Doublet Group distance statistics: 54049

back

Distances from reference structure (by RMSD)

5, 12, 7, 4, 2, 1, 2, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.003, 0.005, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.003 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.001, 0.003, 0.006, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.003 std_dev=0.002
N1	A	0, 0.001, 0.004, 0.007, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.004 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.003, 0.007, 0.011, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.002, 0.007, 0.011, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.005
C1'	A	0, 0.004, 0.008, 0.013, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.008 std_dev=0.005
O2	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.039 max_d=0.039 avg_d=0.016 std_dev=0.011
N4	A	0, 0.007, 0.022, 0.037, 0.055 max_d=0.055 avg_d=0.022 std_dev=0.015
O4'	A	0, -0.031, 0.076, 0.183, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.076 std_dev=0.107
C2'	A	0, -0.024, 0.086, 0.195, 0.688 max_d=0.688 avg_d=0.086 std_dev=0.110
C3'	B	0, 0.109, 0.237, 0.366, 0.549 max_d=0.549 avg_d=0.237 std_dev=0.129
O3'	B	0, 0.062, 0.212, 0.363, 0.843 max_d=0.843 avg_d=0.212 std_dev=0.150
C4'	B	0, 0.115, 0.271, 0.427, 0.660 max_d=0.660 avg_d=0.271 std_dev=0.156
C5'	B	0, 0.134, 0.303, 0.473, 0.731 max_d=0.731 avg_d=0.303 std_dev=0.170
C2'	B	0, 0.083, 0.278, 0.473, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.278 std_dev=0.195
C4'	A	0, -0.079, 0.120, 0.320, 1.250 max_d=1.250 avg_d=0.120 std_dev=0.200
C5'	A	0, -0.022, 0.179, 0.381, 1.260 max_d=1.260 avg_d=0.179 std_dev=0.201
O5'	B	0, 0.122, 0.341, 0.559, 0.816 max_d=0.816 avg_d=0.341 std_dev=0.219
O2'	B	0, 0.054, 0.276, 0.497, 0.890 max_d=0.890 avg_d=0.276 std_dev=0.221
O5'	A	0, -0.030, 0.195, 0.420, 1.421 max_d=1.421 avg_d=0.195 std_dev=0.225
O2'	A	0, -0.094, 0.144, 0.381, 1.475 max_d=1.475 avg_d=0.144 std_dev=0.238
O4'	B	0, 0.105, 0.343, 0.580, 1.055 max_d=1.055 avg_d=0.343 std_dev=0.238
C3'	A	0, -0.131, 0.130, 0.390, 1.627 max_d=1.627 avg_d=0.130 std_dev=0.260
P	A	0, -0.043, 0.222, 0.488, 1.654 max_d=1.654 avg_d=0.222 std_dev=0.265
C1'	B	0, 0.092, 0.361, 0.630, 1.252 max_d=1.252 avg_d=0.361 std_dev=0.269
P	B	0, 0.080, 0.378, 0.677, 1.647 max_d=1.647 avg_d=0.378 std_dev=0.298
OP1	A	0, -0.059, 0.279, 0.616, 2.106 max_d=2.106 avg_d=0.279 std_dev=0.338
N1	B	0, 0.136, 0.484, 0.833, 1.805 max_d=1.805 avg_d=0.484 std_dev=0.348
OP1	B	0, -0.008, 0.364, 0.736, 2.257 max_d=2.257 avg_d=0.364 std_dev=0.372
C6	B	0, 0.188, 0.563, 0.938, 1.869 max_d=1.869 avg_d=0.563 std_dev=0.375
OP2	A	0, -0.132, 0.278, 0.689, 2.537 max_d=2.537 avg_d=0.278 std_dev=0.410
OP2	B	0, 0.054, 0.469, 0.883, 2.506 max_d=2.506 avg_d=0.469 std_dev=0.414
C2	B	0, 0.131, 0.563, 0.995, 2.324 max_d=2.324 avg_d=0.563 std_dev=0.432
O2	B	0, 0.107, 0.544, 0.980, 2.281 max_d=2.281 avg_d=0.544 std_dev=0.437
C5	B	0, 0.221, 0.697, 1.174, 2.447 max_d=2.447 avg_d=0.697 std_dev=0.476
O3'	A	0, -0.313, 0.166, 0.645, 2.944 max_d=2.944 avg_d=0.166 std_dev=0.479
N3	B	0, 0.162, 0.690, 1.217, 2.884 max_d=2.884 avg_d=0.690 std_dev=0.527
C4	B	0, 0.201, 0.750, 1.299, 2.960 max_d=2.960 avg_d=0.750 std_dev=0.549
N4	B	0, 0.228, 0.886, 1.545, 3.546 max_d=3.546 avg_d=0.886 std_dev=0.658

