Doublet Group distance statistics: 53948

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 13, 8, 1, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.004, 0.009, 0.014, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.007, 0.016, 0.025, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.010, 0.021, 0.031, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.021 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.011, 0.022, 0.033, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.022 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.004, 0.016, 0.028, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.016 std_dev=0.012
C4	A	0, 0.009, 0.024, 0.039, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.024 std_dev=0.015
N9	A	0, 0.008, 0.023, 0.039, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.023 std_dev=0.016
N6	A	0, 0.009, 0.031, 0.052, 0.095 max_d=0.095 avg_d=0.031 std_dev=0.022
N7	A	0, 0.006, 0.031, 0.056, 0.104 max_d=0.104 avg_d=0.031 std_dev=0.025
C8	A	0, 0.007, 0.036, 0.065, 0.131 max_d=0.131 avg_d=0.036 std_dev=0.029
C5	B	0, 0.217, 0.314, 0.411, 0.509 max_d=0.509 avg_d=0.314 std_dev=0.097
N3	B	0, 0.224, 0.322, 0.419, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.322 std_dev=0.097
C4	B	0, 0.221, 0.319, 0.418, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.319 std_dev=0.098
C6	B	0, 0.196, 0.295, 0.394, 0.516 max_d=0.516 avg_d=0.295 std_dev=0.099
N4	B	0, 0.251, 0.360, 0.469, 0.568 max_d=0.568 avg_d=0.360 std_dev=0.109
N1	B	0, 0.166, 0.278, 0.389, 0.550 max_d=0.550 avg_d=0.278 std_dev=0.111
C2	B	0, 0.179, 0.295, 0.411, 0.551 max_d=0.551 avg_d=0.295 std_dev=0.116
C2'	B	0, 0.130, 0.246, 0.362, 0.597 max_d=0.597 avg_d=0.246 std_dev=0.116
C1'	B	0, 0.127, 0.272, 0.416, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.272 std_dev=0.144
O4'	A	0, 0.001, 0.152, 0.303, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.152 std_dev=0.151
C2'	A	0, 0.035, 0.187, 0.338, 0.889 max_d=0.889 avg_d=0.187 std_dev=0.151
O2	B	0, 0.148, 0.312, 0.476, 0.812 max_d=0.812 avg_d=0.312 std_dev=0.164
C4'	A	0, -0.036, 0.163, 0.362, 1.103 max_d=1.103 avg_d=0.163 std_dev=0.199
C3'	A	0, -0.037, 0.172, 0.381, 1.171 max_d=1.171 avg_d=0.172 std_dev=0.209
O2'	A	0, 0.145, 0.361, 0.577, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.361 std_dev=0.216
O2'	B	0, 0.094, 0.355, 0.617, 1.512 max_d=1.512 avg_d=0.355 std_dev=0.262
C5'	A	0, 0.010, 0.276, 0.541, 1.508 max_d=1.508 avg_d=0.276 std_dev=0.266
O3'	A	0, -0.127, 0.172, 0.471, 1.617 max_d=1.617 avg_d=0.172 std_dev=0.299
O5'	A	0, -0.051, 0.285, 0.621, 1.864 max_d=1.864 avg_d=0.285 std_dev=0.336
C3'	B	0, -0.038, 0.308, 0.654, 1.934 max_d=1.934 avg_d=0.308 std_dev=0.346
O4'	B	0, -0.004, 0.344, 0.691, 1.941 max_d=1.941 avg_d=0.344 std_dev=0.347
O3'	B	0, -0.015, 0.388, 0.790, 2.280 max_d=2.280 avg_d=0.388 std_dev=0.402
OP2	A	0, -0.001, 0.402, 0.805, 2.221 max_d=2.221 avg_d=0.402 std_dev=0.403
P	A	0, -0.139, 0.333, 0.805, 2.539 max_d=2.539 avg_d=0.333 std_dev=0.472
C4'	B	0, -0.115, 0.374, 0.862, 2.691 max_d=2.691 avg_d=0.374 std_dev=0.488
O5'	B	0, -0.025, 0.501, 1.027, 2.940 max_d=2.940 avg_d=0.501 std_dev=0.526
OP1	A	0, -0.125, 0.466, 1.056, 3.219 max_d=3.219 avg_d=0.466 std_dev=0.591
P	B	0, -0.059, 0.575, 1.209, 3.521 max_d=3.521 avg_d=0.575 std_dev=0.634
OP1	B	0, 0.004, 0.651, 1.297, 3.509 max_d=3.509 avg_d=0.651 std_dev=0.647
C5'	B	0, -0.338, 0.451, 1.240, 4.265 max_d=4.265 avg_d=0.451 std_dev=0.789
OP2	B	0, -0.194, 0.660, 1.514, 4.751 max_d=4.751 avg_d=0.660 std_dev=0.854

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.11	0.00	0.16	0.13	0.20	0.16
