Doublet Group distance statistics: 53916

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 3, 4, 4, 6, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.033 max_d=0.033 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.004, 0.014, 0.023, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C6	A	0, -0.001, 0.011, 0.022, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.011 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.005, 0.019, 0.032, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N9	A	0, 0.005, 0.022, 0.039, 0.070 max_d=0.070 avg_d=0.022 std_dev=0.017
N7	A	0, 0.005, 0.032, 0.059, 0.121 max_d=0.121 avg_d=0.032 std_dev=0.027
C8	A	0, 0.005, 0.037, 0.069, 0.143 max_d=0.143 avg_d=0.037 std_dev=0.032
N6	A	0, -0.002, 0.037, 0.076, 0.164 max_d=0.164 avg_d=0.037 std_dev=0.039
C2	B	0, 0.147, 0.263, 0.379, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.263 std_dev=0.116
O4'	A	0, -0.036, 0.089, 0.213, 0.504 max_d=0.504 avg_d=0.089 std_dev=0.124
N3	B	0, 0.148, 0.277, 0.406, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.277 std_dev=0.129
C2'	A	0, -0.004, 0.125, 0.254, 0.498 max_d=0.498 avg_d=0.125 std_dev=0.129
N1	B	0, 0.117, 0.246, 0.376, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.246 std_dev=0.130
C6	B	0, 0.119, 0.251, 0.383, 0.617 max_d=0.617 avg_d=0.251 std_dev=0.132
C4	B	0, 0.178, 0.316, 0.454, 0.622 max_d=0.622 avg_d=0.316 std_dev=0.138
O2'	A	0, 0.022, 0.173, 0.324, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.173 std_dev=0.151
C5	B	0, 0.158, 0.316, 0.473, 0.667 max_d=0.667 avg_d=0.316 std_dev=0.157
N6	B	0, 0.118, 0.281, 0.444, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.281 std_dev=0.163
C4'	A	0, -0.016, 0.158, 0.331, 0.744 max_d=0.744 avg_d=0.158 std_dev=0.173
C3'	A	0, -0.004, 0.193, 0.389, 0.797 max_d=0.797 avg_d=0.193 std_dev=0.197
OP2	B	0, 0.216, 0.416, 0.616, 0.822 max_d=0.822 avg_d=0.416 std_dev=0.200
N9	B	0, 0.214, 0.421, 0.629, 0.798 max_d=0.798 avg_d=0.421 std_dev=0.208
P	B	0, 0.108, 0.340, 0.573, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.340 std_dev=0.232
O5'	B	0, 0.186, 0.431, 0.675, 1.021 max_d=1.021 avg_d=0.431 std_dev=0.245
C1'	B	0, 0.197, 0.447, 0.696, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.447 std_dev=0.249
O4'	B	0, 0.176, 0.432, 0.688, 0.982 max_d=0.982 avg_d=0.432 std_dev=0.256
N7	B	0, 0.175, 0.438, 0.701, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.438 std_dev=0.263
C8	B	0, 0.221, 0.501, 0.781, 1.115 max_d=1.115 avg_d=0.501 std_dev=0.280
OP1	B	0, 0.087, 0.369, 0.651, 1.192 max_d=1.192 avg_d=0.369 std_dev=0.282
C3'	B	0, 0.258, 0.544, 0.830, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.544 std_dev=0.286
O3'	A	0, 0.007, 0.299, 0.591, 1.201 max_d=1.201 avg_d=0.299 std_dev=0.292
C5'	A	0, -0.015, 0.279, 0.572, 1.195 max_d=1.195 avg_d=0.279 std_dev=0.293
