Doublet Group distance statistics: 53917

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 2, 2, 7, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C5	A	0, 0.011, 0.018, 0.025, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.013, 0.022, 0.031, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.022 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.012, 0.023, 0.034, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.023 std_dev=0.011
N3	A	0, 0.015, 0.026, 0.037, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.026 std_dev=0.011
N7	A	0, 0.015, 0.028, 0.042, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.028 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.015, 0.030, 0.045, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.030 std_dev=0.015
C1'	A	0, 0.019, 0.034, 0.049, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.034 std_dev=0.015
N6	A	0, 0.018, 0.035, 0.052, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.035 std_dev=0.017
N9	A	0, 0.026, 0.048, 0.071, 0.079 max_d=0.079 avg_d=0.048 std_dev=0.022
C8	A	0, 0.024, 0.047, 0.071, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.047 std_dev=0.023
C1'	B	0, 0.361, 0.508, 0.655, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.508 std_dev=0.147
N3	B	0, 0.308, 0.455, 0.602, 0.646 max_d=0.646 avg_d=0.455 std_dev=0.147
C2	B	0, 0.307, 0.461, 0.616, 0.692 max_d=0.692 avg_d=0.461 std_dev=0.155
N9	B	0, 0.361, 0.520, 0.678, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.520 std_dev=0.159
C4	B	0, 0.339, 0.501, 0.664, 0.670 max_d=0.670 avg_d=0.501 std_dev=0.162
O4'	A	0, 0.159, 0.324, 0.488, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.324 std_dev=0.164
C2'	A	0, 0.196, 0.360, 0.525, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.360 std_dev=0.165
N1	B	0, 0.343, 0.516, 0.690, 0.814 max_d=0.814 avg_d=0.516 std_dev=0.174
O2'	A	0, 0.257, 0.445, 0.633, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.445 std_dev=0.188
C8	B	0, 0.409, 0.606, 0.803, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.606 std_dev=0.197
C5	B	0, 0.366, 0.563, 0.761, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.563 std_dev=0.197
C6	B	0, 0.388, 0.591, 0.794, 0.856 max_d=0.856 avg_d=0.591 std_dev=0.203
N7	B	0, 0.426, 0.654, 0.881, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.654 std_dev=0.228
O2'	B	0, 0.425, 0.667, 0.908, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.667 std_dev=0.242
C2'	B	0, 0.322, 0.568, 0.814, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.568 std_dev=0.246
N6	B	0, 0.444, 0.695, 0.947, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.695 std_dev=0.251
O4'	B	0, 0.492, 0.758, 1.025, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.758 std_dev=0.267
C3'	A	0, 0.279, 0.550, 0.821, 1.014 max_d=1.014 avg_d=0.550 std_dev=0.271
C4'	A	0, 0.269, 0.551, 0.833, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.551 std_dev=0.282
