Doublet Group distance statistics: 54032

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.000, 0.005, 0.010, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.005
N3	A	0, 0.000, 0.005, 0.011, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.000, 0.008, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.008
C6	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.019, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
O2	A	0, 0.000, 0.011, 0.022, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.011 std_dev=0.011
N1	A	0, 0.000, 0.018, 0.036, 0.036 max_d=0.036 avg_d=0.018 std_dev=0.018
N4	A	0, 0.000, 0.020, 0.040, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.020 std_dev=0.020
O4'	A	0, 0.000, 0.029, 0.058, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.029 std_dev=0.029
C2'	A	0, 0.000, 0.095, 0.189, 0.189 max_d=0.189 avg_d=0.095 std_dev=0.095
C4'	A	0, 0.000, 0.366, 0.732, 0.732 max_d=0.732 avg_d=0.366 std_dev=0.366
C5'	A	0, 0.000, 0.444, 0.888, 0.888 max_d=0.888 avg_d=0.444 std_dev=0.444
O3'	B	0, 0.000, 0.651, 1.303, 1.303 max_d=1.303 avg_d=0.651 std_dev=0.651
O2'	B	0, 0.000, 0.672, 1.344, 1.344 max_d=1.344 avg_d=0.672 std_dev=0.672
O2'	A	0, 0.000, 0.705, 1.411, 1.411 max_d=1.411 avg_d=0.705 std_dev=0.705
C3'	A	0, 0.000, 0.719, 1.439, 1.439 max_d=1.439 avg_d=0.719 std_dev=0.719
OP1	A	0, 0.000, 0.725, 1.451, 1.451 max_d=1.451 avg_d=0.725 std_dev=0.725
C2'	B	0, 0.000, 0.739, 1.477, 1.477 max_d=1.477 avg_d=0.739 std_dev=0.739
C3'	B	0, 0.000, 0.772, 1.545, 1.545 max_d=1.545 avg_d=0.772 std_dev=0.772
P	A	0, 0.000, 0.973, 1.947, 1.947 max_d=1.947 avg_d=0.973 std_dev=0.973
O5'	A	0, 0.000, 1.036, 2.073, 2.073 max_d=2.073 avg_d=1.036 std_dev=1.036
C1'	B	0, 0.000, 1.063, 2.127, 2.127 max_d=2.127 avg_d=1.063 std_dev=1.063
O5'	B	0, 0.000, 1.068, 2.137, 2.137 max_d=2.137 avg_d=1.068 std_dev=1.068
C4'	B	0, 0.000, 1.140, 2.279, 2.279 max_d=2.279 avg_d=1.140 std_dev=1.140
O4'	B	0, 0.000, 1.353, 2.705, 2.705 max_d=2.705 avg_d=1.353 std_dev=1.353
C5'	B	0, 0.000, 1.407, 2.814, 2.814 max_d=2.814 avg_d=1.407 std_dev=1.407
O3'	A	0, 0.000, 1.428, 2.857, 2.857 max_d=2.857 avg_d=1.428 std_dev=1.428
N9	B	0, 0.000, 1.489, 2.978, 2.978 max_d=2.978 avg_d=1.489 std_dev=1.489
OP2	A	0, 0.000, 1.709, 3.418, 3.418 max_d=3.418 avg_d=1.709 std_dev=1.709
N3	B	0, 0.000, 1.719, 3.438, 3.438 max_d=3.438 avg_d=1.719 std_dev=1.719
C4	B	0, 0.000, 1.778, 3.557, 3.557 max_d=3.557 avg_d=1.778 std_dev=1.778
C8	B	0, 0.000, 1.852, 3.703, 3.703 max_d=3.703 avg_d=1.852 std_dev=1.852
OP1	B	0, 0.000, 1.925, 3.850, 3.850 max_d=3.850 avg_d=1.925 std_dev=1.925
P	B	0, 0.000, 1.986, 3.973, 3.973 max_d=3.973 avg_d=1.986 std_dev=1.986
