Doublet Group distance statistics: 53951

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 1, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C4	A	0, 0.006, 0.018, 0.030, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N1	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.023 std_dev=0.013
C5	A	0, 0.006, 0.020, 0.033, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.020 std_dev=0.014
C2	A	0, 0.007, 0.022, 0.038, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.016
C6	A	0, 0.010, 0.026, 0.042, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.026 std_dev=0.016
C8	A	0, 0.011, 0.028, 0.045, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.028 std_dev=0.017
C1'	A	0, 0.007, 0.024, 0.041, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.024 std_dev=0.017
N3	A	0, 0.012, 0.032, 0.052, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.032 std_dev=0.020
N9	A	0, 0.007, 0.028, 0.048, 0.049 max_d=0.049 avg_d=0.028 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.012, 0.033, 0.054, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.033 std_dev=0.021
N6	A	0, 0.025, 0.061, 0.096, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.061 std_dev=0.036
O2'	A	0, 0.114, 0.288, 0.462, 0.450 max_d=0.450 avg_d=0.288 std_dev=0.174
C2'	A	0, 0.071, 0.281, 0.492, 0.590 max_d=0.590 avg_d=0.281 std_dev=0.211
N1	B	0, 0.087, 0.308, 0.529, 0.522 max_d=0.522 avg_d=0.308 std_dev=0.221
C1'	B	0, 0.127, 0.350, 0.573, 0.620 max_d=0.620 avg_d=0.350 std_dev=0.223
O4'	A	0, 0.023, 0.265, 0.507, 0.630 max_d=0.630 avg_d=0.265 std_dev=0.242
C6	B	0, 0.153, 0.411, 0.668, 0.705 max_d=0.705 avg_d=0.411 std_dev=0.258
C2	B	0, 0.121, 0.382, 0.644, 0.717 max_d=0.717 avg_d=0.382 std_dev=0.261
C4	B	0, 0.114, 0.420, 0.727, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.420 std_dev=0.307
N3	B	0, 0.071, 0.379, 0.687, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.379 std_dev=0.308
C5	B	0, 0.159, 0.485, 0.811, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.485 std_dev=0.326
O2	B	0, 0.191, 0.532, 0.873, 0.943 max_d=0.943 avg_d=0.532 std_dev=0.341
N4	B	0, 0.129, 0.500, 0.872, 1.036 max_d=1.036 avg_d=0.500 std_dev=0.372
C3'	A	0, 0.148, 0.521, 0.894, 1.054 max_d=1.054 avg_d=0.521 std_dev=0.373
C4'	A	0, 0.154, 0.530, 0.905, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.530 std_dev=0.376
O4'	B	0, 0.091, 0.484, 0.876, 1.093 max_d=1.093 avg_d=0.484 std_dev=0.393
C4'	B	0, 0.293, 0.695, 1.097, 0.950 max_d=0.950 avg_d=0.695 std_dev=0.402
O3'	A	0, 0.198, 0.702, 1.206, 1.423 max_d=1.423 avg_d=0.702 std_dev=0.504
C2'	B	0, 0.342, 0.893, 1.445, 1.426 max_d=1.426 avg_d=0.893 std_dev=0.551
C5'	A	0, 0.265, 0.881, 1.496, 1.740 max_d=1.740 avg_d=0.881 std_dev=0.615
C3'	B	0, 0.513, 1.320, 2.127, 2.073 max_d=2.073 avg_d=1.320 std_dev=0.807
