096 max_d=0.096 avg_d=0.037 std_dev=0.036
N9	B	0, 0.082, 0.334, 0.587, 0.690 max_d=0.690 avg_d=0.334 std_dev=0.252
C4	B	0, 0.103, 0.371, 0.638, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.371 std_dev=0.268
C8	B	0, 0.049, 0.319, 0.588, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.319 std_dev=0.269
C5	B	0, 0.095, 0.365, 0.635, 0.703 max_d=0.703 avg_d=0.365 std_dev=0.270
C1'	B	0, 0.102, 0.375, 0.648, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.375 std_dev=0.273
N7	B	0, 0.061, 0.337, 0.613, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.337 std_dev=0.276
C6	B	0, 0.119, 0.442, 0.766, 0.759 max_d=0.759 avg_d=0.442 std_dev=0.324
C2'	B	0, 0.082, 0.406, 0.730, 0.918 max_d=0.918 avg_d=0.406 std_dev=0.324
N3	B	0, 0.121, 0.450, 0.780, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.450 std_dev=0.329
O6	B	0, 0.129, 0.496, 0.863, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.496 std_dev=0.367
N1	B	0, 0.125, 0.505, 0.885, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.505 std_dev=0.380
C2	B	0, 0.127, 0.511, 0.896, 0.953 max_d=0.953 avg_d=0.511 std_dev=0.384
O2'	B	0, 0.003, 0.423, 0.843, 1.248 max_d=1.248 avg_d=0.423 std_dev=0.420
N2	B	0, 0.138, 0.617, 1.096, 1.235 max_d=1.235 avg_d=0.617 std_dev=0.479
C3'	B	0, 0.191, 0.672, 1.152, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.672 std_dev=0.480
O4'	B	0, 0.069, 0.558, 1.047, 1.275 max_d=1.275 avg_d=0.558 std_dev=0.489
C4'	B	0, 0.181, 0.714, 1.248, 1.323 max_d=1.323 avg_d=0.714 std_dev=0.534
O3'	B	0, 0.238, 0.867, 1.496, 1.536 max_d=1.536 avg_d=0.867 std_dev=0.629
O4'	A	0, 0.275, 0.932, 1.589, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.932 std_dev=0.657
C2'	A	0, 0.298, 1.020, 1.741, 1.607 max_d=1.607 avg_d=1.020 std_dev=0.721
C5'	B	0, 0.286, 1.083, 1.879, 2.035 max_d=2.035 avg_d=1.083 std_dev=0.797
C3'	A	0, 0.383, 1.315, 2.246, 2.125 max_d=2.125 avg_d=1.315 std_dev=0.931
C4'	A	0, 0.376, 1.331, 2.286, 2.270 max_d=2.270 avg_d=1.331 std_dev=0.955
O3'	A	0, 0.382, 1.347, 2.313, 2.358 max_d=2.358 avg_d=1.347 std_dev=0.966
O2'	A	0, 0.433, 1.494, 2.554, 2.456 max_d=2.456 avg_d=1.494 std_dev=1.060
O5'	B	0, 0.426, 1.913, 3.399, 3.585 max_d=3.585 avg_d=1.913 std_dev=1.486
OP2	A	0, 0.619, 2.144, 3.670, 3.455 max_d=3.455 avg_d=2.144 std_dev=1.525
C5'	A	0, 0.683, 2.363, 4.043, 3.868 max_d=3.868 avg_d=2.363 std_dev=1.680
P	B	0, 0.508, 2.249, 3.990, 4.358 max_d=4.358 avg_d=2.249 std_dev=1.741
OP1	B	0, 0.588, 2.402, 4.217, 4.553 max_d=4.553 avg_d=2.402 std_dev=1.815
P	A	0, 0.813, 2.770, 4.727, 4.315 max_d=4.315 avg_d=2.770 std_dev=1.957
OP2	B	0, 0.542, 2.542, 4.542, 5.187 max_d=5.187 avg_d=2.542 std_dev=2.000
O5'	A	0, 0.841, 2.859, 4.876, 4.423 max_d=4.423 avg_d=2.859 std_dev=2.018
OP1	A	0, 0.864, 2.987, 5.110, 4.724 max_d=4.724 avg_d=2.987 std_dev=2.123

