Doublet Group distance statistics: 53956

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.026 max_d=0.026 avg_d=0.013 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.000, 0.024, 0.048, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.024 std_dev=0.024
N3	A	0, 0.000, 0.029, 0.057, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.029 std_dev=0.029
N6	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C2	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N1	A	0, 0.000, 0.031, 0.062, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.031 std_dev=0.031
C5	A	0, 0.000, 0.031, 0.063, 0.063 max_d=0.063 avg_d=0.031 std_dev=0.031
N9	A	0, 0.000, 0.037, 0.073, 0.073 max_d=0.073 avg_d=0.037 std_dev=0.037
C1'	A	0, 0.000, 0.050, 0.100, 0.100 max_d=0.100 avg_d=0.050 std_dev=0.050
N7	A	0, 0.000, 0.056, 0.112, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.056 std_dev=0.056
C8	A	0, 0.000, 0.066, 0.133, 0.133 max_d=0.133 avg_d=0.066 std_dev=0.066
O4'	A	0, 0.000, 0.408, 0.816, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.408 std_dev=0.408
N4	B	0, 0.000, 0.505, 1.011, 1.011 max_d=1.011 avg_d=0.505 std_dev=0.505
O2'	A	0, 0.000, 0.508, 1.015, 1.015 max_d=1.015 avg_d=0.508 std_dev=0.508
O4'	B	0, 0.000, 0.519, 1.037, 1.037 max_d=1.037 avg_d=0.519 std_dev=0.519
C4	B	0, 0.000, 0.521, 1.042, 1.042 max_d=1.042 avg_d=0.521 std_dev=0.521
N3	B	0, 0.000, 0.540, 1.080, 1.080 max_d=1.080 avg_d=0.540 std_dev=0.540
C5	B	0, 0.000, 0.551, 1.102, 1.102 max_d=1.102 avg_d=0.551 std_dev=0.551
C2	B	0, 0.000, 0.557, 1.114, 1.114 max_d=1.114 avg_d=0.557 std_dev=0.557
C2'	A	0, 0.000, 0.571, 1.142, 1.142 max_d=1.142 avg_d=0.571 std_dev=0.571
N1	B	0, 0.000, 0.579, 1.159, 1.159 max_d=1.159 avg_d=0.579 std_dev=0.579
O2	B	0, 0.000, 0.582, 1.163, 1.163 max_d=1.163 avg_d=0.582 std_dev=0.582
C1'	B	0, 0.000, 0.582, 1.164, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.582 std_dev=0.582
C6	B	0, 0.000, 0.593, 1.186, 1.186 max_d=1.186 avg_d=0.593 std_dev=0.593
C4'	B	0, 0.000, 0.742, 1.483, 1.483 max_d=1.483 avg_d=0.742 std_dev=0.742
OP2	A	0, 0.000, 0.791, 1.582, 1.582 max_d=1.582 avg_d=0.791 std_dev=0.791
C5'	B	0, 0.000, 0.800, 1.600, 1.600 max_d=1.600 avg_d=0.800 std_dev=0.800
O5'	B	0, 0.000, 0.802, 1.605, 1.605 max_d=1.605 avg_d=0.802 std_dev=0.802
C2'	B	0, 0.000, 0.826, 1.651, 1.651 max_d=1.651 avg_d=0.826 std_dev=0.826
O2'	B	0, 0.000, 0.835, 1.671, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.835 std_dev=0.835
C3'	B	0, 0.000, 0.932, 1.863, 1.863 max_d=1.863 avg_d=0.932 std_dev=0.932
C4'	A	0, 0.000, 0.940, 1.879, 1.879 max_d=1.879 avg_d=0.940 std_dev=0.940
P	B	0, 0.000, 1.034, 2.068, 2.068 max_d=2.068 avg_d=1.034 std_dev=1.034
