Doublet Group distance statistics: 53908

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 13, 17, 1, 0, 0, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.009 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C2	A	0, 0.000, 0.008, 0.016, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.004, 0.012, 0.020, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.012 std_dev=0.008
C4	A	0, 0.006, 0.015, 0.025, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.015 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.003, 0.013, 0.023, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.015 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.008, 0.019, 0.031, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.019 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.007, 0.023, 0.040, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.023 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.009, 0.028, 0.046, 0.078 max_d=0.078 avg_d=0.028 std_dev=0.018
N6	A	0, 0.005, 0.024, 0.042, 0.110 max_d=0.110 avg_d=0.024 std_dev=0.018
O4'	A	0, -0.001, 0.107, 0.215, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.107 std_dev=0.108
C2'	A	0, -0.024, 0.116, 0.256, 0.652 max_d=0.652 avg_d=0.116 std_dev=0.140
C6	B	0, 0.073, 0.220, 0.368, 0.735 max_d=0.735 avg_d=0.220 std_dev=0.148
N1	B	0, 0.067, 0.233, 0.398, 0.730 max_d=0.730 avg_d=0.233 std_dev=0.166
N6	B	0, 0.116, 0.285, 0.454, 0.792 max_d=0.792 avg_d=0.285 std_dev=0.169
C5	B	0, 0.048, 0.218, 0.389, 0.767 max_d=0.767 avg_d=0.218 std_dev=0.171
C4	B	0, 0.043, 0.221, 0.399, 0.758 max_d=0.758 avg_d=0.221 std_dev=0.178
O5'	A	0, 0.097, 0.277, 0.457, 0.969 max_d=0.969 avg_d=0.277 std_dev=0.180
C5'	A	0, 0.069, 0.258, 0.448, 1.099 max_d=1.099 avg_d=0.258 std_dev=0.189
N3	B	0, 0.048, 0.239, 0.430, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.239 std_dev=0.191
C2	B	0, 0.036, 0.235, 0.434, 1.004 max_d=1.004 avg_d=0.235 std_dev=0.199
C4'	A	0, -0.030, 0.194, 0.418, 1.118 max_d=1.118 avg_d=0.194 std_dev=0.224
N9	B	0, 0.048, 0.280, 0.512, 1.166 max_d=1.166 avg_d=0.280 std_dev=0.232
N7	B	0, 0.058, 0.292, 0.527, 1.056 max_d=1.056 avg_d=0.292 std_dev=0.234
C1'	B	0, 0.081, 0.345, 0.608, 1.414 max_d=1.414 avg_d=0.345 std_dev=0.264
C8	B	0, 0.039, 0.311, 0.583, 1.309 max_d=1.309 avg_d=0.311 std_dev=0.272
C3'	A	0, -0.105, 0.240, 0.584, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.240 std_dev=0.344
P	A	0, 0.021, 0.385, 0.749, 1.895 max_d=1.895 avg_d=0.385 std_dev=0.364
O2'	A	0, -0.149, 0.234, 0.617, 1.605 max_d=1.605 avg_d=0.234 std_dev=0.383
OP1	A	0, -0.002, 0.454, 0.910, 2.791 max_d=2.791 avg_d=0.454 std_dev=0.456
O4'	B	0, -0.060, 0.431, 0.923, 2.390 max_d=2.390 avg_d=0.431 std_dev=0.492
C4'	B	0, -0.086, 0.506, 1.097, 2.481 max_d=2.481 avg_d=0.506 std_dev=0.592
C2'	B	0, -0.128, 0.501, 1.129, 2.893 max_d=2.893 avg_d=0.501 std_dev=0.629
