Doublet Group distance statistics: 53906

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 3, 15, 10, 5, 4, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.011, 0.015, 0.020, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.015, 0.022, 0.030, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.022 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.015, 0.023, 0.031, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.023 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.017, 0.025, 0.034, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.025 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.022, 0.033, 0.044, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.033 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.019, 0.030, 0.042, 0.068 max_d=0.068 avg_d=0.030 std_dev=0.012
C1'	A	0, 0.025, 0.039, 0.053, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.039 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.020, 0.035, 0.050, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.035 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.026, 0.042, 0.058, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.042 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.039, 0.057, 0.075, 0.092 max_d=0.092 avg_d=0.057 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.029, 0.050, 0.071, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.050 std_dev=0.021
C4	B	0, 0.244, 0.411, 0.578, 0.906 max_d=0.906 avg_d=0.411 std_dev=0.167
N1	B	0, 0.219, 0.392, 0.565, 0.934 max_d=0.934 avg_d=0.392 std_dev=0.173
N3	B	0, 0.169, 0.363, 0.557, 0.901 max_d=0.901 avg_d=0.363 std_dev=0.194
C6	B	0, 0.345, 0.544, 0.743, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.544 std_dev=0.199
C2'	A	0, 0.294, 0.494, 0.694, 1.220 max_d=1.220 avg_d=0.494 std_dev=0.200
C2	B	0, 0.140, 0.349, 0.559, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.349 std_dev=0.210
N9	B	0, 0.274, 0.487, 0.701, 1.211 max_d=1.211 avg_d=0.487 std_dev=0.214
C5	B	0, 0.335, 0.554, 0.772, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.554 std_dev=0.218
O4'	A	0, 0.333, 0.565, 0.797, 1.297 max_d=1.297 avg_d=0.565 std_dev=0.232
C1'	B	0, 0.226, 0.471, 0.717, 1.126 max_d=1.126 avg_d=0.471 std_dev=0.246
N6	B	0, 0.477, 0.739, 1.002, 1.450 max_d=1.450 avg_d=0.739 std_dev=0.263
C8	B	0, 0.380, 0.679, 0.978, 1.707 max_d=1.707 avg_d=0.679 std_dev=0.299
N7	B	0, 0.426, 0.746, 1.065, 1.680 max_d=1.680 avg_d=0.746 std_dev=0.319
C4'	A	0, 0.458, 0.779, 1.099, 1.989 max_d=1.989 avg_d=0.779 std_dev=0.320
C3'	A	0, 0.135, 0.503, 0.871, 2.418 max_d=2.418 avg_d=0.503 std_dev=0.368
O2'	A	0, 0.500, 0.889, 1.278, 2.508 max_d=2.508 avg_d=0.889 std_dev=0.389
C2'	B	0, 0.236, 0.708, 1.179, 2.990 max_d=2.990 avg_d=0.708 std_dev=0.472
C3'	B	0, 0.197, 0.692, 1.187, 3.041 max_d=3.041 avg_d=0.692 std_dev=0.495
O4'	B	0, -0.116, 0.414, 0.944, 2.768 max_d=2.768 avg_d=0.414 std_dev=0.530
C5'	A	0, 0.686, 1.288, 1.890, 3.730 max_d=3.730 avg_d=1.288 std_dev=0.602