C2	0.02	0.00	0.08	0.03	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.15	0.15	0.13	0.28	0.29	0.33	0.32
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.11	0.05	0.04	0.07	0.08	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.20	0.19	0.29	0.23
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.06	0.02	0.03	0.03	0.06	0.03	0.02	0.00	0.01	0.04	0.07	0.05	0.04
C4	0.01	0.00	0.05	0.02	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.11	0.07	0.26	0.26	0.31	0.30
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.07	0.04	0.09	0.08	0.07	0.04	0.03	0.06	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.03	0.00	0.05	0.00	0.17	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.04	0.28	0.32	0.36	0.35
C5'	0.06	0.18	0.11	0.01	0.15	0.00	0.17	0.00	0.19	0.11	0.20	0.16	0.21	0.14	0.11	0.05	0.08	0.01	0.01	0.04	0.02	0.02
C6	0.01	0.00	0.05	0.03	0.01	0.07	0.01	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.10	0.07	0.31	0.36	0.38	0.38
C8	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.13	0.04	0.07	0.23	0.26	0.32	0.29
N1	0.02	0.00	0.07	0.02	0.01	0.09	0.00	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.11	0.12	0.11	0.30	0.34	0.36	0.36
N3	0.02	0.00	0.08	0.03	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.14	0.15	0.12	0.25	0.24	0.30	0.28
N6	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.07	0.01	0.21	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.08	0.07	0.32	0.40	0.41	0.42
N7	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.14	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.04	0.03	0.26	0.32	0.37	0.35
N9	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.08	0.01	0.23	0.22	0.28	0.25
O2'	0.02	0.15	0.00	0.02	0.06	0.06	0.04	0.05	0.06	0.13	0.11	0.14	0.06	0.10	0.04	0.00	0.06	0.03	0.19	0.18	0.37	0.24
O3'	0.11	0.15	0.01	0.00	0.11	0.01	0.08	0.08	0.10	0.04	0.12	0.15	0.08	0.04	0.08	0.06	0.00	0.11	0.13	0.22	0.11	0.15
O4'	0.00	0.13	0.01	0.01	0.07	0.00	0.04	0.01	0.07	0.07	0.11	0.12	0.07	0.03	0.01	0.03	0.11	0.00	0.06	0.05	0.06	0.05
O5'	0.16	0.28	0.20	0.04	0.26	0.01	0.28	0.01	0.31	0.23	0.30	0.25	0.32	0.26	0.23	0.19	0.13	0.06	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.13	0.29	0.19	0.07	0.26	0.04	0.32	0.04	0.36	0.26	0.34	0.24	0.40	0.32	0.22	0.18	0.22	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.33	0.29	0.05	0.31	0.03	0.36	0.02	0.38	0.32	0.36	0.30	0.41	0.37	0.28	0.37	0.11	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.16	0.32	0.23	0.04	0.30	0.01	0.35	0.02	0.38	0.29	0.36	0.28	0.42	0.35	0.25	0.24	0.15	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.06	0.06	0.06	0.31	0.04	0.26	0.05	0.46	0.05	0.05	0.05	0.09	0.08	0.25	0.32	0.11	0.13	0.19	0.29	0.15
C2	0.14	0.13	0.10	0.25	0.11	0.10	0.11	0.21	0.12	0.13	0.11	0.13	0.15	0.23	0.23	0.12	0.09	0.28	0.13	0.10
C2'	0.08	0.12	0.07	0.29	0.13	0.26	0.07	0.47	0.07	0.09	0.14	0.17	0.14	0.24	0.31	0.11	0.15	0.19	0.32	0.17
C3'	0.13	0.15	0.15	0.19	0.17	0.19	0.17	0.39	0.15	0.15	0.16	0.18	0.15	0.32	0.24	0.07	0.07	0.30	0.26	0.10
C4	0.08	0.07	0.07	0.29	0.07	0.19	0.08	0.34	0.09	0.08	0.07	0.12	0.09	0.24	0.28	0.07	0.07	0.22	0.14	0.07
C4'	0.07	0.07	0.06	0.30	0.09	0.29	0.11	0.50	0.10	0.08	0.08	0.11	0.08	0.26	0.36	0.11	0.14	0.20	0.33	0.15
C5	0.09	0.07	0.08	0.29	0.09	0.18	0.10	0.32	0.11	0.09	0.08	0.12	0.09	0.25	0.27	0.08	0.07	0.20	0.12	0.07
C5'	0.11	0.08	0.09	0.43	0.05	0.45	0.06	0.68	0.07	0.08	0.06	0.09	0.11	0.16	0.51	0.25	0.29	0.10	0.50	0.29
C6	0.15	0.12	0.11	0.25	0.12	0.12	0.13	0.21	0.15	0.14	0.12	0.13	0.13	0.25	0.23	0.12	0.09	0.24	0.12	0.09
C8	0.06	0.08	0.07	0.34	0.09	0.31	0.07	0.49	0.06	0.05	0.09	0.13	0.09	0.25	0.33	0.16	0.16	0.14	0.31	0.18
