Doublet Group distance statistics: 53994

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 4, 4, 0, 1, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.005, 0.008, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.008 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.004, 0.007, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.007 std_dev=0.003
N1	A	0, 0.005, 0.008, 0.012, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C1'	A	0, 0.007, 0.013, 0.019, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.006, 0.013, 0.019, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.013 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.007, 0.013, 0.020, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.013 std_dev=0.007
O2	A	0, 0.020, 0.037, 0.053, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.037 std_dev=0.016
N4	A	0, 0.018, 0.046, 0.075, 0.089 max_d=0.089 avg_d=0.046 std_dev=0.028
O4'	A	0, 0.012, 0.041, 0.071, 0.109 max_d=0.109 avg_d=0.041 std_dev=0.030
C2'	A	0, 0.011, 0.052, 0.093, 0.159 max_d=0.159 avg_d=0.052 std_dev=0.041
C3'	A	0, 0.053, 0.113, 0.172, 0.240 max_d=0.240 avg_d=0.113 std_dev=0.060
C4'	A	0, 0.056, 0.120, 0.184, 0.228 max_d=0.228 avg_d=0.120 std_dev=0.064
C3'	B	0, 0.053, 0.123, 0.194, 0.316 max_d=0.316 avg_d=0.123 std_dev=0.071
O2'	A	0, 0.069, 0.141, 0.212, 0.265 max_d=0.265 avg_d=0.141 std_dev=0.071
C2'	B	0, 0.062, 0.135, 0.209, 0.317 max_d=0.317 avg_d=0.135 std_dev=0.073
C4'	B	0, 0.063, 0.137, 0.211, 0.320 max_d=0.320 avg_d=0.137 std_dev=0.074
C1'	B	0, 0.040, 0.115, 0.189, 0.274 max_d=0.274 avg_d=0.115 std_dev=0.074
O3'	B	0, 0.066, 0.144, 0.222, 0.325 max_d=0.325 avg_d=0.144 std_dev=0.078
O4'	B	0, 0.044, 0.126, 0.207, 0.261 max_d=0.261 avg_d=0.126 std_dev=0.082
O3'	A	0, 0.106, 0.188, 0.270, 0.345 max_d=0.345 avg_d=0.188 std_dev=0.082
C5'	B	0, 0.063, 0.147, 0.230, 0.335 max_d=0.335 avg_d=0.147 std_dev=0.084
O2'	B	0, 0.094, 0.178, 0.262, 0.337 max_d=0.337 avg_d=0.178 std_dev=0.084
O5'	B	0, 0.061, 0.148, 0.235, 0.318 max_d=0.318 avg_d=0.148 std_dev=0.087
N3	B	0, 0.066, 0.155, 0.244, 0.359 max_d=0.359 avg_d=0.155 std_dev=0.089
N9	B	0, 0.034, 0.129, 0.223, 0.347 max_d=0.347 avg_d=0.129 std_dev=0.094
C4	B	0, 0.042, 0.146, 0.249, 0.390 max_d=0.390 avg_d=0.146 std_dev=0.103
C2	B	0, 0.067, 0.174, 0.282, 0.414 max_d=0.414 avg_d=0.174 std_dev=0.108
C5'	A	0, 0.082, 0.191, 0.301, 0.366 max_d=0.366 avg_d=0.191 std_dev=0.110
OP2	B	0, 0.066, 0.185, 0.305, 0.419 max_d=0.419 avg_d=0.185 std_dev=0.120
C8	B	0, 0.028, 0.154, 0.279, 0.423 max_d=0.423 avg_d=0.154 std_dev=0.125
P	B	0, 0.070, 0.202, 0.335, 0.491 max_d=0.491 avg_d=0.202 std_dev=0.133
O5'	A	0, 0.117, 0.250, 0.383, 0.547 max_d=0.547 avg_d=0.250 std_dev=0.133
N1	B	0, 0.048, 0.186, 0.323, 0.496 max_d=0.496 avg_d=0.186 std_dev=0.138
C5	B	0, 0.027, 0.167, 0.307, 0.490 max_d=0.490 avg_d=0.167 std_dev=0.140
C6	B	0, 0.034, 0.189, 0.345, 0.544 max_d=0.544 avg_d=0.189 std_dev=0.156
N7	B	0, 0.019, 0.175, 0.331, 0.516 max_d=0.516 avg_d=0.175 std_dev=0.156
P	A	0, 0.137, 0.298, 0.459, 0.642 max_d=0.642 avg_d=0.298 std_dev=0.161
OP1	B	0, 0.104, 0.275, 0.447, 0.621 max_d=0.621 avg_d=0.275 std_dev=0.171
OP2	A	0, 0.162, 0.337, 0.512, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.337 std_dev=0.175
OP1	A	0, 0.176, 0.368, 0.560, 0.738 max_d=0.738 avg_d=0.368 std_dev=0.192
N6	B	0, 0.031, 0.227, 0.423, 0.658 max_d=0.658 avg_d=0.227 std_dev=0.196