O2'	B	0, 0.501, 1.346, 2.190, 2.335 max_d=2.335 avg_d=1.346 std_dev=0.845
C5'	B	0, 0.493, 1.372, 2.251, 2.369 max_d=2.369 avg_d=1.372 std_dev=0.879
O5'	A	0, 0.579, 1.641, 2.703, 2.660 max_d=2.660 avg_d=1.641 std_dev=1.062
O5'	B	0, 0.508, 1.759, 3.010, 3.187 max_d=3.187 avg_d=1.759 std_dev=1.251
OP1	B	0, 0.910, 2.256, 3.603, 3.448 max_d=3.448 avg_d=2.256 std_dev=1.347
O3'	B	0, 0.710, 2.064, 3.417, 3.528 max_d=3.528 avg_d=2.064 std_dev=1.353
P	B	0, 0.541, 1.898, 3.255, 3.489 max_d=3.489 avg_d=1.898 std_dev=1.357
OP2	B	0, 0.870, 2.331, 3.792, 4.016 max_d=4.016 avg_d=2.331 std_dev=1.461
OP1	A	0, 1.270, 3.023, 4.776, 4.297 max_d=4.297 avg_d=3.023 std_dev=1.753
P	A	0, 1.013, 2.824, 4.634, 4.409 max_d=4.409 avg_d=2.824 std_dev=1.810
OP2	A	0, 1.424, 4.043, 6.662, 6.495 max_d=6.495 avg_d=4.043 std_dev=2.619

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.02	0.00	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.03	0.04	0.03	0.01	0.02	0.02	0.01	0.22	0.49	0.28	0.14
C2	0.04	0.00	0.15	0.17	0.02	0.07	0.03	0.12	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.03	0.03	0.12	0.21	0.06	0.32	0.59	0.68	0.25
C2'	0.01	0.15	0.00	0.00	0.08	0.01	0.07	0.01	0.09	0.10	0.12	0.15	0.08	0.09	0.03	0.00	0.02	0.01	0.13	0.19	0.32	0.08
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.10	0.01	0.12	0.01	0.13	0.17	0.15	0.16	0.15	0.16	0.07	0.01	0.01	0.01	0.10	0.08	0.38	0.16
C4	0.02	0.02	0.08	0.10	0.00	0.06	0.01	0.12	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.10	0.04	0.35	0.62	0.68	0.28
C4'	0.00	0.07	0.01	0.01	0.06	0.00	0.10	0.01	0.10	0.13	0.08	0.06	0.12	0.13	0.06	0.03	0.02	0.00	0.00	0.13	0.26	0.09
C5	0.03	0.03	0.07	0.12	0.01	0.10	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.04	0.13	0.04	0.42	0.70	0.94	0.38
C5'	0.03	0.12	0.01	0.01	0.12	0.01	0.18	0.00	0.18	0.21	0.15	0.10	0.22	0.23	0.11	0.03	0.04	0.02	0.00	0.14	0.30	0.01
C6	0.03	0.02	0.09	0.13	0.01	0.10	0.00	0.18	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.06	0.15	0.04	0.42	0.70	0.98	0.37
C8	0.02	0.02	0.10	0.17	0.01	0.13	0.00	0.21	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.00	0.01	0.07	0.18	0.05	0.49	0.72	0.92	0.43
N1	0.03	0.01	0.12	0.15	0.01	0.08	0.01	0.15	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.10	0.19	0.05	0.36	0.65	0.84	0.30
N3	0.03	0.00	0.15	0.16	0.02	0.06	0.03	0.10	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.03	0.12	0.18	0.05	0.29	0.56	0.57	0.22
N6	0.04	0.02	0.08	0.15	0.01	0.12	0.01	0.22	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.01	0.03	0.04	0.16	0.05	0.45	0.73	1.15	0.44
N7	0.03	0.03	0.09	0.16	0.02	0.13	0.00	0.23	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.06	0.17	0.05	0.50	0.76	1.12	0.48
N9	0.01	0.03	0.03	0.07	0.02	0.06	0.02	0.11	0.03	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03	0.00	0.02	0.07	0.02	0.35	0.62	0.60	0.27
