sequences=8
maxmove=0.1
pval=0.1
usescval=false
complexatt=true
cooling=1.0
currcool=1.0
attfactor=10.0
attvalpow=1
repfactor=10.0
repvalpow=1
dampening=1.0
minattract=1.0
cluster2d=false
blastpath=/home/sdh/apps/blast-2.2.17/bin/blastall -p blastp -M PAM70 -F F -e 10000 -b 500 -v 500
formatdbpath=/home/sdh/apps/blast-2.2.17/bin/formatdb
showinfo=true
zoom=1.0
dotsize=0
ovalsize=10
groupsize=4
usefoldchange=false
avgfoldchange=false
colorcutoffs=0.0;0.1;0.2;0.3;0.4;0.5;0.6;0.7;0.8;0.9;
colorarr=(230;230;230):(207;207;207):(184;184;184):(161;161;161):(138;138;138):(115;115;115):(92;92;92):(69;69;69):(46;46;46):(23;23;23):
1.0;0.0;0.0;
0.0;1.0;0.0;
0.0;0.0;1.0;
>3KNH-A1363-A1362
X
>2UUB-A1427-A1426
X
>2UXC-A1427-A1426
X
>2UUA-A1427-A1426
X
>2VQE-A1427-A1426
X
>2VQF-A1427-A1426
X
>1N32-A1427-A1426
X
>1XMQ-A1421-A1420
X
0 1:0.952369236266
0 2:0.857194764421
0 3:0.762866636177
0 4:0.772156050229
0 5:0.814651297508
0 6:0.999998327729
0 7:0.854350996491
1 2:0.168907625585
1 3:0.228780860386
1 4:0.214931433046
1 5:0.197639467634
1 6:0.124243174956
1 7:0.163379297287
2 3:0.135199785975
2 4:0.09340994351
2 5:0.0940456417702
2 6:0.165471318758
2 7:0.121315442525
3 4:0.0845003881628
3 5:0.115435489948
3 6:0.27118158345
3 7:0.122692156314
4 5:0.100715837167
4 6:0.243872530282
4 7:0.123109562959
5 6:0.205068972988
5 7:0.14597206349
6 7:0.200241651874