Doublet Group distance statistics: 54061

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 1, 2, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N1	A	0, 0.006, 0.011, 0.017, 0.017 max_d=0.017 avg_d=0.011 std_dev=0.005
C5	A	0, 0.002, 0.008, 0.015, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.008 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.028 max_d=0.028 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C4	A	0, 0.004, 0.013, 0.023, 0.030 max_d=0.030 avg_d=0.013 std_dev=0.009
C1'	A	0, 0.006, 0.016, 0.027, 0.037 max_d=0.037 avg_d=0.016 std_dev=0.011
C2	A	0, 0.005, 0.017, 0.028, 0.040 max_d=0.040 avg_d=0.017 std_dev=0.012
N3	A	0, 0.000, 0.013, 0.026, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.013 std_dev=0.013
O2	A	0, 0.008, 0.032, 0.056, 0.074 max_d=0.074 avg_d=0.032 std_dev=0.024
O4'	A	0, 0.040, 0.092, 0.143, 0.181 max_d=0.181 avg_d=0.092 std_dev=0.051
N4	A	0, -0.004, 0.048, 0.101, 0.169 max_d=0.169 avg_d=0.048 std_dev=0.052
C2'	A	0, 0.036, 0.097, 0.157, 0.186 max_d=0.186 avg_d=0.097 std_dev=0.060
C3'	A	0, 0.057, 0.139, 0.221, 0.252 max_d=0.252 avg_d=0.139 std_dev=0.082
O2'	A	0, 0.038, 0.163, 0.288, 0.417 max_d=0.417 avg_d=0.163 std_dev=0.125
O3'	A	0, 0.120, 0.245, 0.370, 0.423 max_d=0.423 avg_d=0.245 std_dev=0.125
C4'	A	0, 0.018, 0.176, 0.335, 0.532 max_d=0.532 avg_d=0.176 std_dev=0.158
O3'	B	0, 0.173, 0.413, 0.652, 0.710 max_d=0.710 avg_d=0.413 std_dev=0.239
C4'	B	0, 0.168, 0.409, 0.650, 0.749 max_d=0.749 avg_d=0.409 std_dev=0.241
C5'	B	0, 0.201, 0.459, 0.717, 0.835 max_d=0.835 avg_d=0.459 std_dev=0.258
O5'	A	0, 0.076, 0.335, 0.594, 0.752 max_d=0.752 avg_d=0.335 std_dev=0.259
C3'	B	0, 0.171, 0.431, 0.691, 0.806 max_d=0.806 avg_d=0.431 std_dev=0.260
P	A	0, 0.171, 0.447, 0.724, 0.866 max_d=0.866 avg_d=0.447 std_dev=0.277
O2'	B	0, 0.076, 0.362, 0.648, 0.858 max_d=0.858 avg_d=0.362 std_dev=0.286
O5'	B	0, 0.176, 0.467, 0.758, 0.914 max_d=0.914 avg_d=0.467 std_dev=0.291
O4'	B	0, 0.152, 0.445, 0.738, 0.917 max_d=0.917 avg_d=0.445 std_dev=0.293
OP1	B	0, 0.235, 0.540, 0.845, 0.948 max_d=0.948 avg_d=0.540 std_dev=0.305
C2'	B	0, 0.103, 0.416, 0.728, 0.952 max_d=0.952 avg_d=0.416 std_dev=0.312
C1'	B	0, 0.092, 0.437, 0.782, 1.030 max_d=1.030 avg_d=0.437 std_dev=0.345
P	B	0, 0.163, 0.509, 0.856, 1.045 max_d=1.045 avg_d=0.509 std_dev=0.347
C5'	A	0, 0.027, 0.412, 0.797, 1.298 max_d=1.298 avg_d=0.412 std_dev=0.385
OP2	A	0, 0.243, 0.632, 1.022, 1.167 max_d=1.167 avg_d=0.632 std_dev=0.390
