Doublet Group distance statistics: 54070

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
N3	A	0, 0.000, 0.005, 0.009, 0.009 max_d=0.009 avg_d=0.005 std_dev=0.005
C4	A	0, 0.000, 0.007, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.007
C6	A	0, 0.000, 0.007, 0.015, 0.015 max_d=0.015 avg_d=0.007 std_dev=0.007
N1	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C5	A	0, 0.000, 0.009, 0.018, 0.018 max_d=0.018 avg_d=0.009 std_dev=0.009
C2	A	0, 0.000, 0.010, 0.020, 0.020 max_d=0.020 avg_d=0.010 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.000, 0.011, 0.021, 0.021 max_d=0.021 avg_d=0.011 std_dev=0.011
O2	A	0, 0.000, 0.017, 0.034, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.017 std_dev=0.017
N4	A	0, 0.000, 0.022, 0.044, 0.044 max_d=0.044 avg_d=0.022 std_dev=0.022
C5'	B	0, 0.000, 0.175, 0.350, 0.350 max_d=0.350 avg_d=0.175 std_dev=0.175
C4'	B	0, 0.000, 0.236, 0.472, 0.472 max_d=0.472 avg_d=0.236 std_dev=0.236
O5'	B	0, 0.000, 0.240, 0.480, 0.480 max_d=0.480 avg_d=0.240 std_dev=0.240
C3'	B	0, 0.000, 0.264, 0.528, 0.528 max_d=0.528 avg_d=0.264 std_dev=0.264
O3'	B	0, 0.000, 0.285, 0.570, 0.570 max_d=0.570 avg_d=0.285 std_dev=0.285
C1'	B	0, 0.000, 0.373, 0.746, 0.746 max_d=0.746 avg_d=0.373 std_dev=0.373
C2'	B	0, 0.000, 0.381, 0.761, 0.761 max_d=0.761 avg_d=0.381 std_dev=0.381
O4'	B	0, 0.000, 0.385, 0.769, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.385 std_dev=0.385
P	B	0, 0.000, 0.393, 0.786, 0.786 max_d=0.786 avg_d=0.393 std_dev=0.393
N1	B	0, 0.000, 0.434, 0.867, 0.867 max_d=0.867 avg_d=0.434 std_dev=0.434
O2'	B	0, 0.000, 0.478, 0.956, 0.956 max_d=0.956 avg_d=0.478 std_dev=0.478
OP2	B	0, 0.000, 0.493, 0.986, 0.986 max_d=0.986 avg_d=0.493 std_dev=0.493
C2	B	0, 0.000, 0.503, 1.006, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.503 std_dev=0.503
OP1	B	0, 0.000, 0.510, 1.020, 1.020 max_d=1.020 avg_d=0.510 std_dev=0.510
O2	B	0, 0.000, 0.556, 1.113, 1.113 max_d=1.113 avg_d=0.556 std_dev=0.556
C2'	A	0, 0.000, 0.579, 1.158, 1.158 max_d=1.158 avg_d=0.579 std_dev=0.579
O4'	A	0, 0.000, 0.603, 1.207, 1.207 max_d=1.207 avg_d=0.603 std_dev=0.603
C6	B	0, 0.000, 0.617, 1.234, 1.234 max_d=1.234 avg_d=0.617 std_dev=0.617
N3	B	0, 0.000, 0.678, 1.355, 1.355 max_d=1.355 avg_d=0.678 std_dev=0.678
C5	B	0, 0.000, 0.687, 1.373, 1.373 max_d=1.373 avg_d=0.687 std_dev=0.687
C4	B	0, 0.000, 0.698, 1.397, 1.397 max_d=1.397 avg_d=0.698 std_dev=0.698
O5'	A	0, 0.000, 0.734, 1.467, 1.467 max_d=1.467 avg_d=0.734 std_dev=0.734
