Doublet Group distance statistics: 53898

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C8	A	0, 0.000, 0.004, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.004 std_dev=0.004
N1	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.000, 0.006, 0.013, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.006 std_dev=0.006
N9	A	0, 0.000, 0.007, 0.014, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N7	A	0, 0.000, 0.008, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.008 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C2	A	0, 0.000, 0.013, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C1'	A	0, 0.000, 0.017, 0.033, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N6	A	0, 0.000, 0.027, 0.055, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.027 std_dev=0.027
O3'	A	0, 0.000, 0.136, 0.273, 0.273 max_d=0.273 avg_d=0.136 std_dev=0.136
N3	B	0, 0.000, 0.166, 0.332, 0.332 max_d=0.332 avg_d=0.166 std_dev=0.166
C4	B	0, 0.000, 0.253, 0.506, 0.506 max_d=0.506 avg_d=0.253 std_dev=0.253
C2	B	0, 0.000, 0.342, 0.683, 0.683 max_d=0.683 avg_d=0.342 std_dev=0.342
C5	B	0, 0.000, 0.369, 0.739, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.369 std_dev=0.369
C6	B	0, 0.000, 0.460, 0.921, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.460 std_dev=0.460
N9	B	0, 0.000, 0.463, 0.926, 0.926 max_d=0.926 avg_d=0.463 std_dev=0.463
N1	B	0, 0.000, 0.475, 0.951, 0.951 max_d=0.951 avg_d=0.475 std_dev=0.475
N7	B	0, 0.000, 0.552, 1.103, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.552 std_dev=0.552
C3'	A	0, 0.000, 0.563, 1.126, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.563 std_dev=0.563
N2	B	0, 0.000, 0.563, 1.126, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.563 std_dev=0.563
C1'	B	0, 0.000, 0.570, 1.140, 1.140 max_d=1.140 avg_d=0.570 std_dev=0.570
O4'	A	0, 0.000, 0.592, 1.184, 1.184 max_d=1.184 avg_d=0.592 std_dev=0.592
C8	B	0, 0.000, 0.594, 1.188, 1.188 max_d=1.188 avg_d=0.594 std_dev=0.594
C2'	A	0, 0.000, 0.600, 1.201, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.600 std_dev=0.600
O6	B	0, 0.000, 0.605, 1.210, 1.210 max_d=1.210 avg_d=0.605 std_dev=0.605
C4'	A	0, 0.000, 0.841, 1.682, 1.682 max_d=1.682 avg_d=0.841 std_dev=0.841
C2'	B	0, 0.000, 0.876, 1.751, 1.751 max_d=1.751 avg_d=0.876 std_dev=0.876
O2'	A	0, 0.000, 1.018, 2.036, 2.036 max_d=2.036 avg_d=1.018 std_dev=1.018
O2'	B	0, 0.000, 1.021, 2.043, 2.043 max_d=2.043 avg_d=1.021 std_dev=1.021
C5'	A	0, 0.000, 1.443, 2.885, 2.885 max_d=2.885 avg_d=1.443 std_dev=1.443
O5'	A	0, 0.000, 1.716, 3.431, 3.431 max_d=3.431 avg_d=1.716 std_dev=1.716
O4'	B	0, 0.000, 1.723, 3.446, 3.446 max_d=3.446 avg_d=1.723 std_dev=1.723
OP1	A	0, 0.000, 1.763, 3.526, 3.526 max_d=3.526 avg_d=1.763 std_dev=1.763
C3'	B	0, 0.000, 1.891, 3.783, 3.783 max_d=3.783 avg_d=1.891 std_dev=1.891
C4'	B	0, 0.000, 2.081, 4.163, 4.163 max_d=4.163 avg_d=2.081 std_dev=2.081
P	A	0, 0.000, 2.211, 4.423, 4.423 max_d=4.423 avg_d=2.211 std_dev=2.211
