Doublet Group distance statistics: 53964

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 0, 0, 1, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.003, 0.008, 0.013, 0.016 max_d=0.016 avg_d=0.008 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.004, 0.010, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C1'	A	0, 0.007, 0.014, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.014 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.005, 0.012, 0.019, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C4	A	0, 0.006, 0.013, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.013 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.012 std_dev=0.008
O2	A	0, 0.014, 0.028, 0.042, 0.043 max_d=0.043 avg_d=0.028 std_dev=0.014
N4	A	0, 0.020, 0.037, 0.055, 0.053 max_d=0.053 avg_d=0.037 std_dev=0.018
O4'	A	0, 0.083, 0.232, 0.381, 0.461 max_d=0.461 avg_d=0.232 std_dev=0.149
C2'	A	0, 0.110, 0.260, 0.409, 0.500 max_d=0.500 avg_d=0.260 std_dev=0.150
C4'	A	0, 0.080, 0.271, 0.462, 0.539 max_d=0.539 avg_d=0.271 std_dev=0.191
C3'	A	0, 0.172, 0.378, 0.584, 0.687 max_d=0.687 avg_d=0.378 std_dev=0.206
O2'	A	0, 0.224, 0.466, 0.707, 0.751 max_d=0.751 avg_d=0.466 std_dev=0.241
C5	B	0, 0.127, 0.384, 0.641, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.384 std_dev=0.257
C6	B	0, 0.126, 0.424, 0.722, 0.880 max_d=0.880 avg_d=0.424 std_dev=0.298
O3'	A	0, 0.292, 0.597, 0.901, 0.912 max_d=0.912 avg_d=0.597 std_dev=0.304
C4	B	0, 0.128, 0.433, 0.737, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.433 std_dev=0.305
O4	B	0, 0.133, 0.467, 0.802, 0.993 max_d=0.993 avg_d=0.467 std_dev=0.334
N1	B	0, 0.126, 0.464, 0.801, 1.016 max_d=1.016 avg_d=0.464 std_dev=0.337
C2	B	0, 0.128, 0.474, 0.820, 1.059 max_d=1.059 avg_d=0.474 std_dev=0.346
N3	B	0, 0.127, 0.477, 0.828, 1.040 max_d=1.040 avg_d=0.477 std_dev=0.351
C5'	A	0, 0.084, 0.458, 0.833, 1.048 max_d=1.048 avg_d=0.458 std_dev=0.374
O4'	B	0, 0.121, 0.502, 0.883, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.502 std_dev=0.381
O2	B	0, 0.131, 0.514, 0.898, 1.203 max_d=1.203 avg_d=0.514 std_dev=0.383
OP2	B	0, 0.170, 0.567, 0.963, 1.230 max_d=1.230 avg_d=0.567 std_dev=0.396
O5'	B	0, 0.122, 0.534, 0.946, 1.217 max_d=1.217 avg_d=0.534 std_dev=0.412
C1'	B	0, 0.136, 0.553, 0.969, 1.249 max_d=1.249 avg_d=0.553 std_dev=0.416
P	B	0, 0.157, 0.585, 1.013, 1.285 max_d=1.285 avg_d=0.585 std_dev=0.428
C5'	B	0, 0.129, 0.567, 1.005, 1.296 max_d=1.296 avg_d=0.567 std_dev=0.438
O5'	A	0, 0.095, 0.533, 0.971, 1.273 max_d=1.273 avg_d=0.533 std_dev=0.438
C4'	B	0, 0.124, 0.585, 1.046, 1.361 max_d=1.361 avg_d=0.585 std_dev=0.461
C2'	B	0, 0.158, 0.629, 1.101, 1.389 max_d=1.389 avg_d=0.629 std_dev=0.471
C3'	B	0, 0.152, 0.683, 1.214, 1.554 max_d=1.554 avg_d=0.683 std_dev=0.531
OP1	B	0, 0.204, 0.742, 1.281, 1.611 max_d=1.611 avg_d=0.742 std_dev=0.538
P	A	0, 0.142, 0.706, 1.270, 1.678 max_d=1.678 avg_d=0.706 std_dev=0.564
O2'	B	0, 0.211, 0.781, 1.350, 1.652 max_d=1.652 avg_d=0.781 std_dev=0.570
OP2	A	0, 0.243, 0.843, 1.443, 1.845 max_d=1.845 avg_d=0.843 std_dev=0.600
OP1	A	0, 0.139, 0.747, 1.355, 1.824 max_d=1.824 avg_d=0.747 std_dev=0.608
O3'	B	0, 0.161, 0.769, 1.377, 1.781 max_d=1.781 avg_d=0.769 std_dev=0.608

