Doublet Group distance statistics: 54064

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C5	A	0, 0.002, 0.005, 0.009, 0.010 max_d=0.010 avg_d=0.005 std_dev=0.004
N3	A	0, 0.005, 0.012, 0.020, 0.022 max_d=0.022 avg_d=0.012 std_dev=0.008
N1	A	0, 0.005, 0.027, 0.050, 0.062 max_d=0.062 avg_d=0.027 std_dev=0.023
C6	A	0, 0.006, 0.037, 0.068, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.037 std_dev=0.031
C1'	A	0, 0.002, 0.035, 0.068, 0.084 max_d=0.084 avg_d=0.035 std_dev=0.033
C2	A	0, 0.002, 0.036, 0.070, 0.087 max_d=0.087 avg_d=0.036 std_dev=0.034
C4	A	0, 0.002, 0.037, 0.071, 0.088 max_d=0.088 avg_d=0.037 std_dev=0.034
O2	A	0, 0.004, 0.080, 0.155, 0.192 max_d=0.192 avg_d=0.080 std_dev=0.075
O4'	A	0, 0.048, 0.152, 0.257, 0.249 max_d=0.249 avg_d=0.152 std_dev=0.104
C2'	A	0, 0.027, 0.136, 0.244, 0.295 max_d=0.295 avg_d=0.136 std_dev=0.108
N4	A	0, 0.008, 0.121, 0.235, 0.289 max_d=0.289 avg_d=0.121 std_dev=0.114
O2'	A	0, 0.070, 0.322, 0.574, 0.696 max_d=0.696 avg_d=0.322 std_dev=0.252
C4'	A	0, 0.161, 0.465, 0.768, 0.851 max_d=0.851 avg_d=0.465 std_dev=0.304
C3'	A	0, 0.157, 0.469, 0.780, 0.874 max_d=0.874 avg_d=0.469 std_dev=0.312
C2'	B	0, 0.087, 0.493, 0.900, 1.121 max_d=1.121 avg_d=0.493 std_dev=0.407
C5'	A	0, 0.213, 0.649, 1.085, 1.222 max_d=1.222 avg_d=0.649 std_dev=0.436
O5'	A	0, 0.202, 0.651, 1.100, 1.247 max_d=1.247 avg_d=0.651 std_dev=0.449
N3	B	0, 0.126, 0.678, 1.229, 1.459 max_d=1.459 avg_d=0.678 std_dev=0.551
O3'	A	0, 0.286, 0.847, 1.408, 1.565 max_d=1.565 avg_d=0.847 std_dev=0.561
O2'	B	0, 0.344, 0.905, 1.467, 1.448 max_d=1.448 avg_d=0.905 std_dev=0.561
P	A	0, 0.251, 0.845, 1.440, 1.645 max_d=1.645 avg_d=0.845 std_dev=0.595
C2	B	0, 0.141, 0.745, 1.349, 1.637 max_d=1.637 avg_d=0.745 std_dev=0.604
OP2	A	0, 0.252, 0.869, 1.487, 1.691 max_d=1.691 avg_d=0.869 std_dev=0.618
N1	B	0, 0.140, 0.781, 1.422, 1.713 max_d=1.713 avg_d=0.781 std_dev=0.641
C1'	B	0, 0.175, 0.838, 1.501, 1.812 max_d=1.812 avg_d=0.838 std_dev=0.663
O3'	B	0, 0.263, 0.927, 1.591, 1.789 max_d=1.789 avg_d=0.927 std_dev=0.664
C3'	B	0, 0.187, 0.861, 1.536, 1.801 max_d=1.801 avg_d=0.861 std_dev=0.674
OP1	A	0, 0.264, 0.947, 1.629, 1.922 max_d=1.922 avg_d=0.947 std_dev=0.682
C4	B	0, 0.133, 0.841, 1.548, 1.755 max_d=1.755 avg_d=0.841 std_dev=0.707
N4	B	0, 0.130, 0.905, 1.679, 1.851 max_d=1.851 avg_d=0.905 std_dev=0.774
O2	B	0, 0.183, 0.970, 1.757, 2.153 max_d=2.153 avg_d=0.970 std_dev=0.787
C6	B	0, 0.169, 1.026, 1.882, 2.215 max_d=2.215 avg_d=1.026 std_dev=0.857
