Doublet Group distance statistics: 53942

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 8, 11, 14, 2, 6, 0, 4, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.010, 0.019, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.010 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.008, 0.017, 0.025, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.017 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.003, 0.013, 0.024, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.013 std_dev=0.010
N3	A	0, 0.007, 0.018, 0.029, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.018 std_dev=0.011
C1'	A	0, 0.005, 0.017, 0.029, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.017 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.005, 0.017, 0.030, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.017 std_dev=0.013
N9	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.002, 0.016, 0.029, 0.085 max_d=0.085 avg_d=0.016 std_dev=0.014
C8	A	0, 0.010, 0.030, 0.050, 0.094 max_d=0.094 avg_d=0.030 std_dev=0.020
N7	A	0, 0.007, 0.031, 0.056, 0.142 max_d=0.142 avg_d=0.031 std_dev=0.024
N6	A	0, 0.011, 0.035, 0.060, 0.139 max_d=0.139 avg_d=0.035 std_dev=0.025
C6	B	0, 0.164, 0.294, 0.424, 0.765 max_d=0.765 avg_d=0.294 std_dev=0.130
C5	B	0, 0.146, 0.298, 0.450, 0.882 max_d=0.882 avg_d=0.298 std_dev=0.152
N1	B	0, 0.153, 0.315, 0.478, 0.781 max_d=0.781 avg_d=0.315 std_dev=0.163
O4'	B	0, 0.222, 0.425, 0.629, 0.847 max_d=0.847 avg_d=0.425 std_dev=0.203
C1'	B	0, 0.194, 0.403, 0.611, 0.872 max_d=0.872 avg_d=0.403 std_dev=0.209
C4	B	0, 0.097, 0.306, 0.516, 0.961 max_d=0.961 avg_d=0.306 std_dev=0.209
C2	B	0, 0.132, 0.389, 0.645, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.389 std_dev=0.257
N3	B	0, 0.097, 0.375, 0.654, 1.091 max_d=1.091 avg_d=0.375 std_dev=0.278
N4	B	0, 0.069, 0.368, 0.666, 1.216 max_d=1.216 avg_d=0.368 std_dev=0.299
O2	B	0, 0.160, 0.528, 0.897, 1.434 max_d=1.434 avg_d=0.528 std_dev=0.368
O4'	A	0, -0.133, 0.258, 0.650, 1.261 max_d=1.261 avg_d=0.258 std_dev=0.391
C4'	B	0, 0.120, 0.522, 0.924, 1.506 max_d=1.506 avg_d=0.522 std_dev=0.402
C2'	A	0, -0.128, 0.306, 0.740, 1.354 max_d=1.354 avg_d=0.306 std_dev=0.434
C2'	B	0, 0.063, 0.524, 0.984, 1.733 max_d=1.733 avg_d=0.524 std_dev=0.460
C3'	B	0, -0.025, 0.547, 1.118, 1.990 max_d=1.990 avg_d=0.547 std_dev=0.572
O2'	B	0, 0.047, 0.635, 1.223, 2.150 max_d=2.150 avg_d=0.635 std_dev=0.588
C5'	B	0, 0.038, 0.643, 1.248, 2.291 max_d=2.291 avg_d=0.643 std_dev=0.605
O5'	B	0, 0.010, 0.642, 1.274, 2.402 max_d=2.402 avg_d=0.642 std_dev=0.632
C3'	A	0, -0.169, 0.486, 1.142, 2.020 max_d=2.020 avg_d=0.486 std_dev=0.655
O2'	A	0, -0.191, 0.489, 1.169, 2.067 max_d=2.067 avg_d=0.489 std_dev=0.680