N1	0.16	0.14	0.11	0.23	0.12	0.09	0.13	0.17	0.15	0.15	0.13	0.14	0.16	0.23	0.21	0.14	0.11	0.28	0.16	0.12
N3	0.11	0.10	0.08	0.27	0.09	0.14	0.09	0.28	0.10	0.10	0.09	0.12	0.12	0.24	0.26	0.08	0.06	0.26	0.11	0.07
N6	0.18	0.15	0.14	0.23	0.13	0.12	0.15	0.17	0.17	0.17	0.14	0.13	0.16	0.26	0.20	0.15	0.13	0.24	0.15	0.13
N7	0.06	0.08	0.07	0.34	0.09	0.27	0.09	0.42	0.09	0.06	0.10	0.12	0.10	0.26	0.32	0.13	0.12	0.15	0.22	0.13
N9	0.06	0.05	0.06	0.32	0.06	0.25	0.05	0.43	0.06	0.05	0.06	0.12	0.08	0.25	0.31	0.11	0.12	0.18	0.25	0.13
O2'	0.14	0.08	0.13	0.39	0.08	0.37	0.17	0.56	0.18	0.12	0.09	0.10	0.10	0.13	0.39	0.23	0.27	0.13	0.42	0.29
O3'	0.10	0.11	0.10	0.21	0.11	0.19	0.13	0.36	0.12	0.11	0.11	0.13	0.11	0.26	0.25	0.08	0.07	0.37	0.22	0.11
O4'	0.07	0.06	0.07	0.28	0.05	0.25	0.08	0.45	0.09	0.07	0.05	0.09	0.08	0.29	0.32	0.10	0.11	0.23	0.28	0.13
O5'	0.21	0.19	0.17	0.52	0.12	0.55	0.11	0.78	0.14	0.18	0.16	0.12	0.22	0.06	0.60	0.36	0.37	0.11	0.60	0.36
OP1	0.33	0.24	0.28	0.66	0.14	0.74	0.15	0.99	0.22	0.26	0.18	0.12	0.28	0.14	0.79	0.51	0.60	0.30	0.82	0.58
OP2	0.42	0.37	0.31	0.67	0.28	0.79	0.27	1.04	0.33	0.38	0.32	0.24	0.39	0.18	0.75	0.61	0.65	0.35	0.93	0.65
P	0.36	0.30	0.30	0.67	0.20	0.75	0.20	0.99	0.25	0.31	0.25	0.17	0.33	0.14	0.78	0.54	0.58	0.28	0.82	0.57

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.09	0.19	0.20	0.09
C2	0.02	0.00	0.12	0.15	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.10	0.06	0.13	0.32	0.28	0.17
C2'	0.00	0.12	0.00	0.00	0.03	0.01	0.07	0.01	0.10	0.02	0.10	0.04	0.20	0.00	0.02	0.01	0.18	0.29	0.20	0.17
C3'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.17	0.00	0.13	0.02	0.10	0.10	0.18	0.19	0.15	0.02	0.01	0.01	0.17	0.22	0.11	0.13
C4	0.01	0.01	0.03	0.17	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.09	0.15	0.01	0.12	0.38	0.20	0.16
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.09	0.00	0.13	0.00	0.12	0.05	0.04	0.10	0.06	0.09	0.01	0.00	0.01	0.03	0.10	0.03
C5	0.01	0.01	0.07	0.13	0.00	0.13	0.00	0.24	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.15	0.12	0.05	0.10	0.34	0.17	0.13
C5'	0.02	0.05	0.01	0.02	0.17	0.00	0.24	0.00	0.22	0.10	0.10	0.20	0.05	0.08	0.04	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01
C6	0.01	0.01	0.10	0.10	0.00	0.12	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.15	0.08	0.08	0.09	0.28	0.15	0.10
N1	0.01	0.01	0.02	0.10	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.10	0.27	0.19	0.11
N3	0.01	0.00	0.10	0.18	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.14	0.05	0.14	0.37	0.27	0.19
N4	0.01	0.01	0.04	0.19	0.00	0.10	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.18	0.02	0.13	0.42	0.20	0.18
O2	0.03	0.00	0.20	0.15	0.01	0.06	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.15	0.10	0.11	0.15	0.31	0.35	0.19
O2'	0.01	0.06	0.00	0.02	0.09	0.09	0.15	0.08	0.15	0.06	0.05	0.10	0.15	0.00	0.06	0.08	0.05	0.13	0.14	0.06
O3'	0.05	0.10	0.02	0.01	0.15	0.01	0.12	0.04	0.08	0.05	0.14	0.18	0.10	0.06	0.00	0.02	0.08	0.09	0.06	0.06
O4'	0.00	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.02	0.08	0.01	0.05	0.02	0.11	0.08	0.02	0.00	0.05	0.10	0.19	0.06
O5'	0.09	0.13	0.18	0.17	0.12	0.01	0.10	0.01	0.09	0.10	0.14	0.13	0.15	0.05	0.08	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.19	0.32	0.29	0.22	0.38	0.03	0.34	0.04	0.28	0.27	0.37	0.42	0.31	0.13	0.09	0.10	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.28	0.20	0.11	0.20	0.10	0.17	0.04	0.15	0.19	0.27	0.20	0.35	0.14	0.06	0.19	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.09	0.17	0.17	0.13	0.16	0.03	0.13	0.01	0.10	0.11	0.19	0.18	0.19	0.06	0.06	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00