C5'	A	0, 0.000, 1.092, 2.185, 2.185 max_d=2.185 avg_d=1.092 std_dev=1.092
P	A	0, 0.000, 1.132, 2.264, 2.264 max_d=2.264 avg_d=1.132 std_dev=1.132
C3'	A	0, 0.000, 1.140, 2.280, 2.280 max_d=2.280 avg_d=1.140 std_dev=1.140
O3'	B	0, 0.000, 1.232, 2.464, 2.464 max_d=2.464 avg_d=1.232 std_dev=1.232
OP1	A	0, 0.000, 1.285, 2.570, 2.570 max_d=2.570 avg_d=1.285 std_dev=1.285
O5'	A	0, 0.000, 1.496, 2.991, 2.991 max_d=2.991 avg_d=1.496 std_dev=1.496
OP2	B	0, 0.000, 1.682, 3.364, 3.364 max_d=3.364 avg_d=1.682 std_dev=1.682
O3'	A	0, 0.000, 2.077, 4.154, 4.154 max_d=4.154 avg_d=2.077 std_dev=2.077
OP1	B	0, 0.000, 2.162, 4.324, 4.324 max_d=4.324 avg_d=2.162 std_dev=2.162

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.05	0.01	0.06	0.04	0.01	0.03	0.03	0.04	0.01	0.05	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.37	0.63	0.22	0.53
C2	0.05	0.00	0.07	0.31	0.00	0.08	0.02	0.14	0.01	0.03	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.49	0.16	0.90	0.77	0.51	0.74
C2'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.17	0.01	0.27	0.02	0.23	0.39	0.15	0.04	0.28	0.37	0.24	0.01	0.01	0.00	0.12	0.33	0.03	0.24
C3'	0.06	0.31	0.00	0.00	0.47	0.01	0.62	0.04	0.58	0.63	0.45	0.25	0.65	0.70	0.46	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.21	0.03
C4	0.04	0.00	0.17	0.47	0.00	0.19	0.00	0.23	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.09	0.60	0.10	0.83	0.79	0.45	0.74
C4'	0.01	0.08	0.01	0.01	0.19	0.00	0.27	0.00	0.24	0.31	0.16	0.06	0.28	0.33	0.22	0.09	0.09	0.01	0.01	0.30	0.21	0.08
C5	0.03	0.02	0.27	0.62	0.00	0.27	0.00	0.31	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.88	0.08	0.88	0.81	0.48	0.76
C5'	0.03	0.14	0.02	0.04	0.23	0.00	0.31	0.00	0.30	0.31	0.22	0.12	0.33	0.35	0.22	0.08	0.10	0.01	0.02	0.26	0.36	0.04
C6	0.04	0.01	0.23	0.58	0.01	0.24	0.00	0.30	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.15	0.90	0.11	0.93	0.81	0.51	0.76
C8	0.01	0.03	0.39	0.63	0.02	0.31	0.01	0.31	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.00	0.01	0.20	0.81	0.01	0.70	0.77	0.40	0.69
N1	0.05	0.00	0.15	0.45	0.01	0.16	0.01	0.22	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.09	0.72	0.15	0.93	0.78	0.52	0.75
N3	0.06	0.00	0.04	0.25	0.00	0.06	0.01	0.12	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.35	0.16	0.86	0.78	0.47	0.75
N6	0.03	0.00	0.28	0.65	0.00	0.28	0.01	0.33	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.00	0.20	1.04	0.10	0.94	0.81	0.51	0.76
N7	0.00	0.03	0.37	0.70	0.02	0.33	0.01	0.35	0.02	0.00	0.03	0.02	0.03	0.00	0.00	0.22	0.99	0.02	0.81	0.80	0.46	0.74
N9	0.01	0.00	0.24	0.46	0.00	0.22	0.01	0.22	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.10	0.51	0.02	0.67	0.75	0.37	0.68