C5	B	0, 0.183, 1.129, 2.076, 2.389 max_d=2.389 avg_d=1.129 std_dev=0.946
O4'	B	0, 0.300, 1.268, 2.236, 2.630 max_d=2.630 avg_d=1.268 std_dev=0.968
C4'	B	0, 0.347, 1.331, 2.314, 2.645 max_d=2.645 avg_d=1.331 std_dev=0.984
O5'	B	0, 0.410, 1.615, 2.819, 3.306 max_d=3.306 avg_d=1.615 std_dev=1.204
C5'	B	0, 0.432, 1.644, 2.857, 3.248 max_d=3.248 avg_d=1.644 std_dev=1.213
OP2	B	0, 0.590, 1.849, 3.108, 3.195 max_d=3.195 avg_d=1.849 std_dev=1.259
P	B	0, 0.335, 1.602, 2.869, 3.377 max_d=3.377 avg_d=1.602 std_dev=1.267
OP1	B	0, 0.563, 1.963, 3.363, 3.645 max_d=3.645 avg_d=1.963 std_dev=1.400

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.03	0.02	0.01	0.15	0.17	0.05	0.10
C2	0.02	0.00	0.02	0.07	0.00	0.04	0.01	0.10	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.05	0.08	0.02	0.12	0.11	0.10	0.08
C2'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.05	0.00	0.04	0.01	0.02	0.01	0.03	0.07	0.04	0.00	0.01	0.00	0.02	0.08	0.11	0.03
C3'	0.00	0.07	0.00	0.00	0.15	0.00	0.13	0.02	0.09	0.06	0.12	0.19	0.04	0.02	0.00	0.01	0.11	0.06	0.16	0.08
C4	0.01	0.00	0.05	0.15	0.00	0.12	0.01	0.21	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.03	0.19	0.02	0.14	0.11	0.16	0.13
C4'	0.01	0.04	0.00	0.00	0.12	0.00	0.12	0.00	0.09	0.05	0.08	0.14	0.03	0.03	0.02	0.01	0.01	0.13	0.06	0.01
C5	0.01	0.01	0.04	0.13	0.01	0.12	0.00	0.22	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.16	0.03	0.18	0.11	0.05	0.11
C5'	0.02	0.10	0.01	0.02	0.21	0.00	0.22	0.00	0.16	0.10	0.16	0.26	0.05	0.03	0.02	0.02	0.01	0.17	0.06	0.01
C6	0.01	0.01	0.02	0.09	0.01	0.09	0.00	0.16	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.02	0.10	0.03	0.22	0.15	0.05	0.12
N1	0.01	0.01	0.01	0.06	0.01	0.05	0.00	0.10	0.00	0.00	0.02	0.01	0.01	0.03	0.06	0.01	0.17	0.14	0.02	0.09
N3	0.02	0.00	0.03	0.12	0.00	0.08	0.01	0.16	0.02	0.02	0.00	0.00	0.00	0.05	0.15	0.02	0.12	0.10	0.16	0.12
N4	0.01	0.00	0.07	0.19	0.00	0.14	0.01	0.26	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.04	0.25	0.02	0.14	0.17	0.24	0.19
O2	0.02	0.00	0.04	0.04	0.00	0.03	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.09	0.06	0.03	0.11	0.12	0.10	0.08
O2'	0.03	0.05	0.00	0.02	0.03	0.03	0.01	0.03	0.02	0.03	0.05	0.04	0.09	0.00	0.03	0.04	0.05	0.06	0.13	0.05
O3'	0.02	0.08	0.01	0.00	0.19	0.02	0.16	0.02	0.10	0.06	0.15	0.25	0.06	0.03	0.00	0.02	0.28	0.10	0.30	0.22
O4'	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.03	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.02	0.00	0.21	0.22	0.12	0.16
