Doublet Group distance statistics: 53943

back

Distances from reference structure (by RMSD)

7, 12, 7, 5, 6, 3, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.006, 0.013, 0.020, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.001, 0.009, 0.017, 0.029 max_d=0.029 avg_d=0.009 std_dev=0.008
C1'	A	0, 0.006, 0.017, 0.028, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.017 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.010, 0.022, 0.034, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.022 std_dev=0.012
C5	A	0, 0.009, 0.022, 0.035, 0.060 max_d=0.060 avg_d=0.022 std_dev=0.013
N3	A	0, 0.008, 0.021, 0.034, 0.050 max_d=0.050 avg_d=0.021 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.011, 0.030, 0.048, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.030 std_dev=0.018
N9	A	0, 0.011, 0.030, 0.049, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.030 std_dev=0.019
N7	A	0, 0.017, 0.042, 0.067, 0.111 max_d=0.111 avg_d=0.042 std_dev=0.025
N6	A	0, 0.015, 0.041, 0.067, 0.102 max_d=0.102 avg_d=0.041 std_dev=0.026
C8	A	0, 0.019, 0.050, 0.082, 0.124 max_d=0.124 avg_d=0.050 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.027, 0.126, 0.225, 0.596 max_d=0.596 avg_d=0.126 std_dev=0.099
C2'	A	0, 0.014, 0.137, 0.261, 0.811 max_d=0.811 avg_d=0.137 std_dev=0.124
N1	B	0, 0.083, 0.227, 0.371, 0.567 max_d=0.567 avg_d=0.227 std_dev=0.144
C2	B	0, 0.057, 0.237, 0.417, 0.877 max_d=0.877 avg_d=0.237 std_dev=0.180
C6	B	0, 0.086, 0.268, 0.450, 0.800 max_d=0.800 avg_d=0.268 std_dev=0.182
C5	B	0, 0.080, 0.266, 0.452, 0.725 max_d=0.725 avg_d=0.266 std_dev=0.186
C4'	A	0, 0.013, 0.207, 0.400, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.207 std_dev=0.193
C1'	B	0, 0.103, 0.304, 0.506, 0.804 max_d=0.804 avg_d=0.304 std_dev=0.201
C4	B	0, 0.050, 0.254, 0.459, 0.915 max_d=0.915 avg_d=0.254 std_dev=0.205
N3	B	0, 0.033, 0.264, 0.496, 1.066 max_d=1.066 avg_d=0.264 std_dev=0.232
O4'	B	0, 0.086, 0.320, 0.555, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.320 std_dev=0.234
C2'	B	0, 0.105, 0.341, 0.577, 0.876 max_d=0.876 avg_d=0.341 std_dev=0.236
C5'	A	0, 0.062, 0.301, 0.541, 1.003 max_d=1.003 avg_d=0.301 std_dev=0.239
O2	B	0, 0.046, 0.304, 0.561, 1.415 max_d=1.415 avg_d=0.304 std_dev=0.257
N4	B	0, 0.053, 0.332, 0.612, 1.264 max_d=1.264 avg_d=0.332 std_dev=0.280
O5'	A	0, 0.006, 0.289, 0.572, 1.769 max_d=1.769 avg_d=0.289 std_dev=0.283
C3'	B	0, 0.011, 0.305, 0.599, 1.643 max_d=1.643 avg_d=0.305 std_dev=0.294
C4'	B	0, 0.036, 0.334, 0.632, 1.262 max_d=1.262 avg_d=0.334 std_dev=0.298
C3'	A	0, -0.074, 0.232, 0.538, 1.871 max_d=1.871 avg_d=0.232 std_dev=0.306
O2'	A	0, -0.034, 0.279, 0.592, 1.763 max_d=1.763 avg_d=0.279 std_dev=0.313
