Doublet Group distance statistics: 53889

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.000, 0.011, 0.023, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.011 std_dev=0.012
C6	A	0, -0.001, 0.011, 0.024, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.011 std_dev=0.012
C4	A	0, -0.002, 0.012, 0.025, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.012 std_dev=0.013
C5	A	0, -0.001, 0.015, 0.031, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.015 std_dev=0.016
N9	A	0, -0.002, 0.021, 0.044, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.021 std_dev=0.023
C1'	A	0, -0.003, 0.025, 0.052, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.025 std_dev=0.028
C2	A	0, -0.006, 0.023, 0.052, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.023 std_dev=0.029
N3	A	0, -0.006, 0.025, 0.056, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.025 std_dev=0.031
C8	A	0, -0.004, 0.027, 0.059, 0.080 max_d=0.080 avg_d=0.027 std_dev=0.032
N7	A	0, -0.005, 0.028, 0.061, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.028 std_dev=0.033
N6	A	0, -0.007, 0.027, 0.061, 0.090 max_d=0.090 avg_d=0.027 std_dev=0.034
C5	B	0, 0.167, 0.436, 0.706, 0.791 max_d=0.791 avg_d=0.436 std_dev=0.270
C8	B	0, 0.177, 0.452, 0.727, 0.782 max_d=0.782 avg_d=0.452 std_dev=0.275
C4	B	0, 0.181, 0.470, 0.760, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.470 std_dev=0.289
C6	B	0, 0.186, 0.478, 0.771, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.478 std_dev=0.293
N9	B	0, 0.188, 0.481, 0.774, 0.784 max_d=0.784 avg_d=0.481 std_dev=0.293
N7	B	0, 0.150, 0.465, 0.780, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.465 std_dev=0.315
N1	B	0, 0.156, 0.474, 0.792, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.474 std_dev=0.318
C2'	B	0, 0.233, 0.577, 0.921, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.577 std_dev=0.344
O6	B	0, 0.216, 0.588, 0.960, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.588 std_dev=0.372
C2	B	0, 0.169, 0.543, 0.917, 0.974 max_d=0.974 avg_d=0.543 std_dev=0.374
N3	B	0, 0.184, 0.564, 0.944, 0.976 max_d=0.976 avg_d=0.564 std_dev=0.380
C1'	B	0, 0.210, 0.620, 1.029, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.620 std_dev=0.409
C3'	B	0, 0.075, 0.560, 1.044, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.560 std_dev=0.484
N2	B	0, 0.173, 0.660, 1.148, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.660 std_dev=0.488
C4'	B	0, 0.200, 0.756, 1.311, 1.588 max_d=1.588 avg_d=0.756 std_dev=0.555
O2'	B	0, 0.273, 0.903, 1.533, 1.707 max_d=1.707 avg_d=0.903 std_dev=0.630
O4'	B	0, 0.209, 0.844, 1.478, 1.595 max_d=1.595 avg_d=0.844 std_dev=0.635
O3'	B	0, 0.162, 0.818, 1.473, 1.950 max_d=1.950 avg_d=0.818 std_dev=0.655
O4'	A	0, 0.054, 0.828, 1.603, 1.861 max_d=1.861 avg_d=0.828 std_dev=0.774
C2'	A	0, 0.074, 0.868, 1.662, 1.831 max_d=1.831 avg_d=0.868 std_dev=0.794
O2'	A	0, 0.119, 0.955, 1.792, 1.978 max_d=1.978 avg_d=0.955 std_dev=0.837
O5'	B	0, 0.153, 1.085, 2.018, 2.350 max_d=2.350 avg_d=1.085 std_dev=0.933
C5'	B	0, 0.083, 1.176, 2.268, 2.946 max_d=2.946 avg_d=1.176 std_dev=1.093
