Doublet Group distance statistics: 53922

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 0, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.011 std_dev=0.008
N9	A	0, 0.006, 0.015, 0.023, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.015 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.004, 0.013, 0.022, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.014 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.006, 0.015, 0.025, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.015 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.004, 0.015, 0.025, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C8	A	0, 0.005, 0.023, 0.041, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.023 std_dev=0.018
N7	A	0, 0.004, 0.023, 0.043, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.023 std_dev=0.019
N6	A	0, 0.004, 0.028, 0.052, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.028 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.039, 0.201, 0.364, 0.471 max_d=0.471 avg_d=0.201 std_dev=0.163
C2'	A	0, 0.048, 0.226, 0.403, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.226 std_dev=0.177
O2'	A	0, 0.096, 0.292, 0.489, 0.566 max_d=0.566 avg_d=0.292 std_dev=0.196
O4'	B	0, 0.071, 0.301, 0.532, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.301 std_dev=0.231
C4'	A	0, 0.100, 0.331, 0.563, 0.713 max_d=0.713 avg_d=0.331 std_dev=0.231
N3	B	0, 0.062, 0.296, 0.529, 0.588 max_d=0.588 avg_d=0.296 std_dev=0.233
C4	B	0, 0.054, 0.289, 0.525, 0.576 max_d=0.576 avg_d=0.289 std_dev=0.236
C3'	A	0, 0.113, 0.363, 0.612, 0.756 max_d=0.756 avg_d=0.363 std_dev=0.250
C5	B	0, 0.041, 0.308, 0.574, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.308 std_dev=0.267
N9	B	0, 0.060, 0.333, 0.607, 0.700 max_d=0.700 avg_d=0.333 std_dev=0.274
C1'	B	0, 0.049, 0.336, 0.624, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.336 std_dev=0.288
C6	B	0, 0.032, 0.320, 0.608, 0.818 max_d=0.818 avg_d=0.320 std_dev=0.288
C2	B	0, 0.061, 0.352, 0.643, 0.819 max_d=0.819 avg_d=0.352 std_dev=0.291
N1	B	0, 0.038, 0.360, 0.683, 0.928 max_d=0.928 avg_d=0.360 std_dev=0.322
N6	B	0, 0.008, 0.332, 0.657, 0.933 max_d=0.933 avg_d=0.332 std_dev=0.324
N7	B	0, 0.030, 0.364, 0.698, 0.954 max_d=0.954 avg_d=0.364 std_dev=0.334
O3'	A	0, 0.149, 0.489, 0.828, 1.010 max_d=1.010 avg_d=0.489 std_dev=0.339
C8	B	0, 0.046, 0.396, 0.746, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.396 std_dev=0.350
C4'	B	0, 0.068, 0.441, 0.814, 0.909 max_d=0.909 avg_d=0.441 std_dev=0.373
OP1	B	0, 0.236, 0.623, 1.010, 1.067 max_d=1.067 avg_d=0.623 std_dev=0.387
C5'	B	0, 0.145, 0.539, 0.933, 1.029 max_d=1.029 avg_d=0.539 std_dev=0.394
C5'	A	0, 0.150, 0.545, 0.941, 1.196 max_d=1.196 avg_d=0.545 std_dev=0.396
OP2	A	0, 0.338, 0.735, 1.132, 1.139 max_d=1.139 avg_d=0.735 std_dev=0.397
C2'	B	0, 0.024, 0.427, 0.830, 1.081 max_d=1.081 avg_d=0.427 std_dev=0.403
