sequences=8 maxmove=0.1 pval=0.1 usescval=false complexatt=true cooling=1.0 currcool=1.0 attfactor=10.0 attvalpow=1 repfactor=10.0 repvalpow=1 dampening=1.0 minattract=1.0 cluster2d=false blastpath=/home/sdh/apps/blast-2.2.17/bin/blastall -p blastp -M PAM70 -F F -e 10000 -b 500 -v 500 formatdbpath=/home/sdh/apps/blast-2.2.17/bin/formatdb showinfo=true zoom=1.0 dotsize=0 ovalsize=10 groupsize=4 usefoldchange=false avgfoldchange=false colorcutoffs=0.0;0.1;0.2;0.3;0.4;0.5;0.6;0.7;0.8;0.9; colorarr=(230;230;230):(207;207;207):(184;184;184):(161;161;161):(138;138;138):(115;115;115):(92;92;92):(69;69;69):(46;46;46):(23;23;23): 1.0;0.0;0.0; 0.0;1.0;0.0; 0.0;0.0;1.0; >3KNH-A1363-A1362 X >2UUB-A1427-A1426 X >2UXC-A1427-A1426 X >2UUA-A1427-A1426 X >2VQE-A1427-A1426 X >2VQF-A1427-A1426 X >1N32-A1427-A1426 X >1XMQ-A1421-A1420 X 0 1:0.952369236266 0 2:0.857194764421 0 3:0.762866636177 0 4:0.772156050229 0 5:0.814651297508 0 6:0.999998327729 0 7:0.854350996491 1 2:0.168907625585 1 3:0.228780860386 1 4:0.214931433046 1 5:0.197639467634 1 6:0.124243174956 1 7:0.163379297287 2 3:0.135199785975 2 4:0.09340994351 2 5:0.0940456417702 2 6:0.165471318758 2 7:0.121315442525 3 4:0.0845003881628 3 5:0.115435489948 3 6:0.27118158345 3 7:0.122692156314 4 5:0.100715837167 4 6:0.243872530282 4 7:0.123109562959 5 6:0.205068972988 5 7:0.14597206349 6 7:0.200241651874