O2'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.09	0.09	0.16	0.08	0.15	0.20	0.09	0.01	0.20	0.22	0.10	0.00	0.12	0.08	0.03	0.35	0.02	0.22
O3'	0.00	0.49	0.01	0.01	0.60	0.09	0.88	0.10	0.90	0.81	0.72	0.35	1.04	0.99	0.51	0.12	0.00	0.06	0.33	0.30	0.45	0.32
O4'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.10	0.01	0.08	0.01	0.11	0.01	0.15	0.16	0.10	0.02	0.02	0.08	0.06	0.00	0.38	0.69	0.14	0.52
O5'	0.37	0.90	0.12	0.01	0.83	0.01	0.88	0.02	0.93	0.70	0.93	0.86	0.94	0.81	0.67	0.03	0.33	0.38	0.00	0.01	0.01	0.01
OP1	0.63	0.77	0.33	0.10	0.79	0.30	0.81	0.26	0.81	0.77	0.78	0.78	0.81	0.80	0.75	0.35	0.30	0.69	0.01	0.00	0.04	0.00
OP2	0.22	0.51	0.03	0.21	0.45	0.21	0.48	0.36	0.51	0.40	0.52	0.47	0.51	0.46	0.37	0.02	0.45	0.14	0.01	0.04	0.00	0.00
P	0.53	0.74	0.24	0.03	0.74	0.08	0.76	0.04	0.76	0.69	0.75	0.75	0.76	0.74	0.68	0.22	0.32	0.52	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.15	0.07	0.38	0.58	0.20	0.50	0.18	0.51	0.11	0.03	0.15	0.23	0.00	0.43	0.82	0.27	0.05	0.18	0.80	0.18
C2	0.20	0.09	0.30	0.54	0.06	0.45	0.09	0.48	0.01	0.09	0.03	0.12	0.13	0.27	0.73	0.32	0.15	0.54	1.13	0.43
C2'	0.05	0.04	0.19	0.35	0.02	0.30	0.09	0.34	0.09	0.02	0.05	0.01	0.10	0.19	0.54	0.15	0.16	0.41	0.92	0.35
C3'	0.17	0.03	0.13	0.08	0.04	0.05	0.10	0.13	0.19	0.15	0.08	0.15	0.01	0.21	0.25	0.06	0.46	0.74	1.05	0.59
C4	0.26	0.11	0.45	0.65	0.07	0.53	0.06	0.54	0.03	0.12	0.02	0.13	0.17	0.42	0.86	0.35	0.02	0.32	0.99	0.28
C4'	0.50	0.46	0.43	0.12	0.39	0.13	0.49	0.01	0.56	0.54	0.37	0.29	0.42	0.43	0.20	0.33	0.57	0.84	1.11	0.70
C5	0.31	0.22	0.49	0.66	0.05	0.53	0.04	0.52	0.12	0.21	0.15	0.02	0.27	0.46	0.85	0.37	0.02	0.32	1.05	0.29
C5'	0.61	0.49	0.62	0.33	0.41	0.29	0.55	0.13	0.66	0.63	0.38	0.29	0.45	0.60	0.03	0.45	0.79	1.11	1.19	0.89
C6	0.30	0.24	0.44	0.61	0.12	0.49	0.08	0.48	0.14	0.23	0.21	0.06	0.28	0.41	0.80	0.36	0.08	0.43	1.13	0.37
C8	0.30	0.16	0.52	0.67	0.00	0.55	0.01	0.54	0.08	0.17	0.07	0.06	0.23	0.52	0.88	0.35	0.08	0.16	0.91	0.18
N1	0.25	0.19	0.36	0.55	0.07	0.45	0.03	0.46	0.09	0.17	0.15	0.01	0.21	0.33	0.73	0.33	0.15	0.54	1.17	0.43
N3	0.19	0.03	0.34	0.60	0.14	0.50	0.14	0.53	0.05	0.04	0.05	0.18	0.08	0.31	0.81	0.33	0.08	0.42	1.02	0.34
N6	0.32	0.29	0.46	0.60	0.20	0.47	0.14	0.45	0.19	0.26	0.28	0.16	0.32	0.43	0.79	0.35	0.09	0.44	1.17	0.39
N7	0.33	0.23	0.53	0.68	0.08	0.54	0.07	0.53	0.14	0.23	0.17	0.01	0.30	0.52	0.88	0.37	0.04	0.22	1.00	0.23
N9	0.25	0.08	0.48	0.66	0.09	0.54	0.07	0.55	0.01	0.10	0.02	0.14	0.15	0.48	0.88	0.34	0.05	0.20	0.89	0.20
O2'	0.09	0.16	0.08	0.28	0.18	0.23	0.21	0.29	0.21	0.18	0.15	0.14	0.13	0.08	0.50	0.02	0.14	0.34	0.84	0.31
O3'	0.41	0.09	0.42	0.23	0.12	0.27	0.08	0.16	0.26	0.27	0.12	0.32	0.12	0.59	0.14	0.32	0.74	0.98	1.17	0.79