P	B	0, 0.106, 1.310, 2.515, 2.964 max_d=2.964 avg_d=1.310 std_dev=1.204
C4'	A	0, 0.071, 1.298, 2.525, 2.901 max_d=2.901 avg_d=1.298 std_dev=1.227
OP2	B	0, 0.188, 1.440, 2.693, 3.122 max_d=3.122 avg_d=1.440 std_dev=1.252
OP1	B	0, 0.135, 1.401, 2.667, 3.233 max_d=3.233 avg_d=1.401 std_dev=1.266
C3'	A	0, 0.108, 1.391, 2.674, 3.008 max_d=3.008 avg_d=1.391 std_dev=1.283
O5'	A	0, 0.278, 1.956, 3.635, 3.995 max_d=3.995 avg_d=1.956 std_dev=1.679
OP2	A	0, 0.655, 2.335, 4.014, 4.175 max_d=4.175 avg_d=2.335 std_dev=1.679
O3'	A	0, 0.150, 2.030, 3.910, 4.396 max_d=4.396 avg_d=2.030 std_dev=1.880
C5'	A	0, 0.163, 2.122, 4.080, 4.628 max_d=4.628 avg_d=2.122 std_dev=1.959
P	A	0, 0.424, 2.696, 4.967, 5.410 max_d=5.410 avg_d=2.696 std_dev=2.271
OP1	A	0, 0.571, 3.360, 6.149, 6.706 max_d=6.706 avg_d=3.360 std_dev=2.789

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.04	0.03	0.03	0.05	0.07	0.03	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.22	0.10	0.27	0.21
C2	0.07	0.00	0.51	0.28	0.02	0.29	0.02	0.61	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.55	0.44	0.49	1.06	0.91	1.17	1.25
C2'	0.00	0.51	0.00	0.00	0.27	0.01	0.14	0.02	0.25	0.25	0.40	0.50	0.18	0.12	0.01	0.00	0.01	0.01	0.35	0.15	0.63	0.36
C3'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.13	0.00	0.06	0.01	0.13	0.18	0.22	0.27	0.09	0.10	0.02	0.01	0.00	0.01	0.42	0.19	0.75	0.42
C4	0.03	0.02	0.27	0.13	0.00	0.16	0.00	0.37	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.27	0.20	0.25	0.85	0.59	0.95	0.95
C4'	0.00	0.29	0.01	0.00	0.16	0.00	0.12	0.00	0.18	0.07	0.25	0.27	0.15	0.01	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.04
C5	0.02	0.02	0.14	0.06	0.00	0.12	0.00	0.30	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.09	0.11	0.91	0.63	1.16	1.10
C5'	0.04	0.61	0.02	0.01	0.37	0.00	0.30	0.00	0.43	0.10	0.57	0.54	0.38	0.07	0.13	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00
C6	0.03	0.01	0.25	0.13	0.01	0.18	0.00	0.43	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.27	0.20	0.22	1.05	0.83	1.34	1.32
C8	0.03	0.04	0.25	0.18	0.02	0.07	0.01	0.10	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.00	0.00	0.20	0.23	0.27	0.46	0.28	0.73	0.56
N1	0.05	0.01	0.40	0.22	0.01	0.25	0.01	0.57	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.44	0.36	0.38	1.12	0.95	1.34	1.38
N3	0.07	0.00	0.50	0.27	0.01	0.27	0.01	0.54	0.02	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.53	0.40	0.48	0.92	0.74	0.97	1.03
N6	0.03	0.01	0.18	0.09	0.01	0.15	0.01	0.38	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.21	0.14	0.14	1.05	0.85	1.46	1.38
N7	0.03	0.02	0.12	0.10	0.01	0.01	0.01	0.07	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.09	0.14	0.14	0.69	0.43	1.05	0.88
N9	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.13	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.55	0.30	0.65	0.59
O2'	0.00	0.55	0.00	0.01	0.27	0.02	0.15	0.02	0.27	0.20	0.44	0.53	0.21	0.09	0.02	0.00	0.01	0.03	0.11	0.07	0.34	0.12
O3'	0.01	0.44	0.01	0.00	0.20	0.01	0.09	0.02	0.20	0.23	0.36	0.40	0.14	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01	0.32	0.21	0.82	0.36