C4'	A	0, -0.227, 0.456, 1.138, 2.088 max_d=2.088 avg_d=0.456 std_dev=0.682
O3'	A	0, -0.136, 0.725, 1.585, 2.630 max_d=2.630 avg_d=0.725 std_dev=0.861
O3'	B	0, -0.177, 0.688, 1.553, 2.809 max_d=2.809 avg_d=0.688 std_dev=0.865
O5'	A	0, -0.207, 0.664, 1.536, 2.666 max_d=2.666 avg_d=0.664 std_dev=0.871
P	B	0, -0.125, 0.783, 1.691, 3.256 max_d=3.256 avg_d=0.783 std_dev=0.908
OP2	B	0, -0.108, 0.823, 1.755, 3.293 max_d=3.293 avg_d=0.823 std_dev=0.932
C5'	A	0, -0.271, 0.682, 1.634, 2.956 max_d=2.956 avg_d=0.682 std_dev=0.952
P	A	0, -0.278, 0.753, 1.785, 3.135 max_d=3.135 avg_d=0.753 std_dev=1.031
OP2	A	0, -0.269, 0.794, 1.857, 3.319 max_d=3.319 avg_d=0.794 std_dev=1.063
OP1	A	0, -0.296, 0.808, 1.913, 3.336 max_d=3.336 avg_d=0.808 std_dev=1.104
OP1	B	0, -0.191, 0.941, 2.072, 3.907 max_d=3.907 avg_d=0.941 std_dev=1.131

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.02	0.00	0.02	0.27	0.01	0.06	0.10	0.11	0.06
C2	0.03	0.00	0.28	0.16	0.01	0.11	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.19	0.26	0.20	0.10	0.10	0.18	0.12
C2'	0.01	0.28	0.00	0.00	0.15	0.01	0.08	0.11	0.14	0.13	0.22	0.27	0.11	0.07	0.02	0.00	0.03	0.02	0.26	0.40	0.31	0.29
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.19	0.01	0.28	0.02	0.28	0.31	0.23	0.12	0.33	0.34	0.19	0.01	0.01	0.02	0.06	0.15	0.10	0.05
C4	0.02	0.01	0.15	0.19	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.14	0.11	0.15	0.13	0.20	0.17
C4'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.03	0.00	0.09	0.01	0.06	0.22	0.05	0.11	0.10	0.20	0.08	0.24	0.02	0.01	0.01	0.07	0.06	0.03
C5	0.01	0.01	0.08	0.28	0.01	0.09	0.00	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.21	0.07	0.06	0.26	0.25	0.33	0.30
C5'	0.02	0.12	0.11	0.02	0.06	0.01	0.14	0.00	0.11	0.28	0.08	0.12	0.16	0.27	0.10	0.13	0.18	0.01	0.01	0.10	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.14	0.28	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.02	0.17	0.06	0.10	0.25	0.26	0.36	0.30
C8	0.02	0.01	0.13	0.31	0.00	0.22	0.01	0.28	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.35	0.17	0.11	0.34	0.27	0.33	0.36
N1	0.03	0.00	0.22	0.23	0.01	0.05	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.14	0.15	0.16	0.17	0.18	0.27	0.21
N3	0.03	0.00	0.27	0.12	0.01	0.11	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.19	0.30	0.19	0.07	0.07	0.14	0.08
N6	0.03	0.01	0.11	0.33	0.02	0.10	0.02	0.16	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.03	0.03	0.22	0.10	0.08	0.31	0.35	0.45	0.39
N7	0.02	0.02	0.07	0.34	0.01	0.20	0.01	0.27	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.02	0.34	0.19	0.06	0.37	0.35	0.44	0.42
N9	0.00	0.01	0.02	0.19	0.01	0.08	0.01	0.10	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.17	0.10	0.01	0.15	0.11	0.17	0.17
