Doublet Group distance statistics: 53945

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 2, 15, 5, 6, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.007, 0.010, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.003
C2	A	0, 0.002, 0.007, 0.012, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.004, 0.010, 0.015, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.010 std_dev=0.005
N1	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N3	A	0, 0.004, 0.011, 0.017, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.006
N9	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.014 std_dev=0.007
N7	A	0, 0.010, 0.020, 0.030, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.020 std_dev=0.010
C8	A	0, 0.012, 0.023, 0.035, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.023 std_dev=0.012
N6	A	0, 0.012, 0.025, 0.038, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.025 std_dev=0.013
O4'	A	0, -0.002, 0.099, 0.199, 0.494 max_d=0.494 avg_d=0.099 std_dev=0.101
N1	B	0, 0.137, 0.239, 0.341, 0.542 max_d=0.542 avg_d=0.239 std_dev=0.102
C2'	A	0, 0.010, 0.116, 0.222, 0.512 max_d=0.512 avg_d=0.116 std_dev=0.106
C1'	B	0, 0.134, 0.272, 0.410, 0.840 max_d=0.840 avg_d=0.272 std_dev=0.138
C4	B	0, 0.111, 0.250, 0.390, 0.734 max_d=0.734 avg_d=0.250 std_dev=0.139
C2'	B	0, 0.147, 0.314, 0.482, 0.722 max_d=0.722 avg_d=0.314 std_dev=0.167
N4	B	0, 0.117, 0.296, 0.475, 1.038 max_d=1.038 avg_d=0.296 std_dev=0.179
O4'	B	0, 0.144, 0.331, 0.518, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.331 std_dev=0.187
N3	B	0, 0.170, 0.368, 0.565, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.368 std_dev=0.198
C2	B	0, 0.172, 0.370, 0.568, 0.884 max_d=0.884 avg_d=0.370 std_dev=0.198
C6	B	0, 0.127, 0.332, 0.538, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.332 std_dev=0.206
C5	B	0, 0.124, 0.347, 0.570, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.347 std_dev=0.223
C5'	A	0, 0.096, 0.345, 0.594, 1.100 max_d=1.100 avg_d=0.345 std_dev=0.249
C4'	A	0, -0.007, 0.308, 0.624, 1.007 max_d=1.007 avg_d=0.308 std_dev=0.315
C5'	B	0, 0.123, 0.467, 0.811, 1.599 max_d=1.599 avg_d=0.467 std_dev=0.344
C4'	B	0, 0.137, 0.492, 0.847, 1.427 max_d=1.427 avg_d=0.492 std_dev=0.355
O2	B	0, 0.174, 0.563, 0.952, 1.613 max_d=1.613 avg_d=0.563 std_dev=0.389
O5'	A	0, 0.026, 0.496, 0.965, 1.938 max_d=1.938 avg_d=0.496 std_dev=0.470
O2'	B	0, 0.027, 0.548, 1.070, 2.141 max_d=2.141 avg_d=0.548 std_dev=0.521
O5'	B	0, 0.030, 0.566, 1.101, 1.899 max_d=1.899 avg_d=0.566 std_dev=0.535
O2'	A	0, -0.093, 0.450, 0.992, 1.479 max_d=1.479 avg_d=0.450 std_dev=0.543
P	B	0, -0.021, 0.569, 1.159, 2.051 max_d=2.051 avg_d=0.569 std_dev=0.590