O4'	0.01	0.49	0.01	0.01	0.25	0.00	0.11	0.00	0.22	0.27	0.38	0.48	0.14	0.14	0.01	0.03	0.01	0.00	0.09	0.11	0.23	0.11
O5'	0.22	1.06	0.35	0.42	0.85	0.01	0.91	0.00	1.05	0.46	1.12	0.92	1.05	0.69	0.55	0.11	0.32	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.10	0.91	0.15	0.19	0.59	0.03	0.63	0.02	0.83	0.28	0.95	0.74	0.85	0.43	0.30	0.07	0.21	0.11	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.27	1.17	0.63	0.75	0.95	0.07	1.16	0.03	1.34	0.73	1.34	0.97	1.46	1.05	0.65	0.34	0.82	0.23	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.21	1.25	0.36	0.42	0.95	0.04	1.10	0.00	1.32	0.56	1.38	1.03	1.38	0.88	0.59	0.12	0.36	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.24	0.27	0.25	0.16	0.18	0.16	0.15	0.32	0.24	0.15	0.27	0.34	0.25	0.16	0.17	0.40	0.18	0.12	0.34	0.37	0.41	0.64	0.46
C2	0.28	0.13	0.23	0.33	0.11	0.22	0.13	0.35	0.23	0.10	0.16	0.18	0.20	0.15	0.16	0.38	0.40	0.18	0.24	0.33	0.39	0.67	0.42
C2'	0.65	0.74	0.60	0.35	0.65	0.34	0.54	0.16	0.54	0.47	0.67	0.80	0.73	0.42	0.59	0.77	0.32	0.47	0.36	0.39	0.27	0.44	0.26
C3'	0.72	0.80	0.60	0.36	0.78	0.39	0.80	0.21	0.83	0.71	0.82	0.79	0.79	0.74	0.74	0.72	0.27	0.59	0.46	0.85	0.10	0.16	0.11
C4	0.22	0.18	0.25	0.19	0.09	0.18	0.13	0.38	0.27	0.09	0.22	0.23	0.18	0.17	0.11	0.42	0.22	0.09	0.33	0.43	0.46	0.75	0.52
C4'	0.32	0.27	0.22	0.11	0.32	0.07	0.37	0.17	0.34	0.41	0.28	0.29	0.28	0.45	0.34	0.31	0.19	0.20	0.30	0.40	0.18	0.24	0.13
C5	0.17	0.16	0.29	0.15	0.06	0.20	0.21	0.46	0.33	0.11	0.24	0.18	0.12	0.25	0.05	0.47	0.17	0.10	0.39	0.46	0.54	0.88	0.62
C5'	0.20	0.17	0.14	0.21	0.24	0.14	0.37	0.27	0.35	0.43	0.21	0.24	0.16	0.52	0.27	0.18	0.37	0.11	0.31	0.49	0.17	0.12	0.07
C6	0.20	0.12	0.30	0.19	0.07	0.23	0.24	0.49	0.31	0.14	0.22	0.11	0.08	0.27	0.07	0.50	0.21	0.11	0.38	0.40	0.54	0.89	0.61
C8	0.15	0.22	0.30	0.12	0.13	0.19	0.21	0.45	0.33	0.13	0.29	0.25	0.17	0.23	0.09	0.45	0.16	0.14	0.43	0.50	0.57	0.87	0.65
N1	0.27	0.12	0.24	0.31	0.11	0.23	0.20	0.41	0.28	0.12	0.21	0.11	0.14	0.21	0.14	0.45	0.35	0.15	0.27	0.35	0.44	0.75	0.49
N3	0.26	0.18	0.22	0.27	0.12	0.20	0.08	0.34	0.20	0.09	0.16	0.25	0.22	0.13	0.15	0.38	0.33	0.15	0.26	0.35	0.40	0.66	0.42
N6	0.16	0.14	0.37	0.13	0.14	0.27	0.28	0.61	0.32	0.21	0.24	0.10	0.09	0.33	0.11	0.56	0.16	0.20	0.48	0.39	0.64	1.03	0.74
N7	0.13	0.19	0.33	0.11	0.10	0.20	0.24	0.50	0.35	0.14	0.28	0.20	0.13	0.28	0.06	0.48	0.17	0.16	0.47	0.49	0.62	0.97	0.72
N9	0.20	0.23	0.27	0.15	0.13	0.17	0.16	0.37	0.29	0.12	0.27	0.28	0.20	0.18	0.13	0.42	0.17	0.10	0.37	0.46	0.47	0.74	0.54
O2'	0.62	0.74	0.58	0.34	0.59	0.34	0.45	0.18	0.44	0.39	0.62	0.84	0.71	0.32	0.54	0.76	0.32	0.46	0.37	0.26	0.30	0.49	0.31
O3'	0.94	1.15	0.77	0.51	1.06	0.59	1.07	0.40	1.17	0.90	1.20	1.17	1.09	0.96	0.97	0.88	0.39	0.83	0.62	1.22	0.13	0.16	0.25
O4'	0.14	0.40	0.16	0.25	0.19	0.23	0.15	0.38	0.24	0.16	0.38	0.51	0.31	0.18	0.12	0.20	0.31	0.12	0.30	0.25	0.32	0.46	0.34
O5'	0.60	0.59	0.70	0.95	0.54	0.95	0.44	1.15	0.39	0.47	0.48	0.64	0.61	0.41	0.54	0.61	1.06	0.75	0.87	0.29	1.08	1.03	1.00
OP1	0.31	0.30	0.49	0.67	0.24	0.60	0.25	0.72	0.27	0.26	0.21	0.39	0.33	0.36	0.24	0.50	0.88	0.34	0.43	0.43	0.56	0.39	0.42