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.08	0.00	0.25	0.71	0.30	0.30
C2	0.01	0.00	0.30	0.20	0.00	0.15	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.32	0.13	0.26	0.44	1.10	0.37	0.53
C2'	0.00	0.30	0.00	0.00	0.14	0.02	0.04	0.03	0.11	0.20	0.22	0.30	0.06	0.12	0.02	0.00	0.04	0.01	0.20	0.79	0.28	0.37
C3'	0.02	0.20	0.00	0.00	0.19	0.00	0.22	0.02	0.24	0.20	0.23	0.18	0.25	0.23	0.16	0.01	0.01	0.02	0.13	0.73	0.13	0.29
C4	0.01	0.00	0.14	0.19	0.00	0.06	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.11	0.13	0.38	1.09	0.36	0.52
C4'	0.01	0.15	0.02	0.00	0.06	0.00	0.11	0.01	0.08	0.26	0.09	0.15	0.12	0.22	0.10	0.16	0.04	0.00	0.02	0.40	0.27	0.07
C5	0.01	0.00	0.04	0.22	0.00	0.11	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.16	0.05	0.41	1.33	0.40	0.65
C5'	0.05	0.25	0.03	0.02	0.17	0.01	0.27	0.00	0.25	0.44	0.22	0.23	0.30	0.43	0.20	0.13	0.09	0.03	0.01	0.26	0.39	0.01
C6	0.01	0.00	0.11	0.24	0.01	0.08	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.15	0.17	0.11	0.43	1.39	0.40	0.68
C8	0.01	0.01	0.20	0.20	0.00	0.26	0.00	0.44	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.35	0.16	0.17	0.44	1.25	0.44	0.67
N1	0.01	0.00	0.22	0.23	0.01	0.09	0.01	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.22	0.16	0.20	0.44	1.27	0.39	0.61
N3	0.01	0.00	0.30	0.18	0.00	0.15	0.01	0.23	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.33	0.10	0.26	0.41	0.99	0.35	0.47
N6	0.02	0.01	0.06	0.25	0.01	0.12	0.01	0.30	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.18	0.20	0.07	0.46	1.55	0.41	0.77
N7	0.01	0.01	0.12	0.23	0.01	0.22	0.00	0.43	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.32	0.19	0.10	0.45	1.46	0.43	0.76
N9	0.00	0.01	0.02	0.16	0.00	0.10	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.13	0.09	0.02	0.34	0.99	0.37	0.48
O2'	0.01	0.32	0.00	0.01	0.13	0.16	0.16	0.13	0.15	0.35	0.22	0.33	0.18	0.32	0.13	0.00	0.07	0.13	0.05	0.70	0.08	0.23
O3'	0.08	0.13	0.04	0.01	0.11	0.04	0.16	0.09	0.17	0.16	0.16	0.10	0.20	0.19	0.09	0.07	0.00	0.04	0.27	0.73	0.07	0.22
O4'	0.00	0.26	0.01	0.02	0.13	0.00	0.05	0.03	0.11	0.17	0.20	0.26	0.07	0.10	0.02	0.13	0.04	0.00	0.25	0.56	0.39	0.24
O5'	0.25	0.44	0.20	0.13	0.38	0.02	0.41	0.01	0.43	0.44	0.44	0.41	0.46	0.45	0.34	0.05	0.27	0.25	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.71	1.10	0.79	0.73	1.09	0.40	1.33	0.26	1.39	1.25	1.27	0.99	1.55	1.46	0.99	0.70	0.73	0.56	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.30	0.37	0.28	0.13	0.36	0.27	0.40	0.39	0.40	0.44	0.39	0.35	0.41	0.43	0.37	0.08	0.07	0.39	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.30	0.53	0.37	0.29	0.52	0.07	0.65	0.01	0.68	0.67	0.61	0.47	0.77	0.76	0.48	0.23	0.22	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.28	0.05	0.15	0.12	0.16	0.07	0.43	0.12	0.11	0.26	0.37	0.21	0.12	0.09	0.23	0.12	0.12	0.57	0.12	0.91	0.84	0.74