C3'	B	0, 0.058, 0.649, 1.240, 1.852 max_d=1.852 avg_d=0.649 std_dev=0.591
OP1	A	0, 0.032, 0.666, 1.300, 2.652 max_d=2.652 avg_d=0.666 std_dev=0.634
C3'	A	0, -0.142, 0.499, 1.140, 1.858 max_d=1.858 avg_d=0.499 std_dev=0.641
P	A	0, 0.035, 0.723, 1.411, 2.305 max_d=2.305 avg_d=0.723 std_dev=0.688
OP1	B	0, -0.109, 0.805, 1.718, 2.669 max_d=2.669 avg_d=0.805 std_dev=0.913
O3'	B	0, -0.119, 1.030, 2.180, 3.223 max_d=3.223 avg_d=1.030 std_dev=1.149
O3'	A	0, -0.332, 0.947, 2.225, 3.565 max_d=3.565 avg_d=0.947 std_dev=1.279
OP2	B	0, -0.176, 1.108, 2.391, 3.992 max_d=3.992 avg_d=1.108 std_dev=1.283
OP2	A	0, -0.276, 1.280, 2.835, 4.743 max_d=4.743 avg_d=1.280 std_dev=1.556

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.30	0.00	0.15	0.55	0.11	0.20
C2	0.02	0.00	0.11	0.16	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.37	0.27	0.04	0.07	0.74	0.55	0.14
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.19	0.05	0.05	0.09	0.10	0.04	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.40	0.53	0.44	0.49
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.22	0.00	0.33	0.01	0.32	0.37	0.24	0.12	0.37	0.40	0.23	0.01	0.01	0.02	0.04	0.15	0.25	0.07
C4	0.01	0.00	0.06	0.22	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.31	0.13	0.03	0.08	0.73	0.53	0.13
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.06	0.00	0.11	0.00	0.10	0.15	0.06	0.02	0.12	0.15	0.08	0.30	0.02	0.00	0.01	0.11	0.21	0.04
C5	0.00	0.00	0.03	0.33	0.00	0.11	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.34	0.10	0.02	0.15	0.78	0.79	0.14
C5'	0.07	0.04	0.19	0.01	0.04	0.00	0.09	0.00	0.08	0.11	0.05	0.04	0.11	0.13	0.05	0.10	0.20	0.01	0.01	0.11	0.34	0.01
C6	0.01	0.01	0.05	0.32	0.00	0.10	0.00	0.08	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.38	0.09	0.03	0.15	0.80	0.86	0.15
C8	0.01	0.00	0.05	0.37	0.00	0.15	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.21	0.02	0.18	0.76	0.68	0.14
N1	0.01	0.00	0.09	0.24	0.00	0.06	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.39	0.14	0.04	0.10	0.78	0.73	0.14
N3	0.01	0.00	0.10	0.12	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.32	0.31	0.04	0.08	0.70	0.42	0.15
N6	0.01	0.01	0.04	0.37	0.01	0.12	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.39	0.16	0.03	0.19	0.82	1.02	0.19
N7	0.01	0.01	0.03	0.40	0.00	0.15	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.28	0.24	0.02	0.22	0.80	0.92	0.18
N9	0.00	0.00	0.01	0.23	0.00	0.08	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.06	0.01	0.08	0.68	0.40	0.14
O2'	0.01	0.37	0.00	0.01	0.31	0.30	0.34	0.10	0.38	0.21	0.39	0.32	0.39	0.28	0.20	0.00	0.04	0.21	0.28	0.38	0.47	0.39
O3'	0.30	0.27	0.02	0.01	0.13	0.02	0.10	0.20	0.09	0.21	0.14	0.31	0.16	0.24	0.06	0.04	0.00	0.22	0.22	0.51	0.22	0.24