C2'	B	0, 0.257, 0.562, 0.868, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.562 std_dev=0.305
C4'	B	0, 0.187, 0.503, 0.819, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.503 std_dev=0.316
O3'	B	0, 0.285, 0.608, 0.931, 1.156 max_d=1.156 avg_d=0.608 std_dev=0.323
O5'	A	0, 0.001, 0.403, 0.806, 1.618 max_d=1.618 avg_d=0.403 std_dev=0.403
O2'	B	0, 0.277, 0.686, 1.095, 1.542 max_d=1.542 avg_d=0.686 std_dev=0.409
C5'	B	0, 0.062, 0.601, 1.140, 2.100 max_d=2.100 avg_d=0.601 std_dev=0.539
OP2	A	0, 0.145, 0.872, 1.599, 2.940 max_d=2.940 avg_d=0.872 std_dev=0.727
P	A	0, -0.075, 0.748, 1.572, 3.218 max_d=3.218 avg_d=0.748 std_dev=0.823
OP1	A	0, -0.162, 1.022, 2.206, 4.457 max_d=4.457 avg_d=1.022 std_dev=1.184

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.08	0.28	0.09	0.08
C2	0.01	0.00	0.09	0.09	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.09	0.13	0.02	0.17	0.57	0.13	0.28
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.01	0.05	0.04	0.08	0.09	0.05	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.21	0.17	0.28	0.13
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.07	0.08	0.09	0.07	0.07	0.03	0.01	0.01	0.01	0.29	0.13	0.42	0.18
C4	0.01	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.06	0.02	0.18	0.58	0.14	0.30
C4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.04	0.05	0.03	0.03	0.06	0.05	0.02	0.04	0.01	0.00	0.01	0.19	0.12	0.11
C5	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.06	0.02	0.21	0.75	0.18	0.43
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.07	0.07	0.06	0.03	0.10	0.08	0.04	0.03	0.04	0.01	0.01	0.12	0.20	0.01
C6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.04	0.01	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.05	0.08	0.03	0.21	0.78	0.18	0.44
C8	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.07	0.03	0.22	0.71	0.19	0.42
N1	0.01	0.00	0.08	0.08	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.11	0.03	0.19	0.69	0.15	0.37
N3	0.01	0.00	0.09	0.09	0.00	0.03	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.12	0.02	0.15	0.49	0.12	0.23
N6	0.03	0.01	0.05	0.07	0.02	0.06	0.02	0.10	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.05	0.08	0.05	0.22	0.88	0.20	0.51
N7	0.01	0.01	0.04	0.07	0.01	0.05	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.07	0.02	0.24	0.84	0.21	0.51
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.16	0.51	0.14	0.26
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.04	0.04	0.03	0.03	0.05	0.03	0.07	0.08	0.05	0.02	0.02	0.00	0.03	0.02	0.11	0.21	0.21	0.07
O3'	0.01	0.13	0.01	0.01	0.06	0.01	0.06	0.04	0.08	0.07	0.11	0.12	0.08	0.07	0.03	0.03	0.00	0.01	0.28	0.31	0.51	0.14
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.05	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.10	0.23	0.11	0.12