C2	B	0, 0.000, 2.287, 4.575, 4.575 max_d=4.575 avg_d=2.287 std_dev=2.287
N7	B	0, 0.000, 2.288, 4.575, 4.575 max_d=4.575 avg_d=2.288 std_dev=2.288
C5	B	0, 0.000, 2.289, 4.579, 4.579 max_d=4.579 avg_d=2.289 std_dev=2.289
OP2	B	0, 0.000, 2.476, 4.951, 4.951 max_d=4.951 avg_d=2.476 std_dev=2.476
C6	B	0, 0.000, 2.791, 5.581, 5.581 max_d=5.581 avg_d=2.791 std_dev=2.791
N1	B	0, 0.000, 2.796, 5.593, 5.593 max_d=5.593 avg_d=2.796 std_dev=2.796
N6	B	0, 0.000, 3.305, 6.610, 6.610 max_d=6.610 avg_d=3.305 std_dev=3.305

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.23	0.00	0.00	0.46	0.06	0.21
C2	0.01	0.00	0.02	0.07	0.00	0.03	0.01	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.25	0.01	0.25	0.50	0.41	0.03
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.16	0.03	0.01	0.01	0.01	0.04	0.00	0.00	0.02	0.29	0.46	0.23	0.45
C3'	0.02	0.07	0.00	0.00	0.24	0.00	0.32	0.00	0.31	0.15	0.13	0.25	0.06	0.01	0.01	0.01	0.04	0.04	0.06	0.04
C4	0.00	0.00	0.00	0.24	0.00	0.11	0.00	0.16	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.30	0.03	0.01	0.43	0.51	0.71	0.10
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.11	0.00	0.16	0.00	0.15	0.07	0.06	0.12	0.03	0.20	0.01	0.00	0.00	0.12	0.01	0.04
C5	0.00	0.01	0.02	0.32	0.00	0.16	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.29	0.20	0.02	0.45	0.50	0.71	0.09
C5'	0.03	0.08	0.16	0.00	0.16	0.00	0.18	0.00	0.15	0.08	0.12	0.18	0.03	0.03	0.16	0.01	0.00	0.09	0.09	0.00
C6	0.01	0.00	0.03	0.31	0.01	0.15	0.00	0.15	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.24	0.18	0.02	0.37	0.50	0.51	0.00
N1	0.00	0.00	0.01	0.15	0.00	0.07	0.00	0.08	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.17	0.08	0.01	0.23	0.49	0.34	0.08
N3	0.00	0.00	0.01	0.13	0.00	0.06	0.00	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.26	0.16	0.01	0.34	0.51	0.58	0.04
N4	0.00	0.00	0.01	0.25	0.00	0.12	0.01	0.18	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.33	0.05	0.01	0.47	0.50	0.81	0.15
O2	0.01	0.00	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.45	0.01	0.16	0.48	0.31	0.07
O2'	0.01	0.19	0.00	0.01	0.30	0.20	0.29	0.03	0.24	0.17	0.26	0.33	0.11	0.00	0.02	0.14	0.26	0.33	0.31	0.44
O3'	0.23	0.25	0.00	0.01	0.03	0.01	0.20	0.16	0.18	0.08	0.16	0.05	0.45	0.02	0.00	0.13	0.12	0.44	0.28	0.23
O4'	0.00	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.13	0.00	0.09	0.42	0.07	0.11
O5'	0.00	0.25	0.29	0.04	0.43	0.00	0.45	0.00	0.37	0.23	0.34	0.47	0.16	0.26	0.12	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.46	0.50	0.46	0.04	0.51	0.12	0.50	0.09	0.50	0.49	0.51	0.50	0.48	0.33	0.44	0.42	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.06	0.41	0.23	0.06	0.71	0.01	0.71	0.09	0.51	0.34	0.58	0.81	0.31	0.31	0.28	0.07	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.21	0.03	0.45	0.04	0.10	0.04	0.09	0.00	0.00	0.08	0.04	0.15	0.07	0.44	0.23	0.11	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.10	0.15	0.16	0.07	0.27	0.30	0.46	0.56	0.46	0.47	0.30	0.11	0.58	0.59	0.27	0.37	0.10	0.33	0.72	1.14	1.26	1.34
