Doublet Group distance statistics: 54054

back

Distances from reference structure (by RMSD)

2, 1, 5, 3, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.001, 0.003, 0.006, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.003 std_dev=0.002
C5	A	0, 0.001, 0.004, 0.007, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.004 std_dev=0.003
N3	A	0, 0.001, 0.004, 0.007, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.004 std_dev=0.003
C4	A	0, 0.002, 0.005, 0.008, 0.011 max_d=0.011 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C6	A	0, 0.002, 0.005, 0.009, 0.013 max_d=0.013 avg_d=0.005 std_dev=0.003
C1'	A	0, 0.001, 0.007, 0.013, 0.024 max_d=0.024 avg_d=0.007 std_dev=0.006
C2	A	0, -0.001, 0.007, 0.015, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.007 std_dev=0.008
N4	A	0, 0.007, 0.018, 0.028, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.018 std_dev=0.011
O2	A	0, -0.002, 0.017, 0.037, 0.081 max_d=0.081 avg_d=0.017 std_dev=0.019
C2'	A	0, 0.023, 0.054, 0.085, 0.132 max_d=0.132 avg_d=0.054 std_dev=0.031
O4'	A	0, 0.016, 0.048, 0.080, 0.117 max_d=0.117 avg_d=0.048 std_dev=0.032
C4'	A	0, 0.050, 0.104, 0.158, 0.188 max_d=0.188 avg_d=0.104 std_dev=0.054
C3'	A	0, 0.048, 0.105, 0.162, 0.219 max_d=0.219 avg_d=0.105 std_dev=0.057
O2'	A	0, 0.021, 0.090, 0.158, 0.278 max_d=0.278 avg_d=0.090 std_dev=0.069
O5'	A	0, 0.082, 0.165, 0.249, 0.294 max_d=0.294 avg_d=0.165 std_dev=0.083
O3'	A	0, 0.073, 0.163, 0.253, 0.341 max_d=0.341 avg_d=0.163 std_dev=0.090
C5'	A	0, 0.087, 0.177, 0.268, 0.293 max_d=0.293 avg_d=0.177 std_dev=0.090
OP1	A	0, 0.083, 0.228, 0.373, 0.540 max_d=0.540 avg_d=0.228 std_dev=0.145
P	A	0, 0.063, 0.211, 0.360, 0.535 max_d=0.535 avg_d=0.211 std_dev=0.149
C5'	B	0, 0.073, 0.237, 0.401, 0.625 max_d=0.625 avg_d=0.237 std_dev=0.164
O3'	B	0, 0.062, 0.230, 0.398, 0.654 max_d=0.654 avg_d=0.230 std_dev=0.168
C4'	B	0, 0.072, 0.248, 0.424, 0.629 max_d=0.629 avg_d=0.248 std_dev=0.176
C3'	B	0, 0.079, 0.257, 0.434, 0.635 max_d=0.635 avg_d=0.257 std_dev=0.178
O5'	B	0, 0.119, 0.298, 0.476, 0.709 max_d=0.709 avg_d=0.298 std_dev=0.179
OP2	A	0, 0.124, 0.315, 0.505, 0.724 max_d=0.724 avg_d=0.315 std_dev=0.191
O4'	B	0, 0.112, 0.312, 0.511, 0.763 max_d=0.763 avg_d=0.312 std_dev=0.199
C2'	B	0, 0.104, 0.312, 0.519, 0.803 max_d=0.803 avg_d=0.312 std_dev=0.207
C1'	B	0, 0.126, 0.344, 0.563, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.344 std_dev=0.218
OP1	B	0, 0.145, 0.366, 0.586, 0.921 max_d=0.921 avg_d=0.366 std_dev=0.220
P	B	0, 0.128, 0.349, 0.570, 0.895 max_d=0.895 avg_d=0.349 std_dev=0.221
N1	B	0, 0.162, 0.393, 0.623, 0.963 max_d=0.963 avg_d=0.393 std_dev=0.230
O2'	B	0, 0.076, 0.306, 0.537, 0.857 max_d=0.857 avg_d=0.306 std_dev=0.230
C6	B	0, 0.182, 0.414, 0.646, 0.968 max_d=0.968 avg_d=0.414 std_dev=0.232
C2	B	0, 0.172, 0.417, 0.662, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.417 std_dev=0.245
O2	B	0, 0.161, 0.408, 0.655, 1.046 max_d=1.046 avg_d=0.408 std_dev=0.247
C5	B	0, 0.201, 0.451, 0.701, 1.051 max_d=1.051 avg_d=0.451 std_dev=0.250
N3	B	0, 0.193, 0.454, 0.715, 1.128 max_d=1.128 avg_d=0.454 std_dev=0.261
C4	B	0, 0.205, 0.469, 0.732, 1.130 max_d=1.130 avg_d=0.469 std_dev=0.264
N4	B	0, 0.221, 0.503, 0.786, 1.213 max_d=1.213 avg_d=0.503 std_dev=0.283
OP2	B	0, 0.161, 0.444, 0.728, 1.095 max_d=1.095 avg_d=0.444 std_dev=0.283