O5'	0.08	0.17	0.21	0.29	0.18	0.01	0.21	0.01	0.21	0.22	0.19	0.15	0.22	0.24	0.16	0.11	0.28	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.28	0.57	0.17	0.13	0.58	0.19	0.75	0.12	0.78	0.71	0.69	0.49	0.88	0.84	0.51	0.21	0.31	0.23	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.09	0.13	0.28	0.42	0.14	0.12	0.18	0.20	0.18	0.19	0.15	0.12	0.20	0.21	0.14	0.21	0.51	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.08	0.28	0.13	0.18	0.30	0.11	0.43	0.01	0.44	0.42	0.37	0.23	0.51	0.51	0.26	0.07	0.14	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.20	0.09	0.15	0.12	0.09	0.14	0.21	0.15	0.17	0.17	0.17	0.17	0.17	0.12	0.18	0.12	0.07	0.20	0.05	0.05	0.06
C2	0.16	0.18	0.17	0.17	0.12	0.18	0.13	0.22	0.14	0.22	0.16	0.17	0.18	0.21	0.15	0.20	0.17	0.18	0.17	0.11	0.14	0.10
C2'	0.10	0.22	0.11	0.18	0.14	0.11	0.16	0.23	0.17	0.19	0.19	0.18	0.18	0.18	0.15	0.13	0.14	0.10	0.23	0.09	0.12	0.11
C3'	0.15	0.18	0.26	0.33	0.16	0.18	0.17	0.27	0.17	0.21	0.18	0.14	0.18	0.19	0.19	0.08	0.30	0.14	0.07	0.02	0.05	0.01
C4	0.09	0.19	0.11	0.14	0.08	0.12	0.12	0.17	0.13	0.18	0.16	0.16	0.17	0.18	0.11	0.11	0.12	0.11	0.16	0.07	0.10	0.07
C4'	0.11	0.14	0.21	0.31	0.14	0.16	0.17	0.28	0.16	0.20	0.15	0.11	0.17	0.19	0.16	0.06	0.27	0.12	0.06	0.07	0.19	0.07
C5	0.10	0.18	0.14	0.14	0.08	0.11	0.12	0.13	0.12	0.19	0.15	0.13	0.17	0.19	0.12	0.10	0.14	0.10	0.17	0.09	0.13	0.09
C5'	0.16	0.14	0.32	0.40	0.19	0.20	0.20	0.27	0.18	0.24	0.16	0.15	0.19	0.22	0.21	0.12	0.38	0.15	0.10	0.14	0.34	0.15
C6	0.14	0.16	0.16	0.16	0.10	0.14	0.12	0.14	0.12	0.21	0.15	0.13	0.18	0.22	0.15	0.14	0.16	0.13	0.17	0.10	0.15	0.11
C8	0.05	0.16	0.15	0.16	0.07	0.09	0.12	0.13	0.13	0.15	0.14	0.10	0.15	0.16	0.10	0.05	0.15	0.06	0.16	0.08	0.09	0.09
N1	0.16	0.16	0.17	0.17	0.10	0.17	0.12	0.18	0.13	0.22	0.15	0.15	0.19	0.22	0.16	0.18	0.17	0.16	0.17	0.11	0.15	0.10
N3	0.13	0.19	0.13	0.15	0.12	0.17	0.14	0.24	0.14	0.20	0.16	0.18	0.17	0.20	0.13	0.19	0.14	0.16	0.17	0.09	0.12	0.08
N6	0.15	0.15	0.19	0.17	0.11	0.14	0.15	0.14	0.13	0.23	0.15	0.12	0.19	0.24	0.17	0.18	0.18	0.13	0.18	0.12	0.17	0.12
N7	0.08	0.15	0.16	0.15	0.08	0.10	0.13	0.13	0.13	0.17	0.14	0.10	0.16	0.18	0.12	0.09	0.15	0.08	0.17	0.10	0.12	0.10
N9	0.06	0.19	0.10	0.15	0.08	0.10	0.13	0.16	0.14	0.17	0.16	0.14	0.16	0.17	0.10	0.09	0.13	0.07	0.17	0.05	0.07	0.06
O2'	0.18	0.24	0.16	0.14	0.19	0.13	0.18	0.29	0.19	0.20	0.21	0.23	0.19	0.19	0.18	0.32	0.11	0.16	0.35	0.14	0.15	0.16
O3'	0.18	0.20	0.29	0.38	0.18	0.22	0.18	0.33	0.18	0.22	0.20	0.17	0.19	0.20	0.21	0.11	0.35	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00
O4'	0.08	0.14	0.14	0.23	0.11	0.12	0.14	0.25	0.14	0.18	0.14	0.10	0.16	0.18	0.13	0.12	0.19	0.09	0.12	0.04	0.12	0.02
O5'	0.30	0.51	0.23	0.23	0.38	0.26	0.39	0.24	0.44	0.30	0.50	0.44	0.44	0.34	0.32	0.30	0.24	0.30	0.35	0.22	0.32	0.29
OP1	0.24	0.67	0.26	0.36	0.47	0.25	0.59	0.35	0.75	0.41	0.81	0.47	0.86	0.54	0.35	0.19	0.42	0.21	0.28	0.62	0.41	0.41
OP2	0.41	0.61	0.37	0.39	0.47	0.44	0.46	0.46	0.51	0.38	0.59	0.55	0.50	0.40	0.41	0.45	0.42	0.42	0.56	0.53	0.59	0.55