O5'	A	0, 0.462, 0.767, 1.072, 1.280 max_d=1.280 avg_d=0.767 std_dev=0.305
C3'	B	0, 0.537, 0.850, 1.163, 1.270 max_d=1.270 avg_d=0.850 std_dev=0.313
C4'	B	0, 0.541, 0.859, 1.178, 1.293 max_d=1.293 avg_d=0.859 std_dev=0.318
OP2	B	0, 0.508, 0.887, 1.266, 1.587 max_d=1.587 avg_d=0.887 std_dev=0.379
OP1	B	0, 0.681, 1.067, 1.453, 1.630 max_d=1.630 avg_d=1.067 std_dev=0.386
O3'	B	0, 0.668, 1.061, 1.453, 1.570 max_d=1.570 avg_d=1.061 std_dev=0.393
O3'	A	0, 0.480, 0.878, 1.276, 1.403 max_d=1.403 avg_d=0.878 std_dev=0.398
P	B	0, 0.516, 0.920, 1.323, 1.619 max_d=1.619 avg_d=0.920 std_dev=0.404
C5'	A	0, 0.344, 0.772, 1.201, 1.692 max_d=1.692 avg_d=0.772 std_dev=0.428
C5'	B	0, 0.724, 1.239, 1.754, 1.932 max_d=1.932 avg_d=1.239 std_dev=0.515
O5'	B	0, 0.904, 1.463, 2.022, 2.271 max_d=2.271 avg_d=1.463 std_dev=0.559
P	A	0, 0.971, 1.591, 2.211, 2.263 max_d=2.263 avg_d=1.591 std_dev=0.620
OP2	A	0, 1.338, 2.060, 2.781, 2.711 max_d=2.711 avg_d=2.060 std_dev=0.721
OP1	A	0, 1.366, 2.480, 3.593, 3.418 max_d=3.418 avg_d=2.480 std_dev=1.113

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.07	0.32	0.30	0.13
C2	0.02	0.00	0.16	0.17	0.00	0.06	0.00	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.23	0.05	0.15	0.38	0.50	0.13
C2'	0.01	0.16	0.00	0.01	0.09	0.02	0.07	0.05	0.10	0.06	0.14	0.16	0.08	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.15	0.18	0.23	0.14
C3'	0.01	0.17	0.01	0.00	0.09	0.01	0.07	0.06	0.11	0.08	0.15	0.16	0.09	0.06	0.03	0.02	0.01	0.02	0.27	0.35	0.21	0.26
C4	0.02	0.00	0.09	0.09	0.00	0.05	0.01	0.18	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.09	0.12	0.04	0.15	0.37	0.48	0.13
C4'	0.01	0.06	0.02	0.01	0.05	0.00	0.07	0.01	0.08	0.10	0.07	0.06	0.09	0.10	0.04	0.09	0.02	0.00	0.02	0.10	0.29	0.07
C5	0.01	0.00	0.07	0.07	0.01	0.07	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.10	0.05	0.20	0.39	0.67	0.19
C5'	0.04	0.18	0.05	0.06	0.18	0.01	0.25	0.00	0.26	0.25	0.23	0.14	0.30	0.29	0.16	0.08	0.05	0.02	0.01	0.14	0.25	0.02
C6	0.02	0.01	0.10	0.11	0.01	0.08	0.01	0.26	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.15	0.05	0.21	0.40	0.73	0.22
C8	0.01	0.01	0.06	0.08	0.00	0.10	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.03	0.08	0.03	0.20	0.38	0.60	0.17
N1	0.02	0.01	0.14	0.15	0.01	0.07	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.15	0.21	0.06	0.18	0.39	0.63	0.18
N3	0.03	0.00	0.16	0.16	0.00	0.06	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.21	0.04	0.12	0.37	0.41	0.11
N6	0.02	0.01	0.08	0.09	0.01	0.09	0.01	0.30	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.13	0.06	0.24	0.40	0.86	0.28
N7	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.10	0.00	0.29	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.06	0.04	0.23	0.39	0.77	0.24
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.03	0.13	0.36	0.41	0.11
