Doublet Group distance statistics: 53975

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 6, 3, 2, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.006, 0.011, 0.016, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.005, 0.014, 0.023, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.014 std_dev=0.009
C6	A	0, 0.003, 0.013, 0.024, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.013 std_dev=0.011
N3	A	0, -0.003, 0.009, 0.021, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.009 std_dev=0.012
C2	A	0, 0.002, 0.016, 0.029, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.016 std_dev=0.014
N1	A	0, -0.002, 0.012, 0.026, 0.057 max_d=0.057 avg_d=0.012 std_dev=0.014
C1'	A	0, 0.001, 0.018, 0.035, 0.072 max_d=0.072 avg_d=0.018 std_dev=0.017
N4	A	0, 0.020, 0.048, 0.076, 0.115 max_d=0.115 avg_d=0.048 std_dev=0.028
O2	A	0, -0.004, 0.037, 0.078, 0.167 max_d=0.167 avg_d=0.037 std_dev=0.041
C2'	A	0, 0.040, 0.099, 0.158, 0.212 max_d=0.212 avg_d=0.099 std_dev=0.059
C3'	A	0, 0.045, 0.115, 0.184, 0.244 max_d=0.244 avg_d=0.115 std_dev=0.069
O4'	A	0, 0.039, 0.109, 0.179, 0.240 max_d=0.240 avg_d=0.109 std_dev=0.070
C4'	A	0, 0.070, 0.170, 0.270, 0.335 max_d=0.335 avg_d=0.170 std_dev=0.100
O2'	A	0, 0.114, 0.215, 0.315, 0.389 max_d=0.389 avg_d=0.215 std_dev=0.101
O3'	A	0, 0.076, 0.185, 0.295, 0.457 max_d=0.457 avg_d=0.185 std_dev=0.109
O5'	B	0, 0.169, 0.332, 0.494, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.332 std_dev=0.163
C5'	A	0, 0.118, 0.282, 0.446, 0.578 max_d=0.578 avg_d=0.282 std_dev=0.164
OP2	B	0, 0.242, 0.410, 0.577, 0.733 max_d=0.733 avg_d=0.410 std_dev=0.168
P	B	0, 0.209, 0.379, 0.549, 0.825 max_d=0.825 avg_d=0.379 std_dev=0.170
P	A	0, 0.182, 0.365, 0.547, 0.677 max_d=0.677 avg_d=0.365 std_dev=0.183
OP2	A	0, 0.220, 0.424, 0.629, 0.777 max_d=0.777 avg_d=0.424 std_dev=0.204
O3'	B	0, 0.167, 0.375, 0.583, 0.676 max_d=0.676 avg_d=0.375 std_dev=0.208
C5'	B	0, 0.178, 0.396, 0.614, 0.821 max_d=0.821 avg_d=0.396 std_dev=0.218
OP1	B	0, 0.226, 0.456, 0.685, 1.104 max_d=1.104 avg_d=0.456 std_dev=0.230
O2'	B	0, 0.167, 0.397, 0.627, 0.808 max_d=0.808 avg_d=0.397 std_dev=0.230
C3'	B	0, 0.131, 0.366, 0.601, 0.739 max_d=0.739 avg_d=0.366 std_dev=0.235
C4'	B	0, 0.156, 0.400, 0.645, 0.828 max_d=0.828 avg_d=0.400 std_dev=0.245
O5'	A	0, 0.123, 0.375, 0.627, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.375 std_dev=0.252
C2'	B	0, 0.122, 0.389, 0.657, 0.897 max_d=0.897 avg_d=0.389 std_dev=0.268
O4'	B	0, 0.178, 0.470, 0.761, 1.022 max_d=1.022 avg_d=0.470 std_dev=0.291
OP1	A	0, 0.249, 0.551, 0.853, 1.108 max_d=1.108 avg_d=0.551 std_dev=0.302
C1'	B	0, 0.138, 0.448, 0.758, 1.105 max_d=1.105 avg_d=0.448 std_dev=0.310
C8	B	0, 0.161, 0.475, 0.788, 1.160 max_d=1.160 avg_d=0.475 std_dev=0.314