P	B	0, 0.233, 0.645, 1.056, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.645 std_dev=0.412
P	A	0, 0.233, 0.666, 1.099, 1.341 max_d=1.341 avg_d=0.666 std_dev=0.433
C3'	B	0, 0.031, 0.478, 0.925, 1.135 max_d=1.135 avg_d=0.478 std_dev=0.447
O2'	B	0, 0.045, 0.505, 0.964, 1.251 max_d=1.251 avg_d=0.505 std_dev=0.460
O5'	A	0, 0.067, 0.532, 0.997, 1.394 max_d=1.394 avg_d=0.532 std_dev=0.465
OP1	A	0, 0.234, 0.746, 1.258, 1.598 max_d=1.598 avg_d=0.746 std_dev=0.512
OP2	B	0, 0.248, 0.793, 1.338, 1.484 max_d=1.484 avg_d=0.793 std_dev=0.545
O5'	B	0, 0.166, 0.730, 1.294, 1.437 max_d=1.437 avg_d=0.730 std_dev=0.564
O3'	B	0, 0.063, 0.639, 1.214, 1.453 max_d=1.453 avg_d=0.639 std_dev=0.576

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.04	0.02
C2	0.02	0.00	0.09	0.08	0.01	0.02	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.12	0.10	0.05	0.10	0.11	0.14	0.12
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.06	0.07	0.09	0.03	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.08	0.13	0.05
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.07	0.02	0.06	0.10	0.07	0.08	0.08	0.09	0.04	0.01	0.01	0.01	0.06	0.09	0.14	0.06
C4	0.01	0.01	0.04	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.06	0.05	0.03	0.10	0.11	0.11	0.11
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.05	0.08	0.03	0.02	0.07	0.08	0.04	0.02	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.02
C5	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.03	0.14	0.18	0.19	0.16
C5'	0.01	0.05	0.01	0.02	0.06	0.01	0.10	0.00	0.10	0.11	0.08	0.03	0.13	0.13	0.06	0.02	0.03	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01
C6	0.02	0.00	0.04	0.06	0.01	0.05	0.01	0.10	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.07	0.06	0.04	0.15	0.19	0.23	0.19
C8	0.01	0.01	0.06	0.10	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.04	0.10	0.03	0.13	0.16	0.14	0.13
N1	0.02	0.00	0.07	0.07	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.08	0.05	0.13	0.16	0.19	0.16
N3	0.02	0.00	0.09	0.08	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.09	0.05	0.07	0.08	0.09	0.08
N6	0.02	0.01	0.03	0.08	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.06	0.07	0.04	0.18	0.24	0.29	0.23
N7	0.02	0.01	0.04	0.09	0.01	0.08	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.16	0.21	0.22	0.19
N9	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.01	0.06	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.01	0.08	0.09	0.07	0.08
O2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.06	0.02	0.04	0.02	0.07	0.04	0.10	0.11	0.06	0.03	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.08	0.12	0.04
O3'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.03	0.06	0.10	0.08	0.09	0.07	0.09	0.04	0.02	0.00	0.01	0.08	0.11	0.18	0.09
O4'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.01	0.03	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.04	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.05	0.04	0.02