N4	B	0, 0.000, 0.870, 1.741, 1.741 max_d=1.741 avg_d=0.870 std_dev=0.870
O2'	A	0, 0.000, 0.946, 1.891, 1.891 max_d=1.891 avg_d=0.946 std_dev=0.946
C3'	A	0, 0.000, 1.072, 2.144, 2.144 max_d=2.144 avg_d=1.072 std_dev=1.072
C4'	A	0, 0.000, 1.137, 2.274, 2.274 max_d=2.274 avg_d=1.137 std_dev=1.137
P	A	0, 0.000, 1.432, 2.863, 2.863 max_d=2.863 avg_d=1.432 std_dev=1.432
O3'	A	0, 0.000, 1.524, 3.049, 3.049 max_d=3.049 avg_d=1.524 std_dev=1.524
C5'	A	0, 0.000, 1.551, 3.102, 3.102 max_d=3.102 avg_d=1.551 std_dev=1.551
OP1	A	0, 0.000, 2.431, 4.862, 4.862 max_d=4.862 avg_d=2.431 std_dev=2.431
OP2	A	0, 0.000, 2.599, 5.198, 5.198 max_d=5.198 avg_d=2.599 std_dev=2.599

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.02	0.25	0.00	0.10	0.92	0.11	0.25
C2	0.00	0.00	0.16	0.35	0.00	0.19	0.00	0.31	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.21	0.06	0.02	0.02	0.95	0.56	0.09
C2'	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00	0.09	0.12	0.13	0.01	0.11	0.01	0.28	0.00	0.03	0.00	0.36	0.86	0.00	0.39
C3'	0.00	0.35	0.00	0.00	0.41	0.00	0.32	0.00	0.23	0.24	0.42	0.44	0.32	0.00	0.01	0.00	0.15	0.46	0.15	0.13
C4	0.01	0.00	0.01	0.41	0.00	0.28	0.00	0.48	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.31	0.22	0.04	0.13	0.73	0.93	0.11
C4'	0.00	0.19	0.00	0.00	0.28	0.00	0.27	0.00	0.22	0.16	0.25	0.31	0.13	0.21	0.03	0.00	0.01	0.46	0.05	0.14
C5	0.01	0.00	0.09	0.32	0.00	0.27	0.00	0.45	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.29	0.18	0.08	0.13	0.66	0.90	0.13
C5'	0.02	0.31	0.12	0.00	0.48	0.00	0.45	0.00	0.34	0.25	0.42	0.53	0.24	0.06	0.11	0.02	0.00	0.08	0.00	0.01
C6	0.01	0.00	0.13	0.23	0.00	0.22	0.00	0.34	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.23	0.08	0.09	0.06	0.80	0.60	0.02
N1	0.00	0.00	0.01	0.24	0.00	0.16	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.17	0.00	0.02	0.01	0.93	0.43	0.13
N3	0.00	0.00	0.11	0.42	0.00	0.25	0.00	0.42	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.28	0.17	0.00	0.08	0.87	0.78	0.02
N4	0.00	0.01	0.01	0.44	0.00	0.31	0.00	0.53	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.34	0.28	0.05	0.16	0.62	1.07	0.19
O2	0.01	0.00	0.28	0.32	0.01	0.13	0.01	0.24	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.12	0.01	0.06	0.02	1.00	0.44	0.15
O2'	0.02	0.21	0.00	0.00	0.31	0.21	0.29	0.06	0.23	0.17	0.28	0.34	0.12	0.00	0.06	0.21	0.13	0.68	0.09	0.22
O3'	0.25	0.06	0.03	0.01	0.22	0.03	0.18	0.11	0.08	0.00	0.17	0.28	0.01	0.06	0.00	0.17	0.02	0.37	0.17	0.05
O4'	0.00	0.02	0.00	0.00	0.04	0.00	0.08	0.02	0.09	0.02	0.00	0.05	0.06	0.21	0.17	0.00	0.03	0.84	0.07	0.24