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.08	0.01	0.03	0.11	0.04	0.05
C2	0.01	0.00	0.06	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.17	0.13	0.04	0.06	0.15	0.04	0.07
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.03	0.03	0.03	0.07	0.06	0.09	0.00	0.04	0.04	0.03	0.13	0.05	0.05
C3'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.07	0.00	0.11	0.01	0.12	0.06	0.04	0.08	0.07	0.02	0.01	0.01	0.02	0.08	0.06	0.04
C4	0.01	0.01	0.06	0.07	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.19	0.05	0.03	0.05	0.07	0.08	0.04
C4'	0.02	0.02	0.01	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.16	0.02	0.01	0.02	0.09	0.05	0.04
C5	0.01	0.01	0.04	0.11	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.14	0.08	0.07	0.09	0.07	0.13	0.10
C5'	0.02	0.05	0.03	0.01	0.06	0.01	0.07	0.00	0.06	0.04	0.06	0.07	0.06	0.13	0.06	0.02	0.01	0.05	0.07	0.02
C6	0.01	0.00	0.03	0.12	0.01	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.08	0.09	0.10	0.06	0.12	0.10
N1	0.01	0.00	0.03	0.06	0.01	0.02	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.10	0.05	0.02	0.03	0.09	0.05	0.04
N3	0.01	0.01	0.07	0.04	0.00	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.20	0.10	0.03	0.06	0.13	0.05	0.06
N4	0.02	0.01	0.06	0.08	0.01	0.03	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.21	0.06	0.03	0.06	0.07	0.10	0.05
O2	0.02	0.01	0.09	0.07	0.01	0.02	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.18	0.21	0.08	0.11	0.22	0.09	0.13
O2'	0.02	0.17	0.00	0.02	0.19	0.16	0.14	0.13	0.10	0.10	0.20	0.21	0.18	0.00	0.05	0.09	0.19	0.37	0.25	0.26
O3'	0.08	0.13	0.04	0.01	0.05	0.02	0.08	0.06	0.08	0.05	0.10	0.06	0.21	0.05	0.00	0.04	0.04	0.12	0.11	0.07
O4'	0.01	0.04	0.04	0.01	0.03	0.01	0.07	0.02	0.09	0.02	0.03	0.03	0.08	0.09	0.04	0.00	0.03	0.09	0.04	0.04
O5'	0.03	0.06	0.03	0.02	0.05	0.02	0.09	0.01	0.10	0.03	0.06	0.06	0.11	0.19	0.04	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01
OP1	0.11	0.15	0.13	0.08	0.07	0.09	0.07	0.05	0.06	0.09	0.13	0.07	0.22	0.37	0.12	0.09	0.02	0.00	0.00	0.01
OP2	0.04	0.04	0.05	0.06	0.08	0.05	0.13	0.07	0.12	0.05	0.05	0.10	0.09	0.25	0.11	0.04	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.07	0.05	0.04	0.04	0.04	0.10	0.02	0.10	0.04	0.06	0.05	0.13	0.26	0.07	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.03	0.07	0.07	0.06	0.11	0.04	0.11	0.05	0.08	0.05	0.10	0.07	0.11	0.05	0.14	0.04	0.03	0.05	0.12	0.05
C2	0.09	0.12	0.13	0.10	0.06	0.07	0.06	0.07	0.09	0.09	0.11	0.14	0.17	0.08	0.08	0.07	0.05	0.07	0.11	0.06
C2'	0.06	0.07	0.09	0.10	0.12	0.08	0.12	0.09	0.09	0.06	0.10	0.07	0.12	0.09	0.15	0.09	0.09	0.10	0.15	0.09
C3'	0.14	0.05	0.19	0.22	0.07	0.18	0.08	0.17	0.06	0.07	0.03	0.09	0.22	0.21	0.12	0.15	0.18	0.15	0.13	0.17
C4	0.09	0.10	0.12	0.09	0.07	0.07	0.13	0.09	0.13	0.10	0.07	0.14	0.14	0.06	0.05	0.07	0.06	0.10	0.10	0.07
C4'	0.04	0.07	0.07	0.07	0.11	0.04	0.11	0.05	0.08	0.06	0.09	0.06	0.12	0.08	0.13	0.04	0.05	0.10	0.14	0.09
C5	0.09	0.06	0.08	0.05	0.12	0.02	0.17	0.06	0.17	0.11	0.07	0.05	0.10	0.06	0.12	0.06	0.05	0.11	0.10	0.08
C5'	0.04	0.03	0.08	0.10	0.04	0.07	0.04	0.10	0.03	0.03	0.03	0.03	0.16	0.12	0.05	0.04	0.12	0.22	0.23	0.18
C6	0.09	0.08	0.09	0.06	0.13	0.04	0.18	0.04	0.18	0.11	0.09	0.06	0.11	0.06	0.14	0.08	0.03	0.08	0.10	0.06
N1	0.04	0.05	0.08	0.07	0.08	0.03	0.10	0.05	0.09	0.03	0.07	0.07	0.12	0.04	0.11	0.03	0.03	0.06	0.11	0.05
