Doublet Group distance statistics: 53949

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 1, 2, 2, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C2	A	0, 0.005, 0.015, 0.025, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.015 std_dev=0.010
C6	A	0, 0.012, 0.027, 0.043, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.027 std_dev=0.016
C1'	A	0, 0.014, 0.033, 0.053, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.033 std_dev=0.020
C5	A	0, 0.016, 0.042, 0.068, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.042 std_dev=0.026
N3	A	0, 0.020, 0.047, 0.074, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.047 std_dev=0.027
N1	A	0, 0.022, 0.051, 0.079, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.051 std_dev=0.028
C4	A	0, 0.027, 0.066, 0.106, 0.122 max_d=0.122 avg_d=0.066 std_dev=0.039
N9	A	0, 0.028, 0.071, 0.113, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.071 std_dev=0.043
N6	A	0, 0.031, 0.080, 0.130, 0.150 max_d=0.150 avg_d=0.080 std_dev=0.049
N7	A	0, 0.032, 0.083, 0.134, 0.152 max_d=0.152 avg_d=0.083 std_dev=0.051
C8	A	0, 0.043, 0.112, 0.182, 0.211 max_d=0.211 avg_d=0.112 std_dev=0.069
C2'	A	0, 0.174, 0.365, 0.556, 0.697 max_d=0.697 avg_d=0.365 std_dev=0.191
C2	B	0, 0.242, 0.445, 0.648, 0.689 max_d=0.689 avg_d=0.445 std_dev=0.203
N1	B	0, 0.207, 0.444, 0.682, 0.721 max_d=0.721 avg_d=0.444 std_dev=0.237
C6	B	0, 0.302, 0.543, 0.785, 0.850 max_d=0.850 avg_d=0.543 std_dev=0.242
O4'	A	0, 0.068, 0.320, 0.572, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.320 std_dev=0.252
O2	B	0, 0.357, 0.665, 0.972, 1.131 max_d=1.131 avg_d=0.665 std_dev=0.307
C1'	B	0, 0.419, 0.733, 1.047, 1.170 max_d=1.170 avg_d=0.733 std_dev=0.314
C5	B	0, 0.232, 0.579, 0.926, 1.240 max_d=1.240 avg_d=0.579 std_dev=0.347
C4'	A	0, 0.209, 0.562, 0.915, 1.169 max_d=1.169 avg_d=0.562 std_dev=0.353
N3	B	0, 0.043, 0.401, 0.759, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.401 std_dev=0.358
C2'	B	0, 0.530, 0.929, 1.329, 1.301 max_d=1.301 avg_d=0.929 std_dev=0.400
O4'	B	0, 0.506, 0.921, 1.337, 1.562 max_d=1.562 avg_d=0.921 std_dev=0.416
C3'	A	0, 0.420, 0.844, 1.267, 1.520 max_d=1.520 avg_d=0.844 std_dev=0.423
C4	B	0, 0.035, 0.461, 0.888, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.461 std_dev=0.426
O5'	B	0, 0.563, 1.017, 1.470, 1.615 max_d=1.615 avg_d=1.017 std_dev=0.454
C3'	B	0, 0.583, 1.043, 1.504, 1.451 max_d=1.451 avg_d=1.043 std_dev=0.460
O2'	A	0, 0.618, 1.102, 1.586, 1.587 max_d=1.587 avg_d=1.102 std_dev=0.484
C4'	B	0, 0.607, 1.112, 1.616, 1.756 max_d=1.756 avg_d=1.112 std_dev=0.504
OP2	B	0, 0.588, 1.125, 1.662, 1.997 max_d=1.997 avg_d=1.125 std_dev=0.537
C5'	B	0, 0.640, 1.208, 1.776, 1.932 max_d=1.932 avg_d=1.208 std_dev=0.568
O2'	B	0, 0.646, 1.217, 1.788, 1.932 max_d=1.932 avg_d=1.217 std_dev=0.571