O4'	0.18	0.41	0.04	0.36	0.49	0.29	0.49	0.35	0.44	0.39	0.46	0.48	0.33	0.13	0.74	0.01	0.16	0.44	0.93	0.39
O5'	0.23	0.06	0.35	0.08	0.26	0.05	0.13	0.14	0.04	0.08	0.23	0.40	0.00	0.54	0.02	0.08	0.50	0.70	0.66	0.46
OP1	0.05	0.14	0.14	0.01	0.23	0.09	0.10	0.26	0.01	0.01	0.24	0.31	0.14	0.24	0.02	0.06	0.38	0.72	0.19	0.31
OP2	0.00	0.11	0.17	0.00	0.17	0.20	0.09	0.41	0.00	0.02	0.18	0.22	0.10	0.21	0.01	0.20	0.40	0.77	0.45	0.38
P	0.05	0.15	0.17	0.01	0.23	0.09	0.11	0.24	0.01	0.02	0.25	0.31	0.14	0.26	0.00	0.07	0.44	0.71	0.45	0.39

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.03	0.02	0.00	0.01	0.20	0.67	0.08
C2	0.02	0.00	0.14	0.18	0.01	0.06	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.07	0.21	0.01	0.11	0.02	1.03	0.26
C2'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.06	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.14	0.08	0.22	0.00	0.03	0.00	0.23	0.16	0.79	0.29
C3'	0.02	0.18	0.00	0.00	0.14	0.00	0.02	0.01	0.05	0.04	0.21	0.17	0.23	0.02	0.01	0.02	0.40	0.39	0.69	0.39
C4	0.00	0.01	0.06	0.14	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.20	0.01	0.27	0.25	1.29	0.46
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.09	0.02	0.03	0.00	0.01	0.07	0.26	0.02
C5	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.00	0.32	0.27	1.32	0.49
C5'	0.02	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.10	0.04	0.02	0.02	0.05	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01
C6	0.01	0.02	0.08	0.05	0.00	0.06	0.00	0.10	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.07	0.04	0.01	0.27	0.13	1.17	0.39
N1	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.02	0.04	0.01	0.15	0.03	0.99	0.25
N3	0.02	0.00	0.14	0.21	0.00	0.06	0.01	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.01	0.08	0.27	0.01	0.18	0.11	1.18	0.36
N4	0.00	0.01	0.08	0.17	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.05	0.26	0.02	0.32	0.36	1.36	0.53
O2	0.04	0.00	0.22	0.23	0.01	0.09	0.01	0.05	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.15	0.25	0.01	0.03	0.13	0.90	0.16
O2'	0.03	0.07	0.00	0.02	0.02	0.02	0.04	0.02	0.07	0.02	0.08	0.05	0.15	0.00	0.08	0.02	0.06	0.03	0.55	0.13
O3'	0.02	0.21	0.03	0.01	0.20	0.03	0.06	0.01	0.04	0.04	0.27	0.26	0.25	0.08	0.00	0.01	0.49	0.59	0.55	0.44
O4'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.16	0.38	0.36	0.12
O5'	0.01	0.11	0.23	0.40	0.27	0.01	0.32	0.01	0.27	0.15	0.18	0.32	0.03	0.06	0.49	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.20	0.02	0.16	0.39	0.25	0.07	0.27	0.03	0.13	0.03	0.11	0.36	0.13	0.03	0.59	0.38	0.01	0.00	0.05	0.00
OP2	0.67	1.03	0.79	0.69	1.29	0.26	1.32	0.05	1.17	0.99	1.18	1.36	0.90	0.55	0.55	0.36	0.00	0.05	0.00	0.01
P	0.08	0.26	0.29	0.39	0.46	0.02	0.49	0.01	0.39	0.25	0.36	0.53	0.16	0.13	0.44	0.12	0.00	0.00	0.01	0.00