Doublet Group distance statistics: 54018

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 1, 1, 2, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.004, 0.006, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.002
N1	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C6	A	0, 0.004, 0.009, 0.015, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.005, 0.012, 0.018, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.012 std_dev=0.007
C2	A	0, 0.005, 0.014, 0.022, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.014 std_dev=0.008
N3	A	0, 0.002, 0.011, 0.021, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.011 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.004, 0.014, 0.024, 0.035 max_d=0.035 avg_d=0.014 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.017, 0.031, 0.045, 0.048 max_d=0.048 avg_d=0.031 std_dev=0.014
N4	A	0, 0.011, 0.031, 0.052, 0.064 max_d=0.064 avg_d=0.031 std_dev=0.020
C2'	B	0, 0.208, 0.386, 0.564, 0.585 max_d=0.585 avg_d=0.386 std_dev=0.178
O4'	A	0, -0.070, 0.133, 0.336, 0.659 max_d=0.659 avg_d=0.133 std_dev=0.203
O2'	B	0, 0.188, 0.401, 0.615, 0.737 max_d=0.737 avg_d=0.401 std_dev=0.214
C2'	A	0, -0.064, 0.151, 0.366, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.151 std_dev=0.215
C3'	B	0, 0.190, 0.409, 0.629, 0.837 max_d=0.837 avg_d=0.409 std_dev=0.220
C4'	B	0, 0.208, 0.432, 0.656, 0.836 max_d=0.836 avg_d=0.432 std_dev=0.224
O4'	B	0, 0.255, 0.490, 0.725, 0.827 max_d=0.827 avg_d=0.490 std_dev=0.235
C1'	B	0, 0.243, 0.478, 0.713, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.478 std_dev=0.235
O3'	B	0, 0.125, 0.403, 0.681, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.403 std_dev=0.278
C5'	B	0, 0.125, 0.492, 0.860, 1.366 max_d=1.366 avg_d=0.492 std_dev=0.367
N9	B	0, 0.248, 0.625, 1.003, 1.425 max_d=1.425 avg_d=0.625 std_dev=0.377
C4'	A	0, -0.182, 0.237, 0.655, 1.337 max_d=1.337 avg_d=0.237 std_dev=0.419
P	A	0, 0.024, 0.461, 0.899, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.461 std_dev=0.438
OP1	B	0, 0.273, 0.736, 1.199, 1.750 max_d=1.750 avg_d=0.736 std_dev=0.463
C3'	A	0, -0.233, 0.237, 0.707, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.237 std_dev=0.470
OP2	B	0, 0.078, 0.549, 1.020, 1.712 max_d=1.712 avg_d=0.549 std_dev=0.471
P	B	0, 0.125, 0.596, 1.067, 1.738 max_d=1.738 avg_d=0.596 std_dev=0.471
O5'	A	0, -0.097, 0.376, 0.849, 1.605 max_d=1.605 avg_d=0.376 std_dev=0.473
OP2	A	0, 0.042, 0.534, 1.026, 1.740 max_d=1.740 avg_d=0.534 std_dev=0.492
O5'	B	0, 0.058, 0.554, 1.050, 1.793 max_d=1.793 avg_d=0.554 std_dev=0.496
C4	B	0, 0.262, 0.762, 1.262, 1.882 max_d=1.882 avg_d=0.762 std_dev=0.500
C5'	A	0, -0.166, 0.335, 0.835, 1.642 max_d=1.642 avg_d=0.335 std_dev=0.501