O3'	A	0, -0.238, 0.422, 1.082, 2.851 max_d=2.851 avg_d=0.422 std_dev=0.660
C3'	B	0, -0.145, 0.555, 1.254, 3.299 max_d=3.299 avg_d=0.555 std_dev=0.699
O3'	B	0, -0.185, 0.629, 1.442, 3.836 max_d=3.836 avg_d=0.629 std_dev=0.814
OP2	A	0, -0.281, 0.571, 1.424, 4.070 max_d=4.070 avg_d=0.571 std_dev=0.853
O2'	B	0, -0.344, 0.668, 1.681, 4.488 max_d=4.488 avg_d=0.668 std_dev=1.013
C5'	B	0, -0.608, 0.729, 2.066, 5.281 max_d=5.281 avg_d=0.729 std_dev=1.337
O5'	B	0, -0.711, 0.789, 2.290, 5.964 max_d=5.964 avg_d=0.789 std_dev=1.501
P	B	0, -1.359, 0.957, 3.273, 9.027 max_d=9.027 avg_d=0.957 std_dev=2.316
OP1	B	0, -1.443, 1.028, 3.498, 9.691 max_d=9.691 avg_d=1.028 std_dev=2.470
OP2	B	0, -1.534, 1.115, 3.764, 10.545 max_d=10.545 avg_d=1.115 std_dev=2.649

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.20	0.00	0.09	0.30	0.11	0.12
C2	0.02	0.00	0.11	0.09	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.13	0.23	0.05	0.08	0.39	0.40	0.10
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.13	0.06	0.06	0.09	0.11	0.05	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.25	0.34	0.28	0.32
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.11	0.00	0.17	0.02	0.17	0.20	0.13	0.07	0.20	0.21	0.12	0.02	0.01	0.01	0.06	0.13	0.16	0.07
C4	0.01	0.01	0.06	0.11	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.14	0.13	0.03	0.09	0.38	0.38	0.11
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.05	0.09	0.03	0.02	0.07	0.09	0.04	0.18	0.02	0.00	0.01	0.13	0.13	0.04
C5	0.01	0.01	0.03	0.17	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.19	0.06	0.03	0.13	0.39	0.54	0.13
C5'	0.04	0.04	0.13	0.02	0.04	0.01	0.07	0.00	0.07	0.08	0.05	0.04	0.10	0.09	0.04	0.05	0.14	0.01	0.01	0.10	0.20	0.01
C6	0.01	0.01	0.06	0.17	0.01	0.05	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.08	0.03	0.13	0.40	0.59	0.13
C8	0.01	0.01	0.06	0.20	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.17	0.09	0.04	0.13	0.37	0.48	0.12
N1	0.02	0.00	0.09	0.13	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.15	0.04	0.11	0.40	0.52	0.12
N3	0.02	0.00	0.11	0.07	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.24	0.05	0.08	0.37	0.31	0.10
N6	0.02	0.01	0.05	0.20	0.01	0.07	0.01	0.10	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.21	0.06	0.04	0.16	0.40	0.69	0.16
N7	0.01	0.01	0.03	0.21	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.20	0.09	0.03	0.16	0.39	0.62	0.15
N9	0.00	0.01	0.01	0.12	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.12	0.08	0.01	0.08	0.35	0.31	0.11
O2'	0.02	0.13	0.00	0.02	0.14	0.18	0.19	0.05	0.19	0.17	0.16	0.11	0.21	0.20	0.12	0.00	0.03	0.13	0.19	0.26	0.31	0.29
O3'	0.20	0.23	0.02	0.01	0.13	0.02	0.06	0.14	0.08	0.09	0.15	0.24	0.06	0.09	0.08	0.03	0.00	0.14	0.15	0.29	0.13	0.13
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.04	0.05	0.04	0.03	0.01	0.13	0.14	0.00	0.05	0.24	0.14	0.12