C2	0.37	0.68	0.08	0.28	0.78	0.44	1.11	0.66	1.20	0.92	0.98	0.55	1.37	1.17	0.69	0.27	0.04	0.53	0.70	1.04	1.33	1.28
C2'	0.01	0.16	0.27	0.00	0.03	0.31	0.09	0.61	0.04	0.25	0.08	0.16	0.12	0.26	0.06	0.37	0.10	0.30	0.72	1.08	1.06	1.25
C3'	0.17	0.06	0.06	0.29	0.00	0.51	0.06	0.68	0.12	0.05	0.11	0.00	0.16	0.04	0.07	0.07	0.33	0.42	0.98	1.37	1.38	1.58
C4	0.42	1.13	0.22	0.34	0.99	0.37	1.24	0.53	1.42	0.90	1.37	0.90	1.51	1.15	0.77	0.22	0.10	0.45	0.59	0.82	1.46	1.16
C4'	0.00	0.07	0.15	0.01	0.06	0.19	0.10	0.38	0.12	0.07	0.10	0.04	0.15	0.11	0.04	0.21	0.04	0.18	0.81	1.34	1.45	1.52
C5	0.28	0.87	0.14	0.29	0.77	0.27	0.94	0.43	1.06	0.68	1.03	0.71	1.13	0.87	0.59	0.30	0.08	0.31	0.56	0.77	1.52	1.16
C5'	0.26	0.06	0.32	0.28	0.08	0.21	0.06	0.12	0.03	0.23	0.09	0.01	0.06	0.15	0.20	0.35	0.28	0.20	0.45	0.97	1.37	1.21
C6	0.18	0.55	0.00	0.21	0.55	0.26	0.72	0.45	0.79	0.56	0.71	0.44	0.87	0.72	0.44	0.36	0.01	0.28	0.62	0.89	1.52	1.24
N1	0.24	0.47	0.01	0.21	0.56	0.36	0.80	0.58	0.83	0.70	0.67	0.38	0.95	0.87	0.50	0.33	0.00	0.41	0.70	1.03	1.39	1.31
N3	0.45	1.02	0.18	0.34	0.99	0.44	1.32	0.63	1.50	1.00	1.35	0.80	1.66	1.28	0.81	0.23	0.08	0.54	0.65	0.93	1.38	1.22
N4	0.47	1.38	0.30	0.37	1.10	0.37	1.34	0.51	1.58	0.94	1.62	1.07	1.68	1.21	0.83	0.16	0.13	0.45	0.54	0.73	1.46	1.10
O2	0.38	0.56	0.06	0.26	0.72	0.48	1.09	0.72	1.16	0.96	0.87	0.45	1.42	1.22	0.68	0.26	0.02	0.58	0.73	1.12	1.22	1.29
O2'	0.36	0.87	0.60	0.20	0.62	0.19	0.49	0.62	0.60	0.09	0.78	0.81	0.46	0.14	0.39	0.66	0.20	0.09	0.65	1.20	0.82	1.18
O3'	0.37	0.31	0.26	0.58	0.11	0.95	0.27	1.23	0.45	0.09	0.45	0.13	0.58	0.18	0.12	0.33	0.67	0.77	1.61	2.14	1.68	2.22
O4'	0.00	0.22	0.21	0.04	0.22	0.14	0.37	0.38	0.43	0.30	0.35	0.14	0.54	0.42	0.17	0.40	0.20	0.17	0.71	1.20	1.40	1.41
O5'	0.43	0.06	0.37	0.44	0.20	0.51	0.22	0.54	0.09	0.51	0.04	0.04	0.09	0.41	0.39	0.32	0.32	0.48	0.01	0.38	1.08	0.71
OP1	0.69	0.29	0.71	0.67	0.46	0.65	0.43	0.50	0.32	0.61	0.26	0.38	0.29	0.51	0.60	0.75	0.71	0.67	0.26	0.76	1.64	1.04
OP2	0.48	0.32	0.22	0.50	0.12	0.91	0.20	1.17	0.00	0.67	0.24	0.18	0.05	0.52	0.43	0.07	0.30	0.80	0.60	0.63	0.61	0.09
P	0.80	0.15	0.71	0.84	0.47	0.97	0.46	0.95	0.29	0.80	0.15	0.29	0.28	0.65	0.70	0.67	0.80	0.92	0.30	0.06	1.04	0.43

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.03	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.02	0.02	0.01	0.03	0.03	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.34	0.35	0.10	0.13
