Doublet Group distance statistics: 54050

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 2, 4, 6, 5, 3, 1, 2, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.004, 0.005, 0.007 max_d=0.007 avg_d=0.004 std_dev=0.001
N3	A	0, 0.004, 0.006, 0.008, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.006 std_dev=0.002
N1	A	0, 0.003, 0.005, 0.007, 0.008 max_d=0.008 avg_d=0.005 std_dev=0.002
C6	A	0, 0.004, 0.008, 0.011, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C4	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.014 max_d=0.014 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.005, 0.009, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.004
C1'	A	0, 0.005, 0.009, 0.013, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.009 std_dev=0.004
O2	A	0, 0.016, 0.028, 0.040, 0.046 max_d=0.046 avg_d=0.028 std_dev=0.012
N4	A	0, 0.010, 0.023, 0.036, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.023 std_dev=0.013
O4'	A	0, -0.021, 0.135, 0.290, 0.823 max_d=0.823 avg_d=0.135 std_dev=0.156
C2'	A	0, -0.020, 0.144, 0.308, 0.865 max_d=0.865 avg_d=0.144 std_dev=0.164
O2'	B	0, 0.208, 0.391, 0.575, 0.787 max_d=0.787 avg_d=0.391 std_dev=0.184
C4'	B	0, 0.279, 0.478, 0.677, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.478 std_dev=0.199
C3'	B	0, 0.223, 0.433, 0.644, 0.859 max_d=0.859 avg_d=0.433 std_dev=0.211
O3'	B	0, 0.209, 0.425, 0.641, 1.117 max_d=1.117 avg_d=0.425 std_dev=0.216
O5'	A	0, 0.138, 0.356, 0.575, 0.936 max_d=0.936 avg_d=0.356 std_dev=0.219
O4'	B	0, 0.345, 0.575, 0.805, 0.992 max_d=0.992 avg_d=0.575 std_dev=0.230
C2'	B	0, 0.198, 0.435, 0.673, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.435 std_dev=0.238
C1'	B	0, 0.322, 0.571, 0.819, 1.062 max_d=1.062 avg_d=0.571 std_dev=0.249
C5'	B	0, 0.310, 0.576, 0.841, 1.026 max_d=1.026 avg_d=0.576 std_dev=0.265
P	A	0, 0.187, 0.471, 0.755, 1.433 max_d=1.433 avg_d=0.471 std_dev=0.284
C4'	A	0, -0.070, 0.217, 0.505, 1.556 max_d=1.556 avg_d=0.217 std_dev=0.288
O5'	B	0, 0.342, 0.645, 0.947, 1.189 max_d=1.189 avg_d=0.645 std_dev=0.302
O2'	A	0, -0.105, 0.203, 0.512, 1.682 max_d=1.682 avg_d=0.203 std_dev=0.309
C3'	A	0, -0.080, 0.242, 0.565, 1.740 max_d=1.740 avg_d=0.242 std_dev=0.322
OP1	A	0, 0.235, 0.563, 0.892, 1.616 max_d=1.616 avg_d=0.563 std_dev=0.328
N1	B	0, 0.357, 0.696, 1.034, 1.367 max_d=1.367 avg_d=0.696 std_dev=0.339
C5'	A	0, -0.016, 0.333, 0.682, 1.865 max_d=1.865 avg_d=0.333 std_dev=0.349
P	B	0, 0.404, 0.760, 1.116, 1.549 max_d=1.549 avg_d=0.760 std_dev=0.356
C6	B	0, 0.393, 0.756, 1.119, 1.547 max_d=1.547 avg_d=0.756 std_dev=0.363
OP1	B	0, 0.400, 0.791, 1.181, 1.785 max_d=1.785 avg_d=0.791 std_dev=0.391
O2	B	0, 0.351, 0.768, 1.186, 1.743 max_d=1.743 avg_d=0.768 std_dev=0.417
OP2	A	0, 0.143, 0.566, 0.990, 2.316 max_d=2.316 avg_d=0.566 std_dev=0.423
C2	B	0, 0.349, 0.780, 1.212, 1.658 max_d=1.658 avg_d=0.780 std_dev=0.432
OP2	B	0, 0.441, 0.874, 1.307, 1.849 max_d=1.849 avg_d=0.874 std_dev=0.433
C5	B	0, 0.417, 0.885, 1.352, 1.831 max_d=1.831 avg_d=0.885 std_dev=0.467
O3'	A	0, -0.161, 0.378, 0.918, 2.926 max_d=2.926 avg_d=0.378 std_dev=0.539
N3	B	0, 0.363, 0.904, 1.444, 2.173 max_d=2.173 avg_d=0.904 std_dev=0.540
C4	B	0, 0.402, 0.954, 1.507, 2.254 max_d=2.254 avg_d=0.954 std_dev=0.553
N4	B	0, 0.418, 1.088, 1.758, 2.882 max_d=2.882 avg_d=1.088 std_dev=0.670