O3'	B	0, 0.094, 0.710, 1.325, 3.233 max_d=3.233 avg_d=0.710 std_dev=0.616
C4'	B	0, -0.071, 0.550, 1.171, 3.800 max_d=3.800 avg_d=0.550 std_dev=0.621
O3'	A	0, -0.302, 0.362, 1.025, 3.528 max_d=3.528 avg_d=0.362 std_dev=0.664
O5'	A	0, 0.539, 1.263, 1.987, 4.963 max_d=4.963 avg_d=1.263 std_dev=0.724
O2'	B	0, 0.214, 1.030, 1.846, 4.681 max_d=4.681 avg_d=1.030 std_dev=0.816
C5'	B	0, -0.231, 0.814, 1.859, 6.559 max_d=6.559 avg_d=0.814 std_dev=1.045
P	A	0, 0.875, 1.991, 3.107, 7.395 max_d=7.395 avg_d=1.991 std_dev=1.116
OP2	A	0, 0.745, 1.896, 3.047, 7.915 max_d=7.915 avg_d=1.896 std_dev=1.151
O5'	B	0, -0.183, 1.103, 2.389, 7.928 max_d=7.928 avg_d=1.103 std_dev=1.286
OP1	A	0, 1.861, 3.205, 4.549, 8.768 max_d=8.768 avg_d=3.205 std_dev=1.344
P	B	0, -0.664, 1.152, 2.967, 10.742 max_d=10.742 avg_d=1.152 std_dev=1.816
OP2	B	0, -0.718, 1.173, 3.065, 10.763 max_d=10.763 avg_d=1.173 std_dev=1.892
OP1	B	0, -0.717, 1.352, 3.421, 12.672 max_d=12.672 avg_d=1.352 std_dev=2.069

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.18	0.00	0.19	0.21	0.15	0.17
C2	0.03	0.00	0.15	0.10	0.01	0.09	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.30	0.30	0.13	0.09	0.11	0.33	0.12
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.08	0.02	0.04	0.12	0.07	0.09	0.12	0.15	0.05	0.06	0.01	0.00	0.02	0.01	0.34	0.34	0.32	0.33
C3'	0.02	0.10	0.00	0.00	0.10	0.00	0.15	0.02	0.14	0.21	0.11	0.10	0.16	0.21	0.11	0.02	0.01	0.01	0.13	0.24	0.11	0.10
C4	0.02	0.01	0.08	0.10	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.17	0.07	0.11	0.12	0.27	0.11
C4'	0.01	0.09	0.02	0.00	0.09	0.00	0.12	0.00	0.12	0.13	0.10	0.08	0.14	0.14	0.08	0.12	0.02	0.00	0.02	0.15	0.11	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.15	0.00	0.12	0.00	0.23	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.10	0.03	0.14	0.13	0.33	0.14
C5'	0.04	0.21	0.12	0.02	0.19	0.00	0.23	0.00	0.25	0.18	0.24	0.17	0.28	0.23	0.14	0.07	0.09	0.01	0.01	0.17	0.16	0.01
C6	0.02	0.00	0.07	0.14	0.01	0.12	0.00	0.25	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.24	0.14	0.06	0.13	0.14	0.38	0.15
C8	0.01	0.01	0.09	0.21	0.01	0.13	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.16	0.12	0.09	0.19	0.19	0.25	0.21
N1	0.03	0.00	0.12	0.11	0.01	0.10	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.28	0.23	0.10	0.11	0.13	0.38	0.14
N3	0.03	0.00	0.15	0.10	0.00	0.08	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.28	0.30	0.13	0.09	0.11	0.27	0.09
N6	0.01	0.01	0.05	0.16	0.01	0.14	0.01	0.28	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.25	0.11	0.05	0.16	0.17	0.42	0.18
N7	0.01	0.01	0.06	0.21	0.00	0.14	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.19	0.11	0.05	0.18	0.16	0.31	0.18
N9	0.00	0.01	0.01	0.11	0.00	0.08	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.10	0.01	0.15	0.16	0.20	0.15
O2'	0.01	0.30	0.00	0.02	0.20	0.12	0.21	0.07	0.24	0.16	0.28	0.28	0.25	0.19	0.11	0.00	0.04	0.11	0.29	0.29	0.39	0.30
O3'	0.18	0.30	0.02	0.01	0.17	0.02	0.10	0.09	0.14	0.12	0.23	0.30	0.11	0.11	0.10	0.04	0.00	0.12	0.14	0.27	0.16	0.13
