Doublet Group distance statistics: 54051

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 4, 2, 6, 0, 0, 0, 2, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.001, 0.003, 0.005, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.003 std_dev=0.002
N3	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.012 max_d=0.012 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C1'	A	0, 0.003, 0.009, 0.015, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.009 std_dev=0.006
N1	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.025 max_d=0.025 avg_d=0.006 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.002, 0.008, 0.014, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.008 std_dev=0.006
C4	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C6	A	0, 0.000, 0.006, 0.012, 0.023 max_d=0.023 avg_d=0.006 std_dev=0.006
O2	A	0, 0.003, 0.018, 0.032, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.018 std_dev=0.014
N4	A	0, 0.004, 0.023, 0.041, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.023 std_dev=0.019
C2'	A	0, 0.011, 0.111, 0.211, 0.388 max_d=0.388 avg_d=0.111 std_dev=0.100
O4'	A	0, 0.002, 0.106, 0.209, 0.382 max_d=0.382 avg_d=0.106 std_dev=0.104
C3'	B	0, 0.148, 0.253, 0.358, 0.384 max_d=0.384 avg_d=0.253 std_dev=0.105
C5'	B	0, 0.156, 0.320, 0.484, 0.802 max_d=0.802 avg_d=0.320 std_dev=0.164
C5'	A	0, 0.116, 0.285, 0.453, 0.674 max_d=0.674 avg_d=0.285 std_dev=0.169
O5'	A	0, 0.098, 0.291, 0.484, 0.716 max_d=0.716 avg_d=0.291 std_dev=0.193
O2'	B	0, 0.141, 0.352, 0.564, 0.955 max_d=0.955 avg_d=0.352 std_dev=0.212
O3'	B	0, 0.057, 0.269, 0.480, 0.864 max_d=0.864 avg_d=0.269 std_dev=0.212
OP1	A	0, 0.175, 0.400, 0.626, 0.946 max_d=0.946 avg_d=0.400 std_dev=0.225
C4'	B	0, 0.133, 0.359, 0.584, 1.033 max_d=1.033 avg_d=0.359 std_dev=0.225
P	A	0, 0.098, 0.325, 0.553, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.325 std_dev=0.227
C2'	B	0, 0.128, 0.374, 0.619, 1.173 max_d=1.173 avg_d=0.374 std_dev=0.246
C4'	A	0, -0.025, 0.229, 0.483, 0.940 max_d=0.940 avg_d=0.229 std_dev=0.254
OP2	A	0, 0.126, 0.499, 0.872, 1.311 max_d=1.311 avg_d=0.499 std_dev=0.373
O2'	A	0, -0.118, 0.256, 0.630, 1.277 max_d=1.277 avg_d=0.256 std_dev=0.374
O5'	B	0, -0.003, 0.451, 0.905, 1.674 max_d=1.674 avg_d=0.451 std_dev=0.454
C3'	A	0, -0.218, 0.266, 0.749, 1.588 max_d=1.588 avg_d=0.266 std_dev=0.483
O4'	B	0, -0.024, 0.629, 1.283, 2.514 max_d=2.514 avg_d=0.629 std_dev=0.653
C1'	B	0, -0.093, 0.634, 1.362, 2.653 max_d=2.653 avg_d=0.634 std_dev=0.727
OP2	B	0, -0.132, 0.597, 1.327, 2.772 max_d=2.772 avg_d=0.597 std_dev=0.729
P	B	0, -0.276, 0.592, 1.461, 3.102 max_d=3.102 avg_d=0.592 std_dev=0.868
O3'	A	0, -0.532, 0.440, 1.411, 3.099 max_d=3.099 avg_d=0.440 std_dev=0.971
N1	B	0, -0.301, 0.975, 2.251, 4.665 max_d=4.665 avg_d=0.975 std_dev=1.276
OP1	B	0, -0.614, 0.713, 2.040, 5.003 max_d=5.003 avg_d=0.713 std_dev=1.327
C6	B	0, -0.245, 1.111, 2.467, 5.107 max_d=5.107 avg_d=1.111 std_dev=1.356
C2	B	0, -0.528, 1.288, 3.104, 6.432 max_d=6.432 avg_d=1.288 std_dev=1.816
O2	B	0, -0.506, 1.311, 3.127, 6.373 max_d=6.373 avg_d=1.311 std_dev=1.816
C5	B	0, -0.463, 1.473, 3.410, 7.120 max_d=7.120 avg_d=1.473 std_dev=1.936
N3	B	0, -0.717, 1.645, 4.007, 8.334 max_d=8.334 avg_d=1.645 std_dev=2.362
C4	B	0, -0.707, 1.719, 4.144, 8.673 max_d=8.673 avg_d=1.719 std_dev=2.425
N4	B	0, -0.896, 2.104, 5.104, 10.676 max_d=10.676 avg_d=2.104 std_dev=3.000