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.14	0.00	0.14	0.14	0.29	0.20
C2	0.01	0.00	0.08	0.15	0.00	0.06	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.11	0.08	0.02	0.16	0.20	0.40	0.25
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.03	0.00	0.05	0.08	0.06	0.01	0.06	0.03	0.14	0.00	0.01	0.01	0.31	0.30	0.42	0.34
C3'	0.00	0.15	0.00	0.00	0.17	0.00	0.15	0.01	0.12	0.10	0.17	0.19	0.14	0.00	0.00	0.01	0.17	0.16	0.11	0.13
C4	0.01	0.00	0.03	0.17	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.16	0.08	0.01	0.17	0.25	0.44	0.28
C4'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.08	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.07	0.08	0.06	0.13	0.01	0.00	0.00	0.07	0.04	0.04
C5	0.00	0.00	0.05	0.15	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.15	0.07	0.02	0.17	0.25	0.44	0.28
C5'	0.02	0.06	0.08	0.01	0.09	0.00	0.09	0.00	0.07	0.04	0.09	0.11	0.07	0.04	0.10	0.01	0.00	0.13	0.17	0.01
C6	0.00	0.00	0.06	0.12	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.12	0.05	0.02	0.17	0.23	0.41	0.27
N1	0.00	0.00	0.01	0.10	0.00	0.04	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.10	0.04	0.01	0.16	0.19	0.37	0.25
N3	0.01	0.00	0.06	0.17	0.00	0.07	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.08	0.01	0.17	0.23	0.43	0.27
N4	0.01	0.00	0.03	0.19	0.00	0.08	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.10	0.01	0.17	0.26	0.44	0.28
O2	0.01	0.00	0.14	0.14	0.00	0.06	0.00	0.07	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.08	0.13	0.03	0.16	0.18	0.37	0.23
O2'	0.01	0.11	0.00	0.00	0.16	0.13	0.15	0.04	0.12	0.10	0.14	0.17	0.08	0.00	0.02	0.09	0.17	0.16	0.38	0.23
O3'	0.14	0.08	0.01	0.00	0.08	0.01	0.07	0.10	0.05	0.04	0.08	0.10	0.13	0.02	0.00	0.09	0.04	0.06	0.10	0.04
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.09	0.09	0.00	0.03	0.07	0.11	0.09
O5'	0.14	0.16	0.31	0.17	0.17	0.00	0.17	0.00	0.17	0.16	0.17	0.17	0.16	0.17	0.04	0.03	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.14	0.20	0.30	0.16	0.25	0.07	0.25	0.13	0.23	0.19	0.23	0.26	0.18	0.16	0.06	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.29	0.40	0.42	0.11	0.44	0.04	0.44	0.17	0.41	0.37	0.43	0.44	0.37	0.38	0.10	0.11	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.20	0.25	0.34	0.13	0.28	0.04	0.28	0.01	0.27	0.25	0.27	0.28	0.23	0.23	0.04	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.13	0.12	0.08	0.12	0.13	0.13	0.16	0.18	0.14	0.12	0.12	0.14	0.16	0.14	0.19	0.16	0.20	0.42	0.32	0.30
C2	0.14	0.16	0.07	0.13	0.12	0.15	0.13	0.22	0.13	0.13	0.14	0.12	0.21	0.11	0.21	0.17	0.22	0.42	0.29	0.29
C2'	0.12	0.14	0.13	0.20	0.23	0.13	0.26	0.20	0.23	0.16	0.17	0.26	0.12	0.10	0.27	0.14	0.26	0.51	0.44	0.39
C3'	0.11	0.12	0.08	0.13	0.25	0.14	0.31	0.24	0.26	0.15	0.17	0.29	0.12	0.16	0.11	0.14	0.32	0.63	0.55	0.51
C4	0.15	0.19	0.09	0.12	0.14	0.15	0.12	0.19	0.12	0.14	0.18	0.14	0.24	0.11	0.19	0.16	0.17	0.34	0.21	0.22
C4'	0.14	0.18	0.10	0.15	0.29	0.17	0.33	0.27	0.29	0.20	0.22	0.32	0.14	0.13	0.11	0.18	0.34	0.59	0.52	0.49
C5	0.13	0.15	0.08	0.11	0.10	0.13	0.09	0.15	0.09	0.11	0.14	0.10	0.21	0.11	0.19	0.14	0.14	0.30	0.19	0.19
C5'	0.17	0.24	0.12	0.18	0.38	0.20	0.42	0.29	0.37	0.26	0.30	0.41	0.18	0.11	0.07	0.21	0.38	0.63	0.61	0.55
C6	0.13	0.13	0.07	0.10	0.09	0.12	0.10	0.15	0.10	0.11	0.11	0.09	0.18	0.13	0.20	0.15	0.15	0.33	0.22	0.21
N1	0.13	0.13	0.07	0.12	0.10	0.13	0.12	0.18	0.11	0.11	0.11	0.10	0.17	0.12	0.21	0.15	0.19	0.39	0.27	0.27