O2'	0.02	0.17	0.01	0.02	0.09	0.09	0.07	0.08	0.11	0.03	0.15	0.16	0.09	0.02	0.02	0.00	0.06	0.04	0.13	0.15	0.21	0.05
O3'	0.02	0.23	0.01	0.01	0.12	0.02	0.10	0.05	0.15	0.08	0.21	0.21	0.13	0.06	0.04	0.06	0.00	0.02	0.35	0.56	0.20	0.35
O4'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.03	0.06	0.04	0.06	0.04	0.03	0.04	0.02	0.00	0.19	0.44	0.40	0.27
O5'	0.07	0.15	0.15	0.27	0.15	0.02	0.20	0.01	0.21	0.20	0.18	0.12	0.24	0.23	0.13	0.13	0.35	0.19	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.32	0.38	0.18	0.35	0.37	0.10	0.39	0.14	0.40	0.38	0.39	0.37	0.40	0.39	0.36	0.15	0.56	0.44	0.02	0.00	0.03	0.00
OP2	0.30	0.50	0.23	0.21	0.48	0.29	0.67	0.25	0.73	0.60	0.63	0.41	0.86	0.77	0.41	0.21	0.20	0.40	0.02	0.03	0.00	0.01
P	0.13	0.13	0.14	0.26	0.13	0.07	0.19	0.02	0.22	0.17	0.18	0.11	0.28	0.24	0.11	0.05	0.35	0.27	0.01	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.15	0.10	0.11	0.14	0.11	0.16	0.11	0.17	0.16	0.16	0.14	0.21	0.18	0.13	0.18	0.11	0.13	0.13	0.19	0.14	0.13
C2	0.09	0.07	0.08	0.10	0.09	0.08	0.13	0.09	0.13	0.14	0.10	0.06	0.17	0.15	0.10	0.18	0.11	0.09	0.11	0.21	0.15	0.12
C2'	0.07	0.13	0.11	0.07	0.07	0.06	0.08	0.09	0.09	0.10	0.12	0.10	0.13	0.12	0.07	0.20	0.08	0.07	0.10	0.21	0.14	0.13
C3'	0.10	0.18	0.13	0.08	0.12	0.09	0.11	0.12	0.14	0.09	0.18	0.15	0.15	0.10	0.10	0.21	0.08	0.09	0.14	0.21	0.18	0.16
C4	0.11	0.11	0.10	0.10	0.12	0.10	0.14	0.10	0.13	0.16	0.11	0.11	0.15	0.18	0.13	0.20	0.10	0.12	0.12	0.20	0.13	0.12
C4'	0.11	0.13	0.16	0.10	0.11	0.12	0.11	0.17	0.11	0.14	0.12	0.11	0.13	0.14	0.12	0.24	0.10	0.10	0.19	0.27	0.22	0.21
C5	0.11	0.10	0.10	0.12	0.11	0.11	0.11	0.13	0.09	0.15	0.09	0.10	0.10	0.16	0.12	0.20	0.11	0.12	0.15	0.19	0.14	0.12
C5'	0.31	0.23	0.37	0.30	0.29	0.32	0.29	0.38	0.25	0.35	0.22	0.25	0.25	0.34	0.32	0.44	0.29	0.29	0.38	0.48	0.41	0.42
C6	0.08	0.10	0.08	0.11	0.08	0.10	0.08	0.12	0.08	0.13	0.09	0.09	0.09	0.12	0.09	0.20	0.11	0.09	0.15	0.20	0.13	0.11
C8	0.14	0.14	0.12	0.13	0.15	0.14	0.17	0.15	0.16	0.19	0.15	0.14	0.17	0.21	0.16	0.21	0.12	0.16	0.18	0.21	0.18	0.16
N1	0.06	0.09	0.07	0.11	0.07	0.07	0.11	0.09	0.12	0.13	0.11	0.07	0.13	0.14	0.09	0.18	0.11	0.07	0.12	0.21	0.14	0.12
N3	0.11	0.09	0.09	0.10	0.12	0.09	0.14	0.09	0.14	0.15	0.10	0.10	0.18	0.17	0.12	0.19	0.10	0.11	0.10	0.20	0.14	0.12
N6	0.12	0.13	0.10	0.15	0.12	0.15	0.11	0.17	0.11	0.14	0.12	0.13	0.10	0.12	0.12	0.20	0.13	0.14	0.21	0.21	0.16	0.14
N7	0.13	0.12	0.12	0.13	0.14	0.15	0.15	0.17	0.13	0.18	0.12	0.13	0.13	0.18	0.15	0.21	0.12	0.16	0.20	0.20	0.18	0.16
N9	0.13	0.14	0.11	0.11	0.15	0.12	0.17	0.12	0.17	0.18	0.15	0.14	0.19	0.20	0.15	0.20	0.11	0.14	0.14	0.20	0.14	0.13
O2'	0.08	0.14	0.11	0.08	0.09	0.07	0.10	0.10	0.12	0.10	0.13	0.12	0.17	0.13	0.08	0.20	0.10	0.08	0.11	0.21	0.14	0.13
O3'	0.16	0.26	0.16	0.12	0.18	0.14	0.17	0.15	0.21	0.12	0.26	0.22	0.21	0.12	0.15	0.22	0.11	0.15	0.16	0.21	0.21	0.18
O4'	0.13	0.14	0.12	0.13	0.13	0.12	0.14	0.13	0.14	0.15	0.14	0.14	0.16	0.16	0.14	0.20	0.13	0.13	0.15	0.19	0.16	0.14