O5'	0.10	0.02	0.36	0.15	0.13	0.01	0.13	0.00	0.06	0.01	0.08	0.16	0.02	0.13	0.02	0.03	0.00	0.01	0.01	0.00
OP1	0.92	0.95	0.86	0.46	0.73	0.46	0.66	0.08	0.80	0.93	0.87	0.62	1.00	0.68	0.37	0.84	0.01	0.00	0.00	0.00
OP2	0.11	0.56	0.00	0.15	0.93	0.05	0.90	0.00	0.60	0.43	0.78	1.07	0.44	0.09	0.17	0.07	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.25	0.09	0.39	0.13	0.11	0.14	0.13	0.01	0.02	0.13	0.02	0.19	0.15	0.22	0.05	0.24	0.00	0.00	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.20	0.08	0.22	0.06	0.02	0.08	0.21	0.02	0.27	0.14	0.12	0.04	0.24	0.33	0.04	0.15	0.01	0.01	0.26	0.12
C2	0.24	0.03	0.25	0.10	0.10	0.11	0.31	0.00	0.36	0.21	0.08	0.03	0.23	0.32	0.07	0.20	0.02	0.08	0.29	0.16
C2'	0.02	0.17	0.02	0.19	0.06	0.21	0.09	0.33	0.12	0.00	0.19	0.10	0.30	0.13	0.26	0.09	0.31	0.33	0.53	0.41
C3'	0.19	0.03	0.16	0.08	0.27	0.05	0.46	0.05	0.45	0.24	0.06	0.27	0.21	0.13	0.04	0.13	0.06	0.14	0.00	0.05
C4	0.25	0.09	0.26	0.15	0.05	0.14	0.33	0.03	0.39	0.22	0.19	0.05	0.29	0.30	0.13	0.24	0.00	0.10	0.28	0.17
C4'	0.10	0.12	0.09	0.10	0.12	0.09	0.34	0.14	0.35	0.12	0.09	0.11	0.37	0.04	0.05	0.09	0.13	0.29	0.09	0.14
C5	0.23	0.19	0.27	0.15	0.08	0.13	0.20	0.01	0.31	0.15	0.28	0.17	0.36	0.30	0.13	0.21	0.01	0.07	0.28	0.16
C5'	0.11	0.05	0.07	0.13	0.25	0.10	0.46	0.23	0.44	0.18	0.02	0.26	0.32	0.09	0.02	0.10	0.21	0.41	0.29	0.29
C6	0.21	0.16	0.25	0.10	0.07	0.09	0.17	0.02	0.26	0.12	0.23	0.14	0.34	0.33	0.09	0.17	0.02	0.04	0.27	0.14
N1	0.22	0.09	0.24	0.09	0.02	0.09	0.23	0.02	0.30	0.16	0.15	0.05	0.27	0.33	0.06	0.17	0.02	0.05	0.28	0.15
N3	0.26	0.02	0.26	0.13	0.13	0.13	0.36	0.02	0.40	0.24	0.08	0.05	0.22	0.31	0.10	0.23	0.01	0.10	0.29	0.17
N4	0.25	0.07	0.25	0.17	0.08	0.17	0.40	0.05	0.43	0.24	0.21	0.05	0.25	0.26	0.14	0.27	0.01	0.12	0.27	0.17
O2	0.24	0.00	0.23	0.09	0.14	0.10	0.33	0.01	0.36	0.22	0.03	0.09	0.19	0.32	0.06	0.20	0.02	0.08	0.30	0.17
O2'	0.07	0.24	0.12	0.11	0.28	0.13	0.10	0.31	0.01	0.05	0.35	0.38	0.31	0.34	0.10	0.03	0.31	0.37	0.68	0.48
O3'	0.09	0.14	0.07	0.07	0.15	0.07	0.40	0.13	0.39	0.12	0.10	0.15	0.42	0.01	0.02	0.09	0.12	0.28	0.09	0.14
O4'	0.10	0.20	0.11	0.09	0.04	0.10	0.17	0.09	0.22	0.05	0.22	0.08	0.42	0.17	0.10	0.10	0.08	0.18	0.09	0.03
O5'	0.02	0.24	0.02	0.04	0.07	0.04	0.14	0.10	0.19	0.01	0.24	0.10	0.43	0.01	0.01	0.03	0.10	0.27	0.05	0.12
OP1	0.68	1.16	0.83	0.25	0.77	0.02	0.39	0.43	0.33	0.73	1.11	0.78	1.51	0.91	0.03	0.30	0.38	0.90	0.40	0.52
OP2	0.10	0.16	0.04	0.30	0.66	0.21	0.89	0.61	0.78	0.38	0.35	0.73	0.20	0.59	0.00	0.15	0.53	0.82	0.94	0.75