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.07	0.00	0.03	0.01	0.06	0.09	0.10	0.13	0.05	0.05	0.01	0.11	0.12	0.00	0.11	0.16	0.18	0.12
O5'	0.19	0.09	0.34	0.13	0.11	0.02	0.14	0.01	0.13	0.19	0.11	0.09	0.16	0.18	0.15	0.29	0.14	0.11	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.21	0.11	0.34	0.24	0.12	0.15	0.13	0.17	0.14	0.19	0.13	0.11	0.17	0.16	0.16	0.29	0.27	0.16	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.33	0.32	0.11	0.27	0.11	0.33	0.16	0.38	0.25	0.38	0.27	0.42	0.31	0.20	0.39	0.16	0.18	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.17	0.12	0.33	0.10	0.11	0.03	0.14	0.01	0.15	0.21	0.14	0.09	0.18	0.18	0.15	0.30	0.13	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.18	0.24	0.15	0.16	0.21	0.21	0.36	0.21	0.24	0.20	0.16	0.29	0.27	0.19	0.41	0.23	0.22	0.28	0.40	0.57	0.39
C2	0.18	0.18	0.18	0.15	0.15	0.34	0.19	0.67	0.21	0.20	0.19	0.16	0.27	0.22	0.16	0.45	0.22	0.28	0.43	0.64	0.72	0.69
C2'	0.18	0.24	0.21	0.14	0.16	0.18	0.20	0.28	0.20	0.27	0.23	0.18	0.30	0.29	0.19	0.31	0.20	0.19	0.34	0.50	0.63	0.45
C3'	0.29	0.28	0.36	0.30	0.23	0.21	0.22	0.20	0.21	0.33	0.28	0.24	0.21	0.30	0.27	0.48	0.34	0.21	0.57	0.72	0.82	0.63
C4	0.18	0.18	0.23	0.13	0.15	0.25	0.19	0.46	0.20	0.22	0.19	0.15	0.27	0.25	0.17	0.46	0.23	0.24	0.22	0.34	0.47	0.37
C4'	0.24	0.22	0.36	0.27	0.19	0.19	0.17	0.23	0.16	0.26	0.22	0.20	0.16	0.23	0.23	0.52	0.34	0.18	0.49	0.66	0.76	0.56
C5	0.18	0.18	0.27	0.15	0.15	0.27	0.18	0.46	0.20	0.22	0.19	0.16	0.24	0.24	0.17	0.52	0.27	0.28	0.23	0.32	0.42	0.34
C5'	0.32	0.24	0.48	0.41	0.24	0.28	0.23	0.31	0.22	0.31	0.25	0.24	0.25	0.26	0.29	0.63	0.46	0.24	0.66	0.85	0.93	0.74
C6	0.18	0.18	0.24	0.12	0.13	0.33	0.17	0.60	0.18	0.20	0.18	0.15	0.22	0.21	0.16	0.55	0.26	0.33	0.32	0.42	0.48	0.48
C8	0.22	0.19	0.32	0.22	0.18	0.24	0.22	0.32	0.23	0.27	0.21	0.18	0.29	0.29	0.21	0.48	0.32	0.26	0.40	0.52	0.65	0.47
N1	0.18	0.18	0.19	0.14	0.14	0.37	0.17	0.72	0.19	0.19	0.19	0.15	0.23	0.21	0.16	0.50	0.24	0.32	0.48	0.65	0.71	0.71
N3	0.17	0.17	0.20	0.13	0.14	0.28	0.19	0.56	0.21	0.21	0.18	0.15	0.28	0.24	0.16	0.43	0.21	0.24	0.29	0.47	0.58	0.52
N6	0.18	0.19	0.29	0.15	0.13	0.38	0.16	0.63	0.17	0.19	0.17	0.17	0.19	0.20	0.15	0.64	0.32	0.40	0.36	0.42	0.44	0.47
N7	0.22	0.20	0.34	0.23	0.19	0.26	0.22	0.35	0.22	0.26	0.21	0.19	0.26	0.27	0.21	0.54	0.34	0.29	0.36	0.46	0.56	0.41
N9	0.19	0.18	0.26	0.16	0.16	0.22	0.21	0.36	0.21	0.25	0.20	0.16	0.29	0.27	0.19	0.45	0.26	0.23	0.28	0.39	0.53	0.37
O2'	0.37	0.45	0.42	0.39	0.41	0.44	0.47	0.58	0.52	0.45	0.50	0.41	0.62	0.50	0.40	0.43	0.34	0.41	0.34	0.48	0.66	0.51
O3'	0.29	0.35	0.33	0.27	0.26	0.23	0.27	0.25	0.29	0.36	0.37	0.28	0.32	0.35	0.29	0.44	0.31	0.24	0.52	0.66	0.79	0.59
O4'	0.20	0.18	0.28	0.17	0.16	0.22	0.16	0.32	0.15	0.21	0.17	0.17	0.18	0.20	0.18	0.47	0.29	0.24	0.31	0.44	0.57	0.39
O5'	0.31	0.48	0.31	0.25	0.39	0.25	0.43	0.22	0.52	0.32	0.53	0.42	0.59	0.37	0.34	0.44	0.37	0.33	0.47	0.70	0.73	0.55
OP1	0.42	0.57	0.46	0.40	0.51	0.33	0.56	0.31	0.64	0.47	0.63	0.51	0.72	0.54	0.46	0.59	0.51	0.40	0.65	0.96	0.96	0.77
