Doublet Group distance statistics: 53890

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.013, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.003, 0.012, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.007, 0.017, 0.027, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C5	A	0, 0.007, 0.018, 0.028, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.018 std_dev=0.010
N7	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C2	A	0, 0.003, 0.017, 0.030, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.017 std_dev=0.014
N3	A	0, 0.002, 0.016, 0.030, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.007, 0.022, 0.038, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.022 std_dev=0.015
N1	A	0, 0.000, 0.016, 0.033, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.016 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.006, 0.026, 0.046, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.026 std_dev=0.020
N6	A	0, 0.006, 0.034, 0.061, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.034 std_dev=0.027
C2'	A	0, -0.015, 0.106, 0.228, 0.311 max_d=0.311 avg_d=0.106 std_dev=0.122
O4'	A	0, 0.035, 0.158, 0.281, 0.337 max_d=0.337 avg_d=0.158 std_dev=0.123
O2'	A	0, 0.008, 0.141, 0.274, 0.360 max_d=0.360 avg_d=0.141 std_dev=0.133
C4'	A	0, 0.020, 0.199, 0.379, 0.463 max_d=0.463 avg_d=0.199 std_dev=0.179
C3'	A	0, 0.019, 0.207, 0.394, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.207 std_dev=0.188
OP2	A	0, 0.153, 0.396, 0.639, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.396 std_dev=0.243
O5'	A	0, 0.163, 0.423, 0.682, 0.707 max_d=0.707 avg_d=0.423 std_dev=0.260
N1	B	0, 0.143, 0.407, 0.670, 0.643 max_d=0.643 avg_d=0.407 std_dev=0.263
P	A	0, 0.177, 0.449, 0.721, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.449 std_dev=0.272
C5'	A	0, 0.074, 0.352, 0.629, 0.753 max_d=0.753 avg_d=0.352 std_dev=0.278
N2	B	0, 0.126, 0.411, 0.696, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.411 std_dev=0.285
O6	B	0, 0.174, 0.476, 0.777, 0.741 max_d=0.741 avg_d=0.476 std_dev=0.301
C2	B	0, 0.135, 0.442, 0.749, 0.762 max_d=0.762 avg_d=0.442 std_dev=0.307
O3'	A	0, 0.038, 0.346, 0.654, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.346 std_dev=0.308
OP1	A	0, 0.215, 0.525, 0.835, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.525 std_dev=0.310
C6	B	0, 0.162, 0.475, 0.788, 0.766 max_d=0.766 avg_d=0.475 std_dev=0.313
N3	B	0, 0.137, 0.542, 0.947, 0.995 max_d=0.995 avg_d=0.542 std_dev=0.405
C5	B	0, 0.163, 0.574, 0.985, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.574 std_dev=0.411
C4	B	0, 0.144, 0.588, 1.032, 1.089 max_d=1.089 avg_d=0.588 std_dev=0.444
N7	B	0, 0.183, 0.673, 1.164, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.673 std_dev=0.490
N9	B	0, 0.159, 0.704, 1.249, 1.346 max_d=1.346 avg_d=0.704 std_dev=0.545
C8	B	0, 0.176, 0.734, 1.292, 1.390 max_d=1.390 avg_d=0.734 std_dev=0.558
C1'	B	0, 0.176, 0.791, 1.406, 1.519 max_d=1.519 avg_d=0.791 std_dev=0.615