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.12	0.00	0.13	0.12	0.20	0.15
C2	0.01	0.00	0.05	0.10	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.04	0.01	0.18	0.18	0.33	0.22
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.07	0.04	0.01	0.04	0.02	0.09	0.00	0.01	0.01	0.26	0.25	0.27	0.25
C3'	0.00	0.10	0.00	0.00	0.14	0.00	0.13	0.01	0.10	0.08	0.13	0.15	0.08	0.01	0.00	0.01	0.12	0.14	0.08	0.08
C4	0.01	0.00	0.02	0.14	0.00	0.05	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.05	0.01	0.20	0.23	0.40	0.26
C4'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.04	0.03	0.05	0.06	0.03	0.11	0.01	0.00	0.01	0.07	0.09	0.03
C5	0.01	0.00	0.03	0.13	0.00	0.05	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.06	0.01	0.19	0.22	0.38	0.25
C5'	0.03	0.04	0.07	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.05	0.07	0.03	0.04	0.09	0.01	0.00	0.12	0.17	0.01
C6	0.00	0.00	0.04	0.10	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.03	0.02	0.18	0.19	0.32	0.23
N1	0.00	0.00	0.01	0.08	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.04	0.01	0.17	0.17	0.29	0.21
N3	0.01	0.00	0.04	0.13	0.00	0.05	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.13	0.03	0.01	0.20	0.21	0.38	0.25
N4	0.01	0.00	0.02	0.15	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.07	0.01	0.20	0.24	0.42	0.26
O2	0.01	0.00	0.09	0.08	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.11	0.08	0.02	0.17	0.17	0.31	0.21
O2'	0.01	0.11	0.00	0.01	0.13	0.11	0.11	0.04	0.08	0.08	0.13	0.14	0.11	0.00	0.02	0.08	0.14	0.13	0.24	0.16
O3'	0.12	0.04	0.01	0.00	0.05	0.01	0.06	0.09	0.03	0.04	0.03	0.07	0.08	0.02	0.00	0.09	0.03	0.04	0.17	0.05
O4'	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.09	0.00	0.03	0.07	0.07	0.08
O5'	0.13	0.18	0.26	0.12	0.20	0.01	0.19	0.00	0.18	0.17	0.20	0.20	0.17	0.14	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.12	0.18	0.25	0.14	0.23	0.07	0.22	0.12	0.19	0.17	0.21	0.24	0.17	0.13	0.04	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.20	0.33	0.27	0.08	0.40	0.09	0.38	0.17	0.32	0.29	0.38	0.42	0.31	0.24	0.17	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.15	0.22	0.25	0.08	0.26	0.03	0.25	0.01	0.23	0.21	0.25	0.26	0.21	0.16	0.05	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.17	0.15	0.15	0.21	0.17	0.24	0.16	0.22	0.18	0.18	0.22	0.17	0.19	0.17	0.19	0.19	0.35	0.25	0.24
C2	0.22	0.22	0.19	0.16	0.21	0.18	0.23	0.16	0.23	0.21	0.21	0.22	0.24	0.24	0.19	0.23	0.17	0.32	0.20	0.20
C2'	0.12	0.14	0.13	0.18	0.23	0.13	0.26	0.18	0.23	0.16	0.17	0.26	0.12	0.13	0.21	0.12	0.25	0.43	0.37	0.32
C3'	0.09	0.13	0.08	0.12	0.25	0.12	0.29	0.21	0.25	0.15	0.18	0.29	0.10	0.15	0.10	0.11	0.30	0.55	0.48	0.43
C4	0.24	0.25	0.21	0.16	0.23	0.17	0.23	0.15	0.23	0.24	0.25	0.23	0.28	0.26	0.19	0.23	0.16	0.26	0.15	0.16
C4'	0.12	0.17	0.10	0.14	0.27	0.13	0.31	0.22	0.26	0.18	0.21	0.30	0.13	0.10	0.10	0.13	0.30	0.49	0.44	0.40
C5	0.23	0.23	0.21	0.17	0.22	0.17	0.22	0.14	0.22	0.22	0.22	0.22	0.25	0.25	0.19	0.22	0.16	0.24	0.15	0.16
C5'	0.14	0.21	0.11	0.16	0.31	0.14	0.34	0.23	0.30	0.22	0.25	0.34	0.17	0.04	0.06	0.16	0.33	0.46	0.46	0.41
C6	0.20	0.20	0.19	0.17	0.21	0.17	0.22	0.15	0.22	0.20	0.19	0.21	0.21	0.23	0.20	0.20	0.17	0.26	0.18	0.18
N1	0.20	0.19	0.18	0.16	0.21	0.17	0.23	0.16	0.22	0.20	0.19	0.21	0.20	0.22	0.19	0.21	0.18	0.31	0.21	0.20
N3	0.24	0.24	0.20	0.16	0.23	0.18	0.23	0.15	0.23	0.23	0.24	0.23	0.27	0.25	0.19	0.23	0.16	0.29	0.17	0.18
N4	0.26	0.28	0.22	0.16	0.26	0.17	0.24	0.14	0.24	0.25	0.28	0.26	0.32	0.26	0.18	0.24	0.15	0.24	0.14	0.15
O2	0.22	0.21	0.18	0.16	0.21	0.18	0.23	0.16	0.23	0.21	0.21	0.22	0.23	0.23	0.19	0.23	0.18	0.35	0.22	0.22
O2'	0.15	0.13	0.12	0.12	0.19	0.16	0.23	0.14	0.21	0.15	0.15	0.21	0.13	0.16	0.16	0.19	0.15	0.25	0.21	0.16
O3'	0.13	0.16	0.10	0.13	0.29	0.16	0.33	0.27	0.28	0.19	0.21	0.32	0.12	0.13	0.09	0.16	0.34	0.59	0.52	0.49
O4'	0.15	0.16	0.14	0.15	0.23	0.15	0.25	0.18	0.23	0.18	0.19	0.24	0.15	0.16	0.14	0.16	0.21	0.35	0.28	0.26
O5'	0.04	0.07	0.02	0.02	0.16	0.12	0.20	0.16	0.17	0.08	0.11	0.19	0.09	0.03	0.01	0.10	0.14	0.08	0.12	0.09
OP1	0.05	0.14	0.10	0.03	0.18	0.11	0.21	0.23	0.18	0.10	0.16	0.20	0.18	0.11	0.01	0.07	0.26	0.29	0.21	0.26
OP2	0.08	0.12	0.11	0.02	0.11	0.03	0.14	0.11	0.13	0.08	0.11	0.12	0.20	0.16	0.01	0.03	0.16	0.15	0.15	0.15
P	0.03	0.09	0.07	0.01	0.13	0.07	0.17	0.14	0.14	0.07	0.10	0.15	0.14	0.08	0.00	0.04	0.16	0.13	0.12	0.13