OP1	A	0, 0.029, 0.553, 1.078, 1.818 max_d=1.818 avg_d=0.553 std_dev=0.524
O2'	A	0, -0.199, 0.356, 0.911, 1.809 max_d=1.809 avg_d=0.356 std_dev=0.555
C8	B	0, 0.161, 0.756, 1.351, 2.209 max_d=2.209 avg_d=0.756 std_dev=0.595
N3	B	0, 0.224, 0.833, 1.442, 2.239 max_d=2.239 avg_d=0.833 std_dev=0.609
C5	B	0, 0.250, 0.924, 1.598, 2.539 max_d=2.539 avg_d=0.924 std_dev=0.674
N7	B	0, 0.174, 0.935, 1.697, 2.821 max_d=2.821 avg_d=0.935 std_dev=0.762
C2	B	0, 0.213, 1.014, 1.815, 2.922 max_d=2.922 avg_d=1.014 std_dev=0.801
C6	B	0, 0.269, 1.103, 1.937, 3.121 max_d=3.121 avg_d=1.103 std_dev=0.834
O3'	A	0, -0.453, 0.399, 1.251, 2.649 max_d=2.649 avg_d=0.399 std_dev=0.852
N1	B	0, 0.252, 1.128, 2.003, 3.229 max_d=3.229 avg_d=1.128 std_dev=0.876
N6	B	0, 0.268, 1.296, 2.323, 3.831 max_d=3.831 avg_d=1.296 std_dev=1.028

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.02	0.24	0.00	0.03	0.05	0.19	0.11
C2	0.02	0.00	0.06	0.14	0.01	0.04	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.23	0.16	0.03	0.16	0.08	0.12	0.08
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.07	0.12	0.08	0.02	0.04	0.03	0.12	0.00	0.04	0.01	0.25	0.24	0.44	0.33
C3'	0.01	0.14	0.00	0.00	0.22	0.00	0.22	0.01	0.18	0.13	0.19	0.24	0.08	0.01	0.01	0.00	0.04	0.04	0.10	0.05
C4	0.01	0.01	0.03	0.22	0.00	0.10	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.28	0.02	0.01	0.30	0.20	0.26	0.22
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.10	0.00	0.12	0.00	0.11	0.06	0.07	0.10	0.02	0.20	0.01	0.00	0.01	0.05	0.07	0.04
C5	0.01	0.00	0.07	0.22	0.00	0.12	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.24	0.05	0.02	0.31	0.20	0.23	0.22
C5'	0.03	0.07	0.12	0.01	0.16	0.00	0.18	0.00	0.14	0.07	0.12	0.18	0.03	0.07	0.14	0.01	0.01	0.06	0.02	0.02
C6	0.00	0.00	0.08	0.18	0.01	0.11	0.00	0.14	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.18	0.02	0.04	0.23	0.12	0.11	0.12
N1	0.01	0.01	0.02	0.13	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.16	0.11	0.00	0.13	0.06	0.11	0.06
N3	0.02	0.00	0.04	0.19	0.00	0.07	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.28	0.09	0.03	0.24	0.15	0.19	0.16
N4	0.02	0.01	0.03	0.24	0.01	0.10	0.01	0.18	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.31	0.03	0.01	0.34	0.25	0.35	0.28
O2	0.02	0.00	0.12	0.08	0.01	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.20	0.27	0.05	0.09	0.05	0.12	0.06
O2'	0.02	0.23	0.00	0.01	0.28	0.20	0.24	0.07	0.18	0.16	0.28	0.31	0.20	0.00	0.05	0.16	0.18	0.14	0.50	0.28
O3'	0.24	0.16	0.04	0.01	0.02	0.01	0.05	0.14	0.02	0.11	0.09	0.03	0.27	0.05	0.00	0.16	0.17	0.25	0.17	0.15
O4'	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.16	0.16	0.00	0.03	0.05	0.10	0.05
O5'	0.03	0.16	0.25	0.04	0.30	0.01	0.31	0.01	0.23	0.13	0.24	0.34	0.09	0.18	0.17	0.03	0.00	0.02	0.01	0.01