O3'	B	0, 0.000, 2.697, 5.395, 5.395 max_d=5.395 avg_d=2.697 std_dev=2.697
OP2	A	0, 0.000, 3.548, 7.097, 7.097 max_d=7.097 avg_d=3.548 std_dev=3.548
C5'	B	0, 0.000, 3.574, 7.148, 7.148 max_d=7.148 avg_d=3.574 std_dev=3.574
O5'	B	0, 0.000, 3.897, 7.794, 7.794 max_d=7.794 avg_d=3.897 std_dev=3.897
P	B	0, 0.000, 5.398, 10.796, 10.796 max_d=10.796 avg_d=5.398 std_dev=5.398
OP2	B	0, 0.000, 5.446, 10.893, 10.893 max_d=10.893 avg_d=5.446 std_dev=5.446
OP1	B	0, 0.000, 6.376, 12.752, 12.752 max_d=12.752 avg_d=6.376 std_dev=6.376

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.00	0.13	0.27	0.18	0.01
C2	0.02	0.00	0.09	0.06	0.01	0.26	0.01	0.32	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.28	0.09	0.28	0.42	0.53	0.16	0.20
C2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.04	0.09	0.07	0.09	0.02	0.05	0.01	0.00	0.03	0.02	0.08	0.37	0.32	0.04
C3'	0.02	0.06	0.01	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.12	0.19	0.02
C4	0.01	0.01	0.04	0.03	0.00	0.11	0.00	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.08	0.15	0.26	0.42	0.11	0.03
C4'	0.01	0.26	0.01	0.00	0.11	0.00	0.03	0.01	0.09	0.17	0.19	0.25	0.04	0.11	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.05	0.07	0.01
C5	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.08	0.06	0.18	0.39	0.28	0.10
C5'	0.01	0.32	0.04	0.02	0.12	0.01	0.00	0.00	0.08	0.27	0.23	0.31	0.01	0.21	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.21	0.23	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.09	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.08	0.12	0.25	0.45	0.17	0.03
C8	0.01	0.01	0.09	0.03	0.01	0.17	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.26	0.07	0.14	0.07	0.22	0.63	0.34
N1	0.01	0.00	0.07	0.04	0.00	0.19	0.00	0.23	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.20	0.08	0.21	0.36	0.51	0.04	0.11
N3	0.02	0.00	0.09	0.06	0.00	0.25	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.28	0.09	0.29	0.39	0.49	0.12	0.18
N6	0.01	0.02	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.08	0.19	0.41	0.28	0.12
N7	0.01	0.01	0.05	0.02	0.00	0.11	0.00	0.21	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.19	0.07	0.07	0.00	0.28	0.59	0.31
N9	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.07	0.00	0.13	0.32	0.29	0.09
O2'	0.01	0.28	0.00	0.01	0.11	0.01	0.00	0.04	0.08	0.26	0.20	0.28	0.02	0.19	0.05	0.00	0.02	0.00	0.07	0.47	0.40	0.06
O3'	0.07	0.09	0.03	0.00	0.08	0.00	0.08	0.00	0.08	0.07	0.08	0.09	0.08	0.07	0.07	0.02	0.00	0.01	0.07	0.04	0.17	0.01
O4'	0.00	0.28	0.02	0.00	0.15	0.00	0.06	0.02	0.12	0.14	0.21	0.29	0.08	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.16	0.10	0.08	0.02