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.03	0.08	0.05
C2	0.01	0.00	0.03	0.04	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.04	0.02	0.04	0.05	0.10	0.07
C2'	0.00	0.03	0.00	0.00	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.07	0.04
C3'	0.00	0.04	0.00	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.05	0.05	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.02	0.06	0.03
C4	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.03	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.03	0.06	0.01	0.05	0.07	0.13	0.08
C4'	0.01	0.03	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.00	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.03
C5	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.06	0.01	0.06	0.07	0.13	0.08
C5'	0.01	0.04	0.01	0.01	0.06	0.00	0.06	0.00	0.05	0.03	0.05	0.06	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01
C6	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.05	0.06	0.12	0.08
N1	0.00	0.01	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.01	0.04	0.04	0.10	0.06
N3	0.01	0.00	0.03	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.04	0.05	0.01	0.04	0.05	0.11	0.07
N4	0.01	0.00	0.02	0.05	0.00	0.04	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.03	0.07	0.01	0.06	0.07	0.13	0.08
O2	0.03	0.00	0.04	0.04	0.00	0.04	0.00	0.05	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.07	0.05	0.03	0.04	0.04	0.10	0.06
O2'	0.00	0.04	0.00	0.01	0.03	0.03	0.02	0.03	0.01	0.01	0.04	0.03	0.07	0.00	0.01	0.03	0.04	0.07	0.04	0.05
O3'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.06	0.01	0.06	0.02	0.05	0.03	0.05	0.07	0.05	0.01	0.00	0.01	0.03	0.03	0.05	0.03
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.03	0.01	0.00	0.03	0.03	0.08	0.05
O5'	0.02	0.04	0.01	0.01	0.05	0.01	0.06	0.01	0.05	0.04	0.04	0.06	0.04	0.04	0.03	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.03	0.05	0.02	0.02	0.07	0.02	0.07	0.01	0.06	0.04	0.05	0.07	0.04	0.07	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.08	0.10	0.07	0.06	0.13	0.04	0.13	0.03	0.12	0.10	0.11	0.13	0.10	0.04	0.05	0.08	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.05	0.07	0.04	0.03	0.08	0.03	0.08	0.01	0.08	0.06	0.07	0.08	0.06	0.05	0.03	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.03	0.03	0.05	0.04	0.03	0.03	0.04	0.06	0.04	0.03	0.03	0.04	0.03	0.08	0.09	0.05	0.05	0.11	0.07	0.07
C2	0.04	0.04	0.06	0.06	0.04	0.06	0.05	0.07	0.05	0.04	0.04	0.04	0.04	0.08	0.09	0.07	0.07	0.12	0.07	0.08
C2'	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.05	0.04	0.03	0.03	0.04	0.03	0.06	0.07	0.06	0.05	0.11	0.07	0.07
C3'	0.04	0.03	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.06	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.05	0.05	0.06	0.06	0.13	0.09	0.09
C4	0.07	0.06	0.07	0.07	0.06	0.08	0.07	0.09	0.07	0.07	0.06	0.06	0.06	0.07	0.08	0.09	0.08	0.12	0.08	0.09
C4'	0.03	0.03	0.03	0.02	0.04	0.05	0.04	0.07	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.04	0.05	0.06	0.06	0.13	0.10	0.09
C5	0.08	0.05	0.06	0.06	0.06	0.09	0.07	0.10	0.07	0.07	0.05	0.06	0.05	0.05	0.07	0.10	0.09	0.12	0.08	0.09
C5'	0.05	0.04	0.04	0.03	0.04	0.07	0.05	0.08	0.05	0.04	0.04	0.04	0.06	0.06	0.02	0.07	0.08	0.14	0.12	0.11
C6	0.06	0.03	0.04	0.05	0.04	0.08	0.05	0.09	0.06	0.05	0.03	0.04	0.03	0.04	0.08	0.09	0.08	0.12	0.08	0.09