O5'	0.26	0.20	0.31	0.23	0.25	0.24	0.27	0.27	0.25	0.31	0.21	0.22	0.26	0.31	0.27	0.38	0.22	0.25	0.27	0.35	0.29	0.29
OP1	0.53	0.39	0.48	0.52	0.49	0.57	0.53	0.62	0.46	0.62	0.39	0.43	0.49	0.63	0.54	0.48	0.50	0.60	0.67	0.79	0.85	0.78
OP2	0.96	0.63	0.98	1.06	0.83	1.07	0.82	1.12	0.68	1.03	0.59	0.74	0.62	0.97	0.94	0.97	1.06	1.02	1.15	1.21	1.20	1.20
P	0.45	0.32	0.43	0.44	0.42	0.48	0.44	0.51	0.39	0.53	0.32	0.36	0.39	0.53	0.47	0.45	0.41	0.49	0.54	0.60	0.63	0.59

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.06	0.17	0.10	0.07
C2	0.01	0.00	0.07	0.04	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.05	0.07	0.13	0.19	0.20	0.14
C2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.04	0.01	0.04	0.04	0.05	0.08	0.06	0.07	0.06	0.06	0.03	0.01	0.02	0.01	0.05	0.28	0.09	0.11
C3'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.03	0.04	0.05	0.04	0.03	0.05	0.05	0.03	0.03	0.00	0.01	0.08	0.28	0.12	0.14
C4	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.07	0.03	0.03	0.11	0.18	0.18	0.13
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.07	0.03	0.04	0.04	0.07	0.03	0.09	0.02	0.00	0.02	0.12	0.04	0.03
C5	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.04	0.04	0.12	0.19	0.21	0.16
C5'	0.01	0.07	0.04	0.03	0.04	0.01	0.06	0.00	0.06	0.11	0.06	0.06	0.08	0.10	0.04	0.08	0.04	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.04	0.04	0.13	0.20	0.23	0.17
C8	0.01	0.01	0.08	0.05	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.07	0.06	0.09	0.14	0.17	0.18	0.14
N1	0.01	0.01	0.06	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.11	0.04	0.05	0.13	0.20	0.22	0.16
N3	0.02	0.00	0.07	0.03	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.11	0.04	0.07	0.12	0.19	0.17	0.13
N6	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.04	0.01	0.08	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.04	0.04	0.14	0.21	0.26	0.19
N7	0.01	0.01	0.06	0.05	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.08	0.05	0.07	0.15	0.19	0.22	0.17
N9	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.04	0.09	0.17	0.15	0.11
O2'	0.02	0.12	0.01	0.03	0.07	0.09	0.08	0.08	0.10	0.07	0.11	0.11	0.10	0.08	0.04	0.00	0.06	0.08	0.05	0.26	0.07	0.10
O3'	0.02	0.05	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.06	0.04	0.04	0.04	0.05	0.02	0.06	0.00	0.01	0.14	0.34	0.20	0.21
O4'	0.01	0.07	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.04	0.09	0.05	0.07	0.04	0.07	0.04	0.08	0.01	0.00	0.07	0.11	0.12	0.09
O5'	0.06	0.13	0.05	0.08	0.11	0.02	0.12	0.01	0.13	0.14	0.13	0.12	0.14	0.15	0.09	0.05	0.14	0.07	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.17	0.19	0.28	0.28	0.18	0.12	0.19	0.07	0.20	0.17	0.20	0.19	0.21	0.19	0.17	0.26	0.34	0.11	0.02	0.00	0.03	0.01
OP2	0.10	0.20	0.09	0.12	0.18	0.04	0.21	0.02	0.23	0.18	0.22	0.17	0.26	0.22	0.15	0.07	0.20	0.12	0.01	0.03	0.00	0.01
P	0.07	0.14	0.11	0.14	0.13	0.03	0.16	0.01	0.17	0.14	0.16	0.13	0.19	0.17	0.11	0.10	0.21	0.09	0.00	0.01	0.01	0.00