O5'	0.13	0.42	0.08	0.04	0.26	0.02	0.18	0.00	0.25	0.07	0.36	0.39	0.19	0.00	0.13	0.07	0.07	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.27	0.53	0.37	0.12	0.42	0.05	0.39	0.21	0.45	0.22	0.51	0.49	0.41	0.28	0.32	0.47	0.04	0.10	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.18	0.16	0.32	0.19	0.11	0.07	0.28	0.23	0.17	0.63	0.04	0.12	0.28	0.59	0.29	0.40	0.17	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.01	0.20	0.04	0.02	0.03	0.01	0.10	0.01	0.03	0.34	0.11	0.18	0.12	0.31	0.09	0.06	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.07	0.02	0.36	0.02	0.00	0.58	0.12	1.02	0.23	0.05	0.16	0.13	0.09	0.14	0.04	0.52	0.16	0.67	0.97	0.35	1.19	0.97	1.27
C2	0.23	0.12	0.47	0.03	0.08	0.77	0.00	1.29	0.13	0.15	0.19	0.20	0.05	0.06	0.19	0.66	0.33	1.01	1.18	0.17	1.39	1.04	1.44
C2'	0.19	0.24	0.51	0.15	0.26	0.30	0.35	0.71	0.46	0.28	0.41	0.14	0.19	0.35	0.22	0.67	0.27	0.33	0.66	0.55	0.87	0.68	0.93
C3'	0.09	0.13	0.43	0.04	0.18	0.46	0.34	0.90	0.45	0.27	0.34	0.02	0.07	0.38	0.15	0.58	0.16	0.48	0.84	0.62	1.12	0.87	1.15
C4	0.13	0.01	0.44	0.13	0.05	0.51	0.05	0.89	0.16	0.04	0.15	0.01	0.08	0.04	0.10	0.56	0.37	0.72	0.79	0.23	0.88	0.62	0.98
C4'	0.10	0.01	0.34	0.01	0.05	0.62	0.26	1.06	0.40	0.17	0.25	0.18	0.10	0.32	0.01	0.45	0.17	0.70	0.93	0.62	1.19	0.85	1.22
C5	0.13	0.04	0.48	0.35	0.09	0.26	0.02	0.48	0.05	0.08	0.03	0.04	0.10	0.03	0.13	0.50	0.60	0.58	0.30	0.11	0.24	0.02	0.36
C5'	0.02	0.08	0.45	0.20	0.16	0.41	0.41	0.76	0.55	0.31	0.36	0.11	0.01	0.49	0.12	0.49	0.39	0.55	0.55	0.81	0.68	0.29	0.73
C6	0.21	0.00	0.54	0.45	0.14	0.25	0.09	0.44	0.00	0.19	0.03	0.05	0.09	0.13	0.21	0.52	0.75	0.66	0.23	0.04	0.15	0.12	0.27
C8	0.05	0.11	0.40	0.28	0.04	0.21	0.05	0.40	0.09	0.04	0.01	0.17	0.11	0.09	0.04	0.44	0.48	0.43	0.24	0.19	0.16	0.07	0.29
N1	0.27	0.08	0.54	0.26	0.12	0.55	0.06	0.90	0.06	0.21	0.12	0.16	0.06	0.13	0.24	0.63	0.60	0.93	0.72	0.08	0.77	0.45	0.85
N3	0.17	0.10	0.44	0.02	0.04	0.74	0.06	1.28	0.20	0.07	0.23	0.12	0.05	0.02	0.12	0.63	0.24	0.90	1.21	0.25	1.45	1.15	1.52
N6	0.23	0.04	0.56	0.74	0.17	0.08	0.17	0.07	0.09	0.27	0.04	0.02	0.10	0.23	0.25	0.42	1.04	0.45	0.34	0.07	0.54	0.78	0.40
N7	0.07	0.11	0.44	0.43	0.07	0.06	0.02	0.17	0.00	0.02	0.06	0.13	0.11	0.01	0.07	0.42	0.65	0.37	0.05	0.06	0.22	0.47	0.08
N9	0.08	0.04	0.40	0.12	0.03	0.44	0.08	0.79	0.18	0.02	0.11	0.11	0.09	0.10	0.05	0.51	0.32	0.61	0.69	0.28	0.77	0.55	0.88
O2'	0.27	0.32	0.50	0.07	0.28	0.27	0.27	0.71	0.32	0.23	0.37	0.28	0.28	0.24	0.24	0.74	0.16	0.23	0.76	0.29	1.02	0.94	1.08
O3'	0.08	0.05	0.24	0.26	0.00	0.74	0.14	1.28	0.24	0.08	0.14	0.20	0.10	0.18	0.03	0.46	0.14	0.70	1.29	0.38	1.70	1.51	1.72
O4'	0.23	0.12	0.27	0.07	0.09	0.72	0.11	1.17	0.25	0.01	0.13	0.25	0.21	0.15	0.13	0.39	0.14	0.85	1.04	0.45	1.26	0.94	1.33
O5'	0.00	0.12	0.41	0.24	0.19	0.29	0.42	0.55	0.57	0.32	0.38	0.05	0.03	0.50	0.14	0.42	0.40	0.44	0.29	0.85	0.32	0.08	0.38
OP1	0.20	0.14	0.21	0.22	0.07	0.25	0.12	0.33	0.21	0.06	0.05	0.27	0.19	0.20	0.09	0.15	0.40	0.48	0.02	0.43	0.21	0.58	0.08
OP2	0.73	0.81	1.10	1.06	0.97	0.55	1.29	0.43	1.43	1.19	1.13	0.57	0.74	1.43	0.93	0.99	1.19	0.38	0.81	1.79	0.88	1.43	0.86
P	0.36	0.37	0.77	0.72	0.52	0.20	0.76	0.05	0.86	0.70	0.62	0.17	0.33	0.88	0.49	0.71	0.88	0.00	0.36	1.13	0.45	0.87	0.37

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.05	0.11	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.14	0.03	0.08	0.30	0.16