O5'	0.03	0.10	0.03	0.06	0.10	0.01	0.14	0.01	0.15	0.13	0.13	0.07	0.18	0.16	0.08	0.03	0.08	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.11	0.08	0.09	0.11	0.07	0.18	0.06	0.19	0.16	0.16	0.08	0.24	0.21	0.09	0.08	0.11	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.04	0.14	0.13	0.14	0.11	0.08	0.19	0.05	0.23	0.14	0.19	0.09	0.29	0.22	0.07	0.12	0.18	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.02	0.12	0.05	0.06	0.11	0.02	0.16	0.01	0.19	0.13	0.16	0.08	0.23	0.19	0.08	0.04	0.09	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.26	0.15	0.20	0.14	0.16	0.16	0.22	0.21	0.16	0.27	0.17	0.22	0.15	0.14	0.11	0.19	0.14	0.23	0.21	0.22	0.23
C2	0.10	0.21	0.10	0.13	0.10	0.14	0.07	0.13	0.09	0.15	0.16	0.19	0.07	0.12	0.11	0.08	0.15	0.13	0.13	0.19	0.10	0.12
C2'	0.15	0.31	0.15	0.18	0.21	0.15	0.23	0.19	0.26	0.19	0.30	0.25	0.25	0.20	0.18	0.18	0.16	0.14	0.23	0.14	0.15	0.15
C3'	0.14	0.32	0.14	0.16	0.20	0.17	0.21	0.21	0.25	0.15	0.32	0.25	0.25	0.17	0.16	0.19	0.17	0.14	0.29	0.10	0.10	0.08
C4	0.08	0.21	0.10	0.12	0.05	0.10	0.08	0.12	0.12	0.13	0.20	0.11	0.14	0.12	0.09	0.05	0.11	0.10	0.13	0.15	0.10	0.14
C4'	0.11	0.32	0.13	0.16	0.17	0.14	0.18	0.19	0.25	0.13	0.33	0.22	0.25	0.14	0.13	0.15	0.16	0.11	0.25	0.18	0.17	0.15
C5	0.07	0.17	0.08	0.09	0.05	0.07	0.07	0.08	0.11	0.12	0.17	0.10	0.13	0.12	0.08	0.06	0.08	0.08	0.11	0.14	0.09	0.11
C5'	0.09	0.33	0.10	0.14	0.15	0.12	0.17	0.18	0.25	0.09	0.35	0.22	0.27	0.11	0.10	0.13	0.15	0.08	0.27	0.15	0.12	0.11
C6	0.07	0.17	0.07	0.06	0.07	0.06	0.03	0.07	0.07	0.11	0.15	0.14	0.05	0.10	0.07	0.08	0.07	0.08	0.07	0.16	0.10	0.09
C8	0.10	0.21	0.13	0.15	0.12	0.11	0.16	0.14	0.21	0.15	0.26	0.12	0.24	0.16	0.12	0.09	0.14	0.10	0.19	0.15	0.15	0.17
N1	0.09	0.20	0.10	0.10	0.13	0.11	0.10	0.10	0.11	0.14	0.17	0.19	0.08	0.13	0.11	0.10	0.12	0.11	0.09	0.20	0.12	0.11
N3	0.08	0.21	0.10	0.14	0.02	0.14	0.03	0.15	0.08	0.13	0.17	0.14	0.08	0.10	0.08	0.04	0.14	0.12	0.14	0.16	0.10	0.15
N6	0.07	0.16	0.07	0.05	0.09	0.05	0.06	0.06	0.08	0.09	0.15	0.13	0.05	0.09	0.07	0.09	0.05	0.07	0.06	0.17	0.12	0.08
N7	0.08	0.16	0.10	0.11	0.09	0.07	0.13	0.10	0.17	0.13	0.20	0.09	0.20	0.14	0.10	0.07	0.10	0.08	0.15	0.13	0.11	0.13
N9	0.10	0.24	0.13	0.16	0.12	0.12	0.15	0.16	0.19	0.15	0.26	0.14	0.21	0.15	0.12	0.08	0.15	0.11	0.19	0.16	0.16	0.18
O2'	0.24	0.30	0.24	0.28	0.26	0.25	0.26	0.31	0.27	0.25	0.29	0.28	0.26	0.25	0.25	0.26	0.26	0.23	0.32	0.18	0.24	0.23
O3'	0.20	0.32	0.19	0.20	0.24	0.24	0.24	0.27	0.26	0.20	0.31	0.27	0.26	0.21	0.21	0.26	0.24	0.20	0.35	0.08	0.09	0.08
O4'	0.13	0.30	0.15	0.19	0.14	0.16	0.16	0.21	0.23	0.15	0.32	0.19	0.25	0.15	0.13	0.11	0.18	0.14	0.23	0.24	0.23	0.23
O5'	0.04	0.34	0.02	0.05	0.13	0.06	0.15	0.14	0.26	0.03	0.37	0.21	0.28	0.07	0.05	0.07	0.08	0.03	0.23	0.16	0.10	0.11
OP1	0.07	0.29	0.10	0.16	0.13	0.16	0.15	0.25	0.24	0.05	0.32	0.19	0.26	0.08	0.08	0.13	0.21	0.08	0.38	0.10	0.16	0.14
OP2	0.08	0.34	0.13	0.21	0.17	0.19	0.18	0.30	0.28	0.07	0.38	0.23	0.31	0.11	0.10	0.13	0.26	0.08	0.44	0.11	0.25	0.20