O2	B	0, 0.077, 0.477, 0.877, 1.164 max_d=1.164 avg_d=0.477 std_dev=0.400
N1	B	0, 0.125, 0.549, 0.973, 1.281 max_d=1.281 avg_d=0.549 std_dev=0.424
OP2	B	0, 0.115, 0.546, 0.977, 1.255 max_d=1.255 avg_d=0.546 std_dev=0.431
C2	B	0, 0.108, 0.544, 0.980, 1.299 max_d=1.299 avg_d=0.544 std_dev=0.436
OP1	A	0, 0.184, 0.641, 1.098, 1.465 max_d=1.465 avg_d=0.641 std_dev=0.457
C6	B	0, 0.189, 0.673, 1.157, 1.478 max_d=1.478 avg_d=0.673 std_dev=0.484
N3	B	0, 0.152, 0.639, 1.126, 1.471 max_d=1.471 avg_d=0.639 std_dev=0.487
C4	B	0, 0.188, 0.732, 1.276, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.732 std_dev=0.544
C5	B	0, 0.211, 0.762, 1.312, 1.662 max_d=1.662 avg_d=0.762 std_dev=0.550
N4	B	0, 0.213, 0.811, 1.409, 1.775 max_d=1.775 avg_d=0.811 std_dev=0.598

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01	0.02	0.02	0.03	0.06	0.03	0.00	0.09	0.33	0.19	0.14
C2	0.02	0.00	0.06	0.07	0.01	0.06	0.01	0.20	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.09	0.08	0.03	0.12	0.22	0.30	0.10
C2'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.05	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.05	0.07	0.01	0.04	0.01	0.12	0.33	0.17	0.11
C3'	0.01	0.07	0.00	0.00	0.06	0.01	0.06	0.06	0.05	0.04	0.07	0.06	0.09	0.02	0.00	0.03	0.18	0.32	0.19	0.10
C4	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.11	0.01	0.33	0.01	0.01	0.01	0.01	0.02	0.08	0.04	0.04	0.12	0.13	0.40	0.17
C4'	0.01	0.06	0.01	0.01	0.11	0.00	0.13	0.01	0.12	0.07	0.08	0.12	0.05	0.06	0.03	0.01	0.02	0.32	0.20	0.07
C5	0.01	0.01	0.04	0.06	0.01	0.13	0.00	0.36	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.05	0.04	0.12	0.13	0.40	0.18
C5'	0.05	0.20	0.03	0.06	0.33	0.01	0.36	0.00	0.31	0.20	0.27	0.36	0.13	0.08	0.05	0.02	0.02	0.31	0.29	0.01
C6	0.01	0.01	0.04	0.05	0.01	0.12	0.00	0.31	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.05	0.04	0.11	0.14	0.33	0.14
N1	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.07	0.01	0.20	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.05	0.04	0.02	0.11	0.22	0.28	0.11
N3	0.02	0.01	0.05	0.07	0.01	0.08	0.00	0.27	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.10	0.07	0.03	0.12	0.15	0.36	0.13
N4	0.02	0.01	0.05	0.06	0.01	0.12	0.01	0.36	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.09	0.04	0.04	0.13	0.15	0.43	0.19
O2	0.03	0.01	0.07	0.09	0.02	0.05	0.01	0.13	0.01	0.01	0.02	0.02	0.00	0.11	0.11	0.03	0.11	0.28	0.27	0.10
O2'	0.06	0.09	0.01	0.02	0.08	0.06	0.05	0.08	0.04	0.05	0.10	0.09	0.11	0.00	0.11	0.09	0.06	0.34	0.18	0.12