O2'	0.02	0.12	0.00	0.01	0.06	0.03	0.04	0.03	0.06	0.07	0.10	0.12	0.04	0.06	0.02	0.00	0.04	0.06	0.02	0.10	0.45	0.17
O3'	0.02	0.21	0.02	0.01	0.10	0.02	0.13	0.04	0.15	0.18	0.19	0.18	0.16	0.17	0.07	0.04	0.00	0.02	0.14	0.34	0.73	0.38
O4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.02	0.04	0.05	0.05	0.05	0.05	0.05	0.02	0.06	0.02	0.00	0.18	0.53	0.12	0.16
O5'	0.22	0.32	0.13	0.10	0.35	0.00	0.42	0.00	0.42	0.49	0.36	0.29	0.45	0.50	0.35	0.02	0.14	0.18	0.00	0.01	0.02	0.01
OP1	0.49	0.59	0.19	0.08	0.62	0.13	0.70	0.14	0.70	0.72	0.65	0.56	0.73	0.76	0.62	0.10	0.34	0.53	0.01	0.00	0.01	0.01
OP2	0.28	0.68	0.32	0.38	0.68	0.26	0.94	0.30	0.98	0.92	0.84	0.57	1.15	1.12	0.60	0.45	0.73	0.12	0.02	0.01	0.00	0.00
P	0.14	0.25	0.08	0.16	0.28	0.09	0.38	0.01	0.37	0.43	0.30	0.22	0.44	0.48	0.27	0.17	0.38	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.18	0.29	0.42	0.20	0.12	0.20	0.22	0.17	0.10	0.22	0.24	0.22	0.61	0.74	0.24	0.41	0.68	0.73	0.80
C2	0.07	0.24	0.14	0.33	0.10	0.11	0.16	0.05	0.11	0.07	0.28	0.14	0.35	0.47	0.34	0.04	0.07	0.75	0.31	0.48
C2'	0.25	0.17	0.31	0.31	0.18	0.22	0.18	0.34	0.25	0.21	0.19	0.22	0.17	0.54	0.56	0.44	0.45	0.75	0.80	0.87
C3'	0.26	0.15	0.47	0.34	0.17	0.15	0.11	0.29	0.14	0.18	0.16	0.23	0.16	0.64	0.64	0.32	0.46	0.53	0.78	0.79
C4	0.07	0.23	0.19	0.36	0.13	0.13	0.16	0.10	0.12	0.06	0.24	0.15	0.33	0.55	0.46	0.10	0.22	0.76	0.39	0.61
C4'	0.25	0.18	0.55	0.49	0.15	0.14	0.08	0.16	0.11	0.18	0.17	0.19	0.21	0.80	0.95	0.14	0.43	0.40	0.84	0.70
C5	0.13	0.24	0.17	0.30	0.08	0.14	0.20	0.11	0.16	0.10	0.20	0.10	0.37	0.55	0.33	0.05	0.23	0.78	0.30	0.59
C5'	0.41	0.30	0.70	0.60	0.20	0.34	0.19	0.18	0.25	0.32	0.24	0.18	0.34	0.98	1.12	0.18	0.36	0.37	0.67	0.49
C6	0.16	0.26	0.14	0.26	0.13	0.14	0.24	0.08	0.18	0.13	0.22	0.16	0.41	0.48	0.22	0.07	0.14	0.79	0.22	0.50
C8	0.09	0.16	0.24	0.33	0.09	0.15	0.16	0.23	0.13	0.04	0.15	0.11	0.26	0.67	0.54	0.12	0.45	0.74	0.55	0.74
N1	0.12	0.25	0.12	0.29	0.09	0.13	0.22	0.07	0.15	0.10	0.24	0.12	0.38	0.44	0.23	0.04	0.08	0.77	0.26	0.46
N3	0.06	0.24	0.18	0.37	0.18	0.11	0.15	0.05	0.11	0.07	0.29	0.23	0.32	0.50	0.46	0.10	0.11	0.74	0.37	0.55
N6	0.21	0.27	0.15	0.21	0.21	0.15	0.28	0.09	0.21	0.18	0.21	0.25	0.44	0.46	0.18	0.14	0.14	0.78	0.18	0.47
N7	0.15	0.20	0.21	0.29	0.09	0.15	0.19	0.18	0.16	0.10	0.14	0.11	0.33	0.64	0.36	0.06	0.36	0.76	0.39	0.65
N9	0.06	0.19	0.24	0.38	0.14	0.14	0.17	0.19	0.13	0.05	0.20	0.17	0.26	0.61	0.60	0.16	0.36	0.74	0.55	0.73
O2'	0.33	0.24	0.32	0.32	0.30	0.29	0.33	0.42	0.36	0.29	0.27	0.34	0.22	0.53	0.60	0.54	0.48	0.73	1.01	0.95
O3'	0.36	0.19	0.53	0.35	0.20	0.31	0.18	0.42	0.19	0.24	0.17	0.28	0.22	0.62	0.59	0.46	0.49	0.44	0.99	0.87
O4'	0.18	0.20	0.46	0.55	0.15	0.21	0.08	0.16	0.02	0.12	0.20	0.19	0.25	0.76	0.99	0.07	0.39	0.51	0.74	0.71