OP2	1.06	0.88	1.07	1.40	0.94	1.52	0.86	1.83	0.76	0.96	0.78	0.87	0.95	0.88	1.00	0.96	1.47	1.32	1.54	0.65	1.88	1.80	1.78
P	0.86	0.70	1.00	1.29	0.71	1.29	0.55	1.50	0.45	0.64	0.55	0.75	0.78	0.51	0.75	0.94	1.44	1.03	1.15	0.28	1.42	1.26	1.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.05	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.33	0.12
C2	0.05	0.00	0.25	0.24	0.01	0.04	0.01	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.17	0.32	0.18	0.15	0.03	0.06	0.32	0.08
C2'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.14	0.00	0.06	0.01	0.12	0.12	0.19	0.30	0.25	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.09	0.22	0.24	0.07
C3'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.14	0.01	0.09	0.02	0.15	0.10	0.21	0.28	0.21	0.03	0.02	0.02	0.01	0.01	0.23	0.13	0.30	0.21	0.15
C4	0.02	0.01	0.14	0.14	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.08	0.16	0.09	0.13	0.02	0.07	0.34	0.11
C4'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.07	0.03	0.05	0.04	0.07	0.02	0.03	0.01	0.00	0.02	0.06	0.09	0.26	0.05
C5	0.01	0.01	0.06	0.09	0.01	0.04	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.11	0.03	0.16	0.01	0.12	0.36	0.16
C5'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.04	0.01	0.08	0.00	0.07	0.14	0.05	0.09	0.06	0.14	0.05	0.04	0.03	0.00	0.02	0.10	0.06	0.22	0.02
C6	0.01	0.02	0.12	0.15	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.07	0.19	0.06	0.17	0.01	0.13	0.34	0.15
C8	0.02	0.01	0.12	0.10	0.00	0.07	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.09	0.12	0.12	0.18	0.01	0.14	0.39	0.23
N1	0.04	0.00	0.19	0.21	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.28	0.14	0.16	0.02	0.09	0.32	0.10
N2	0.05	0.00	0.30	0.28	0.01	0.05	0.01	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.39	0.22	0.15	0.02	0.06	0.32	0.08
N3	0.04	0.00	0.25	0.21	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.17	0.27	0.18	0.13	0.03	0.05	0.32	0.08
N7	0.01	0.02	0.06	0.03	0.02	0.07	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.06	0.04	0.08	0.19	0.01	0.17	0.40	0.24
N9	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.11	0.01	0.08	0.34	0.14
O2'	0.02	0.17	0.01	0.02	0.08	0.03	0.03	0.04	0.07	0.09	0.12	0.23	0.17	0.06	0.01	0.00	0.02	0.04	0.02	0.05	0.18	0.26	0.05
O3'	0.00	0.32	0.01	0.01	0.16	0.01	0.11	0.03	0.19	0.12	0.28	0.39	0.27	0.04	0.02	0.02	0.00	0.00	0.22	0.17	0.41	0.21	0.23
O4'	0.00	0.18	0.01	0.01	0.09	0.00	0.03	0.00	0.06	0.12	0.14	0.22	0.18	0.08	0.01	0.04	0.00	0.00	0.12	0.03	0.10	0.37	0.19
O5'	0.03	0.15	0.14	0.23	0.13	0.02	0.16	0.02	0.17	0.18	0.16	0.15	0.13	0.19	0.11	0.02	0.22	0.12	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01
O6	0.01	0.03	0.09	0.13	0.02	0.06	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.01	0.05	0.17	0.03	0.18	0.00	0.17	0.34	0.18
OP1	0.07	0.06	0.22	0.30	0.07	0.09	0.12	0.06	0.13	0.14	0.09	0.06	0.05	0.17	0.08	0.18	0.41	0.10	0.01	0.17	0.00	0.00	0.00
OP2	0.33	0.32	0.24	0.21	0.34	0.26	0.36	0.22	0.34	0.39	0.32	0.32	0.32	0.40	0.34	0.26	0.21	0.37	0.01	0.34	0.00	0.00	0.00
P	0.12	0.08	0.07	0.15	0.11	0.05	0.16	0.02	0.15	0.23	0.10	0.08	0.08	0.24	0.14	0.05	0.23	0.19	0.01	0.18	0.00	0.00	0.00