O5'	0.15	0.12	0.02	0.11	0.14	0.01	0.18	0.01	0.22	0.17	0.12	0.14	0.11	0.05	0.28	0.21	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.17	0.11	0.08	0.06	0.11	0.13	0.11	0.17	0.15	0.14	0.10	0.17	0.12	0.06	0.10	0.22	0.02	0.00	0.00	0.01
OP2	0.05	0.10	0.11	0.16	0.16	0.06	0.05	0.06	0.05	0.02	0.16	0.24	0.10	0.13	0.30	0.12	0.02	0.00	0.00	0.00
P	0.10	0.08	0.03	0.08	0.13	0.01	0.11	0.01	0.12	0.09	0.12	0.19	0.08	0.05	0.22	0.16	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.17	0.30	0.12	0.06	0.10	0.11	0.11	0.08	0.10	0.14	0.26	0.08	0.49	0.28	0.04	0.16	0.10	0.27	0.34	0.20
C2	0.11	0.15	0.09	0.13	0.16	0.12	0.32	0.17	0.30	0.14	0.13	0.16	0.31	0.21	0.10	0.12	0.18	0.17	0.25	0.23
C2'	0.10	0.22	0.07	0.06	0.06	0.07	0.24	0.09	0.21	0.05	0.18	0.08	0.43	0.27	0.07	0.09	0.19	0.27	0.46	0.32
C3'	0.08	0.11	0.08	0.14	0.14	0.12	0.32	0.18	0.30	0.08	0.07	0.17	0.31	0.23	0.14	0.10	0.30	0.30	0.64	0.42
C4	0.25	0.17	0.20	0.25	0.28	0.27	0.44	0.31	0.43	0.29	0.17	0.23	0.16	0.22	0.21	0.27	0.30	0.26	0.26	0.28
C4'	0.09	0.18	0.05	0.05	0.04	0.08	0.18	0.08	0.17	0.03	0.14	0.06	0.36	0.23	0.07	0.10	0.19	0.32	0.53	0.30
C5	0.22	0.11	0.18	0.20	0.11	0.21	0.25	0.22	0.30	0.22	0.09	0.07	0.12	0.22	0.16	0.21	0.17	0.17	0.36	0.16
C5'	0.08	0.04	0.09	0.13	0.13	0.11	0.26	0.13	0.26	0.10	0.03	0.14	0.17	0.13	0.11	0.10	0.24	0.31	0.63	0.34
C6	0.10	0.17	0.08	0.10	0.08	0.09	0.12	0.11	0.15	0.09	0.18	0.08	0.27	0.19	0.08	0.09	0.06	0.17	0.36	0.15
N1	0.10	0.21	0.07	0.07	0.07	0.07	0.18	0.09	0.19	0.09	0.19	0.06	0.37	0.22	0.05	0.09	0.08	0.18	0.31	0.17
N3	0.19	0.14	0.15	0.21	0.27	0.22	0.43	0.27	0.41	0.24	0.15	0.25	0.22	0.20	0.17	0.21	0.28	0.23	0.22	0.30
N4	0.34	0.29	0.27	0.33	0.44	0.37	0.59	0.42	0.54	0.40	0.29	0.38	0.21	0.25	0.28	0.38	0.42	0.41	0.27	0.40
O2	0.10	0.17	0.07	0.11	0.17	0.09	0.33	0.15	0.30	0.12	0.14	0.18	0.35	0.23	0.07	0.10	0.18	0.17	0.26	0.25
O2'	0.17	0.32	0.10	0.03	0.07	0.08	0.17	0.06	0.15	0.13	0.27	0.05	0.55	0.27	0.06	0.15	0.16	0.27	0.47	0.29
O3'	0.10	0.08	0.11	0.22	0.20	0.19	0.40	0.28	0.37	0.13	0.04	0.23	0.30	0.21	0.22	0.15	0.42	0.33	0.87	0.57
O4'	0.22	0.32	0.17	0.12	0.14	0.17	0.05	0.14	0.06	0.18	0.28	0.12	0.47	0.30	0.10	0.21	0.17	0.35	0.38	0.24
O5'	0.20	0.31	0.20	0.09	0.21	0.08	0.21	0.03	0.20	0.21	0.29	0.20	0.42	0.26	0.02	0.14	0.14	0.35	0.60	0.29
OP1	0.04	0.13	0.09	0.01	0.11	0.06	0.19	0.17	0.17	0.06	0.12	0.12	0.23	0.16	0.01	0.03	0.35	0.45	1.10	0.54
OP2	0.07	0.07	0.10	0.06	0.12	0.08	0.23	0.14	0.22	0.07	0.07	0.13	0.15	0.15	0.00	0.09	0.33	0.39	0.83	0.50