O5'	0.39	0.34	0.57	0.62	0.32	0.50	0.33	0.39	0.36	0.36	0.32	0.30	0.33	0.86	1.12	0.33	0.30	0.33	0.30	0.29
OP1	0.52	0.58	0.75	0.52	0.49	0.33	0.41	0.21	0.41	0.50	0.56	0.48	0.64	1.03	1.06	0.27	0.49	0.47	0.90	0.53
OP2	0.36	0.53	0.50	0.25	0.45	0.52	0.41	0.72	0.39	0.39	0.54	0.46	0.64	0.94	0.70	0.27	0.48	0.90	0.78	0.70
P	0.58	0.43	0.71	0.77	0.36	0.76	0.41	0.57	0.49	0.50	0.38	0.31	0.44	1.00	1.41	0.56	0.17	0.55	0.36	0.24

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.03	0.02	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.03	0.02	0.06	0.02	0.27	0.01	0.08	0.79	0.10	0.33
C2	0.03	0.00	0.08	0.06	0.00	0.03	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.26	0.30	0.07	0.11	0.77	0.24	0.26
C2'	0.00	0.08	0.00	0.01	0.04	0.02	0.12	0.16	0.14	0.03	0.05	0.04	0.19	0.00	0.03	0.03	0.33	0.67	0.31	0.47
C3'	0.03	0.06	0.01	0.00	0.25	0.01	0.34	0.01	0.32	0.15	0.13	0.26	0.11	0.01	0.00	0.02	0.04	0.18	0.11	0.07
C4	0.02	0.00	0.04	0.25	0.00	0.10	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.34	0.16	0.01	0.28	0.65	0.41	0.13
C4'	0.02	0.03	0.02	0.01	0.10	0.00	0.16	0.01	0.16	0.06	0.04	0.11	0.11	0.24	0.00	0.00	0.01	0.45	0.10	0.11
C5	0.01	0.01	0.12	0.34	0.01	0.16	0.00	0.21	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.33	0.25	0.06	0.33	0.63	0.40	0.11
C5'	0.05	0.08	0.16	0.01	0.17	0.01	0.21	0.00	0.18	0.08	0.12	0.19	0.11	0.09	0.16	0.01	0.00	0.29	0.16	0.02
C6	0.01	0.01	0.14	0.32	0.01	0.16	0.00	0.18	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.27	0.24	0.08	0.26	0.72	0.28	0.20
N1	0.01	0.01	0.03	0.15	0.01	0.06	0.01	0.08	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.19	0.16	0.01	0.12	0.78	0.20	0.27
N3	0.03	0.00	0.05	0.13	0.00	0.04	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.32	0.23	0.05	0.19	0.72	0.33	0.20
N4	0.02	0.00	0.04	0.26	0.00	0.11	0.01	0.19	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.38	0.18	0.01	0.32	0.60	0.47	0.08
O2	0.06	0.00	0.19	0.11	0.00	0.11	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.31	0.52	0.13	0.08	0.80	0.20	0.31
O2'	0.02	0.26	0.00	0.01	0.34	0.24	0.33	0.09	0.27	0.19	0.32	0.38	0.31	0.00	0.09	0.15	0.25	0.62	0.21	0.38
O3'	0.27	0.30	0.03	0.00	0.16	0.00	0.25	0.16	0.24	0.16	0.23	0.18	0.52	0.09	0.00	0.15	0.17	0.24	0.24	0.23
O4'	0.01	0.07	0.03	0.02	0.01	0.00	0.06	0.01	0.08	0.01	0.05	0.01	0.13	0.15	0.15	0.00	0.05	0.83	0.17	0.30
O5'	0.08	0.11	0.33	0.04	0.28	0.01	0.33	0.00	0.26	0.12	0.19	0.32	0.08	0.25	0.17	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.79	0.77	0.67	0.18	0.65	0.45	0.63	0.29	0.72	0.78	0.72	0.60	0.80	0.62	0.24	0.83	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.24	0.31	0.11	0.41	0.10	0.40	0.16	0.28	0.20	0.33	0.47	0.20	0.21	0.24	0.17	0.01	0.01	0.00	0.01
P	0.33	0.26	0.47	0.07	0.13	0.11	0.11	0.02	0.20	0.27	0.20	0.08	0.31	0.38	0.23	0.30	0.01	0.00	0.01	0.00