N3	0.16	0.19	0.09	0.13	0.14	0.17	0.13	0.22	0.13	0.15	0.18	0.14	0.24	0.11	0.21	0.18	0.21	0.39	0.25	0.26
N4	0.17	0.22	0.11	0.13	0.18	0.16	0.15	0.19	0.14	0.17	0.22	0.19	0.28	0.12	0.18	0.17	0.17	0.32	0.19	0.21
O2	0.15	0.16	0.08	0.14	0.14	0.16	0.15	0.24	0.15	0.14	0.15	0.14	0.21	0.11	0.21	0.18	0.24	0.45	0.32	0.33
O2'	0.14	0.13	0.09	0.11	0.15	0.15	0.17	0.19	0.15	0.13	0.13	0.16	0.14	0.11	0.20	0.21	0.18	0.34	0.28	0.24
O3'	0.14	0.17	0.09	0.15	0.30	0.20	0.35	0.32	0.31	0.20	0.21	0.33	0.13	0.13	0.10	0.20	0.38	0.66	0.58	0.56
O4'	0.12	0.12	0.09	0.12	0.17	0.13	0.20	0.19	0.18	0.13	0.13	0.18	0.13	0.14	0.15	0.15	0.23	0.43	0.34	0.33
O5'	0.08	0.11	0.04	0.05	0.16	0.17	0.17	0.23	0.14	0.10	0.14	0.19	0.11	0.06	0.01	0.15	0.18	0.24	0.25	0.20
OP1	0.07	0.17	0.13	0.01	0.17	0.13	0.14	0.26	0.12	0.11	0.19	0.19	0.19	0.14	0.01	0.07	0.27	0.25	0.23	0.24
OP2	0.10	0.13	0.13	0.04	0.10	0.03	0.10	0.12	0.10	0.09	0.13	0.10	0.17	0.18	0.00	0.03	0.15	0.17	0.18	0.15
P	0.03	0.10	0.08	0.00	0.10	0.09	0.10	0.17	0.09	0.06	0.11	0.12	0.12	0.09	0.00	0.05	0.16	0.15	0.17	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.03	0.05	0.05	0.03
C2	0.00	0.00	0.05	0.06	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.07	0.02	0.07	0.09	0.12	0.09
C2'	0.00	0.05	0.00	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.04	0.01	0.04	0.02	0.09	0.00	0.01	0.00	0.02	0.10	0.07	0.04
C3'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.06	0.03	0.06	0.05	0.08	0.00	0.00	0.00	0.03	0.12	0.09	0.06
C4	0.00	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.06	0.01	0.09	0.13	0.16	0.13
C4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.02	0.03	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.06	0.03	0.01
C5	0.00	0.00	0.03	0.05	0.00	0.04	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.07	0.02	0.09	0.13	0.15	0.13
C5'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.06	0.00	0.07	0.00	0.06	0.03	0.05	0.07	0.02	0.02	0.02	0.00	0.00	0.04	0.01	0.01
C6	0.00	0.00	0.04	0.06	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.03	0.08	0.10	0.11	0.10
N1	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.06	0.08	0.09	0.07
N3	0.00	0.00	0.04	0.06	0.00	0.02	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.07	0.02	0.08	0.11	0.15	0.11
N4	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.01	0.10	0.15	0.18	0.14
O2	0.01	0.00	0.09	0.08	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.07	0.10	0.03	0.06	0.08	0.11	0.07
O2'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.01	0.03	0.01	0.07	0.00	0.02	0.02	0.02	0.10	0.06	0.03
O3'	0.01	0.07	0.01	0.00	0.06	0.00	0.07	0.02	0.06	0.03	0.07	0.07	0.10	0.02	0.00	0.00	0.05	0.16	0.13	0.10
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.03	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.00	0.00	0.02	0.03	0.05	0.04
O5'	0.03	0.07	0.02	0.03	0.09	0.00	0.09	0.00	0.08	0.06	0.08	0.10	0.06	0.02	0.05	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.05	0.09	0.10	0.12	0.13	0.06	0.13	0.04	0.10	0.08	0.11	0.15	0.08	0.10	0.16	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.05	0.12	0.07	0.09	0.16	0.03	0.15	0.01	0.11	0.09	0.15	0.18	0.11	0.06	0.13	0.05	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.09	0.04	0.06	0.13	0.01	0.13	0.01	0.10	0.07	0.11	0.14	0.07	0.03	0.10	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00