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.05	0.06	0.09	0.06
C2	0.01	0.00	0.04	0.05	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.01	0.14	0.15	0.24	0.18
C2'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.04	0.01	0.03	0.03	0.07	0.00	0.01	0.00	0.04	0.07	0.07	0.04
C3'	0.01	0.05	0.00	0.00	0.09	0.00	0.11	0.01	0.10	0.05	0.06	0.09	0.06	0.01	0.00	0.01	0.04	0.08	0.05	0.03
C4	0.01	0.00	0.02	0.09	0.00	0.07	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.09	0.02	0.22	0.28	0.37	0.30
C4'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.09	0.04	0.04	0.08	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.06	0.02	0.01
C5	0.01	0.00	0.04	0.11	0.00	0.09	0.00	0.17	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.12	0.02	0.24	0.30	0.37	0.31
C5'	0.02	0.07	0.01	0.01	0.15	0.00	0.17	0.00	0.15	0.08	0.11	0.16	0.04	0.02	0.02	0.01	0.00	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.10	0.00	0.09	0.00	0.15	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.11	0.02	0.20	0.22	0.27	0.24
N1	0.00	0.00	0.01	0.05	0.00	0.04	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.05	0.01	0.13	0.13	0.20	0.16
N3	0.01	0.00	0.03	0.06	0.00	0.04	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.06	0.06	0.02	0.18	0.21	0.31	0.24
N4	0.01	0.00	0.03	0.09	0.00	0.08	0.00	0.16	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.10	0.02	0.24	0.33	0.42	0.34
O2	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.08	0.02	0.10	0.11	0.20	0.14
O2'	0.01	0.06	0.00	0.01	0.03	0.02	0.02	0.02	0.02	0.02	0.06	0.03	0.10	0.00	0.02	0.03	0.03	0.08	0.06	0.03
O3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.01	0.12	0.02	0.11	0.05	0.06	0.10	0.08	0.02	0.00	0.01	0.06	0.10	0.07	0.05
O4'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.00	0.04	0.05	0.05	0.03
O5'	0.05	0.14	0.04	0.04	0.22	0.01	0.24	0.00	0.20	0.13	0.18	0.24	0.10	0.03	0.06	0.04	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.06	0.15	0.07	0.08	0.28	0.06	0.30	0.05	0.22	0.13	0.21	0.33	0.11	0.08	0.10	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.09	0.24	0.07	0.05	0.37	0.02	0.37	0.01	0.27	0.20	0.31	0.42	0.20	0.06	0.07	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.06	0.18	0.04	0.03	0.30	0.01	0.31	0.01	0.24	0.16	0.24	0.34	0.14	0.03	0.05	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00