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.23	0.00	0.15	0.13	0.35	0.22
C2	0.01	0.00	0.07	0.17	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.08	0.02	0.10	0.17	0.38	0.22
C2'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.14	0.04	0.01	0.06	0.03	0.10	0.00	0.01	0.01	0.29	0.26	0.45	0.34
C3'	0.01	0.17	0.00	0.00	0.28	0.00	0.28	0.01	0.23	0.16	0.23	0.30	0.09	0.01	0.00	0.01	0.06	0.06	0.07	0.06
C4	0.01	0.00	0.03	0.28	0.00	0.10	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.25	0.10	0.01	0.13	0.20	0.36	0.21
C4'	0.00	0.06	0.01	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.09	0.06	0.08	0.11	0.03	0.21	0.01	0.00	0.01	0.05	0.06	0.04
C5	0.00	0.00	0.02	0.28	0.00	0.10	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.19	0.14	0.01	0.14	0.20	0.35	0.21
C5'	0.05	0.04	0.14	0.01	0.09	0.00	0.10	0.00	0.08	0.04	0.07	0.11	0.03	0.07	0.16	0.01	0.00	0.06	0.01	0.00
C6	0.00	0.00	0.04	0.23	0.00	0.09	0.00	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.14	0.07	0.02	0.11	0.18	0.36	0.22
N1	0.00	0.00	0.01	0.16	0.00	0.06	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.06	0.01	0.11	0.16	0.37	0.22
N3	0.01	0.00	0.06	0.23	0.00	0.08	0.00	0.07	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.27	0.03	0.02	0.11	0.18	0.37	0.21
N4	0.01	0.00	0.03	0.30	0.00	0.11	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.27	0.14	0.01	0.15	0.22	0.34	0.21
O2	0.01	0.00	0.10	0.09	0.00	0.03	0.00	0.03	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.24	0.19	0.03	0.11	0.15	0.38	0.22
O2'	0.01	0.23	0.00	0.01	0.25	0.21	0.19	0.07	0.14	0.15	0.27	0.27	0.24	0.00	0.02	0.14	0.19	0.11	0.47	0.26
O3'	0.23	0.08	0.01	0.00	0.10	0.01	0.14	0.16	0.07	0.06	0.03	0.14	0.19	0.02	0.00	0.16	0.24	0.30	0.28	0.23
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.14	0.16	0.00	0.07	0.08	0.22	0.14
O5'	0.15	0.10	0.29	0.06	0.13	0.01	0.14	0.00	0.11	0.11	0.11	0.15	0.11	0.19	0.24	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.13	0.17	0.26	0.06	0.20	0.05	0.20	0.06	0.18	0.16	0.18	0.22	0.15	0.11	0.30	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00
OP2	0.35	0.38	0.45	0.07	0.36	0.06	0.35	0.01	0.36	0.37	0.37	0.34	0.38	0.47	0.28	0.22	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.22	0.22	0.34	0.06	0.21	0.04	0.21	0.00	0.22	0.22	0.21	0.21	0.22	0.26	0.23	0.14	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.57	0.88	0.12	0.11	0.64	0.20	0.39	0.23	0.34	0.59	0.86	0.66	1.11	0.23	0.22	0.59	0.32	0.81	0.26	0.52
C2	0.70	1.24	0.18	0.15	1.07	0.19	0.74	0.25	0.62	0.86	1.30	1.14	1.49	0.29	0.20	0.64	0.24	0.61	0.20	0.38
C2'	0.41	0.63	0.11	0.17	0.34	0.13	0.15	0.28	0.14	0.36	0.58	0.34	0.90	0.28	0.28	0.45	0.47	1.09	0.43	0.72
C3'	0.45	0.54	0.11	0.07	0.17	0.20	0.18	0.28	0.13	0.30	0.42	0.16	0.84	0.06	0.05	0.43	0.54	1.35	0.57	0.89
C4	0.71	1.31	0.21	0.17	1.19	0.18	0.88	0.23	0.74	0.93	1.40	1.28	1.55	0.31	0.17	0.59	0.20	0.40	0.21	0.23
C4'	0.30	0.34	0.06	0.09	0.12	0.15	0.27	0.31	0.21	0.15	0.24	0.15	0.59	0.12	0.12	0.32	0.56	1.26	0.50	0.85
C5	0.68	1.12	0.20	0.17	0.97	0.18	0.73	0.21	0.63	0.82	1.15	1.02	1.34	0.29	0.17	0.57	0.19	0.37	0.23	0.22
C5'	0.19	0.11	0.07	0.08	0.34	0.18	0.49	0.23	0.38	0.10	0.15	0.42	0.32	0.07	0.08	0.24	0.54	1.19	0.48	0.78
C6	0.64	0.98	0.17	0.15	0.79	0.19	0.56	0.21	0.50	0.71	0.97	0.81	1.20	0.27	0.20	0.60	0.22	0.50	0.21	0.30
N1	0.65	1.05	0.16	0.14	0.85	0.19	0.58	0.23	0.50	0.74	1.06	0.89	1.29	0.27	0.21	0.62	0.26	0.64	0.21	0.40
