Doublet Group distance statistics: 53952

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.002, 0.011, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.003, 0.014, 0.025, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.014 std_dev=0.011
N6	A	0, 0.004, 0.015, 0.027, 0.027 max_d=0.027 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.003, 0.018, 0.033, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.007, 0.025, 0.043, 0.038 max_d=0.038 avg_d=0.025 std_dev=0.018
C8	A	0, 0.008, 0.027, 0.047, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.027 std_dev=0.019
N1	A	0, 0.009, 0.032, 0.055, 0.054 max_d=0.054 avg_d=0.032 std_dev=0.023
N9	A	0, 0.007, 0.030, 0.053, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.030 std_dev=0.023
N3	A	0, 0.009, 0.034, 0.059, 0.059 max_d=0.059 avg_d=0.034 std_dev=0.025
C2	A	0, 0.011, 0.039, 0.067, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.039 std_dev=0.028
C1'	A	0, 0.013, 0.051, 0.089, 0.091 max_d=0.091 avg_d=0.051 std_dev=0.038
C4'	A	0, 0.079, 0.281, 0.483, 0.465 max_d=0.465 avg_d=0.281 std_dev=0.202
C3'	A	0, 0.086, 0.304, 0.522, 0.501 max_d=0.501 avg_d=0.304 std_dev=0.218
O3'	A	0, 0.065, 0.285, 0.506, 0.537 max_d=0.537 avg_d=0.285 std_dev=0.220
N1	B	0, 0.082, 0.304, 0.527, 0.525 max_d=0.525 avg_d=0.304 std_dev=0.222
O4'	A	0, 0.100, 0.380, 0.659, 0.666 max_d=0.666 avg_d=0.380 std_dev=0.280
C2'	A	0, 0.122, 0.445, 0.769, 0.757 max_d=0.757 avg_d=0.445 std_dev=0.323
C5'	A	0, 0.155, 0.534, 0.913, 0.842 max_d=0.842 avg_d=0.534 std_dev=0.379
O5'	A	0, 0.157, 0.592, 1.027, 1.034 max_d=1.034 avg_d=0.592 std_dev=0.435
C2	B	0, 0.031, 0.478, 0.925, 1.075 max_d=1.075 avg_d=0.478 std_dev=0.447
C6	B	0, 0.176, 0.626, 1.076, 1.039 max_d=1.039 avg_d=0.626 std_dev=0.450
C1'	B	0, 0.198, 0.683, 1.169, 1.086 max_d=1.086 avg_d=0.683 std_dev=0.486
C2'	B	0, 0.195, 0.707, 1.218, 1.194 max_d=1.194 avg_d=0.707 std_dev=0.512
C5	B	0, 0.230, 0.845, 1.460, 1.447 max_d=1.447 avg_d=0.845 std_dev=0.615
O2'	A	0, 0.216, 0.854, 1.491, 1.531 max_d=1.531 avg_d=0.854 std_dev=0.637
O2	B	0, 0.128, 0.770, 1.411, 1.570 max_d=1.570 avg_d=0.770 std_dev=0.641
N3	B	0, 0.166, 0.838, 1.511, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.838 std_dev=0.673
C4	B	0, 0.189, 0.910, 1.631, 1.763 max_d=1.763 avg_d=0.910 std_dev=0.721
C3'	B	0, 0.300, 1.038, 1.776, 1.646 max_d=1.646 avg_d=1.038 std_dev=0.738
O4'	B	0, 0.313, 1.070, 1.828, 1.647 max_d=1.647 avg_d=1.070 std_dev=0.757
P	A	0, 0.289, 1.134, 1.979, 2.029 max_d=2.029 avg_d=1.134 std_dev=0.845
O2'	B	0, 0.180, 1.099, 2.018, 2.250 max_d=2.250 avg_d=1.099 std_dev=0.919
O3'	B	0, 0.373, 1.364, 2.354, 2.322 max_d=2.322 avg_d=1.364 std_dev=0.990
C4'	B	0, 0.392, 1.401, 2.410, 2.335 max_d=2.335 avg_d=1.401 std_dev=1.009
N4	B	0, 0.295, 1.365, 2.434, 2.613 max_d=2.613 avg_d=1.365 std_dev=1.070
OP2	A	0, 0.200, 1.396, 2.591, 2.920 max_d=2.920 avg_d=1.396 std_dev=1.195
O5'	B	0, 0.464, 1.670, 2.876, 2.806 max_d=2.806 avg_d=1.670 std_dev=1.206
C5'	B	0, 0.498, 1.808, 3.118, 3.062 max_d=3.062 avg_d=1.808 std_dev=1.310
OP1	A	0, 0.682, 2.329, 3.976, 3.531 max_d=3.531 avg_d=2.329 std_dev=1.647
P	B	0, 0.630, 2.317, 4.005, 3.971 max_d=3.971 avg_d=2.317 std_dev=1.688
OP2	B	0, 0.606, 2.319, 4.032, 4.085 max_d=4.085 avg_d=2.319 std_dev=1.713
OP1	B	0, 0.787, 2.859, 4.931, 4.845 max_d=4.845 avg_d=2.859 std_dev=2.072

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.05	0.03	0.01	0.04	0.04	0.02	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.11	0.06	0.33	0.10
C2	0.04	0.00	0.06	0.02	0.01	0.05	0.01	0.11	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.16	0.07	0.08	0.18	0.42	0.05	0.27