O5'	0.09	0.08	0.25	0.06	0.09	0.01	0.13	0.01	0.13	0.13	0.11	0.08	0.16	0.16	0.08	0.19	0.15	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.30	0.39	0.34	0.13	0.38	0.13	0.39	0.10	0.40	0.37	0.40	0.37	0.40	0.39	0.35	0.26	0.29	0.24	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.40	0.28	0.16	0.38	0.13	0.54	0.20	0.59	0.48	0.52	0.31	0.69	0.62	0.31	0.31	0.13	0.14	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.12	0.10	0.32	0.07	0.11	0.04	0.13	0.01	0.13	0.12	0.12	0.10	0.16	0.15	0.11	0.29	0.13	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.18	0.10	0.23	0.13	0.15	0.43	0.18	0.97	0.16	0.21	0.11	0.12	0.20	0.22	0.18	0.41	0.20	0.35	1.01	1.54	0.92	1.30
C2	0.22	0.18	0.47	0.33	0.16	0.36	0.17	0.76	0.10	0.28	0.13	0.17	0.12	0.26	0.23	0.60	0.40	0.45	0.88	1.40	0.65	1.11
C2'	0.09	0.10	0.10	0.24	0.10	0.55	0.14	1.12	0.16	0.13	0.13	0.09	0.21	0.15	0.10	0.21	0.12	0.40	1.11	1.54	1.05	1.37
C3'	0.09	0.18	0.13	0.26	0.13	0.56	0.15	1.12	0.20	0.11	0.22	0.14	0.23	0.13	0.11	0.19	0.12	0.43	1.11	1.53	1.04	1.36
C4	0.18	0.13	0.32	0.22	0.15	0.34	0.17	0.75	0.11	0.24	0.10	0.12	0.16	0.24	0.19	0.43	0.28	0.36	0.80	1.29	0.52	1.00
C4'	0.10	0.12	0.12	0.14	0.08	0.48	0.09	1.03	0.10	0.11	0.13	0.10	0.14	0.10	0.09	0.28	0.11	0.38	1.04	1.55	0.97	1.33
C5	0.16	0.15	0.32	0.29	0.13	0.24	0.15	0.52	0.08	0.22	0.12	0.13	0.13	0.23	0.17	0.34	0.30	0.30	0.52	0.97	0.11	0.62
C5'	0.13	0.12	0.13	0.12	0.11	0.42	0.12	0.92	0.12	0.14	0.12	0.11	0.14	0.13	0.12	0.25	0.13	0.33	0.91	1.40	0.74	1.15
C6	0.16	0.18	0.38	0.39	0.12	0.19	0.13	0.37	0.07	0.24	0.16	0.15	0.11	0.24	0.17	0.36	0.36	0.31	0.36	0.80	0.18	0.42
C8	0.15	0.12	0.23	0.19	0.14	0.28	0.16	0.64	0.13	0.20	0.10	0.12	0.18	0.21	0.16	0.28	0.22	0.28	0.63	1.08	0.25	0.76
N1	0.20	0.20	0.47	0.43	0.14	0.24	0.14	0.47	0.08	0.28	0.16	0.17	0.11	0.26	0.21	0.50	0.43	0.38	0.52	1.00	0.15	0.64
N3	0.21	0.15	0.39	0.23	0.17	0.41	0.18	0.89	0.12	0.26	0.11	0.14	0.15	0.25	0.22	0.56	0.32	0.42	1.00	1.52	0.84	1.27
N6	0.15	0.19	0.36	0.46	0.12	0.15	0.11	0.18	0.11	0.21	0.18	0.16	0.13	0.21	0.15	0.27	0.38	0.25	0.11	0.44	0.63	0.10
N7	0.15	0.14	0.26	0.26	0.13	0.21	0.15	0.48	0.11	0.20	0.12	0.12	0.15	0.21	0.16	0.25	0.26	0.26	0.44	0.87	0.11	0.51
N9	0.17	0.11	0.26	0.17	0.15	0.35	0.18	0.80	0.14	0.22	0.09	0.12	0.19	0.22	0.18	0.37	0.23	0.33	0.83	1.32	0.58	1.04
O2'	0.42	0.45	0.31	0.11	0.46	0.30	0.50	0.92	0.51	0.49	0.49	0.42	0.51	0.51	0.46	0.55	0.21	0.14	0.94	1.41	1.05	1.27
O3'	0.18	0.15	0.16	0.16	0.13	0.40	0.13	0.99	0.16	0.13	0.19	0.14	0.21	0.12	0.15	0.35	0.17	0.27	0.97	1.36	1.01	1.25
O4'	0.17	0.10	0.24	0.14	0.14	0.41	0.15	0.93	0.13	0.21	0.10	0.11	0.17	0.20	0.17	0.41	0.24	0.35	0.97	1.52	0.86	1.27
O5'	0.15	0.14	0.15	0.13	0.14	0.35	0.15	0.78	0.15	0.16	0.13	0.14	0.17	0.16	0.15	0.22	0.15	0.28	0.76	1.22	0.50	0.94
OP1	0.40	0.31	0.39	0.37	0.39	0.16	0.42	0.39	0.39	0.45	0.33	0.34	0.42	0.46	0.42	0.40	0.41	0.18	0.34	0.72	0.18	0.42
OP2	0.26	0.19	0.27	0.31	0.27	0.57	0.34	0.94	0.33	0.36	0.24	0.21	0.42	0.39	0.30	0.23	0.28	0.53	0.93	1.37	0.52	1.02