O4'	0.00	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.04	0.03	0.02	0.01	0.21	0.22	0.00	0.04	0.42	0.10	0.10
O5'	0.15	0.07	0.40	0.04	0.08	0.01	0.15	0.01	0.15	0.18	0.10	0.08	0.19	0.22	0.08	0.28	0.22	0.04	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.55	0.74	0.53	0.15	0.73	0.11	0.78	0.11	0.80	0.76	0.78	0.70	0.82	0.80	0.68	0.38	0.51	0.42	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.55	0.44	0.25	0.53	0.21	0.79	0.34	0.86	0.68	0.73	0.42	1.02	0.92	0.40	0.47	0.22	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.20	0.14	0.49	0.07	0.13	0.04	0.14	0.01	0.15	0.14	0.14	0.15	0.19	0.18	0.14	0.39	0.24	0.10	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.18	0.11	0.66	0.12	0.39	0.24	0.29	0.21	0.09	0.16	0.14	0.28	0.44	0.98	0.15	0.09	0.54	0.48	0.32
C2	0.11	0.21	0.14	0.57	0.11	0.31	0.21	0.26	0.15	0.11	0.21	0.15	0.31	0.48	0.53	0.13	0.27	0.91	0.97	0.14
C2'	0.10	0.14	0.11	0.73	0.15	0.45	0.25	0.38	0.19	0.09	0.12	0.19	0.20	0.30	1.05	0.19	0.22	0.51	0.55	0.24
C3'	0.66	0.51	0.77	0.09	0.50	0.26	0.61	0.29	0.70	0.62	0.46	0.43	0.46	0.92	0.47	0.52	0.55	0.53	0.13	0.74
C4	0.10	0.21	0.13	0.61	0.10	0.34	0.25	0.26	0.20	0.09	0.19	0.14	0.33	0.50	0.67	0.14	0.15	0.81	0.72	0.22
C4'	0.33	0.18	0.43	0.25	0.27	0.07	0.41	0.16	0.45	0.31	0.18	0.25	0.12	0.64	0.85	0.22	0.48	0.40	0.28	0.74
C5	0.12	0.23	0.17	0.54	0.11	0.31	0.26	0.23	0.20	0.09	0.20	0.16	0.38	0.53	0.51	0.14	0.13	0.85	0.62	0.24
C5'	0.19	0.09	0.31	0.30	0.16	0.20	0.27	0.18	0.29	0.17	0.10	0.16	0.10	0.48	1.00	0.08	0.42	0.15	0.36	0.58
C6	0.13	0.23	0.20	0.49	0.12	0.28	0.24	0.22	0.17	0.10	0.21	0.19	0.38	0.50	0.37	0.14	0.17	0.92	0.74	0.19
C8	0.11	0.21	0.14	0.59	0.12	0.35	0.26	0.24	0.24	0.09	0.17	0.14	0.35	0.53	0.77	0.16	0.14	0.66	0.32	0.38
N1	0.13	0.22	0.18	0.51	0.11	0.28	0.21	0.23	0.15	0.11	0.21	0.17	0.34	0.48	0.40	0.13	0.23	0.94	0.90	0.14
N3	0.10	0.21	0.12	0.61	0.11	0.34	0.22	0.28	0.16	0.10	0.20	0.14	0.30	0.48	0.66	0.14	0.24	0.84	0.91	0.16
N6	0.16	0.24	0.24	0.41	0.16	0.25	0.23	0.20	0.17	0.12	0.21	0.23	0.40	0.48	0.26	0.15	0.16	0.92	0.67	0.20
N7	0.13	0.22	0.19	0.51	0.13	0.32	0.26	0.22	0.23	0.10	0.19	0.17	0.39	0.56	0.54	0.16	0.14	0.76	0.40	0.33
N9	0.09	0.20	0.11	0.64	0.11	0.37	0.25	0.27	0.22	0.08	0.17	0.13	0.32	0.49	0.82	0.15	0.09	0.69	0.52	0.31
O2'	0.44	0.60	0.26	0.88	0.55	0.66	0.45	0.55	0.43	0.51	0.61	0.53	0.63	0.11	1.12	0.53	0.50	0.35	0.91	0.11
O3'	0.99	0.65	1.08	0.53	0.48	0.86	0.64	1.00	0.85	0.83	0.51	0.34	0.64	1.15	0.08	1.01	1.18	1.08	0.82	1.48
O4'	0.10	0.14	0.16	0.53	0.13	0.29	0.28	0.19	0.27	0.10	0.14	0.14	0.25	0.49	1.01	0.07	0.22	0.46	0.13	0.53
O5'	0.07	0.09	0.20	0.48	0.10	0.45	0.14	0.42	0.14	0.08	0.10	0.11	0.14	0.47	1.10	0.22	0.15	0.27	0.15	0.22