P	0.17	0.40	0.27	0.02	0.09	0.08	0.16	0.34	0.18	0.13	0.33	0.08	0.66	0.47	0.01	0.05	0.29	0.59	0.38	0.40

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	N1	N3	N4	O2	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.08	0.09	0.15	0.14
C2	0.00	0.00	0.11	0.22	0.00	0.14	0.00	0.25	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.02	0.22	0.00	0.24	0.34	0.47	0.38
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.03	0.00	0.04	0.01	0.07	0.01	0.09	0.03	0.20	0.00	0.02	0.02	0.03	0.01	0.12	0.08
C3'	0.00	0.22	0.00	0.00	0.15	0.00	0.02	0.01	0.05	0.07	0.23	0.17	0.29	0.00	0.01	0.01	0.00	0.07	0.07	0.02
C4	0.01	0.00	0.03	0.15	0.00	0.17	0.00	0.33	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.15	0.03	0.39	0.59	0.67	0.60
C4'	0.00	0.14	0.00	0.00	0.17	0.00	0.12	0.00	0.07	0.09	0.17	0.19	0.13	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.03	0.00
C5	0.01	0.00	0.04	0.02	0.00	0.12	0.00	0.27	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.05	0.40	0.59	0.60	0.62
C5'	0.04	0.25	0.01	0.01	0.33	0.00	0.27	0.00	0.18	0.18	0.32	0.37	0.23	0.01	0.04	0.00	0.01	0.06	0.02	0.01
C6	0.01	0.00	0.07	0.05	0.01	0.07	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.06	0.05	0.33	0.43	0.40	0.47
N1	0.00	0.00	0.01	0.07	0.00	0.09	0.00	0.18	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.01	0.22	0.29	0.35	0.34
N3	0.00	0.00	0.09	0.23	0.00	0.17	0.00	0.32	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.23	0.01	0.32	0.48	0.60	0.51
N4	0.01	0.00	0.03	0.17	0.00	0.19	0.01	0.37	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.18	0.04	0.43	0.69	0.75	0.68
O2	0.01	0.00	0.20	0.29	0.00	0.13	0.00	0.23	0.00	0.00	0.00	0.00	0.00	0.04	0.31	0.03	0.17	0.24	0.42	0.30
O2'	0.01	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00	0.03	0.01	0.03	0.01	0.00	0.01	0.04	0.00	0.03	0.06	0.01	0.05	0.09	0.05
O3'	0.01	0.22	0.02	0.01	0.15	0.01	0.01	0.04	0.06	0.06	0.23	0.18	0.31	0.03	0.00	0.00	0.04	0.17	0.03	0.05
O4'	0.00	0.00	0.02	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.05	0.01	0.01	0.04	0.03	0.06	0.00	0.00	0.02	0.03	0.02	0.05
O5'	0.08	0.24	0.03	0.00	0.39	0.01	0.40	0.01	0.33	0.22	0.32	0.43	0.17	0.01	0.04	0.02	0.00	0.00	0.01	0.00
OP1	0.09	0.34	0.01	0.07	0.59	0.06	0.59	0.06	0.43	0.29	0.48	0.69	0.24	0.05	0.17	0.03	0.00	0.00	0.00	0.00
OP2	0.15	0.47	0.12	0.07	0.67	0.03	0.60	0.02	0.40	0.35	0.60	0.75	0.42	0.09	0.03	0.02	0.01	0.00	0.00	0.00
P	0.14	0.38	0.08	0.02	0.60	0.00	0.62	0.01	0.47	0.34	0.51	0.68	0.30	0.05	0.05	0.05	0.00	0.00	0.00	0.00