OP1	0.05	0.08	0.24	0.04	0.20	0.05	0.20	0.06	0.12	0.06	0.15	0.25	0.05	0.14	0.25	0.05	0.02	0.00	0.01	0.00
OP2	0.19	0.12	0.44	0.10	0.26	0.07	0.23	0.02	0.11	0.11	0.19	0.35	0.12	0.50	0.17	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.08	0.33	0.05	0.22	0.04	0.22	0.02	0.12	0.06	0.16	0.28	0.06	0.28	0.15	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.11	0.24	0.09	0.19	0.08	0.25	0.23	0.42	0.15	0.46	0.10	0.22	0.27	0.47	0.20	0.20	0.16	0.20	0.52	0.53	0.48	0.50
C2	0.15	0.05	0.09	0.14	0.20	0.24	0.40	0.43	0.35	0.58	0.15	0.06	0.49	0.63	0.30	0.18	0.08	0.24	0.57	0.60	0.58	0.58
C2'	0.26	0.15	0.22	0.36	0.19	0.44	0.33	0.60	0.25	0.57	0.09	0.12	0.34	0.56	0.33	0.13	0.35	0.38	0.66	0.69	0.61	0.63
C3'	0.09	0.32	0.10	0.10	0.11	0.07	0.12	0.18	0.09	0.29	0.20	0.31	0.14	0.29	0.10	0.20	0.09	0.06	0.27	0.28	0.22	0.24
C4	0.18	0.17	0.09	0.09	0.31	0.20	0.51	0.38	0.49	0.63	0.32	0.13	0.63	0.71	0.36	0.17	0.11	0.26	0.57	0.61	0.60	0.61
C4'	0.09	0.34	0.09	0.13	0.11	0.09	0.12	0.20	0.10	0.31	0.21	0.33	0.15	0.31	0.10	0.22	0.12	0.06	0.30	0.31	0.25	0.28
C5	0.17	0.12	0.09	0.10	0.27	0.21	0.45	0.40	0.42	0.59	0.26	0.09	0.53	0.64	0.33	0.17	0.12	0.25	0.58	0.59	0.53	0.57
C5'	0.11	0.34	0.09	0.09	0.15	0.04	0.10	0.08	0.12	0.21	0.23	0.33	0.12	0.21	0.08	0.19	0.09	0.08	0.17	0.19	0.12	0.14
C6	0.14	0.05	0.08	0.14	0.18	0.24	0.35	0.43	0.30	0.53	0.12	0.06	0.41	0.55	0.28	0.18	0.07	0.24	0.55	0.55	0.48	0.52
N1	0.13	0.10	0.09	0.16	0.15	0.25	0.33	0.43	0.27	0.53	0.08	0.10	0.39	0.55	0.26	0.18	0.09	0.23	0.55	0.57	0.52	0.54
N3	0.17	0.10	0.09	0.11	0.27	0.22	0.48	0.41	0.45	0.62	0.26	0.08	0.60	0.70	0.34	0.17	0.07	0.25	0.58	0.61	0.60	0.61
N4	0.20	0.28	0.11	0.10	0.38	0.17	0.59	0.32	0.59	0.65	0.44	0.22	0.74	0.76	0.40	0.16	0.16	0.26	0.53	0.61	0.61	0.61
O2	0.14	0.09	0.09	0.15	0.17	0.25	0.38	0.43	0.32	0.57	0.11	0.10	0.47	0.62	0.28	0.18	0.10	0.24	0.57	0.60	0.58	0.58
O2'	0.14	0.40	0.11	0.27	0.08	0.41	0.16	0.66	0.07	0.47	0.25	0.34	0.15	0.44	0.19	0.23	0.26	0.32	0.70	0.81	0.79	0.74
O3'	0.16	0.42	0.12	0.07	0.16	0.06	0.09	0.13	0.08	0.28	0.26	0.41	0.14	0.30	0.07	0.30	0.06	0.11	0.29	0.29	0.30	0.30
O4'	0.08	0.30	0.10	0.16	0.08	0.17	0.18	0.31	0.11	0.39	0.16	0.29	0.21	0.40	0.15	0.24	0.13	0.12	0.41	0.42	0.36	0.39
O5'	0.07	0.24	0.05	0.02	0.09	0.03	0.04	0.04	0.06	0.15	0.16	0.23	0.06	0.14	0.03	0.10	0.02	0.05	0.08	0.11	0.11	0.04
OP1	0.13	0.20	0.03	0.03	0.13	0.17	0.09	0.16	0.12	0.06	0.16	0.20	0.09	0.05	0.09	0.09	0.02	0.19	0.12	0.06	0.24	0.13
OP2	0.07	0.09	0.07	0.03	0.07	0.05	0.08	0.05	0.07	0.11	0.07	0.09	0.08	0.10	0.07	0.11	0.01	0.06	0.04	0.04	0.23	0.09
P	0.05	0.14	0.03	0.01	0.06	0.06	0.03	0.05	0.04	0.10	0.09	0.14	0.04	0.09	0.02	0.04	0.00	0.06	0.03	0.06	0.19	0.06