N9	B	0, 0.121, 0.470, 0.820, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.470 std_dev=0.349
N7	B	0, 0.185, 0.572, 0.960, 1.444 max_d=1.444 avg_d=0.572 std_dev=0.388
C4	B	0, 0.094, 0.552, 1.011, 1.671 max_d=1.671 avg_d=0.552 std_dev=0.458
C5	B	0, 0.124, 0.608, 1.093, 1.777 max_d=1.777 avg_d=0.608 std_dev=0.485
N3	B	0, 0.124, 0.638, 1.153, 1.936 max_d=1.936 avg_d=0.638 std_dev=0.515
C6	B	0, 0.129, 0.732, 1.334, 2.212 max_d=2.212 avg_d=0.732 std_dev=0.602
O6	B	0, 0.188, 0.813, 1.438, 2.347 max_d=2.347 avg_d=0.813 std_dev=0.625
C2	B	0, 0.100, 0.753, 1.407, 2.410 max_d=2.410 avg_d=0.753 std_dev=0.654
N1	B	0, 0.094, 0.787, 1.480, 2.525 max_d=2.525 avg_d=0.787 std_dev=0.693
N2	B	0, 0.099, 0.873, 1.647, 2.836 max_d=2.836 avg_d=0.873 std_dev=0.774

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.03	0.02	0.06	0.02	0.06	0.00	0.09	0.13	0.24	0.06
C2	0.03	0.00	0.04	0.05	0.00	0.04	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.06	0.09	0.04	0.13	0.14	0.23	0.06
C2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.01	0.05	0.02	0.05	0.02	0.03	0.04	0.07	0.00	0.03	0.01	0.14	0.17	0.28	0.13
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.03	0.04	0.04	0.09	0.03	0.01	0.01	0.07	0.17	0.27	0.12
C4	0.02	0.00	0.03	0.04	0.00	0.04	0.01	0.09	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.03	0.13	0.10	0.25	0.08
C4'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.04	0.00	0.06	0.01	0.06	0.03	0.04	0.05	0.08	0.03	0.04	0.01	0.02	0.13	0.20	0.03
C5	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.06	0.00	0.10	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.07	0.04	0.12	0.10	0.26	0.10
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.09	0.01	0.10	0.00	0.09	0.05	0.07	0.10	0.06	0.03	0.04	0.01	0.01	0.10	0.18	0.02
C6	0.01	0.01	0.05	0.04	0.01	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.07	0.04	0.11	0.10	0.25	0.07
N1	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.06	0.02	0.12	0.12	0.23	0.05
N3	0.03	0.00	0.03	0.04	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.09	0.03	0.13	0.12	0.24	0.06
N4	0.02	0.01	0.04	0.04	0.01	0.05	0.01	0.10	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.08	0.04	0.13	0.10	0.26	0.09
O2	0.06	0.00	0.07	0.09	0.01	0.08	0.01	0.06	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.09	0.13	0.07	0.15	0.19	0.21	0.09
O2'	0.02	0.06	0.00	0.03	0.08	0.03	0.08	0.03	0.07	0.04	0.07	0.09	0.09	0.00	0.08	0.02	0.16	0.21	0.31	0.17
O3'	0.06	0.09	0.03	0.01	0.08	0.04	0.07	0.04	0.07	0.06	0.09	0.08	0.13	0.08	0.00	0.06	0.06	0.18	0.28	0.12
O4'	0.00	0.04	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.03	0.04	0.07	0.02	0.06	0.00	0.03	0.11	0.21	0.02
O5'	0.09	0.13	0.14	0.07	0.13	0.02	0.12	0.01	0.11	0.12	0.13	0.13	0.15	0.16	0.06	0.03	0.00	0.02	0.03	0.01