C2'	B	0, 0.187, 0.807, 1.427, 1.571 max_d=1.571 avg_d=0.807 std_dev=0.620
O4'	B	0, 0.172, 0.808, 1.444, 1.537 max_d=1.537 avg_d=0.808 std_dev=0.636
OP1	B	0, 0.394, 1.039, 1.684, 1.655 max_d=1.655 avg_d=1.039 std_dev=0.645
O2'	B	0, 0.284, 0.930, 1.575, 1.731 max_d=1.731 avg_d=0.930 std_dev=0.645
C5'	B	0, 0.145, 0.808, 1.470, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.808 std_dev=0.662
C3'	B	0, 0.192, 0.867, 1.542, 1.709 max_d=1.709 avg_d=0.867 std_dev=0.675
P	B	0, 0.285, 0.976, 1.666, 1.864 max_d=1.864 avg_d=0.976 std_dev=0.691
C4'	B	0, 0.159, 0.854, 1.548, 1.730 max_d=1.730 avg_d=0.854 std_dev=0.695
O3'	B	0, 0.270, 1.009, 1.748, 1.924 max_d=1.924 avg_d=1.009 std_dev=0.739
O5'	B	0, 0.179, 0.933, 1.687, 1.943 max_d=1.943 avg_d=0.933 std_dev=0.754
OP2	B	0, 0.274, 1.070, 1.865, 2.229 max_d=2.229 avg_d=1.070 std_dev=0.796

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01
C2	0.03	0.00	0.09	0.07	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.10	0.11	0.04	0.01	0.02	0.08	0.03
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.02	0.07	0.08	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.06	0.08	0.05
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.05	0.06	0.06	0.05	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.07	0.09	0.09	0.08
C4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.06	0.03	0.01	0.02	0.07	0.03
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02
C5	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.06	0.03	0.03	0.05	0.10	0.05
C5'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.03	0.02	0.02	0.07	0.04	0.02	0.02	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01
C6	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.07	0.04	0.04	0.06	0.11	0.06
C8	0.00	0.01	0.02	0.05	0.00	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.06	0.03	0.02	0.03	0.07	0.03
N1	0.03	0.01	0.07	0.06	0.02	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.10	0.04	0.02	0.04	0.10	0.04
N3	0.03	0.01	0.08	0.06	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.10	0.04	0.01	0.02	0.06	0.02
N6	0.02	0.01	0.02	0.05	0.01	0.04	0.02	0.07	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.03	0.07	0.04	0.07	0.11	0.16	0.10
N7	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.07	0.03	0.04	0.06	0.10	0.05
N9	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.05	0.01
O2'	0.01	0.10	0.00	0.02	0.05	0.02	0.03	0.02	0.05	0.02	0.09	0.10	0.03	0.01	0.02	0.00	0.05	0.03	0.03	0.05	0.06	0.03
O3'	0.01	0.11	0.02	0.01	0.06	0.02	0.06	0.05	0.07	0.06	0.10	0.10	0.07	0.07	0.03	0.05	0.00	0.01	0.12	0.17	0.14	0.13
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.03	0.02	0.03	0.01	0.00	0.05	0.05	0.02	0.05
O5'	0.01	0.01	0.05	0.07	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.02	0.02	0.01	0.07	0.04	0.01	0.03	0.12	0.05	0.00	0.01	0.02	0.00