N3	0.12	0.16	0.15	0.12	0.09	0.09	0.12	0.09	0.13	0.13	0.14	0.19	0.18	0.10	0.05	0.09	0.06	0.09	0.10	0.06
N4	0.12	0.16	0.13	0.10	0.13	0.09	0.15	0.11	0.15	0.14	0.14	0.20	0.15	0.08	0.10	0.10	0.08	0.11	0.10	0.08
O2	0.12	0.15	0.15	0.12	0.13	0.08	0.09	0.06	0.11	0.12	0.16	0.17	0.20	0.11	0.14	0.08	0.05	0.07	0.11	0.06
O2'	0.04	0.09	0.10	0.10	0.14	0.09	0.10	0.11	0.06	0.05	0.13	0.09	0.18	0.08	0.19	0.10	0.11	0.13	0.15	0.12
O3'	0.10	0.05	0.17	0.24	0.21	0.20	0.20	0.23	0.10	0.04	0.14	0.03	0.19	0.22	0.28	0.14	0.25	0.28	0.27	0.29
O4'	0.06	0.07	0.06	0.07	0.07	0.09	0.07	0.13	0.07	0.07	0.07	0.07	0.11	0.06	0.07	0.09	0.13	0.17	0.23	0.16
O5'	0.12	0.07	0.14	0.16	0.04	0.17	0.05	0.21	0.08	0.09	0.05	0.08	0.12	0.16	0.05	0.14	0.24	0.34	0.31	0.28
OP1	0.15	0.08	0.18	0.23	0.06	0.22	0.05	0.25	0.07	0.10	0.05	0.09	0.17	0.25	0.10	0.17	0.26	0.42	0.32	0.31
OP2	0.25	0.20	0.26	0.28	0.13	0.27	0.12	0.28	0.17	0.21	0.17	0.22	0.25	0.31	0.11	0.25	0.28	0.38	0.26	0.28
P	0.18	0.12	0.20	0.23	0.07	0.22	0.07	0.25	0.11	0.14	0.09	0.13	0.18	0.24	0.07	0.19	0.26	0.39	0.31	0.29

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	O2	O2'	O3'	O4	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.05	0.07	0.05
C2	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.06	0.01	0.03	0.03	0.04	0.09	0.03
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.03	0.04	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.02	0.01	0.05	0.06	0.07	0.06
C3'	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.01	0.04	0.05	0.04	0.03
C4	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.02	0.08	0.07	0.16	0.09
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.01	0.05	0.01	0.02	0.03	0.00	0.01	0.03	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.03	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.08	0.02	0.02	0.04	0.09	0.10	0.17	0.11
C5'	0.02	0.05	0.03	0.01	0.05	0.01	0.05	0.00	0.05	0.03	0.05	0.08	0.03	0.02	0.06	0.01	0.01	0.06	0.01	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.01	0.02	0.08	0.02	0.01	0.04	0.09	0.10	0.15	0.11
N1	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.03	0.03	0.01	0.01	0.06	0.06	0.10	0.06
N3	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.02	0.02	0.05	0.04	0.13	0.05
O2	0.02	0.01	0.03	0.03	0.01	0.05	0.01	0.08	0.02	0.02	0.00	0.00	0.06	0.09	0.02	0.08	0.03	0.07	0.06	0.04
O2'	0.01	0.03	0.00	0.02	0.05	0.01	0.08	0.03	0.08	0.03	0.03	0.06	0.00	0.04	0.06	0.01	0.06	0.08	0.09	0.07
O3'	0.03	0.06	0.02	0.00	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.05	0.09	0.04	0.00	0.04	0.03	0.03	0.06	0.05	0.03
O4	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.06	0.01	0.01	0.02	0.02	0.06	0.04	0.00	0.03	0.09	0.08	0.18	0.10
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.02	0.08	0.01	0.03	0.03	0.00	0.05	0.06	0.06	0.05
O5'	0.05	0.03	0.05	0.04	0.08	0.01	0.09	0.01	0.09	0.06	0.05	0.03	0.06	0.03	0.09	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.04	0.06	0.05	0.07	0.03	0.10	0.06	0.10	0.06	0.04	0.07	0.08	0.06	0.08	0.06	0.01	0.00	0.00	0.01
OP2	0.07	0.09	0.07	0.04	0.16	0.02	0.17	0.01	0.15	0.10	0.13	0.06	0.09	0.05	0.18	0.06	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.03	0.06	0.03	0.09	0.01	0.11	0.01	0.11	0.06	0.05	0.04	0.07	0.03	0.10	0.05	0.00	0.01	0.00	0.00