P	0.05	0.33	0.08	0.14	0.15	0.12	0.16	0.22	0.27	0.05	0.37	0.22	0.29	0.09	0.07	0.10	0.18	0.05	0.34	0.10	0.14	0.11

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.02	0.32	0.31	0.18
C2	0.03	0.00	0.10	0.09	0.00	0.12	0.01	0.24	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.11	0.10	0.26	0.27	0.24	0.17
C2'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.01	0.06	0.05	0.09	0.10	0.05	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.35	0.37	0.21
C3'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.00	0.06	0.02	0.05	0.11	0.06	0.09	0.06	0.10	0.05	0.01	0.00	0.01	0.05	0.28	0.34	0.19
C4	0.02	0.00	0.06	0.05	0.00	0.09	0.00	0.17	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.05	0.05	0.06	0.17	0.30	0.30	0.19
C4'	0.00	0.12	0.01	0.00	0.09	0.00	0.09	0.00	0.11	0.05	0.12	0.11	0.11	0.07	0.05	0.05	0.03	0.00	0.01	0.29	0.27	0.18
C5	0.02	0.01	0.04	0.06	0.00	0.09	0.00	0.19	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.05	0.05	0.19	0.30	0.32	0.20
C5'	0.02	0.24	0.01	0.02	0.17	0.00	0.19	0.00	0.23	0.11	0.25	0.21	0.24	0.16	0.10	0.04	0.03	0.01	0.01	0.06	0.06	0.02
C6	0.02	0.01	0.06	0.05	0.01	0.11	0.01	0.23	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.06	0.07	0.24	0.29	0.30	0.20
C8	0.01	0.01	0.05	0.11	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.06	0.09	0.01	0.10	0.30	0.36	0.20
N1	0.03	0.00	0.09	0.06	0.01	0.12	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.09	0.09	0.27	0.28	0.26	0.18
N3	0.02	0.00	0.10	0.09	0.00	0.11	0.01	0.21	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.04	0.10	0.10	0.21	0.28	0.25	0.17
N6	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.11	0.01	0.24	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.10	0.07	0.06	0.25	0.29	0.31	0.21
N7	0.02	0.01	0.02	0.10	0.01	0.07	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.08	0.08	0.02	0.16	0.30	0.36	0.21
N9	0.01	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.09	0.31	0.33	0.19
O2'	0.02	0.06	0.00	0.01	0.05	0.05	0.07	0.04	0.08	0.06	0.08	0.04	0.10	0.08	0.03	0.00	0.04	0.07	0.02	0.50	0.47	0.31
O3'	0.03	0.11	0.02	0.00	0.05	0.03	0.05	0.03	0.06	0.09	0.09	0.10	0.07	0.08	0.03	0.04	0.00	0.03	0.07	0.31	0.43	0.25
O4'	0.01	0.10	0.01	0.01	0.06	0.00	0.05	0.01	0.07	0.01	0.09	0.10	0.06	0.02	0.01	0.07	0.03	0.00	0.01	0.29	0.25	0.15
O5'	0.02	0.26	0.04	0.05	0.17	0.01	0.19	0.01	0.24	0.10	0.27	0.21	0.25	0.16	0.09	0.02	0.07	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.32	0.27	0.35	0.28	0.30	0.29	0.30	0.06	0.29	0.30	0.28	0.28	0.29	0.30	0.31	0.50	0.31	0.29	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.31	0.24	0.37	0.34	0.30	0.27	0.32	0.06	0.30	0.36	0.26	0.25	0.31	0.36	0.33	0.47	0.43	0.25	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.18	0.17	0.21	0.19	0.19	0.18	0.20	0.02	0.20	0.20	0.18	0.17	0.21	0.21	0.19	0.31	0.25	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00