OP1	0.13	0.14	0.17	0.17	0.10	0.13	0.10	0.10	0.10	0.12	0.12	0.10	0.19	0.21	0.18	0.11	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.24	0.23	0.28	0.27	0.25	0.20	0.26	0.18	0.25	0.23	0.24	0.26	0.21	0.31	0.28	0.21	0.03	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.06	0.13	0.12	0.08	0.03	0.10	0.02	0.07	0.05	0.06	0.09	0.09	0.17	0.12	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.10	0.08	0.07	0.10	0.10	0.12	0.13	0.12	0.15	0.10	0.12	0.09	0.16	0.10	0.11	0.10	0.09	0.11	0.14	0.10	0.11	0.10
C2	0.08	0.12	0.09	0.08	0.10	0.08	0.12	0.10	0.12	0.16	0.11	0.15	0.11	0.16	0.10	0.13	0.12	0.08	0.09	0.14	0.09	0.11	0.09
C2'	0.09	0.10	0.08	0.08	0.12	0.11	0.15	0.16	0.14	0.17	0.12	0.09	0.10	0.18	0.12	0.10	0.12	0.11	0.13	0.16	0.13	0.14	0.13
C3'	0.07	0.10	0.06	0.06	0.12	0.10	0.15	0.14	0.15	0.16	0.13	0.10	0.10	0.18	0.12	0.08	0.09	0.10	0.10	0.18	0.09	0.11	0.10
C4	0.10	0.21	0.11	0.11	0.14	0.10	0.12	0.11	0.14	0.11	0.18	0.26	0.19	0.12	0.10	0.13	0.13	0.10	0.11	0.13	0.12	0.13	0.12
C4'	0.07	0.09	0.08	0.07	0.10	0.09	0.13	0.13	0.13	0.15	0.10	0.09	0.08	0.17	0.11	0.11	0.10	0.09	0.09	0.15	0.08	0.11	0.08
C5	0.11	0.22	0.12	0.12	0.15	0.11	0.13	0.12	0.15	0.10	0.20	0.27	0.20	0.11	0.11	0.13	0.14	0.11	0.12	0.14	0.12	0.13	0.12
C5'	0.10	0.13	0.07	0.07	0.14	0.12	0.18	0.19	0.18	0.20	0.15	0.12	0.12	0.21	0.15	0.10	0.10	0.14	0.14	0.20	0.09	0.12	0.10
C6	0.08	0.17	0.10	0.10	0.12	0.09	0.11	0.11	0.12	0.11	0.15	0.20	0.15	0.11	0.09	0.13	0.12	0.09	0.10	0.12	0.10	0.12	0.10
N1	0.07	0.12	0.09	0.08	0.10	0.08	0.11	0.11	0.11	0.14	0.11	0.15	0.11	0.14	0.09	0.12	0.11	0.08	0.10	0.12	0.10	0.12	0.09
N3	0.08	0.16	0.09	0.09	0.11	0.08	0.11	0.09	0.12	0.13	0.14	0.21	0.14	0.14	0.09	0.13	0.12	0.08	0.09	0.13	0.10	0.12	0.10
N4	0.12	0.27	0.13	0.13	0.17	0.13	0.15	0.14	0.18	0.11	0.23	0.33	0.24	0.12	0.12	0.14	0.14	0.13	0.13	0.16	0.15	0.15	0.15
O2	0.11	0.12	0.12	0.11	0.13	0.11	0.17	0.13	0.17	0.21	0.13	0.13	0.11	0.22	0.15	0.15	0.14	0.11	0.11	0.20	0.10	0.12	0.10
O2'	0.08	0.09	0.09	0.08	0.11	0.11	0.13	0.14	0.13	0.15	0.10	0.09	0.09	0.16	0.11	0.12	0.14	0.11	0.13	0.15	0.15	0.16	0.14
O3'	0.08	0.10	0.08	0.07	0.11	0.09	0.14	0.11	0.14	0.14	0.12	0.10	0.10	0.16	0.11	0.10	0.07	0.09	0.08	0.17	0.07	0.10	0.08
O4'	0.09	0.11	0.10	0.10	0.10	0.11	0.12	0.13	0.11	0.15	0.11	0.13	0.11	0.15	0.11	0.12	0.12	0.10	0.11	0.13	0.10	0.10	0.10
O5'	0.13	0.16	0.09	0.11	0.17	0.13	0.20	0.18	0.21	0.20	0.19	0.15	0.15	0.22	0.16	0.10	0.02	0.16	0.12	0.22	0.09	0.16	0.09
OP1	0.16	0.23	0.15	0.09	0.23	0.09	0.26	0.11	0.27	0.24	0.25	0.22	0.21	0.26	0.21	0.21	0.03	0.13	0.11	0.28	0.18	0.18	0.13
OP2	0.13	0.19	0.16	0.04	0.17	0.05	0.18	0.12	0.19	0.15	0.20	0.21	0.18	0.18	0.14	0.24	0.03	0.06	0.19	0.20	0.15	0.21	0.16
P	0.05	0.11	0.08	0.01	0.11	0.02	0.13	0.07	0.14	0.13	0.13	0.11	0.09	0.15	0.09	0.14	0.01	0.03	0.09	0.16	0.14	0.16	0.10

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.02	0.04	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.01	0.03	0.02	0.12	0.10	0.06