O5'	A	0, 0.582, 1.191, 1.800, 1.978 max_d=1.978 avg_d=1.191 std_dev=0.609
N4	B	0, 0.070, 0.686, 1.303, 2.089 max_d=2.089 avg_d=0.686 std_dev=0.617
O3'	B	0, 0.698, 1.315, 1.932, 1.827 max_d=1.827 avg_d=1.315 std_dev=0.617
P	B	0, 0.612, 1.232, 1.853, 2.242 max_d=2.242 avg_d=1.232 std_dev=0.620
C5'	A	0, 0.407, 1.046, 1.684, 2.224 max_d=2.224 avg_d=1.046 std_dev=0.639
P	A	0, 0.736, 1.416, 2.096, 2.359 max_d=2.359 avg_d=1.416 std_dev=0.680
OP1	B	0, 0.757, 1.552, 2.346, 2.846 max_d=2.846 avg_d=1.552 std_dev=0.795
OP1	A	0, 0.689, 1.494, 2.299, 2.991 max_d=2.991 avg_d=1.494 std_dev=0.805
O3'	A	0, 0.944, 1.764, 2.584, 2.600 max_d=2.600 avg_d=1.764 std_dev=0.820
OP2	A	0, 0.803, 1.715, 2.628, 3.319 max_d=3.319 avg_d=1.715 std_dev=0.912

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.26	0.00	0.14	0.30	0.11	0.09
C2	0.03	0.00	0.17	0.13	0.00	0.04	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.31	0.41	0.09	0.23	0.42	0.22	0.21
C2'	0.00	0.17	0.00	0.01	0.08	0.02	0.06	0.15	0.09	0.12	0.13	0.17	0.08	0.09	0.04	0.00	0.07	0.02	0.30	0.27	0.30	0.27
C3'	0.02	0.13	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.01	0.07	0.14	0.10	0.12	0.07	0.12	0.06	0.03	0.01	0.01	0.12	0.25	0.15	0.13
C4	0.02	0.00	0.08	0.06	0.00	0.04	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.21	0.28	0.06	0.25	0.40	0.22	0.21
C4'	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.06	0.12	0.04	0.04	0.08	0.12	0.05	0.12	0.04	0.01	0.01	0.27	0.08	0.07
C5	0.01	0.00	0.06	0.07	0.00	0.07	0.00	0.22	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.24	0.21	0.05	0.32	0.51	0.30	0.29
C5'	0.07	0.12	0.15	0.01	0.15	0.00	0.22	0.00	0.22	0.26	0.17	0.10	0.25	0.28	0.16	0.07	0.15	0.02	0.01	0.13	0.11	0.01
C6	0.02	0.00	0.09	0.07	0.01	0.06	0.00	0.22	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.28	0.26	0.06	0.32	0.55	0.32	0.31
C8	0.01	0.00	0.12	0.14	0.00	0.12	0.00	0.26	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.11	0.05	0.34	0.45	0.28	0.26
N1	0.02	0.00	0.13	0.10	0.01	0.04	0.00	0.17	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.30	0.35	0.08	0.28	0.50	0.28	0.27
N3	0.03	0.00	0.17	0.12	0.00	0.04	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.29	0.41	0.08	0.20	0.37	0.18	0.17
N6	0.01	0.01	0.08	0.07	0.01	0.08	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.29	0.22	0.06	0.35	0.62	0.37	0.37
N7	0.01	0.00	0.09	0.12	0.00	0.12	0.00	0.28	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.23	0.11	0.05	0.37	0.56	0.34	0.34
N9	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.05	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.13	0.20	0.02	0.24	0.36	0.19	0.17
O2'	0.02	0.31	0.00	0.03	0.21	0.12	0.24	0.07	0.28	0.20	0.30	0.29	0.29	0.23	0.13	0.00	0.10	0.08	0.28	0.27	0.29	0.29