O2'	0.02	0.19	0.00	0.01	0.11	0.24	0.21	0.13	0.17	0.35	0.14	0.19	0.22	0.34	0.17	0.00	0.07	0.17	0.15	0.33	0.28	0.19
O3'	0.27	0.26	0.03	0.01	0.14	0.02	0.07	0.18	0.06	0.17	0.15	0.30	0.10	0.19	0.10	0.07	0.00	0.16	0.22	0.30	0.29	0.25
O4'	0.01	0.20	0.02	0.02	0.11	0.01	0.06	0.01	0.10	0.11	0.16	0.19	0.08	0.06	0.01	0.17	0.16	0.00	0.06	0.07	0.15	0.11
O5'	0.06	0.10	0.26	0.06	0.15	0.01	0.26	0.01	0.25	0.34	0.17	0.07	0.31	0.37	0.15	0.15	0.22	0.06	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.10	0.10	0.40	0.15	0.13	0.07	0.25	0.10	0.26	0.27	0.18	0.07	0.35	0.35	0.11	0.33	0.30	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.18	0.31	0.10	0.20	0.06	0.33	0.03	0.36	0.33	0.27	0.14	0.45	0.44	0.17	0.28	0.29	0.15	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.06	0.12	0.29	0.05	0.17	0.03	0.30	0.01	0.30	0.36	0.21	0.08	0.39	0.42	0.17	0.19	0.25	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.19	0.10	0.08	0.18	0.12	0.14	0.19	0.13	0.14	0.21	0.21	0.21	0.11	0.09	0.12	0.22	0.32	0.36	0.32
C2	0.17	0.13	0.20	0.33	0.08	0.31	0.12	0.43	0.17	0.15	0.14	0.17	0.17	0.17	0.34	0.22	0.49	0.62	0.65	0.58
C2'	0.33	0.49	0.25	0.17	0.46	0.21	0.29	0.19	0.27	0.36	0.55	0.53	0.54	0.28	0.13	0.28	0.19	0.16	0.16	0.17
C3'	0.55	0.60	0.42	0.40	0.64	0.52	0.61	0.58	0.58	0.58	0.63	0.68	0.60	0.43	0.32	0.59	0.58	0.60	0.64	0.65
C4	0.11	0.14	0.10	0.12	0.12	0.18	0.14	0.29	0.14	0.12	0.14	0.12	0.15	0.11	0.11	0.14	0.36	0.50	0.58	0.49
C4'	0.28	0.32	0.15	0.16	0.40	0.30	0.41	0.41	0.36	0.32	0.36	0.45	0.30	0.14	0.10	0.35	0.45	0.58	0.64	0.60
C5	0.09	0.12	0.14	0.09	0.12	0.16	0.17	0.31	0.15	0.10	0.13	0.13	0.15	0.17	0.10	0.14	0.40	0.58	0.71	0.59
C5'	0.33	0.36	0.16	0.17	0.47	0.37	0.51	0.51	0.45	0.38	0.40	0.53	0.32	0.14	0.09	0.44	0.54	0.70	0.78	0.75
C6	0.08	0.14	0.12	0.15	0.07	0.24	0.16	0.43	0.17	0.08	0.15	0.10	0.20	0.17	0.13	0.17	0.54	0.72	0.82	0.71
C8	0.10	0.14	0.18	0.15	0.19	0.11	0.18	0.19	0.13	0.11	0.17	0.24	0.14	0.20	0.21	0.11	0.23	0.39	0.49	0.41
N1	0.13	0.14	0.14	0.32	0.08	0.33	0.14	0.48	0.19	0.11	0.18	0.15	0.20	0.12	0.32	0.22	0.57	0.72	0.75	0.68
N3	0.16	0.15	0.16	0.23	0.09	0.24	0.12	0.34	0.15	0.15	0.14	0.12	0.18	0.15	0.24	0.18	0.40	0.52	0.56	0.49
N6	0.11	0.19	0.24	0.11	0.09	0.25	0.18	0.50	0.18	0.10	0.18	0.10	0.27	0.29	0.11	0.18	0.64	0.87	0.95	0.86
N7	0.12	0.13	0.23	0.17	0.16	0.12	0.19	0.24	0.14	0.11	0.14	0.20	0.15	0.25	0.24	0.12	0.30	0.50	0.67	0.54
N9	0.10	0.15	0.11	0.08	0.17	0.12	0.15	0.22	0.13	0.13	0.18	0.20	0.17	0.13	0.10	0.12	0.26	0.39	0.47	0.40
O2'	0.22	0.18	0.21	0.29	0.20	0.33	0.36	0.39	0.34	0.21	0.20	0.19	0.25	0.19	0.30	0.31	0.42	0.50	0.50	0.48
O3'	0.34	0.35	0.21	0.20	0.39	0.34	0.39	0.42	0.38	0.36	0.36	0.41	0.34	0.22	0.14	0.40	0.43	0.50	0.51	0.52
O4'	0.11	0.16	0.13	0.09	0.20	0.14	0.20	0.26	0.16	0.13	0.18	0.24	0.17	0.16	0.13	0.15	0.31	0.49	0.56	0.49