C2	0.07	0.00	0.16	0.42	0.01	0.63	0.01	1.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.45	0.36	0.48	1.25	0.03	1.39	1.40	1.47
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.06	0.01	0.02	0.00	0.05	0.08	0.11	0.22	0.15	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.04	0.01	0.13	0.03
C3'	0.00	0.42	0.00	0.00	0.19	0.00	0.06	0.01	0.14	0.24	0.30	0.50	0.41	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.05	0.00	0.05
C4	0.03	0.01	0.06	0.19	0.00	0.29	0.00	0.43	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.19	0.16	0.25	0.37	0.01	0.36	0.18	0.37
C4'	0.01	0.63	0.01	0.00	0.29	0.00	0.10	0.00	0.22	0.33	0.46	0.76	0.62	0.21	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.12	0.06	0.06	0.00
C5	0.01	0.01	0.02	0.06	0.00	0.10	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.06	0.08	0.01	0.01	0.09	0.30	0.08
C5'	0.01	1.07	0.00	0.01	0.43	0.00	0.12	0.00	0.35	0.58	0.78	1.39	1.00	0.40	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00	0.18	0.05	0.02	0.02
C6	0.03	0.01	0.05	0.14	0.01	0.22	0.00	0.35	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.16	0.13	0.17	0.29	0.01	0.25	0.11	0.29
C8	0.03	0.00	0.08	0.24	0.00	0.33	0.00	0.58	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.22	0.18	0.29	0.89	0.02	0.97	1.30	1.05
N1	0.05	0.00	0.11	0.30	0.01	0.46	0.01	0.78	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.33	0.27	0.35	0.86	0.03	0.94	0.92	1.01
N2	0.11	0.01	0.22	0.50	0.02	0.76	0.00	1.39	0.02	0.02	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.61	0.44	0.56	1.68	0.05	2.02	2.14	2.12
N3	0.06	0.01	0.15	0.41	0.00	0.62	0.01	1.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.01	0.01	0.43	0.34	0.50	1.12	0.01	1.17	1.08	1.23
N7	0.02	0.01	0.06	0.15	0.00	0.21	0.00	0.40	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.11	0.16	0.68	0.02	0.85	1.18	0.89
N9	0.01	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.22	0.01	0.22	0.46	0.27
O2'	0.00	0.45	0.00	0.01	0.19	0.02	0.07	0.02	0.16	0.22	0.33	0.61	0.43	0.15	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.10	0.10	0.07	0.02
O3'	0.00	0.36	0.01	0.00	0.16	0.01	0.06	0.00	0.13	0.18	0.27	0.44	0.34	0.11	0.01	0.02	0.00	0.01	0.15	0.07	0.17	0.18	0.17
O4'	0.00	0.48	0.01	0.01	0.25	0.00	0.08	0.01	0.17	0.29	0.35	0.56	0.50	0.16	0.01	0.01	0.01	0.00	0.16	0.10	0.06	0.27	0.15
O5'	0.14	1.25	0.02	0.05	0.37	0.02	0.01	0.00	0.29	0.89	0.86	1.68	1.12	0.68	0.22	0.00	0.15	0.16	0.00	0.09	0.02	0.03	0.00
O6	0.03	0.03	0.04	0.07	0.01	0.12	0.01	0.18	0.01	0.02	0.03	0.05	0.01	0.02	0.01	0.10	0.07	0.10	0.09	0.00	0.02	0.18	0.03
OP1	0.08	1.39	0.01	0.05	0.36	0.06	0.09	0.05	0.25	0.97	0.94	2.02	1.17	0.85	0.22	0.10	0.17	0.06	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00
OP2	0.30	1.40	0.13	0.00	0.18	0.06	0.30	0.02	0.11	1.30	0.92	2.14	1.08	1.18	0.46	0.07	0.18	0.27	0.03	0.18	0.00	0.00	0.00
P	0.16	1.47	0.03	0.05	0.37	0.00	0.08	0.02	0.29	1.05	1.01	2.12	1.23	0.89	0.27	0.02	0.17	0.15	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00