C2	0.02	0.00	0.07	0.03	0.01	0.09	0.01	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.04	0.11	0.15	0.01	0.22	0.16	0.17
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.04	0.01	0.03	0.02	0.04	0.02	0.06	0.08	0.06	0.02	0.02	0.00	0.02	0.01	0.05	0.04	0.14	0.14	0.09
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.04	0.00	0.05	0.02	0.05	0.07	0.04	0.05	0.03	0.07	0.04	0.03	0.01	0.01	0.06	0.05	0.14	0.14	0.10
C4	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.06	0.09	0.01	0.16	0.12	0.10
C4'	0.01	0.09	0.01	0.00	0.05	0.00	0.03	0.01	0.04	0.07	0.07	0.12	0.08	0.05	0.03	0.06	0.03	0.00	0.02	0.04	0.12	0.09	0.06
C5	0.01	0.01	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.04	0.09	0.01	0.14	0.10	0.08
C5'	0.02	0.16	0.02	0.02	0.09	0.01	0.08	0.00	0.09	0.10	0.13	0.19	0.14	0.09	0.06	0.06	0.04	0.01	0.01	0.09	0.06	0.02	0.02
C6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.07	0.06	0.10	0.00	0.15	0.10	0.10
C8	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.07	0.00	0.10	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.04	0.11	0.01	0.13	0.13	0.11
N1	0.02	0.00	0.06	0.04	0.01	0.07	0.01	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.05	0.09	0.13	0.01	0.19	0.13	0.14
N2	0.04	0.01	0.08	0.05	0.01	0.12	0.01	0.19	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.02	0.02	0.11	0.04	0.13	0.18	0.02	0.26	0.20	0.21
N3	0.02	0.01	0.06	0.03	0.00	0.08	0.01	0.14	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.03	0.10	0.13	0.01	0.21	0.16	0.15
N7	0.01	0.01	0.02	0.07	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.03	0.10	0.01	0.13	0.12	0.10
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.01	0.06	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.13	0.11	0.08
O2'	0.02	0.08	0.00	0.03	0.04	0.06	0.03	0.06	0.04	0.04	0.07	0.11	0.08	0.03	0.01	0.00	0.05	0.05	0.08	0.03	0.17	0.19	0.13
O3'	0.02	0.04	0.02	0.01	0.04	0.03	0.07	0.04	0.07	0.09	0.05	0.04	0.03	0.09	0.05	0.05	0.00	0.02	0.07	0.08	0.18	0.20	0.14
O4'	0.01	0.11	0.01	0.01	0.06	0.00	0.04	0.01	0.06	0.04	0.09	0.13	0.10	0.03	0.01	0.05	0.02	0.00	0.02	0.05	0.12	0.07	0.05
O5'	0.03	0.15	0.05	0.06	0.09	0.02	0.09	0.01	0.10	0.11	0.13	0.18	0.13	0.10	0.06	0.08	0.07	0.02	0.00	0.10	0.01	0.01	0.00
O6	0.02	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.01	0.09	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.08	0.05	0.10	0.00	0.14	0.10	0.09
OP1	0.12	0.22	0.14	0.14	0.16	0.12	0.14	0.06	0.15	0.13	0.19	0.26	0.21	0.13	0.13	0.17	0.18	0.12	0.01	0.14	0.00	0.02	0.01
OP2	0.10	0.16	0.14	0.14	0.12	0.09	0.10	0.02	0.10	0.13	0.13	0.20	0.16	0.12	0.11	0.19	0.20	0.07	0.01	0.10	0.02	0.00	0.01
P	0.06	0.17	0.09	0.10	0.10	0.06	0.08	0.02	0.10	0.11	0.14	0.21	0.15	0.10	0.08	0.13	0.14	0.05	0.00	0.09	0.01	0.01	0.00