N3	0.73	1.35	0.20	0.16	1.23	0.18	0.88	0.25	0.73	0.94	1.45	1.32	1.60	0.30	0.18	0.63	0.21	0.50	0.19	0.30
N4	0.70	1.38	0.23	0.18	1.33	0.18	1.00	0.23	0.82	0.97	1.51	1.44	1.59	0.31	0.17	0.55	0.19	0.32	0.24	0.19
O2	0.69	1.26	0.17	0.14	1.09	0.19	0.74	0.25	0.61	0.85	1.33	1.17	1.51	0.28	0.20	0.65	0.27	0.70	0.22	0.45
O2'	0.54	0.78	0.08	0.07	0.54	0.30	0.31	0.09	0.29	0.52	0.75	0.54	1.00	0.25	0.21	0.63	0.23	0.80	0.18	0.45
O3'	0.33	0.41	0.10	0.08	0.13	0.12	0.30	0.38	0.23	0.18	0.30	0.17	0.72	0.07	0.08	0.28	0.63	1.53	0.62	1.02
O4'	0.45	0.63	0.10	0.11	0.39	0.18	0.21	0.24	0.20	0.41	0.58	0.38	0.84	0.20	0.19	0.48	0.36	0.85	0.27	0.56
O5'	0.28	0.17	0.02	0.03	0.22	0.20	0.34	0.14	0.24	0.07	0.10	0.29	0.39	0.04	0.01	0.30	0.38	0.96	0.35	0.56
OP1	0.09	0.53	0.15	0.02	0.81	0.17	0.78	0.15	0.61	0.44	0.70	0.91	0.40	0.08	0.01	0.04	0.22	0.56	0.27	0.26
OP2	0.14	0.10	0.12	0.03	0.29	0.06	0.32	0.10	0.23	0.09	0.20	0.35	0.16	0.08	0.01	0.14	0.19	0.60	0.26	0.26
P	0.12	0.14	0.08	0.01	0.37	0.11	0.42	0.09	0.32	0.14	0.26	0.44	0.15	0.05	0.01	0.14	0.24	0.64	0.25	0.32

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.23	0.00	0.09	0.33	0.12	0.11
C2	0.01	0.00	0.13	0.16	0.00	0.04	0.00	0.10	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.14	0.09	0.17	0.43	0.41	0.13
C2'	0.00	0.13	0.00	0.00	0.02	0.01	0.10	0.13	0.13	0.01	0.10	0.03	0.24	0.00	0.02	0.02	0.27	0.31	0.38	0.34
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.24	0.00	0.24	0.01	0.21	0.15	0.21	0.26	0.13	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.24	0.08
C4	0.01	0.00	0.02	0.24	0.00	0.09	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.08	0.02	0.27	0.47	0.73	0.22
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.09	0.00	0.14	0.00	0.14	0.06	0.05	0.10	0.07	0.20	0.02	0.00	0.01	0.08	0.15	0.02
C5	0.01	0.00	0.10	0.24	0.00	0.14	0.00	0.19	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.30	0.14	0.07	0.29	0.46	0.74	0.24
C5'	0.05	0.10	0.13	0.01	0.16	0.00	0.19	0.00	0.16	0.09	0.12	0.17	0.12	0.07	0.15	0.01	0.00	0.05	0.21	0.01
C6	0.01	0.00	0.13	0.21	0.00	0.14	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.27	0.11	0.10	0.24	0.42	0.52	0.16
N1	0.01	0.00	0.01	0.15	0.00	0.06	0.00	0.09	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.14	0.09	0.01	0.16	0.40	0.34	0.11
N3	0.01	0.00	0.10	0.21	0.00	0.05	0.00	0.12	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.15	0.09	0.07	0.22	0.46	0.59	0.18
N4	0.01	0.01	0.03	0.26	0.00	0.10	0.00	0.17	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.25	0.10	0.02	0.30	0.48	0.84	0.27
O2	0.02	0.00	0.24	0.13	0.00	0.07	0.01	0.12	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.15	0.26	0.16	0.14	0.41	0.31	0.12
O2'	0.01	0.09	0.00	0.01	0.23	0.20	0.30	0.07	0.27	0.14	0.15	0.25	0.15	0.00	0.03	0.14	0.20	0.20	0.46	0.31
O3'	0.23	0.14	0.02	0.01	0.08	0.02	0.14	0.15	0.11	0.09	0.09	0.10	0.26	0.03	0.00	0.16	0.17	0.44	0.21	0.21
O4'	0.00	0.09	0.02	0.01	0.02	0.00	0.07	0.01	0.10	0.01	0.07	0.02	0.16	0.14	0.16	0.00	0.05	0.31	0.06	0.08
O5'	0.09	0.17	0.27	0.04	0.27	0.01	0.29	0.00	0.24	0.16	0.22	0.30	0.14	0.20	0.17	0.05	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.33	0.43	0.31	0.14	0.47	0.08	0.46	0.05	0.42	0.40	0.46	0.48	0.41	0.20	0.44	0.31	0.00	0.00	0.01	0.00
OP2	0.12	0.41	0.38	0.24	0.73	0.15	0.74	0.21	0.52	0.34	0.59	0.84	0.31	0.46	0.21	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.11	0.13	0.34	0.08	0.22	0.02	0.24	0.01	0.16	0.11	0.18	0.27	0.12	0.31	0.21	0.08	0.00	0.00	0.00	0.00