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.09	0.02
C2	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.03	0.01	0.04	0.04	0.08	0.02
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.03	0.06	0.09	0.03
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.06	0.08	0.04
C4	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.02	0.05	0.06	0.09	0.05
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.03	0.03	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01
C5	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.05	0.07	0.10	0.06
C5'	0.01	0.05	0.01	0.01	0.07	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.06	0.07	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.06	0.01
C6	0.01	0.00	0.02	0.03	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	0.04	0.06	0.10	0.05
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.03	0.00	0.04	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.03	0.04	0.08	0.02
N3	0.01	0.00	0.02	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.05	0.05	0.08	0.03
N4	0.02	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.01	0.07	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.03	0.04	0.02	0.06	0.08	0.10	0.07
O2	0.01	0.00	0.03	0.04	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.04	0.03	0.07	0.02
O2'	0.01	0.03	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.03	0.03	0.04	0.00	0.04	0.02	0.03	0.07	0.09	0.04
O3'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.04	0.00	0.01	0.05	0.07	0.07	0.05
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.09	0.02
O5'	0.01	0.04	0.03	0.04	0.05	0.01	0.05	0.00	0.04	0.03	0.05	0.06	0.04	0.03	0.05	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.04	0.04	0.06	0.06	0.06	0.03	0.07	0.02	0.06	0.04	0.05	0.08	0.03	0.07	0.07	0.03	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.09	0.08	0.09	0.08	0.09	0.07	0.10	0.06	0.10	0.08	0.08	0.10	0.07	0.09	0.07	0.09	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.02	0.02	0.03	0.04	0.05	0.01	0.06	0.01	0.05	0.02	0.03	0.07	0.02	0.04	0.05	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.02	0.08	0.04	0.02	0.03	0.03	0.06	0.03	0.05	0.11	0.06	0.07	0.07	0.12	0.04	0.05	0.03	0.06	0.04	0.06	0.08	0.05
C2	0.03	0.10	0.04	0.03	0.05	0.03	0.05	0.03	0.08	0.07	0.10	0.08	0.08	0.08	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.06	0.08	0.05
C2'	0.03	0.07	0.03	0.03	0.04	0.04	0.07	0.04	0.06	0.12	0.05	0.05	0.10	0.14	0.05	0.05	0.02	0.07	0.04	0.06	0.07	0.04
C3'	0.03	0.06	0.03	0.04	0.03	0.05	0.06	0.06	0.06	0.11	0.04	0.04	0.09	0.12	0.05	0.04	0.03	0.08	0.04	0.05	0.05	0.03
C4	0.04	0.11	0.05	0.04	0.08	0.03	0.09	0.03	0.11	0.04	0.12	0.09	0.12	0.07	0.05	0.05	0.04	0.06	0.03	0.07	0.08	0.05
C4'	0.03	0.05	0.03	0.04	0.03	0.06	0.06	0.06	0.05	0.11	0.04	0.04	0.07	0.11	0.05	0.04	0.04	0.09	0.04	0.05	0.04	0.03
C5	0.06	0.11	0.07	0.05	0.09	0.04	0.10	0.03	0.11	0.07	0.12	0.10	0.12	0.09	0.07	0.06	0.05	0.07	0.03	0.07	0.08	0.05
C5'	0.05	0.06	0.05	0.07	0.04	0.08	0.05	0.09	0.05	0.09	0.05	0.05	0.07	0.09	0.05	0.06	0.06	0.11	0.05	0.05	0.05	0.02
C6	0.05	0.11	0.07	0.05	0.09	0.04	0.09	0.03	0.09	0.07	0.11	0.10	0.09	0.09	0.06	0.07	0.05	0.07	0.03	0.06	0.08	0.05
N1	0.03	0.10	0.05	0.03	0.06	0.03	0.06	0.02	0.07	0.08	0.09	0.09	0.07	0.09	0.04	0.05	0.04	0.06	0.03	0.06	0.08	0.05
N3	0.03	0.10	0.04	0.03	0.06	0.03	0.06	0.03	0.09	0.04	0.11	0.08	0.10	0.05	0.03	0.04	0.03	0.06	0.03	0.07	0.08	0.06