O3'	0.03	0.08	0.04	0.00	0.04	0.03	0.05	0.05	0.05	0.04	0.07	0.04	0.11	0.11	0.00	0.02	0.12	0.28	0.23	0.07
O4'	0.00	0.03	0.01	0.03	0.04	0.01	0.04	0.02	0.04	0.02	0.03	0.04	0.03	0.09	0.02	0.00	0.06	0.34	0.15	0.16
O5'	0.09	0.12	0.12	0.18	0.12	0.02	0.12	0.02	0.11	0.11	0.12	0.13	0.11	0.06	0.12	0.06	0.00	0.06	0.02	0.00
OP1	0.33	0.22	0.33	0.32	0.13	0.32	0.13	0.31	0.14	0.22	0.15	0.15	0.28	0.34	0.28	0.34	0.06	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.30	0.17	0.19	0.40	0.20	0.40	0.29	0.33	0.28	0.36	0.43	0.27	0.18	0.23	0.15	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.14	0.10	0.11	0.10	0.17	0.07	0.18	0.01	0.14	0.11	0.13	0.19	0.10	0.12	0.07	0.16	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.12	0.11	0.14	0.16	0.11	0.11	0.12	0.12	0.12	0.11	0.11	0.12	0.11	0.14	0.21	0.10	0.15	0.24	0.19	0.20
C2	0.11	0.10	0.09	0.11	0.11	0.11	0.12	0.16	0.12	0.11	0.10	0.11	0.10	0.10	0.16	0.11	0.16	0.24	0.18	0.20
C2'	0.11	0.10	0.12	0.13	0.11	0.10	0.11	0.10	0.11	0.10	0.10	0.11	0.11	0.14	0.16	0.10	0.15	0.26	0.20	0.21
C3'	0.10	0.10	0.10	0.08	0.09	0.09	0.07	0.08	0.06	0.09	0.10	0.09	0.11	0.13	0.11	0.10	0.09	0.18	0.12	0.12
C4	0.06	0.05	0.04	0.10	0.06	0.12	0.08	0.19	0.08	0.06	0.05	0.06	0.05	0.07	0.15	0.10	0.16	0.23	0.17	0.19
C4'	0.09	0.09	0.07	0.08	0.09	0.11	0.07	0.13	0.07	0.08	0.09	0.09	0.09	0.07	0.12	0.12	0.10	0.14	0.11	0.11
C5	0.08	0.06	0.07	0.11	0.07	0.14	0.10	0.20	0.11	0.08	0.06	0.07	0.06	0.08	0.15	0.11	0.16	0.23	0.17	0.19
C5'	0.14	0.14	0.08	0.10	0.17	0.22	0.18	0.31	0.17	0.15	0.15	0.18	0.12	0.09	0.08	0.22	0.30	0.35	0.30	0.32
C6	0.04	0.05	0.05	0.09	0.05	0.10	0.08	0.17	0.08	0.05	0.05	0.05	0.06	0.08	0.15	0.06	0.15	0.23	0.17	0.19
N1	0.08	0.08	0.09	0.11	0.08	0.08	0.09	0.14	0.08	0.08	0.08	0.08	0.09	0.11	0.17	0.07	0.15	0.23	0.17	0.19
N3	0.07	0.07	0.05	0.10	0.08	0.10	0.09	0.17	0.09	0.07	0.07	0.08	0.07	0.07	0.15	0.09	0.16	0.24	0.17	0.20
N4	0.11	0.10	0.10	0.13	0.11	0.16	0.12	0.21	0.13	0.11	0.10	0.10	0.10	0.11	0.16	0.14	0.17	0.23	0.17	0.20
O2	0.15	0.14	0.13	0.14	0.15	0.14	0.17	0.17	0.17	0.16	0.14	0.15	0.13	0.13	0.18	0.16	0.18	0.27	0.21	0.23
O2'	0.20	0.20	0.18	0.21	0.23	0.20	0.25	0.20	0.24	0.21	0.21	0.24	0.18	0.16	0.22	0.21	0.25	0.35	0.31	0.31
O3'	0.08	0.08	0.06	0.06	0.08	0.08	0.08	0.10	0.07	0.07	0.08	0.09	0.09	0.10	0.07	0.10	0.11	0.23	0.18	0.17
O4'	0.10	0.09	0.13	0.13	0.09	0.08	0.08	0.10	0.07	0.09	0.09	0.09	0.10	0.14	0.21	0.10	0.11	0.21	0.15	0.16
O5'	0.10	0.11	0.04	0.12	0.20	0.19	0.25	0.31	0.24	0.14	0.14	0.21	0.08	0.07	0.01	0.17	0.30	0.41	0.40	0.38