N1	0.03	0.02	0.05	0.05	0.03	0.05	0.04	0.07	0.04	0.03	0.02	0.03	0.02	0.07	0.08	0.07	0.07	0.12	0.07	0.08
N3	0.06	0.05	0.07	0.06	0.06	0.07	0.06	0.08	0.06	0.06	0.05	0.06	0.06	0.08	0.08	0.08	0.08	0.12	0.07	0.08
N4	0.09	0.08	0.08	0.07	0.09	0.09	0.09	0.10	0.09	0.09	0.08	0.08	0.08	0.07	0.07	0.11	0.09	0.12	0.09	0.09
O2	0.04	0.04	0.06	0.06	0.04	0.05	0.04	0.07	0.04	0.04	0.04	0.04	0.05	0.09	0.09	0.06	0.06	0.13	0.07	0.08
O2'	0.05	0.05	0.06	0.05	0.06	0.05	0.07	0.06	0.07	0.06	0.06	0.07	0.05	0.08	0.08	0.07	0.05	0.10	0.07	0.07
O3'	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.05	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.05	0.04	0.05	0.06	0.14	0.11	0.10
O4'	0.03	0.03	0.04	0.03	0.04	0.04	0.04	0.07	0.04	0.03	0.03	0.04	0.04	0.06	0.09	0.06	0.06	0.12	0.08	0.08
O5'	0.04	0.03	0.03	0.03	0.04	0.07	0.05	0.09	0.05	0.04	0.03	0.05	0.04	0.05	0.01	0.06	0.09	0.14	0.12	0.12
OP1	0.02	0.03	0.03	0.02	0.05	0.04	0.06	0.08	0.05	0.03	0.04	0.06	0.04	0.05	0.01	0.03	0.09	0.12	0.12	0.11
OP2	0.05	0.08	0.05	0.03	0.08	0.03	0.08	0.06	0.07	0.07	0.08	0.08	0.10	0.06	0.01	0.03	0.08	0.13	0.11	0.10
P	0.01	0.03	0.02	0.01	0.04	0.03	0.05	0.06	0.04	0.02	0.03	0.05	0.04	0.05	0.00	0.02	0.07	0.11	0.10	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.03
C2	0.01	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.02	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.05	0.06	0.09	0.06
C2'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.02	0.03	0.02	0.02
C3'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.03	0.03	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.03	0.02
C4	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.09	0.13	0.09
C4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01
C5	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.03	0.01	0.07	0.10	0.12	0.10
C5'	0.01	0.02	0.01	0.01	0.04	0.00	0.04	0.00	0.04	0.03	0.03	0.04	0.02	0.01	0.03	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01
C6	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.03	0.01	0.06	0.07	0.09	0.07
N1	0.00	0.00	0.01	0.02	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.05	0.07	0.06
N3	0.00	0.00	0.01	0.03	0.00	0.01	0.00	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.06	0.08	0.11	0.08
N4	0.00	0.00	0.02	0.03	0.00	0.02	0.00	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.04	0.01	0.07	0.11	0.14	0.10
O2	0.01	0.00	0.03	0.03	0.00	0.01	0.00	0.02	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.04	0.01	0.04	0.04	0.08	0.05
O2'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.00	0.04	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01
O3'	0.01	0.03	0.02	0.00	0.03	0.01	0.03	0.03	0.03	0.02	0.03	0.04	0.04	0.04	0.00	0.01	0.04	0.06	0.06	0.04
O4'	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.03
O5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.07	0.00	0.07	0.00	0.06	0.04	0.06	0.07	0.04	0.01	0.04	0.02	0.00	0.01	0.00	0.00
OP1	0.02	0.06	0.03	0.03	0.09	0.02	0.10	0.02	0.07	0.05	0.08	0.11	0.04	0.03	0.06	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.04	0.09	0.02	0.03	0.13	0.01	0.12	0.00	0.09	0.07	0.11	0.14	0.08	0.02	0.06	0.04	0.00	0.00	0.00	0.00
P	0.03	0.06	0.02	0.02	0.09	0.01	0.10	0.01	0.07	0.06	0.08	0.10	0.05	0.01	0.04	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00