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.12	0.04	0.04	0.05	0.06	0.04	0.04	0.02	0.00	0.01	0.01	0.25	0.42	0.70	0.35
C3'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.02	0.10	0.43	0.62	0.30
C4	0.02	0.01	0.04	0.01	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.08	0.07	0.06	0.19	0.26	0.07	0.18
C4'	0.02	0.05	0.01	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.05	0.04	0.05	0.04	0.05	0.04	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.09	0.26	0.08
C5	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.07	0.06	0.22	0.29	0.09	0.19
C5'	0.05	0.11	0.12	0.01	0.11	0.01	0.13	0.00	0.14	0.11	0.13	0.10	0.15	0.13	0.10	0.07	0.09	0.02	0.00	0.05	0.06	0.01
C6	0.03	0.01	0.04	0.02	0.01	0.05	0.01	0.14	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.09	0.07	0.06	0.22	0.38	0.13	0.24
C8	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.17	0.07	0.09	0.19	0.19	0.19	0.06
N1	0.04	0.00	0.05	0.02	0.01	0.05	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.12	0.07	0.07	0.20	0.43	0.11	0.28
N3	0.04	0.00	0.06	0.03	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.16	0.07	0.09	0.16	0.33	0.03	0.23
N6	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.05	0.00	0.15	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.07	0.06	0.24	0.39	0.19	0.24
N7	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.04	0.00	0.13	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.07	0.08	0.22	0.23	0.14	0.12
N9	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.10	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.06	0.08	0.04	0.17	0.14	0.18	0.11
O2'	0.02	0.16	0.00	0.03	0.08	0.05	0.08	0.07	0.09	0.17	0.12	0.16	0.10	0.15	0.06	0.00	0.07	0.03	0.27	0.51	0.96	0.47
O3'	0.09	0.07	0.01	0.01	0.07	0.02	0.07	0.09	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.07	0.08	0.07	0.00	0.07	0.08	0.40	0.66	0.27
O4'	0.01	0.08	0.01	0.02	0.06	0.01	0.06	0.02	0.06	0.09	0.07	0.09	0.06	0.08	0.04	0.03	0.07	0.00	0.09	0.22	0.11	0.25
O5'	0.11	0.18	0.25	0.10	0.19	0.01	0.22	0.00	0.22	0.19	0.20	0.16	0.24	0.22	0.17	0.27	0.08	0.09	0.00	0.00	0.02	0.00
OP1	0.06	0.42	0.42	0.43	0.26	0.09	0.29	0.05	0.38	0.19	0.43	0.33	0.39	0.23	0.14	0.51	0.40	0.22	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.33	0.05	0.70	0.62	0.07	0.26	0.09	0.06	0.13	0.19	0.11	0.03	0.19	0.14	0.18	0.96	0.66	0.11	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.27	0.35	0.30	0.18	0.08	0.19	0.01	0.24	0.06	0.28	0.23	0.24	0.12	0.11	0.47	0.27	0.25	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.22	0.34	0.30	0.21	0.17	0.25	0.27	0.47	0.25	0.21	0.36	0.13	0.46	0.39	0.22	0.18	0.60	0.90	1.02	0.86
C2	0.22	0.08	0.37	0.19	0.37	0.14	0.36	0.20	0.21	0.09	0.18	0.56	0.29	0.57	0.24	0.14	0.35	0.53	0.71	0.52
C2'	0.22	0.43	0.30	0.19	0.31	0.22	0.18	0.47	0.19	0.24	0.50	0.39	0.53	0.36	0.22	0.13	0.58	0.93	0.99	0.86
C3'	0.22	0.39	0.30	0.20	0.28	0.24	0.21	0.47	0.21	0.24	0.44	0.31	0.50	0.37	0.23	0.16	0.58	0.94	0.98	0.86
C4	0.22	0.23	0.33	0.21	0.09	0.22	0.28	0.37	0.23	0.17	0.19	0.22	0.38	0.44	0.23	0.18	0.50	0.74	0.87	0.70
C4'	0.20	0.31	0.29	0.23	0.15	0.27	0.22	0.50	0.22	0.19	0.33	0.13	0.43	0.38	0.26	0.17	0.62	0.98	1.05	0.90
C5	0.21	0.18	0.32	0.25	0.10	0.26	0.23	0.39	0.22	0.16	0.19	0.21	0.29	0.39	0.26	0.22	0.49	0.70	0.80	0.66
C5'	0.26	0.27	0.35	0.39	0.17	0.42	0.31	0.64	0.33	0.25	0.28	0.13	0.37	0.39	0.44	0.31	0.73	1.14	1.14	1.02
C6	0.20	0.09	0.34	0.23	0.26	0.21	0.26	0.28	0.19	0.10	0.21	0.36	0.20	0.45	0.26	0.19	0.36	0.54	0.62	0.49
C8	0.23	0.30	0.29	0.28	0.22	0.34	0.21	0.54	0.27	0.22	0.36	0.29	0.37	0.31	0.30	0.26	0.63	0.93	1.01	0.87