OP1	0.42	0.71	0.43	0.37	0.64	0.31	0.49	0.15	0.43	0.54	0.74	0.67	0.80	0.37	1.01	0.34	0.41	0.19	0.54	0.48
OP2	0.41	0.55	0.56	0.19	0.53	0.58	0.46	0.86	0.42	0.46	0.58	0.55	0.59	0.95	0.67	0.33	0.43	0.95	0.54	0.54
P	0.30	0.31	0.20	0.66	0.23	0.78	0.20	0.71	0.23	0.28	0.28	0.21	0.36	0.17	1.38	0.56	0.18	0.57	0.19	0.15

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.32	0.00	0.09	0.73	0.10	0.21
C2	0.01	0.00	0.15	0.17	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.14	0.25	0.09	0.13	0.96	0.48	0.15
C2'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.03	0.01	0.10	0.18	0.13	0.02	0.12	0.03	0.27	0.00	0.03	0.02	0.42	0.74	0.25	0.51
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.30	0.01	0.32	0.02	0.27	0.18	0.24	0.32	0.10	0.01	0.01	0.02	0.09	0.14	0.09	0.09
C4	0.01	0.01	0.03	0.30	0.00	0.11	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.34	0.04	0.02	0.29	1.06	0.85	0.15
C4'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.11	0.00	0.17	0.01	0.17	0.07	0.05	0.12	0.07	0.25	0.02	0.00	0.01	0.14	0.17	0.04
C5	0.01	0.01	0.10	0.32	0.00	0.17	0.00	0.18	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.39	0.10	0.07	0.33	1.05	0.88	0.16
C5'	0.05	0.04	0.18	0.02	0.13	0.01	0.18	0.00	0.15	0.05	0.07	0.15	0.08	0.07	0.21	0.01	0.01	0.13	0.35	0.01
C6	0.01	0.00	0.13	0.27	0.01	0.17	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.34	0.07	0.10	0.26	0.99	0.63	0.13
N1	0.00	0.01	0.02	0.18	0.01	0.07	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.20	0.15	0.01	0.12	0.91	0.41	0.15
N3	0.01	0.00	0.12	0.24	0.00	0.05	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.24	0.16	0.07	0.21	1.03	0.68	0.14
N4	0.01	0.01	0.03	0.32	0.00	0.12	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.37	0.05	0.03	0.33	1.07	0.99	0.18
O2	0.02	0.00	0.27	0.10	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.11	0.41	0.15	0.07	0.90	0.34	0.17
O2'	0.01	0.14	0.00	0.01	0.34	0.25	0.39	0.07	0.34	0.20	0.24	0.37	0.11	0.00	0.03	0.17	0.32	0.60	0.23	0.43
O3'	0.32	0.25	0.03	0.01	0.04	0.02	0.10	0.21	0.07	0.15	0.16	0.05	0.41	0.03	0.00	0.21	0.18	0.38	0.20	0.24
O4'	0.00	0.09	0.02	0.02	0.02	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.07	0.03	0.15	0.17	0.21	0.00	0.09	0.54	0.10	0.10
O5'	0.09	0.13	0.42	0.09	0.29	0.01	0.33	0.01	0.26	0.12	0.21	0.33	0.07	0.32	0.18	0.09	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.73	0.96	0.74	0.14	1.06	0.14	1.05	0.13	0.99	0.91	1.03	1.07	0.90	0.60	0.38	0.54	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.48	0.25	0.09	0.85	0.17	0.88	0.35	0.63	0.41	0.68	0.99	0.34	0.23	0.20	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.21	0.15	0.51	0.09	0.15	0.04	0.16	0.01	0.13	0.15	0.14	0.18	0.17	0.43	0.24	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00