P	0.32	0.73	0.24	0.21	0.51	0.20	0.57	0.15	0.69	0.41	0.78	0.57	0.73	0.50	0.40	0.28	0.19	0.28	0.24	0.10	0.25	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.04	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.04	0.06	0.15	0.06
C2	0.02	0.00	0.21	0.13	0.03	0.11	0.02	0.25	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.04	0.17	0.16	0.12	0.20	0.23	0.29	0.23
C2'	0.00	0.21	0.00	0.00	0.12	0.01	0.09	0.02	0.13	0.08	0.18	0.20	0.13	0.05	0.03	0.00	0.01	0.01	0.20	0.14	0.14	0.18
C3'	0.01	0.13	0.00	0.00	0.08	0.00	0.09	0.02	0.09	0.13	0.10	0.14	0.10	0.14	0.07	0.01	0.01	0.01	0.32	0.23	0.14	0.25
C4	0.01	0.03	0.12	0.08	0.00	0.07	0.01	0.16	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.12	0.09	0.07	0.15	0.15	0.23	0.16
C4'	0.02	0.11	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.09	0.03	0.11	0.09	0.08	0.05	0.03	0.07	0.02	0.00	0.01	0.06	0.18	0.01
C5	0.01	0.02	0.09	0.09	0.01	0.07	0.00	0.17	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	0.01	0.01	0.14	0.10	0.04	0.16	0.17	0.25	0.17
C5'	0.01	0.25	0.02	0.02	0.16	0.00	0.17	0.00	0.22	0.07	0.25	0.21	0.21	0.13	0.08	0.06	0.03	0.02	0.00	0.08	0.29	0.01
C6	0.01	0.01	0.13	0.09	0.00	0.09	0.01	0.22	0.00	0.04	0.00	0.03	0.01	0.04	0.02	0.17	0.11	0.07	0.18	0.20	0.28	0.20
C8	0.01	0.04	0.08	0.13	0.01	0.03	0.03	0.07	0.04	0.00	0.04	0.02	0.08	0.00	0.01	0.06	0.11	0.03	0.10	0.10	0.19	0.12
N1	0.01	0.01	0.18	0.10	0.01	0.11	0.02	0.25	0.00	0.04	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.18	0.13	0.11	0.20	0.23	0.30	0.23
N3	0.02	0.01	0.20	0.14	0.01	0.09	0.01	0.21	0.03	0.02	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.14	0.15	0.12	0.19	0.19	0.25	0.19
N6	0.04	0.02	0.13	0.10	0.01	0.08	0.03	0.21	0.01	0.08	0.02	0.02	0.00	0.08	0.04	0.20	0.12	0.05	0.18	0.20	0.29	0.21
N7	0.02	0.03	0.05	0.14	0.02	0.05	0.01	0.13	0.04	0.00	0.03	0.02	0.08	0.00	0.02	0.10	0.12	0.02	0.13	0.13	0.23	0.14
N9	0.00	0.04	0.03	0.07	0.01	0.03	0.01	0.08	0.02	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.11	0.11	0.18	0.12
O2'	0.01	0.17	0.00	0.01	0.12	0.07	0.14	0.06	0.17	0.06	0.18	0.14	0.20	0.10	0.06	0.00	0.03	0.06	0.04	0.08	0.11	0.04
O3'	0.02	0.16	0.01	0.01	0.09	0.02	0.10	0.03	0.11	0.11	0.13	0.15	0.12	0.12	0.05	0.03	0.00	0.01	0.30	0.23	0.12	0.24
O4'	0.01	0.12	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.02	0.07	0.03	0.11	0.12	0.05	0.02	0.01	0.06	0.01	0.00	0.10	0.09	0.22	0.08
O5'	0.04	0.20	0.20	0.32	0.15	0.01	0.16	0.00	0.18	0.10	0.20	0.19	0.18	0.13	0.11	0.04	0.30	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.06	0.23	0.14	0.23	0.15	0.06	0.17	0.08	0.20	0.10	0.23	0.19	0.20	0.13	0.11	0.08	0.23	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.15	0.29	0.14	0.14	0.23	0.18	0.25	0.29	0.28	0.19	0.30	0.25	0.29	0.23	0.18	0.11	0.12	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.23	0.18	0.25	0.16	0.01	0.17	0.01	0.20	0.12	0.23	0.19	0.21	0.14	0.12	0.04	0.24	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00