P	A	0, -0.011, 0.337, 0.686, 2.071 max_d=2.071 avg_d=0.337 std_dev=0.349
OP1	A	0, 0.040, 0.390, 0.739, 1.891 max_d=1.891 avg_d=0.390 std_dev=0.350
C5'	B	0, 0.008, 0.363, 0.718, 1.466 max_d=1.466 avg_d=0.363 std_dev=0.355
O5'	B	0, -0.022, 0.378, 0.778, 1.895 max_d=1.895 avg_d=0.378 std_dev=0.400
O2'	B	0, 0.059, 0.523, 0.986, 2.611 max_d=2.611 avg_d=0.523 std_dev=0.463
P	B	0, -0.060, 0.452, 0.964, 2.272 max_d=2.272 avg_d=0.452 std_dev=0.512
O3'	B	0, -0.143, 0.392, 0.928, 3.291 max_d=3.291 avg_d=0.392 std_dev=0.536
OP1	B	0, -0.039, 0.510, 1.059, 2.171 max_d=2.171 avg_d=0.510 std_dev=0.549
OP2	A	0, -0.167, 0.439, 1.045, 3.904 max_d=3.904 avg_d=0.439 std_dev=0.606
O3'	A	0, -0.248, 0.360, 0.967, 3.538 max_d=3.538 avg_d=0.360 std_dev=0.607
OP2	B	0, -0.202, 0.499, 1.200, 4.239 max_d=4.239 avg_d=0.499 std_dev=0.701

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.18	0.00	0.08	0.30	0.07	0.11
C2	0.02	0.00	0.11	0.11	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.21	0.23	0.05	0.11	0.34	0.30	0.10
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.10	0.07	0.07	0.09	0.10	0.06	0.05	0.02	0.00	0.05	0.01	0.20	0.29	0.15	0.23
C3'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.11	0.00	0.16	0.01	0.15	0.19	0.13	0.09	0.18	0.20	0.11	0.01	0.01	0.01	0.07	0.13	0.05	0.07
C4	0.01	0.00	0.05	0.11	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.16	0.16	0.03	0.12	0.34	0.27	0.11
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.06	0.11	0.04	0.03	0.08	0.11	0.05	0.14	0.02	0.00	0.01	0.13	0.08	0.05
C5	0.01	0.01	0.04	0.16	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.18	0.13	0.04	0.18	0.35	0.38	0.15
C5'	0.03	0.05	0.10	0.01	0.07	0.00	0.12	0.00	0.12	0.14	0.08	0.03	0.15	0.16	0.07	0.05	0.11	0.01	0.01	0.07	0.14	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.15	0.01	0.06	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.21	0.15	0.05	0.18	0.35	0.42	0.16
C8	0.01	0.01	0.07	0.19	0.00	0.11	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.14	0.04	0.19	0.34	0.30	0.14
N1	0.02	0.00	0.09	0.13	0.01	0.04	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.22	0.19	0.05	0.15	0.35	0.38	0.13
N3	0.02	0.00	0.10	0.09	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.19	0.24	0.05	0.09	0.34	0.23	0.09
N6	0.01	0.01	0.06	0.18	0.01	0.08	0.01	0.15	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.22	0.16	0.06	0.22	0.36	0.49	0.19
N7	0.01	0.01	0.05	0.20	0.01	0.11	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.00	0.16	0.16	0.04	0.22	0.35	0.42	0.18
N9	0.00	0.01	0.02	0.11	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.10	0.11	0.01	0.11	0.33	0.20	0.10
O2'	0.02	0.21	0.00	0.01	0.16	0.14	0.18	0.05	0.21	0.12	0.22	0.19	0.22	0.16	0.10	0.00	0.05	0.10	0.16	0.24	0.13	0.20