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.04	0.00	0.05	0.23	0.06	0.07
C2	0.02	0.00	0.11	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.20	0.15	0.05	0.06	0.41	0.13	0.21
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.05	0.00	0.02	0.02	0.04	0.09	0.08	0.12	0.03	0.07	0.02	0.00	0.04	0.00	0.05	0.15	0.14	0.05
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.03	0.00	0.08	0.02	0.06	0.16	0.04	0.07	0.09	0.15	0.06	0.01	0.01	0.00	0.03	0.11	0.15	0.04
C4	0.01	0.00	0.05	0.03	0.00	0.03	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.10	0.04	0.03	0.06	0.34	0.12	0.18
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.08	0.03	0.02	0.06	0.08	0.04	0.02	0.01	0.00	0.01	0.16	0.07	0.03
C5	0.01	0.00	0.02	0.08	0.00	0.05	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.06	0.02	0.10	0.33	0.20	0.23
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.06	0.00	0.09	0.00	0.09	0.09	0.08	0.04	0.11	0.11	0.04	0.02	0.03	0.02	0.00	0.10	0.06	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.06	0.01	0.05	0.01	0.09	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.10	0.04	0.03	0.10	0.36	0.23	0.26
C8	0.01	0.00	0.09	0.16	0.00	0.08	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.05	0.17	0.02	0.09	0.21	0.16	0.17
N1	0.02	0.00	0.08	0.04	0.01	0.03	0.01	0.08	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.16	0.08	0.04	0.08	0.40	0.19	0.25
N3	0.01	0.00	0.12	0.07	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.20	0.15	0.05	0.05	0.38	0.10	0.18
N6	0.02	0.01	0.03	0.09	0.01	0.06	0.01	0.11	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.08	0.02	0.13	0.34	0.29	0.28
N7	0.00	0.00	0.07	0.15	0.00	0.08	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.16	0.01	0.13	0.25	0.24	0.24
N9	0.00	0.01	0.02	0.06	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.04	0.27	0.08	0.14
O2'	0.01	0.20	0.00	0.01	0.10	0.02	0.06	0.02	0.10	0.05	0.16	0.20	0.08	0.02	0.02	0.00	0.07	0.02	0.03	0.18	0.13	0.03
O3'	0.04	0.15	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.03	0.04	0.17	0.08	0.15	0.08	0.16	0.04	0.07	0.00	0.02	0.07	0.12	0.14	0.04
O4'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.03	0.00	0.02	0.02	0.03	0.02	0.04	0.05	0.02	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.06	0.24	0.07	0.09
O5'	0.05	0.06	0.05	0.03	0.06	0.01	0.10	0.00	0.10	0.09	0.08	0.05	0.13	0.13	0.04	0.03	0.07	0.06	0.00	0.03	0.01	0.01
OP1	0.23	0.41	0.15	0.11	0.34	0.16	0.33	0.10	0.36	0.21	0.40	0.38	0.34	0.25	0.27	0.18	0.12	0.24	0.03	0.00	0.01	0.00
OP2	0.06	0.13	0.14	0.15	0.12	0.07	0.20	0.06	0.23	0.16	0.19	0.10	0.29	0.24	0.08	0.13	0.14	0.07	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.21	0.05	0.04	0.18	0.03	0.23	0.01	0.26	0.17	0.25	0.18	0.28	0.24	0.14	0.03	0.04	0.09	0.01	0.00	0.00	0.00