C2	0.15	0.21	0.15	0.14	0.19	0.13	0.22	0.26	0.26	0.18	0.24	0.20	0.20	0.22	0.17	0.32	0.20	0.20	0.56	0.28	0.73	0.72	0.63
C2'	0.07	0.32	0.10	0.13	0.12	0.13	0.10	0.42	0.16	0.12	0.30	0.43	0.23	0.15	0.07	0.27	0.10	0.06	0.64	0.16	1.07	0.99	0.86
C3'	0.38	0.49	0.36	0.44	0.44	0.47	0.48	0.66	0.54	0.45	0.54	0.51	0.44	0.49	0.42	0.38	0.43	0.43	0.25	0.61	0.53	0.36	0.30
C4	0.10	0.16	0.05	0.13	0.09	0.13	0.11	0.36	0.13	0.14	0.14	0.22	0.14	0.17	0.09	0.24	0.11	0.12	0.50	0.18	0.78	0.69	0.62
C4'	0.22	0.31	0.24	0.39	0.26	0.38	0.37	0.62	0.41	0.40	0.35	0.39	0.24	0.47	0.28	0.26	0.39	0.27	0.25	0.55	0.47	0.27	0.27
C5	0.11	0.12	0.04	0.14	0.05	0.14	0.07	0.34	0.09	0.13	0.10	0.16	0.10	0.13	0.09	0.21	0.12	0.10	0.39	0.13	0.69	0.53	0.50
C5'	0.50	0.45	0.51	0.68	0.54	0.69	0.68	0.92	0.70	0.73	0.54	0.45	0.43	0.82	0.58	0.45	0.68	0.59	0.54	0.87	0.41	0.41	0.43
C6	0.11	0.05	0.05	0.12	0.09	0.08	0.12	0.25	0.13	0.13	0.09	0.05	0.06	0.15	0.11	0.24	0.13	0.11	0.37	0.15	0.62	0.46	0.44
C8	0.12	0.25	0.08	0.21	0.12	0.22	0.10	0.46	0.18	0.13	0.26	0.29	0.19	0.11	0.11	0.19	0.19	0.10	0.37	0.19	0.77	0.56	0.54
N1	0.13	0.16	0.13	0.14	0.17	0.10	0.20	0.21	0.22	0.16	0.20	0.13	0.15	0.19	0.15	0.30	0.20	0.17	0.46	0.23	0.65	0.57	0.51
N3	0.13	0.20	0.11	0.12	0.16	0.13	0.19	0.32	0.23	0.17	0.21	0.24	0.18	0.21	0.14	0.29	0.14	0.18	0.58	0.27	0.80	0.78	0.68
N6	0.14	0.08	0.06	0.14	0.10	0.09	0.10	0.22	0.10	0.12	0.09	0.07	0.09	0.11	0.12	0.22	0.15	0.11	0.23	0.12	0.52	0.28	0.30
N7	0.14	0.20	0.10	0.21	0.13	0.22	0.12	0.43	0.17	0.15	0.21	0.22	0.17	0.13	0.13	0.19	0.19	0.12	0.29	0.18	0.68	0.44	0.44
N9	0.10	0.23	0.04	0.16	0.09	0.16	0.04	0.42	0.10	0.12	0.21	0.30	0.17	0.12	0.08	0.21	0.13	0.10	0.49	0.13	0.83	0.71	0.64
O2'	0.42	0.42	0.38	0.43	0.45	0.49	0.52	0.71	0.53	0.53	0.45	0.45	0.41	0.57	0.46	0.43	0.38	0.48	1.22	0.62	1.65	1.67	1.49
O3'	0.34	0.43	0.32	0.38	0.37	0.41	0.40	0.60	0.44	0.39	0.46	0.48	0.39	0.42	0.36	0.37	0.37	0.38	0.33	0.49	0.63	0.50	0.42
O4'	0.07	0.29	0.06	0.23	0.07	0.21	0.14	0.48	0.20	0.19	0.26	0.42	0.21	0.25	0.05	0.21	0.23	0.05	0.31	0.33	0.60	0.45	0.42
O5'	0.51	0.25	0.50	0.82	0.48	0.87	0.65	1.21	0.63	0.78	0.41	0.17	0.29	0.85	0.58	0.32	0.81	0.66	0.54	0.84	0.33	0.56	0.49
OP1	1.51	0.73	1.66	1.96	1.20	1.91	1.19	2.17	0.84	1.63	0.62	0.56	1.00	1.51	1.47	1.53	2.05	1.60	1.53	0.72	1.36	1.39	1.42
OP2	0.40	0.35	0.40	0.63	0.41	0.67	0.51	0.93	0.53	0.57	0.44	0.33	0.33	0.61	0.45	0.31	0.63	0.54	0.49	0.67	0.24	0.45	0.38
P	0.85	0.35	0.90	1.22	0.70	1.25	0.78	1.57	0.63	1.05	0.40	0.20	0.51	1.03	0.87	0.74	1.26	0.99	0.95	0.71	0.76	0.93	0.89

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.42	0.01	0.55	0.35	0.38
C2	0.02	0.00	0.10	0.05	0.01	0.10	0.01	0.32	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.06	0.12	0.77	0.01	0.92	1.00	0.84