O5'	0.45	0.47	0.25	0.27	0.58	0.48	0.63	0.62	0.57	0.50	0.50	0.62	0.42	0.23	0.16	0.56	0.64	0.79	0.87	0.85
OP1	0.50	0.50	0.27	0.27	0.59	0.52	0.64	0.66	0.60	0.53	0.53	0.62	0.46	0.26	0.15	0.63	0.65	0.79	0.82	0.86
OP2	0.60	0.58	0.34	0.37	0.70	0.66	0.79	0.84	0.75	0.64	0.60	0.72	0.51	0.31	0.21	0.76	0.86	1.06	1.15	1.14
P	0.53	0.52	0.29	0.32	0.64	0.58	0.71	0.74	0.66	0.57	0.55	0.66	0.46	0.27	0.18	0.67	0.76	0.95	1.02	1.01

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.07	0.07	0.14	0.05
C2	0.01	0.00	0.05	0.06	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.02	0.13	0.13	0.21	0.12
C2'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.04	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.04	0.05	0.09	0.00	0.02	0.01	0.05	0.10	0.14	0.06
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.07	0.02	0.07	0.03	0.05	0.06	0.10	0.02	0.01	0.01	0.06	0.11	0.11	0.07
C4	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.06	0.03	0.18	0.18	0.25	0.18
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.06	0.03	0.04	0.06	0.04	0.04	0.01	0.01	0.02	0.11	0.08	0.02
C5	0.03	0.01	0.05	0.07	0.00	0.07	0.00	0.13	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.05	0.19	0.17	0.25	0.18
C5'	0.02	0.07	0.02	0.02	0.12	0.01	0.13	0.00	0.11	0.07	0.09	0.13	0.05	0.04	0.03	0.01	0.01	0.12	0.04	0.02
C6	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.06	0.00	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.08	0.04	0.16	0.13	0.21	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.12	0.10	0.19	0.10
N3	0.02	0.01	0.04	0.05	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.06	0.03	0.16	0.16	0.24	0.16
N4	0.02	0.01	0.05	0.06	0.00	0.06	0.01	0.13	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.05	0.07	0.04	0.19	0.21	0.26	0.21
O2	0.03	0.01	0.09	0.10	0.02	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.12	0.04	0.11	0.12	0.21	0.11
O2'	0.01	0.04	0.00	0.02	0.04	0.04	0.04	0.04	0.04	0.02	0.05	0.05	0.07	0.00	0.05	0.04	0.04	0.11	0.12	0.05
O3'	0.02	0.07	0.02	0.01	0.06	0.01	0.08	0.03	0.08	0.03	0.06	0.07	0.12	0.05	0.00	0.02	0.09	0.14	0.12	0.09
O4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.04	0.04	0.02	0.00	0.06	0.08	0.13	0.05
O5'	0.07	0.13	0.05	0.06	0.18	0.02	0.19	0.01	0.16	0.12	0.16	0.19	0.11	0.04	0.09	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.07	0.13	0.10	0.11	0.18	0.11	0.17	0.12	0.13	0.10	0.16	0.21	0.12	0.11	0.14	0.08	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.14	0.21	0.14	0.11	0.25	0.08	0.25	0.04	0.21	0.19	0.24	0.26	0.21	0.12	0.12	0.13	0.02	0.02	0.00	0.01
P	0.05	0.12	0.06	0.07	0.18	0.02	0.18	0.02	0.13	0.10	0.16	0.21	0.11	0.05	0.09	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00