OP1	0.01	0.02	0.06	0.09	0.02	0.02	0.05	0.02	0.06	0.03	0.04	0.02	0.11	0.06	0.01	0.05	0.17	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.03	0.08	0.08	0.09	0.07	0.03	0.10	0.02	0.11	0.07	0.10	0.06	0.16	0.10	0.05	0.06	0.14	0.02	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.01	0.03	0.05	0.08	0.03	0.02	0.05	0.01	0.06	0.03	0.04	0.02	0.10	0.05	0.01	0.03	0.13	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.05	0.06	0.07	0.07	0.05	0.06	0.07	0.12	0.07	0.08	0.05	0.10	0.05	0.11	0.05	0.10	0.04	0.04	0.13	0.10	0.20	0.28	0.17
C2	0.08	0.22	0.13	0.16	0.10	0.18	0.06	0.24	0.07	0.13	0.16	0.27	0.21	0.16	0.06	0.11	0.10	0.14	0.24	0.09	0.26	0.26	0.24
C2'	0.08	0.13	0.11	0.13	0.07	0.14	0.02	0.18	0.03	0.01	0.10	0.18	0.11	0.03	0.05	0.10	0.13	0.12	0.20	0.06	0.26	0.31	0.22
C3'	0.12	0.17	0.15	0.16	0.12	0.16	0.10	0.19	0.12	0.07	0.16	0.19	0.15	0.07	0.11	0.15	0.16	0.14	0.20	0.09	0.26	0.31	0.22
C4	0.11	0.18	0.15	0.15	0.12	0.15	0.08	0.18	0.09	0.08	0.15	0.21	0.17	0.09	0.10	0.14	0.12	0.14	0.17	0.07	0.20	0.22	0.18
C4'	0.05	0.08	0.08	0.08	0.05	0.07	0.04	0.13	0.05	0.03	0.08	0.11	0.06	0.04	0.04	0.09	0.07	0.05	0.15	0.04	0.23	0.32	0.20
C5	0.21	0.23	0.22	0.23	0.20	0.24	0.15	0.24	0.15	0.14	0.19	0.24	0.23	0.12	0.19	0.21	0.20	0.23	0.24	0.09	0.23	0.24	0.22
C5'	0.06	0.09	0.09	0.08	0.06	0.07	0.06	0.12	0.08	0.06	0.09	0.11	0.07	0.06	0.06	0.11	0.08	0.06	0.14	0.08	0.23	0.32	0.19
C6	0.27	0.27	0.28	0.29	0.25	0.31	0.19	0.31	0.17	0.18	0.22	0.28	0.29	0.14	0.25	0.26	0.25	0.31	0.32	0.09	0.28	0.31	0.30
C8	0.16	0.16	0.18	0.18	0.15	0.17	0.13	0.17	0.13	0.13	0.15	0.18	0.16	0.13	0.15	0.19	0.16	0.17	0.16	0.10	0.20	0.21	0.17
N1	0.22	0.27	0.24	0.26	0.21	0.30	0.11	0.32	0.12	0.08	0.21	0.30	0.28	0.07	0.18	0.20	0.20	0.28	0.33	0.07	0.30	0.32	0.31
N3	0.04	0.17	0.08	0.09	0.05	0.10	0.08	0.16	0.07	0.13	0.12	0.22	0.13	0.16	0.05	0.08	0.05	0.06	0.16	0.10	0.20	0.22	0.18
N6	0.37	0.29	0.36	0.38	0.31	0.40	0.25	0.38	0.20	0.29	0.24	0.30	0.33	0.22	0.34	0.34	0.35	0.40	0.39	0.12	0.32	0.38	0.36
N7	0.22	0.21	0.24	0.24	0.21	0.24	0.18	0.23	0.17	0.18	0.19	0.22	0.22	0.17	0.21	0.23	0.21	0.24	0.22	0.12	0.21	0.23	0.21
N9	0.10	0.13	0.13	0.13	0.09	0.12	0.08	0.14	0.08	0.08	0.11	0.16	0.12	0.09	0.09	0.14	0.10	0.11	0.14	0.07	0.19	0.22	0.16
O2'	0.04	0.06	0.05	0.08	0.03	0.12	0.07	0.17	0.09	0.07	0.02	0.12	0.05	0.10	0.03	0.05	0.09	0.09	0.20	0.15	0.26	0.34	0.22
O3'	0.19	0.22	0.22	0.23	0.19	0.22	0.16	0.24	0.17	0.14	0.21	0.25	0.21	0.13	0.17	0.21	0.23	0.20	0.24	0.15	0.28	0.32	0.24
O4'	0.06	0.04	0.07	0.06	0.05	0.05	0.06	0.11	0.05	0.08	0.04	0.07	0.04	0.09	0.06	0.10	0.03	0.04	0.13	0.06	0.21	0.31	0.19
O5'	0.11	0.11	0.13	0.12	0.10	0.10	0.09	0.12	0.10	0.10	0.11	0.13	0.10	0.10	0.10	0.15	0.11	0.10	0.13	0.10	0.21	0.27	0.17
OP1	0.11	0.10	0.13	0.12	0.10	0.09	0.10	0.12	0.10	0.12	0.10	0.11	0.09	0.12	0.11	0.16	0.11	0.10	0.13	0.11	0.22	0.30	0.18
OP2	0.13	0.11	0.14	0.13	0.11	0.11	0.11	0.12	0.11	0.13	0.11	0.12	0.11	0.13	0.13	0.17	0.11	0.12	0.11	0.11	0.21	0.24	0.16
P	0.12	0.11	0.14	0.12	0.11	0.10	0.11	0.11	0.11	0.12	0.11	0.12	0.10	0.12	0.12	0.16	0.11	0.11	0.11	0.11	0.19	0.26	0.16

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.04	0.04	0.03	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.14	0.02	0.05