P	0.05	0.14	0.08	0.00	0.11	0.03	0.19	0.11	0.17	0.06	0.13	0.12	0.22	0.15	0.00	0.01	0.27	0.40	0.82	0.42

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.01	0.00	0.08	0.21	0.28	0.12
C2	0.02	0.00	0.08	0.06	0.01	0.02	0.01	0.05	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.07	0.03	0.15	0.34	0.62	0.21
C2'	0.00	0.08	0.00	0.00	0.02	0.01	0.04	0.02	0.06	0.01	0.07	0.03	0.13	0.01	0.02	0.01	0.10	0.21	0.28	0.16
C3'	0.01	0.06	0.00	0.00	0.08	0.01	0.11	0.02	0.12	0.05	0.06	0.08	0.08	0.02	0.00	0.01	0.13	0.25	0.36	0.20
C4	0.01	0.01	0.02	0.08	0.00	0.07	0.00	0.11	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.08	0.09	0.02	0.17	0.32	0.81	0.19
C4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.08	0.03	0.04	0.07	0.02	0.06	0.01	0.00	0.01	0.09	0.16	0.03
C5	0.00	0.01	0.04	0.11	0.00	0.09	0.00	0.12	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.04	0.14	0.04	0.14	0.21	0.74	0.12
C5'	0.02	0.05	0.02	0.02	0.11	0.00	0.12	0.00	0.09	0.05	0.08	0.12	0.04	0.05	0.03	0.02	0.00	0.05	0.27	0.01
C6	0.00	0.01	0.06	0.12	0.00	0.08	0.00	0.09	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.05	0.14	0.05	0.11	0.17	0.56	0.10
N1	0.01	0.01	0.01	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.03	0.05	0.01	0.11	0.25	0.49	0.14
N3	0.01	0.00	0.07	0.06	0.00	0.04	0.01	0.08	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.12	0.07	0.03	0.17	0.37	0.76	0.22
N4	0.01	0.00	0.03	0.08	0.00	0.07	0.01	0.12	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.09	0.09	0.02	0.18	0.34	0.90	0.20
O2	0.02	0.00	0.13	0.08	0.01	0.02	0.01	0.04	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.18	0.13	0.05	0.14	0.37	0.57	0.22
O2'	0.01	0.12	0.01	0.02	0.08	0.06	0.04	0.05	0.05	0.03	0.12	0.09	0.18	0.00	0.04	0.06	0.04	0.15	0.24	0.10
O3'	0.01	0.07	0.02	0.00	0.09	0.01	0.14	0.03	0.14	0.05	0.07	0.09	0.13	0.04	0.00	0.01	0.17	0.34	0.59	0.26
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.04	0.02	0.05	0.01	0.03	0.02	0.05	0.06	0.01	0.00	0.09	0.24	0.21	0.15
O5'	0.08	0.15	0.10	0.13	0.17	0.01	0.14	0.00	0.11	0.11	0.17	0.18	0.14	0.04	0.17	0.09	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.21	0.34	0.21	0.25	0.32	0.09	0.21	0.05	0.17	0.25	0.37	0.34	0.37	0.15	0.34	0.24	0.02	0.00	0.02	0.01
OP2	0.28	0.62	0.28	0.36	0.81	0.16	0.74	0.27	0.56	0.49	0.76	0.90	0.57	0.24	0.59	0.21	0.02	0.02	0.00	0.00
P	0.12	0.21	0.16	0.20	0.19	0.03	0.12	0.01	0.10	0.14	0.22	0.20	0.22	0.10	0.26	0.15	0.00	0.01	0.00	0.00