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.03	0.05	0.08	0.07	0.12	0.09	0.06	0.02	0.00	0.02	0.02	0.17	0.04	0.46	0.15	0.21
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.08	0.00	0.12	0.01	0.11	0.17	0.08	0.04	0.04	0.16	0.09	0.01	0.01	0.02	0.11	0.13	0.42	0.17	0.16
C4	0.01	0.01	0.05	0.08	0.00	0.11	0.00	0.31	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.12	0.04	0.07	0.69	0.00	0.88	0.81	0.74
C4'	0.01	0.10	0.01	0.00	0.11	0.00	0.16	0.01	0.17	0.18	0.14	0.09	0.08	0.20	0.11	0.04	0.02	0.00	0.01	0.19	0.24	0.17	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.12	0.00	0.16	0.00	0.40	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.09	0.05	0.71	0.01	1.00	0.91	0.83
C5'	0.07	0.32	0.03	0.01	0.31	0.01	0.40	0.00	0.43	0.37	0.38	0.29	0.26	0.43	0.26	0.04	0.06	0.02	0.01	0.47	0.34	0.36	0.02
C6	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.17	0.00	0.43	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.14	0.07	0.07	0.76	0.00	1.08	1.06	0.92
C8	0.00	0.01	0.08	0.17	0.00	0.18	0.00	0.37	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.17	0.08	0.51	0.01	0.85	0.52	0.59
N1	0.02	0.00	0.07	0.08	0.01	0.14	0.00	0.38	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.18	0.04	0.10	0.80	0.00	1.03	1.09	0.92
N2	0.03	0.00	0.12	0.04	0.01	0.09	0.01	0.29	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.24	0.10	0.14	0.78	0.01	0.89	1.02	0.84
N3	0.02	0.01	0.09	0.04	0.01	0.08	0.00	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.18	0.06	0.12	0.72	0.01	0.83	0.86	0.74
N7	0.00	0.01	0.06	0.16	0.00	0.20	0.00	0.43	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.16	0.06	0.59	0.01	1.00	0.74	0.74
N9	0.00	0.01	0.02	0.09	0.01	0.11	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.07	0.02	0.57	0.01	0.76	0.57	0.58
O2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.12	0.04	0.10	0.04	0.14	0.07	0.18	0.24	0.18	0.07	0.04	0.00	0.05	0.10	0.04	0.13	0.27	0.05	0.06
O3'	0.02	0.06	0.02	0.01	0.04	0.02	0.09	0.06	0.07	0.17	0.04	0.10	0.06	0.16	0.07	0.05	0.00	0.02	0.40	0.10	0.42	0.44	0.35
O4'	0.00	0.12	0.02	0.02	0.07	0.00	0.05	0.02	0.07	0.08	0.10	0.14	0.12	0.06	0.02	0.10	0.02	0.00	0.43	0.06	0.46	0.29	0.34
O5'	0.42	0.77	0.17	0.11	0.69	0.01	0.71	0.01	0.76	0.51	0.80	0.78	0.72	0.59	0.57	0.04	0.40	0.43	0.00	0.75	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.01	0.04	0.13	0.00	0.19	0.01	0.47	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.10	0.06	0.75	0.00	1.15	1.10	0.96
OP1	0.55	0.92	0.46	0.42	0.88	0.24	1.00	0.34	1.08	0.85	1.03	0.89	0.83	1.00	0.76	0.27	0.42	0.46	0.01	1.15	0.00	0.01	0.00
OP2	0.35	1.00	0.15	0.17	0.81	0.17	0.91	0.36	1.06	0.52	1.09	1.02	0.86	0.74	0.57	0.05	0.44	0.29	0.01	1.10	0.01	0.00	0.00
P	0.38	0.84	0.21	0.16	0.74	0.02	0.83	0.02	0.92	0.59	0.92	0.84	0.74	0.74	0.58	0.06	0.35	0.34	0.01	0.96	0.00	0.00	0.00