N1	0.19	0.08	0.36	0.20	0.38	0.16	0.33	0.19	0.20	0.07	0.28	0.51	0.21	0.55	0.26	0.15	0.29	0.46	0.61	0.44
N3	0.22	0.18	0.35	0.19	0.25	0.16	0.34	0.29	0.22	0.14	0.07	0.44	0.38	0.52	0.22	0.14	0.44	0.66	0.83	0.64
N6	0.17	0.13	0.30	0.25	0.26	0.24	0.20	0.26	0.15	0.08	0.26	0.33	0.14	0.38	0.29	0.20	0.28	0.45	0.46	0.38
N7	0.22	0.22	0.29	0.30	0.15	0.35	0.15	0.51	0.25	0.19	0.28	0.24	0.29	0.30	0.31	0.28	0.58	0.84	0.89	0.78
N9	0.21	0.30	0.30	0.23	0.10	0.27	0.25	0.47	0.24	0.20	0.32	0.08	0.41	0.37	0.24	0.20	0.59	0.86	0.99	0.82
O2'	0.28	0.50	0.35	0.22	0.41	0.23	0.29	0.45	0.26	0.31	0.58	0.49	0.61	0.40	0.23	0.18	0.57	0.87	0.94	0.82
O3'	0.31	0.44	0.38	0.26	0.35	0.27	0.33	0.46	0.30	0.32	0.47	0.36	0.53	0.45	0.28	0.24	0.57	0.88	0.94	0.82
O4'	0.20	0.27	0.29	0.24	0.11	0.28	0.26	0.50	0.24	0.19	0.27	0.05	0.39	0.38	0.26	0.20	0.62	0.95	1.05	0.89
O5'	0.32	0.21	0.37	0.51	0.20	0.57	0.38	0.79	0.41	0.29	0.23	0.18	0.26	0.34	0.57	0.44	0.85	1.28	1.23	1.14
OP1	0.03	0.31	0.15	0.22	0.15	0.40	0.28	0.75	0.24	0.07	0.35	0.21	0.50	0.29	0.26	0.24	0.84	1.39	1.36	1.25
OP2	0.39	0.40	0.31	0.49	0.55	0.62	0.63	0.88	0.58	0.43	0.50	0.65	0.39	0.23	0.56	0.54	0.92	1.45	1.29	1.25
P	0.18	0.38	0.21	0.20	0.33	0.33	0.31	0.61	0.28	0.23	0.45	0.39	0.50	0.28	0.25	0.22	0.67	1.20	1.12	1.03

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.03
C2	0.03	0.00	0.03	0.08	0.01	0.03	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.08	0.03	0.11	0.13	0.17	0.13
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.00	0.03	0.02	0.04	0.04	0.04	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.00
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.10	0.00	0.07	0.01	0.04	0.05	0.11	0.10	0.07	0.01	0.01	0.01	0.02	0.09	0.05	0.02
C4	0.02	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.13	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.09	0.02	0.18	0.22	0.26	0.23
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.01	0.06	0.02	0.05	0.07	0.04	0.04	0.01	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00
C5	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.02	0.18	0.20	0.21	0.21
C5'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.13	0.01	0.14	0.00	0.10	0.05	0.10	0.14	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01
C6	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.06	0.01	0.10	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.12	0.12	0.11	0.13
N1	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.08	0.09	0.10	0.09
N3	0.02	0.01	0.04	0.11	0.00	0.05	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.07	0.10	0.02	0.16	0.19	0.24	0.19
N4	0.02	0.01	0.04	0.10	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.07	0.11	0.02	0.20	0.25	0.30	0.26
O2	0.05	0.01	0.04	0.07	0.01	0.04	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.10	0.07	0.06	0.07	0.09	0.15	0.10
O2'	0.01	0.07	0.00	0.01	0.06	0.04	0.03	0.03	0.02	0.03	0.07	0.07	0.10	0.00	0.03	0.06	0.02	0.09	0.04	0.03
O3'	0.02	0.08	0.01	0.01	0.09	0.01	0.07	0.02	0.03	0.03	0.10	0.11	0.07	0.03	0.00	0.01	0.02	0.13	0.08	0.05
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.06	0.06	0.01	0.00	0.03	0.01	0.04	0.05
O5'	0.02	0.11	0.01	0.02	0.18	0.00	0.18	0.00	0.12	0.08	0.16	0.20	0.07	0.02	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.03	0.13	0.07	0.09	0.22	0.04	0.20	0.03	0.12	0.09	0.19	0.25	0.09	0.09	0.13	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01
OP2	0.03	0.17	0.02	0.05	0.26	0.02	0.21	0.02	0.11	0.10	0.24	0.30	0.15	0.04	0.08	0.04	0.01	0.02	0.00	0.01
P	0.03	0.13	0.00	0.02	0.23	0.00	0.21	0.01	0.13	0.09	0.19	0.26	0.10	0.03	0.05	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00