C2	0.03	0.00	0.17	0.20	0.01	0.09	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.12	0.25	0.01	0.40	0.21	0.04	0.09
C2'	0.00	0.17	0.00	0.00	0.10	0.00	0.06	0.02	0.09	0.04	0.14	0.17	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.07	0.60	0.26
C3'	0.01	0.20	0.00	0.00	0.11	0.01	0.08	0.02	0.12	0.04	0.17	0.18	0.10	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.13	0.07	0.77	0.47
C4	0.02	0.01	0.10	0.11	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.13	0.01	0.47	0.32	0.15	0.21
C4'	0.00	0.09	0.00	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.02	0.08	0.08	0.05	0.01	0.01	0.03	0.02	0.00	0.01	0.22	0.36	0.13
C5	0.02	0.00	0.06	0.08	0.00	0.03	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.10	0.03	0.56	0.36	0.44	0.34
C5'	0.02	0.04	0.02	0.02	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.08	0.02	0.03	0.01	0.07	0.04	0.02	0.01	0.01	0.00	0.27	0.03	0.01
C6	0.02	0.01	0.09	0.12	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.02	0.05	0.16	0.03	0.54	0.31	0.41	0.30
C8	0.01	0.00	0.04	0.04	0.01	0.02	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.03	0.04	0.05	0.63	0.48	0.61	0.46
N1	0.03	0.00	0.14	0.17	0.01	0.08	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.09	0.23	0.02	0.47	0.24	0.18	0.19
N3	0.03	0.00	0.17	0.18	0.00	0.08	0.01	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.02	0.02	0.01	0.11	0.22	0.01	0.37	0.23	0.10	0.08
N6	0.03	0.02	0.08	0.10	0.00	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.04	0.14	0.04	0.57	0.33	0.60	0.38
N7	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.00	0.00	0.00	0.02	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.04	0.64	0.45	0.74	0.49
N9	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.00	0.00	0.00	0.03	0.02	0.50	0.39	0.21	0.27
O2'	0.00	0.12	0.00	0.01	0.05	0.03	0.03	0.02	0.05	0.03	0.09	0.11	0.04	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.01	0.85	0.37
O3'	0.00	0.25	0.00	0.00	0.13	0.02	0.10	0.01	0.16	0.04	0.23	0.22	0.14	0.01	0.03	0.00	0.00	0.03	0.41	0.34	1.35	0.83
O4'	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.05	0.02	0.01	0.04	0.04	0.02	0.00	0.03	0.00	0.38	0.47	0.06	0.26
O5'	0.34	0.40	0.06	0.13	0.47	0.01	0.56	0.00	0.54	0.63	0.47	0.37	0.57	0.64	0.50	0.07	0.41	0.38	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.35	0.21	0.07	0.07	0.32	0.22	0.36	0.27	0.31	0.48	0.24	0.23	0.33	0.45	0.39	0.01	0.34	0.47	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.10	0.04	0.60	0.77	0.15	0.36	0.44	0.03	0.41	0.61	0.18	0.10	0.60	0.74	0.21	0.85	1.35	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.13	0.09	0.26	0.47	0.21	0.13	0.34	0.01	0.30	0.46	0.19	0.08	0.38	0.49	0.27	0.37	0.83	0.26	0.00	0.00	0.00	0.00