N4	0.05	0.11	0.06	0.04	0.08	0.03	0.10	0.03	0.12	0.05	0.13	0.09	0.14	0.08	0.06	0.05	0.05	0.06	0.03	0.07	0.07	0.05
O2	0.03	0.10	0.03	0.03	0.04	0.04	0.05	0.03	0.06	0.09	0.09	0.07	0.08	0.11	0.04	0.03	0.03	0.06	0.03	0.06	0.08	0.05
O2'	0.06	0.04	0.05	0.04	0.06	0.05	0.11	0.05	0.09	0.14	0.04	0.04	0.13	0.16	0.08	0.06	0.04	0.08	0.04	0.05	0.06	0.04
O3'	0.04	0.05	0.04	0.04	0.04	0.05	0.08	0.06	0.07	0.12	0.05	0.05	0.11	0.13	0.06	0.05	0.04	0.08	0.04	0.05	0.05	0.03
O4'	0.02	0.07	0.03	0.02	0.03	0.04	0.05	0.05	0.05	0.11	0.05	0.06	0.06	0.11	0.04	0.04	0.03	0.08	0.04	0.06	0.07	0.05
O5'	0.06	0.06	0.06	0.08	0.04	0.09	0.05	0.11	0.04	0.09	0.04	0.05	0.06	0.09	0.06	0.06	0.08	0.11	0.06	0.06	0.05	0.03
OP1	0.04	0.07	0.03	0.04	0.04	0.07	0.05	0.09	0.05	0.09	0.06	0.06	0.06	0.09	0.05	0.03	0.04	0.09	0.06	0.08	0.06	0.05
OP2	0.10	0.08	0.09	0.09	0.09	0.11	0.10	0.12	0.09	0.13	0.08	0.08	0.11	0.13	0.10	0.09	0.08	0.15	0.09	0.08	0.08	0.07
P	0.05	0.06	0.04	0.05	0.04	0.08	0.06	0.10	0.05	0.09	0.05	0.05	0.07	0.10	0.06	0.05	0.05	0.11	0.07	0.08	0.05	0.05

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.03	0.04	0.05	0.04
C2	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.01	0.04	0.04	0.08	0.05
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.03	0.04	0.04	0.03	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.03	0.04	0.06	0.03
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.04	0.03	0.04	0.02	0.03	0.02	0.01	0.00	0.02	0.04	0.05	0.05	0.04
C4	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.03	0.01	0.04	0.05	0.08	0.05
C4'	0.00	0.02	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02
C5	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.01	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.02	0.01	0.06	0.07	0.10	0.07
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.00	0.03	0.05	0.02	0.02	0.04	0.05	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.06	0.07	0.11	0.07
C8	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.04	0.01	0.07	0.07	0.09	0.07
N1	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.06	0.05	0.01	0.05	0.06	0.10	0.06
N3	0.01	0.00	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.05	0.01	0.03	0.04	0.07	0.04
N6	0.01	0.00	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.03	0.01	0.06	0.08	0.12	0.08
N7	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.05	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.07	0.08	0.11	0.09
N9	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.04	0.05	0.07	0.05
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.01	0.06	0.06	0.05	0.02	0.02	0.00	0.02	0.03	0.03	0.05	0.05	0.03
O3'	0.01	0.06	0.01	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.05	0.05	0.03	0.03	0.02	0.02	0.00	0.01	0.04	0.07	0.06	0.04
O4'	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.00	0.05	0.06	0.07	0.06
O5'	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.01	0.06	0.01	0.06	0.07	0.05	0.03	0.06	0.07	0.04	0.03	0.04	0.05	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.04	0.04	0.04	0.05	0.05	0.03	0.07	0.03	0.07	0.07	0.06	0.04	0.08	0.08	0.05	0.05	0.07	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.05	0.08	0.06	0.05	0.08	0.02	0.10	0.01	0.11	0.09	0.10	0.07	0.12	0.11	0.07	0.05	0.06	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.05	0.03	0.04	0.05	0.02	0.07	0.01	0.07	0.07	0.06	0.04	0.08	0.09	0.05	0.03	0.04	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00