OP1	0.05	0.10	0.10	0.04	0.11	0.19	0.11	0.34	0.11	0.07	0.12	0.13	0.12	0.11	0.02	0.14	0.32	0.41	0.29	0.34
OP2	0.17	0.27	0.20	0.11	0.27	0.03	0.25	0.08	0.22	0.21	0.29	0.30	0.30	0.22	0.02	0.09	0.16	0.18	0.21	0.16
P	0.03	0.08	0.07	0.02	0.04	0.07	0.07	0.13	0.08	0.03	0.08	0.05	0.12	0.10	0.01	0.04	0.13	0.18	0.15	0.14

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.03	0.00	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.02	0.01	0.03	0.05	0.07	0.05
C2	0.02	0.00	0.06	0.05	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.06	0.06	0.03	0.05	0.08	0.11	0.09
C2'	0.00	0.06	0.00	0.01	0.03	0.01	0.04	0.02	0.05	0.01	0.05	0.03	0.09	0.01	0.01	0.01	0.08	0.11	0.13	0.09
C3'	0.01	0.05	0.01	0.00	0.03	0.00	0.04	0.03	0.06	0.02	0.05	0.04	0.07	0.02	0.01	0.01	0.10	0.13	0.11	0.10
C4	0.01	0.01	0.03	0.03	0.00	0.02	0.00	0.06	0.01	0.01	0.00	0.01	0.02	0.04	0.04	0.01	0.05	0.11	0.14	0.11
C4'	0.01	0.02	0.01	0.00	0.02	0.00	0.02	0.00	0.02	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.04	0.00	0.02	0.00	0.07	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.06	0.02	0.05	0.11	0.13	0.12
C5'	0.03	0.04	0.02	0.03	0.06	0.00	0.07	0.00	0.07	0.05	0.05	0.06	0.04	0.03	0.02	0.02	0.00	0.03	0.01	0.01
C6	0.00	0.01	0.05	0.06	0.01	0.02	0.00	0.07	0.00	0.00	0.01	0.00	0.02	0.04	0.07	0.04	0.04	0.09	0.10	0.11
N1	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.04	0.08	0.10	0.08
N3	0.02	0.00	0.05	0.05	0.00	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.07	0.06	0.03	0.05	0.10	0.13	0.10
N4	0.01	0.01	0.03	0.04	0.01	0.02	0.00	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00	0.02	0.04	0.05	0.02	0.06	0.12	0.15	0.12
O2	0.02	0.01	0.09	0.07	0.02	0.03	0.02	0.04	0.02	0.02	0.01	0.02	0.00	0.10	0.09	0.05	0.06	0.08	0.11	0.08
O2'	0.01	0.06	0.01	0.02	0.04	0.04	0.04	0.03	0.04	0.02	0.07	0.04	0.10	0.00	0.03	0.02	0.06	0.08	0.11	0.06
O3'	0.02	0.06	0.01	0.01	0.04	0.02	0.06	0.02	0.07	0.02	0.06	0.05	0.09	0.03	0.00	0.02	0.10	0.16	0.12	0.11
O4'	0.01	0.03	0.01	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.04	0.01	0.03	0.02	0.05	0.02	0.02	0.00	0.06	0.06	0.04	0.07
O5'	0.03	0.05	0.08	0.10	0.05	0.01	0.05	0.00	0.04	0.04	0.05	0.06	0.06	0.06	0.10	0.06	0.00	0.03	0.01	0.00
OP1	0.05	0.08	0.11	0.13	0.11	0.02	0.11	0.03	0.09	0.08	0.10	0.12	0.08	0.08	0.16	0.06	0.03	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.11	0.13	0.11	0.14	0.02	0.13	0.01	0.10	0.10	0.13	0.15	0.11	0.11	0.12	0.04	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.05	0.09	0.09	0.10	0.11	0.01	0.12	0.01	0.11	0.08	0.10	0.12	0.08	0.06	0.11	0.07	0.00	0.01	0.00	0.00