OP2	0.51	0.64	0.52	0.49	0.61	0.47	0.67	0.46	0.72	0.56	0.69	0.60	0.79	0.65	0.56	0.60	0.57	0.51	0.73	0.97	0.93	0.80
P	0.42	0.55	0.40	0.35	0.51	0.34	0.56	0.29	0.62	0.47	0.60	0.50	0.69	0.54	0.46	0.52	0.49	0.43	0.54	0.79	0.80	0.62

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.14	0.00	0.23	0.31	0.22	0.22
C2	0.02	0.00	0.24	0.26	0.01	0.26	0.01	0.53	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.09	0.13	0.29	0.42	0.64	0.48
C2'	0.00	0.24	0.00	0.00	0.12	0.02	0.06	0.10	0.11	0.13	0.18	0.24	0.08	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01	0.22	0.37	0.23	0.23
C3'	0.02	0.26	0.00	0.00	0.12	0.00	0.07	0.01	0.12	0.11	0.20	0.25	0.09	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.28	0.16	0.11
C4	0.01	0.01	0.12	0.12	0.00	0.12	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.12	0.05	0.07	0.12	0.14	0.24	0.10
C4'	0.01	0.26	0.02	0.00	0.12	0.00	0.06	0.01	0.11	0.11	0.20	0.25	0.09	0.06	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.17	0.12	0.04
C5	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.06	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.11	0.07	0.04	0.29	0.32	0.37	0.27
C5'	0.04	0.53	0.10	0.01	0.23	0.01	0.12	0.00	0.24	0.21	0.42	0.49	0.18	0.13	0.05	0.06	0.05	0.01	0.01	0.16	0.17	0.02
C6	0.02	0.00	0.11	0.12	0.01	0.11	0.00	0.24	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.05	0.07	0.16	0.17	0.30	0.14
C8	0.01	0.01	0.13	0.11	0.00	0.11	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.16	0.06	0.63	0.72	0.76	0.68
N1	0.02	0.00	0.18	0.20	0.01	0.20	0.00	0.42	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.17	0.06	0.11	0.14	0.25	0.44	0.30
N3	0.02	0.00	0.24	0.25	0.00	0.25	0.00	0.49	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.07	0.13	0.24	0.32	0.54	0.39
N6	0.02	0.01	0.08	0.09	0.01	0.09	0.01	0.18	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.13	0.06	0.06	0.25	0.27	0.38	0.24
N7	0.01	0.01	0.08	0.07	0.00	0.06	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.11	0.13	0.04	0.56	0.66	0.73	0.62
N9	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.01	0.34	0.39	0.36	0.32
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.12	0.04	0.11	0.06	0.14	0.11	0.17	0.17	0.13	0.11	0.06	0.00	0.04	0.03	0.18	0.38	0.26	0.23
O3'	0.14	0.09	0.02	0.00	0.05	0.02	0.07	0.05	0.05	0.16	0.06	0.07	0.06	0.13	0.11	0.04	0.00	0.11	0.13	0.29	0.23	0.17
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.06	0.11	0.13	0.06	0.04	0.01	0.03	0.11	0.00	0.17	0.24	0.16	0.16
O5'	0.23	0.29	0.22	0.06	0.12	0.02	0.29	0.01	0.16	0.63	0.14	0.24	0.25	0.56	0.34	0.18	0.13	0.17	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.31	0.42	0.37	0.28	0.14	0.17	0.32	0.16	0.17	0.72	0.25	0.32	0.27	0.66	0.39	0.38	0.29	0.24	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.22	0.64	0.23	0.16	0.24	0.12	0.37	0.17	0.30	0.76	0.44	0.54	0.38	0.73	0.36	0.26	0.23	0.16	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.22	0.48	0.23	0.11	0.10	0.04	0.27	0.02	0.14	0.68	0.30	0.39	0.24	0.62	0.32	0.23	0.17	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00