O3'	0.26	0.41	0.07	0.01	0.28	0.04	0.21	0.15	0.26	0.11	0.35	0.41	0.22	0.11	0.20	0.10	0.00	0.19	0.22	0.27	0.21	0.20
O4'	0.00	0.09	0.02	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.06	0.05	0.08	0.08	0.06	0.05	0.02	0.08	0.19	0.00	0.08	0.40	0.10	0.19
O5'	0.14	0.23	0.30	0.12	0.25	0.01	0.32	0.01	0.32	0.34	0.28	0.20	0.35	0.37	0.24	0.28	0.22	0.08	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.30	0.42	0.27	0.25	0.40	0.27	0.51	0.13	0.55	0.45	0.50	0.37	0.62	0.56	0.36	0.27	0.27	0.40	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.11	0.22	0.30	0.15	0.22	0.08	0.30	0.11	0.32	0.28	0.28	0.18	0.37	0.34	0.19	0.29	0.21	0.10	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.09	0.21	0.27	0.13	0.21	0.07	0.29	0.01	0.31	0.26	0.27	0.17	0.37	0.34	0.17	0.29	0.20	0.19	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.19	0.22	0.24	0.17	0.33	0.17	0.29	0.16	0.19	0.17	0.29	0.42	0.21	0.28	0.09	0.21	0.17	0.36	0.28	0.25
C2	0.12	0.22	0.18	0.12	0.21	0.13	0.10	0.17	0.11	0.09	0.30	0.32	0.29	0.26	0.12	0.16	0.23	0.38	0.48	0.36
C2'	0.24	0.26	0.25	0.27	0.36	0.29	0.34	0.34	0.29	0.25	0.32	0.43	0.23	0.25	0.32	0.27	0.34	0.50	0.34	0.38
C3'	0.23	0.32	0.22	0.16	0.43	0.16	0.40	0.17	0.32	0.28	0.38	0.48	0.29	0.20	0.17	0.23	0.24	0.46	0.33	0.32
C4	0.14	0.21	0.20	0.13	0.25	0.13	0.12	0.14	0.08	0.11	0.28	0.33	0.25	0.27	0.11	0.17	0.19	0.34	0.39	0.29
C4'	0.20	0.19	0.21	0.19	0.31	0.23	0.28	0.26	0.20	0.17	0.26	0.38	0.17	0.23	0.07	0.27	0.25	0.38	0.32	0.30
C5	0.14	0.18	0.20	0.16	0.15	0.14	0.13	0.15	0.12	0.10	0.21	0.21	0.25	0.28	0.18	0.16	0.21	0.32	0.40	0.29
C5'	0.11	0.15	0.12	0.13	0.28	0.24	0.25	0.35	0.15	0.10	0.23	0.35	0.12	0.15	0.04	0.24	0.33	0.45	0.43	0.40
C6	0.13	0.17	0.21	0.17	0.10	0.15	0.22	0.16	0.18	0.09	0.17	0.19	0.28	0.29	0.20	0.15	0.23	0.33	0.45	0.33
C8	0.20	0.20	0.24	0.16	0.21	0.16	0.17	0.15	0.13	0.16	0.22	0.24	0.21	0.30	0.15	0.20	0.18	0.31	0.29	0.24
N1	0.12	0.20	0.19	0.15	0.11	0.14	0.18	0.17	0.16	0.09	0.23	0.20	0.30	0.28	0.17	0.16	0.24	0.36	0.49	0.36
N3	0.13	0.23	0.19	0.12	0.28	0.13	0.12	0.16	0.07	0.10	0.31	0.40	0.27	0.26	0.09	0.17	0.20	0.37	0.43	0.32
N6	0.14	0.12	0.23	0.20	0.25	0.16	0.33	0.16	0.24	0.12	0.06	0.34	0.28	0.32	0.25	0.15	0.23	0.31	0.45	0.33
N7	0.17	0.18	0.22	0.18	0.15	0.16	0.14	0.15	0.13	0.14	0.18	0.18	0.22	0.30	0.21	0.18	0.20	0.29	0.34	0.26
N9	0.18	0.21	0.23	0.14	0.28	0.15	0.20	0.13	0.13	0.15	0.27	0.34	0.22	0.28	0.09	0.19	0.16	0.33	0.31	0.24
O2'	0.48	0.46	0.40	0.45	0.52	0.53	0.58	0.63	0.57	0.50	0.47	0.52	0.42	0.38	0.43	0.53	0.66	0.81	0.81	0.77
O3'	0.29	0.32	0.27	0.26	0.44	0.31	0.44	0.38	0.37	0.31	0.38	0.51	0.28	0.26	0.27	0.32	0.40	0.75	0.44	0.53
O4'	0.31	0.20	0.36	0.34	0.26	0.35	0.22	0.30	0.18	0.21	0.22	0.34	0.21	0.40	0.26	0.37	0.23	0.30	0.19	0.21
O5'	0.10	0.18	0.12	0.12	0.30	0.23	0.27	0.31	0.18	0.12	0.25	0.35	0.15	0.15	0.01	0.20	0.25	0.39	0.26	0.29