O3'	0.18	0.23	0.05	0.01	0.16	0.02	0.13	0.11	0.15	0.14	0.19	0.24	0.16	0.16	0.11	0.05	0.00	0.13	0.14	0.21	0.14	0.15
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.04	0.01	0.05	0.04	0.05	0.05	0.06	0.04	0.01	0.10	0.13	0.00	0.07	0.29	0.11	0.13
O5'	0.08	0.11	0.20	0.07	0.12	0.01	0.18	0.01	0.18	0.19	0.15	0.09	0.22	0.22	0.11	0.16	0.14	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.30	0.34	0.29	0.13	0.34	0.13	0.35	0.07	0.35	0.34	0.35	0.34	0.36	0.35	0.33	0.24	0.21	0.29	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.07	0.30	0.15	0.05	0.27	0.08	0.38	0.14	0.42	0.30	0.38	0.23	0.49	0.42	0.20	0.13	0.14	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.10	0.23	0.07	0.11	0.05	0.15	0.01	0.16	0.14	0.13	0.09	0.19	0.18	0.10	0.20	0.15	0.13	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.14	0.17	0.22	0.17	0.14	0.22	0.13	0.21	0.15	0.15	0.19	0.14	0.24	0.33	0.13	0.12	0.21	0.22	0.15
C2	0.13	0.14	0.15	0.15	0.12	0.10	0.14	0.12	0.14	0.12	0.15	0.14	0.16	0.33	0.15	0.10	0.15	0.27	0.46	0.18
C2'	0.22	0.19	0.23	0.30	0.24	0.25	0.29	0.24	0.27	0.22	0.20	0.27	0.17	0.26	0.42	0.22	0.21	0.23	0.25	0.19
C3'	0.30	0.26	0.33	0.12	0.32	0.18	0.37	0.21	0.36	0.30	0.27	0.33	0.23	0.37	0.19	0.27	0.31	0.32	0.34	0.40
C4	0.13	0.12	0.15	0.16	0.12	0.10	0.15	0.11	0.16	0.11	0.14	0.13	0.14	0.31	0.19	0.10	0.11	0.24	0.34	0.13
C4'	0.17	0.11	0.19	0.08	0.20	0.10	0.27	0.18	0.26	0.17	0.14	0.21	0.09	0.25	0.28	0.16	0.30	0.37	0.33	0.41
C5	0.14	0.12	0.17	0.14	0.09	0.10	0.12	0.09	0.14	0.11	0.14	0.12	0.16	0.35	0.16	0.10	0.10	0.26	0.30	0.13
C5'	0.12	0.10	0.13	0.10	0.17	0.14	0.23	0.23	0.22	0.13	0.13	0.18	0.12	0.19	0.33	0.14	0.36	0.46	0.39	0.45
C6	0.15	0.12	0.18	0.13	0.08	0.10	0.11	0.09	0.13	0.11	0.13	0.13	0.17	0.37	0.15	0.10	0.11	0.28	0.35	0.14
C8	0.13	0.13	0.16	0.17	0.11	0.12	0.14	0.12	0.16	0.11	0.15	0.12	0.17	0.30	0.23	0.11	0.14	0.24	0.17	0.17
N1	0.14	0.13	0.17	0.13	0.09	0.09	0.12	0.10	0.13	0.12	0.14	0.10	0.17	0.36	0.13	0.10	0.13	0.28	0.43	0.17
N3	0.13	0.13	0.15	0.17	0.14	0.11	0.15	0.13	0.15	0.12	0.15	0.16	0.14	0.30	0.20	0.10	0.15	0.25	0.43	0.16
N6	0.17	0.12	0.20	0.15	0.11	0.12	0.12	0.10	0.12	0.12	0.13	0.19	0.18	0.40	0.20	0.13	0.11	0.29	0.32	0.14
N7	0.14	0.14	0.18	0.16	0.11	0.12	0.11	0.12	0.14	0.10	0.16	0.14	0.18	0.36	0.19	0.11	0.12	0.26	0.20	0.15
N9	0.13	0.13	0.16	0.18	0.13	0.12	0.17	0.11	0.18	0.13	0.14	0.14	0.15	0.28	0.25	0.11	0.10	0.22	0.24	0.13
O2'	0.38	0.39	0.32	0.41	0.43	0.40	0.46	0.41	0.44	0.40	0.40	0.44	0.37	0.31	0.47	0.41	0.42	0.36	0.48	0.37
O3'	0.43	0.33	0.45	0.28	0.33	0.40	0.38	0.48	0.41	0.39	0.31	0.34	0.32	0.46	0.15	0.45	0.53	0.55	0.52	0.67
O4'	0.13	0.12	0.15	0.19	0.15	0.13	0.20	0.13	0.20	0.13	0.13	0.16	0.14	0.23	0.36	0.11	0.19	0.28	0.20	0.27
O5'	0.09	0.12	0.11	0.14	0.16	0.14	0.19	0.17	0.18	0.11	0.14	0.17	0.14	0.20	0.36	0.11	0.24	0.34	0.27	0.29