P	0.20	0.20	0.19	0.15	0.20	0.22	0.19	0.61	0.19	0.20	0.20	0.21	0.20	0.19	0.20	0.25	0.18	0.17	0.58	1.04	0.23	0.71

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.21	0.00	0.08	0.16	0.16	0.12
C2	0.02	0.00	0.17	0.25	0.01	0.40	0.01	0.78	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.21	0.27	0.71	0.88	0.46	0.73
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.08	0.01	0.04	0.13	0.07	0.08	0.13	0.17	0.05	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.09	0.13	0.08	0.07
C3'	0.01	0.25	0.00	0.00	0.05	0.00	0.09	0.02	0.04	0.30	0.14	0.25	0.09	0.25	0.10	0.02	0.00	0.01	0.21	0.27	0.09	0.16
C4	0.01	0.01	0.08	0.05	0.00	0.16	0.00	0.34	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.12	0.14	0.14	0.25	0.36	0.18	0.17
C4'	0.00	0.40	0.01	0.00	0.16	0.00	0.05	0.01	0.14	0.25	0.29	0.38	0.08	0.17	0.04	0.15	0.02	0.00	0.01	0.12	0.23	0.06
C5	0.00	0.01	0.04	0.09	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.07	0.07	0.15	0.22	0.55	0.20
C5'	0.04	0.78	0.13	0.02	0.34	0.01	0.15	0.00	0.32	0.37	0.60	0.72	0.21	0.24	0.04	0.05	0.12	0.01	0.01	0.20	0.26	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.04	0.01	0.14	0.01	0.32	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.17	0.09	0.12	0.24	0.40	0.38	0.16
C8	0.01	0.01	0.08	0.30	0.00	0.25	0.01	0.37	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.19	0.05	0.14	0.59	0.49	1.05	0.74
N1	0.01	0.00	0.13	0.14	0.01	0.29	0.01	0.60	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.16	0.21	0.52	0.72	0.18	0.50
N3	0.02	0.00	0.17	0.25	0.00	0.38	0.00	0.72	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.23	0.27	0.64	0.75	0.41	0.62
N6	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.08	0.01	0.21	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.20	0.05	0.08	0.17	0.29	0.62	0.18
N7	0.01	0.01	0.05	0.25	0.01	0.17	0.00	0.24	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.21	0.04	0.07	0.48	0.39	1.08	0.66
N9	0.00	0.01	0.02	0.10	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.11	0.01	0.17	0.17	0.44	0.25
O2'	0.02	0.12	0.00	0.02	0.12	0.15	0.17	0.05	0.17	0.19	0.14	0.11	0.20	0.21	0.12	0.00	0.04	0.11	0.15	0.21	0.07	0.13
O3'	0.21	0.21	0.02	0.00	0.14	0.02	0.07	0.12	0.09	0.05	0.16	0.23	0.05	0.04	0.11	0.04	0.00	0.15	0.21	0.33	0.13	0.18
O4'	0.00	0.27	0.01	0.01	0.14	0.00	0.07	0.01	0.12	0.14	0.21	0.27	0.08	0.07	0.01	0.11	0.15	0.00	0.07	0.18	0.10	0.09
O5'	0.08	0.71	0.09	0.21	0.25	0.01	0.15	0.01	0.24	0.59	0.52	0.64	0.17	0.48	0.17	0.15	0.21	0.07	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.16	0.88	0.13	0.27	0.36	0.12	0.22	0.20	0.40	0.49	0.72	0.75	0.29	0.39	0.17	0.21	0.33	0.18	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.16	0.46	0.08	0.09	0.18	0.23	0.55	0.26	0.38	1.05	0.18	0.41	0.62	1.08	0.44	0.07	0.13	0.10	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.12	0.73	0.07	0.16	0.17	0.06	0.20	0.01	0.16	0.74	0.50	0.62	0.18	0.66	0.25	0.13	0.18	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00