OP1	0.35	0.51	0.37	0.16	0.58	0.10	0.55	0.05	0.49	0.47	0.57	0.61	0.48	0.37	0.02	0.21	0.15	0.25	0.15	0.14
OP2	0.07	0.12	0.09	0.08	0.23	0.25	0.23	0.41	0.17	0.09	0.19	0.28	0.10	0.15	0.02	0.19	0.30	0.50	0.37	0.40
P	0.08	0.22	0.14	0.01	0.32	0.10	0.32	0.19	0.27	0.20	0.28	0.36	0.17	0.17	0.01	0.05	0.10	0.28	0.16	0.17

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.00	0.11	0.09	0.20	0.15
C2	0.02	0.00	0.05	0.08	0.01	0.05	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.15	0.05	0.05	0.29	0.30	0.50	0.37
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.04	0.02	0.05	0.04	0.05	0.02	0.05	0.05	0.08	0.00	0.02	0.01	0.10	0.11	0.13	0.11
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.16	0.00	0.19	0.04	0.18	0.10	0.11	0.17	0.05	0.01	0.00	0.01	0.11	0.13	0.12	0.11
C4	0.01	0.01	0.04	0.16	0.00	0.13	0.00	0.30	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.12	0.14	0.05	0.44	0.55	0.75	0.58
C4'	0.01	0.05	0.02	0.00	0.13	0.00	0.17	0.01	0.15	0.07	0.08	0.14	0.03	0.09	0.01	0.00	0.03	0.04	0.05	0.04
C5	0.01	0.01	0.05	0.19	0.00	0.17	0.00	0.34	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.20	0.04	0.46	0.58	0.75	0.60
C5'	0.05	0.16	0.04	0.04	0.30	0.01	0.34	0.00	0.29	0.17	0.22	0.33	0.09	0.09	0.04	0.03	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.18	0.01	0.15	0.00	0.29	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.18	0.04	0.40	0.45	0.56	0.47
N1	0.01	0.01	0.02	0.10	0.01	0.07	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.06	0.06	0.03	0.27	0.28	0.42	0.33
N3	0.02	0.00	0.05	0.11	0.00	0.08	0.01	0.22	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.08	0.05	0.37	0.43	0.65	0.48
N4	0.02	0.01	0.05	0.17	0.00	0.14	0.01	0.33	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.13	0.16	0.05	0.48	0.63	0.85	0.65
O2	0.02	0.00	0.08	0.05	0.01	0.03	0.01	0.09	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.20	0.11	0.06	0.22	0.20	0.42	0.28
O2'	0.03	0.15	0.00	0.01	0.12	0.09	0.06	0.09	0.03	0.06	0.16	0.13	0.20	0.00	0.06	0.10	0.13	0.11	0.14	0.13
O3'	0.03	0.05	0.02	0.00	0.14	0.01	0.20	0.04	0.18	0.06	0.08	0.16	0.11	0.06	0.00	0.02	0.13	0.19	0.15	0.14
O4'	0.00	0.05	0.01	0.01	0.05	0.00	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.05	0.06	0.10	0.02	0.00	0.05	0.08	0.13	0.11
O5'	0.11	0.29	0.10	0.11	0.44	0.03	0.46	0.01	0.40	0.27	0.37	0.48	0.22	0.13	0.13	0.05	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.09	0.30	0.11	0.13	0.55	0.04	0.58	0.06	0.45	0.28	0.43	0.63	0.20	0.11	0.19	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.20	0.50	0.13	0.12	0.75	0.05	0.75	0.02	0.56	0.42	0.65	0.85	0.42	0.14	0.15	0.13	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.15	0.37	0.11	0.11	0.58	0.04	0.60	0.02	0.47	0.33	0.48	0.65	0.28	0.13	0.14	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00