OP1	0.22	0.40	0.23	0.13	0.36	0.10	0.28	0.07	0.24	0.29	0.42	0.38	0.46	0.22	0.27	0.16	0.16	0.23	0.23	0.22
OP2	0.21	0.25	0.23	0.05	0.25	0.06	0.26	0.13	0.25	0.23	0.26	0.26	0.27	0.36	0.19	0.10	0.23	0.35	0.25	0.27
P	0.10	0.18	0.09	0.19	0.14	0.19	0.13	0.16	0.12	0.12	0.18	0.15	0.23	0.11	0.43	0.14	0.16	0.30	0.20	0.20

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.11	0.00	0.07	0.20	0.12	0.08
C2	0.01	0.00	0.08	0.09	0.01	0.02	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.07	0.11	0.05	0.10	0.29	0.25	0.12
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.01	0.06	0.06	0.07	0.02	0.06	0.03	0.14	0.00	0.02	0.01	0.14	0.21	0.12	0.16
C3'	0.01	0.09	0.00	0.00	0.13	0.00	0.15	0.02	0.13	0.08	0.11	0.14	0.09	0.01	0.01	0.01	0.05	0.12	0.10	0.06
C4	0.01	0.01	0.03	0.13	0.00	0.06	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.13	0.07	0.03	0.16	0.32	0.41	0.18
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.09	0.04	0.03	0.07	0.05	0.10	0.02	0.00	0.01	0.08	0.09	0.02
C5	0.01	0.00	0.06	0.15	0.00	0.09	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.10	0.05	0.18	0.30	0.43	0.19
C5'	0.03	0.05	0.06	0.02	0.10	0.00	0.12	0.00	0.11	0.05	0.07	0.11	0.06	0.05	0.09	0.01	0.01	0.10	0.15	0.01
C6	0.01	0.01	0.07	0.13	0.01	0.09	0.00	0.11	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.14	0.09	0.06	0.15	0.26	0.32	0.14
N1	0.00	0.01	0.02	0.08	0.01	0.04	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.01	0.09	0.26	0.22	0.11
N3	0.01	0.00	0.06	0.11	0.00	0.03	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.09	0.09	0.04	0.13	0.32	0.33	0.15
N4	0.01	0.01	0.03	0.14	0.00	0.07	0.01	0.11	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.15	0.08	0.03	0.18	0.33	0.47	0.20
O2	0.02	0.00	0.14	0.09	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.18	0.09	0.09	0.28	0.20	0.11
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.13	0.10	0.16	0.05	0.14	0.07	0.09	0.15	0.11	0.00	0.04	0.08	0.11	0.17	0.12	0.13
O3'	0.11	0.11	0.02	0.01	0.07	0.02	0.10	0.09	0.09	0.05	0.09	0.08	0.18	0.04	0.00	0.07	0.12	0.26	0.14	0.15
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.03	0.00	0.05	0.01	0.06	0.01	0.04	0.03	0.09	0.08	0.07	0.00	0.06	0.16	0.11	0.08
O5'	0.07	0.10	0.14	0.05	0.16	0.01	0.18	0.01	0.15	0.09	0.13	0.18	0.09	0.11	0.12	0.06	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.20	0.29	0.21	0.12	0.32	0.08	0.30	0.10	0.26	0.26	0.32	0.33	0.28	0.17	0.26	0.16	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.12	0.25	0.12	0.10	0.41	0.09	0.43	0.15	0.32	0.22	0.33	0.47	0.20	0.12	0.14	0.11	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.08	0.12	0.16	0.06	0.18	0.02	0.19	0.01	0.14	0.11	0.15	0.20	0.11	0.13	0.15	0.08	0.00	0.01	0.01	0.00