C2	0.04	0.00	0.05	0.05	0.02	0.06	0.02	0.10	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.06	0.07	0.09	0.12	0.02	0.29	0.23	0.18
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.02	0.04	0.05	0.05	0.02	0.05	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.03	0.02	0.05	0.05	0.18	0.03	0.08
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.02	0.06	0.05	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.05	0.07	0.08	0.02
C4	0.02	0.02	0.04	0.03	0.00	0.04	0.01	0.09	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.06	0.05	0.05	0.09	0.02	0.25	0.14	0.14
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.06	0.07	0.05	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.03	0.05	0.03	0.07	0.03
C5	0.03	0.02	0.04	0.04	0.01	0.04	0.00	0.09	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.01	0.02	0.07	0.05	0.04	0.09	0.01	0.26	0.15	0.14
C5'	0.03	0.10	0.05	0.02	0.09	0.00	0.09	0.00	0.10	0.06	0.10	0.12	0.10	0.08	0.07	0.05	0.04	0.02	0.01	0.10	0.02	0.03	0.03
C6	0.04	0.01	0.05	0.05	0.02	0.05	0.01	0.10	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.07	0.06	0.06	0.11	0.01	0.28	0.19	0.16
C8	0.01	0.04	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.03	0.00	0.03	0.04	0.03	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.05	0.02	0.21	0.06	0.09
N1	0.04	0.01	0.05	0.06	0.02	0.06	0.02	0.10	0.01	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.07	0.07	0.08	0.12	0.02	0.29	0.23	0.18
N2	0.04	0.01	0.03	0.05	0.03	0.07	0.03	0.12	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.06	0.09	0.15	0.03	0.31	0.30	0.21
N3	0.03	0.01	0.04	0.05	0.01	0.05	0.02	0.10	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.02	0.05	0.06	0.08	0.10	0.02	0.27	0.18	0.15
N7	0.01	0.03	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.08	0.02	0.01	0.03	0.04	0.03	0.00	0.01	0.06	0.04	0.02	0.07	0.02	0.24	0.10	0.12
N9	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.07	0.03	0.01	0.03	0.03	0.02	0.01	0.00	0.04	0.03	0.02	0.06	0.03	0.21	0.07	0.10
O2'	0.02	0.06	0.01	0.02	0.06	0.03	0.07	0.05	0.07	0.05	0.07	0.04	0.05	0.06	0.04	0.00	0.05	0.03	0.05	0.07	0.22	0.02	0.09
O3'	0.03	0.07	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.04	0.06	0.03	0.07	0.06	0.06	0.04	0.03	0.05	0.00	0.04	0.07	0.06	0.02	0.18	0.07
O4'	0.01	0.09	0.02	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.08	0.09	0.08	0.02	0.02	0.03	0.04	0.00	0.03	0.06	0.05	0.05	0.03
O5'	0.01	0.12	0.05	0.04	0.09	0.03	0.09	0.01	0.11	0.05	0.12	0.15	0.10	0.07	0.06	0.05	0.07	0.03	0.00	0.10	0.03	0.02	0.01
O6	0.04	0.02	0.05	0.05	0.02	0.05	0.01	0.10	0.01	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.03	0.07	0.06	0.06	0.10	0.00	0.27	0.19	0.16
OP1	0.14	0.29	0.18	0.07	0.25	0.03	0.26	0.02	0.28	0.21	0.29	0.31	0.27	0.24	0.21	0.22	0.02	0.05	0.03	0.27	0.00	0.04	0.01
OP2	0.02	0.23	0.03	0.08	0.14	0.07	0.15	0.03	0.19	0.06	0.23	0.30	0.18	0.10	0.07	0.02	0.18	0.05	0.02	0.19	0.04	0.00	0.01
P	0.05	0.18	0.08	0.02	0.14	0.03	0.14	0.03	0.16	0.09	0.18	0.21	0.15	0.12	0.10	0.09	0.07	0.03	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00