Doublet Group distance statistics: 54102

back

Distances from reference structure (by RMSD)

5, 27, 16, 5, 0, 1, 1, 1, 1, 3, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.005, 0.011, 0.017, 0.031 max_d=0.031 avg_d=0.011 std_dev=0.006
C2	A	0, 0.002, 0.009, 0.016, 0.032 max_d=0.032 avg_d=0.009 std_dev=0.007
N3	A	0, 0.005, 0.014, 0.024, 0.056 max_d=0.056 avg_d=0.014 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.006, 0.016, 0.026, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.016 std_dev=0.010
N1	A	0, 0.005, 0.017, 0.028, 0.061 max_d=0.061 avg_d=0.017 std_dev=0.011
C5	A	0, 0.006, 0.018, 0.029, 0.058 max_d=0.058 avg_d=0.018 std_dev=0.012
N9	A	0, 0.006, 0.019, 0.032, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.019 std_dev=0.013
C4	A	0, 0.005, 0.019, 0.033, 0.076 max_d=0.076 avg_d=0.019 std_dev=0.014
N6	A	0, 0.016, 0.037, 0.059, 0.107 max_d=0.107 avg_d=0.037 std_dev=0.021
N7	A	0, 0.009, 0.033, 0.057, 0.112 max_d=0.112 avg_d=0.033 std_dev=0.024
C8	A	0, 0.008, 0.035, 0.062, 0.120 max_d=0.120 avg_d=0.035 std_dev=0.027
O2'	B	0, 0.100, 0.217, 0.335, 0.684 max_d=0.684 avg_d=0.217 std_dev=0.117
O5'	B	0, 0.073, 0.195, 0.317, 0.589 max_d=0.589 avg_d=0.195 std_dev=0.122
O3'	B	0, 0.111, 0.242, 0.373, 0.656 max_d=0.656 avg_d=0.242 std_dev=0.131
P	B	0, 0.077, 0.211, 0.345, 0.634 max_d=0.634 avg_d=0.211 std_dev=0.134
C2'	B	0, 0.094, 0.229, 0.364, 0.769 max_d=0.769 avg_d=0.229 std_dev=0.135
C3'	B	0, 0.095, 0.241, 0.386, 0.771 max_d=0.771 avg_d=0.241 std_dev=0.146
C1'	B	0, 0.113, 0.266, 0.419, 0.863 max_d=0.863 avg_d=0.266 std_dev=0.153
P	A	0, 0.094, 0.256, 0.418, 0.794 max_d=0.794 avg_d=0.256 std_dev=0.162
O5'	A	0, 0.019, 0.188, 0.357, 0.743 max_d=0.743 avg_d=0.188 std_dev=0.169
OP1	A	0, 0.129, 0.304, 0.478, 0.886 max_d=0.886 avg_d=0.304 std_dev=0.175
OP1	B	0, 0.064, 0.240, 0.415, 0.779 max_d=0.779 avg_d=0.240 std_dev=0.176
O4'	B	0, 0.143, 0.328, 0.513, 1.006 max_d=1.006 avg_d=0.328 std_dev=0.185
C4'	B	0, 0.094, 0.279, 0.465, 0.925 max_d=0.925 avg_d=0.279 std_dev=0.186
C5'	B	0, 0.074, 0.262, 0.450, 0.873 max_d=0.873 avg_d=0.262 std_dev=0.188
O4'	A	0, -0.059, 0.144, 0.347, 0.796 max_d=0.796 avg_d=0.144 std_dev=0.203
C2'	A	0, -0.060, 0.161, 0.382, 0.879 max_d=0.879 avg_d=0.161 std_dev=0.221
N9	B	0, 0.067, 0.304, 0.540, 1.155 max_d=1.155 avg_d=0.304 std_dev=0.236
OP2	A	0, 0.130, 0.384, 0.638, 1.279 max_d=1.279 avg_d=0.384 std_dev=0.254
C5'	A	0, -0.035, 0.253, 0.541, 1.215 max_d=1.215 avg_d=0.253 std_dev=0.288
C8	B	0, 0.066, 0.363, 0.659, 1.488 max_d=1.488 avg_d=0.363 std_dev=0.296
C4'	A	0, -0.121, 0.203, 0.527, 1.243 max_d=1.243 avg_d=0.203 std_dev=0.324
N7	B	0, 0.043, 0.390, 0.737, 1.638 max_d=1.638 avg_d=0.390 std_dev=0.347
C3'	A	0, -0.173, 0.230, 0.634, 1.486 max_d=1.486 avg_d=0.230 std_dev=0.404
OP2	B	0, -0.071, 0.354, 0.780, 1.801 max_d=1.801 avg_d=0.354 std_dev=0.425
O2'	A	0, -0.133, 0.294, 0.721, 1.630 max_d=1.630 avg_d=0.294 std_dev=0.427
C4	B	0, -0.111, 0.368, 0.847, 1.943 max_d=1.943 avg_d=0.368 std_dev=0.479
C5	B	0, -0.079, 0.403, 0.886, 1.989 max_d=1.989 avg_d=0.403 std_dev=0.482
O3'	A	0, -0.372, 0.356, 1.084, 2.623 max_d=2.623 avg_d=0.356 std_dev=0.728
C6	B	0, -0.242, 0.505, 1.253, 2.890 max_d=2.890 avg_d=0.505 std_dev=0.748
N3	B	0, -0.322, 0.432, 1.186, 2.789 max_d=2.789 avg_d=0.432 std_dev=0.754
O6	B	0, -0.223, 0.567, 1.357, 3.080 max_d=3.080 avg_d=0.567 std_dev=0.790
N1	B	0, -0.449, 0.569, 1.587, 3.725 max_d=3.725 avg_d=0.569 std_dev=1.018
C2	B	0, -0.488, 0.539, 1.566, 3.704 max_d=3.704 avg_d=0.539 std_dev=1.027
N2	B	0, -0.685, 0.653, 1.992, 4.836 max_d=4.836 avg_d=0.653 std_dev=1.338

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.07	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.02	0.20	0.00	0.13	0.09	0.22	0.13
C2	0.02	0.00	0.06	0.03	0.01	0.14	0.01	0.17	0.01	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.33	0.16	0.11	0.06	0.12	0.07
C2'	0.00	0.06	0.00	0.00	0.03	0.01	0.02	0.17	0.03	0.06	0.04	0.06	0.03	0.04	0.02	0.00	0.02	0.01	0.34	0.36	0.47	0.38
C3'	0.01	0.03	0.00	0.00	0.07	0.00	0.14	0.01	0.11	0.23	0.05	0.04	0.15	0.22	0.11	0.02	0.01	0.01	0.04	0.13	0.07	0.07
C4	0.01	0.01	0.03	0.07	0.00	0.05	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.08	0.18	0.08	0.09	0.06	0.13	0.07
C4'	0.01	0.14	0.01	0.00	0.05	0.00	0.03	0.00	0.05	0.13	0.10	0.13	0.04	0.09	0.04	0.16	0.01	0.00	0.01	0.04	0.03	0.01
C5	0.01	0.01	0.02	0.14	0.00	0.03	0.00	0.09	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.15	0.07	0.05	0.08	0.08	0.11	0.07
C5'	0.07	0.17	0.17	0.01	0.11	0.00	0.09	0.00	0.12	0.08	0.15	0.16	0.11	0.08	0.07	0.03	0.14	0.01	0.01	0.04	0.04	0.01
C6	0.02	0.01	0.03	0.11	0.01	0.05	0.01	0.12	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.12	0.12	0.09	0.09	0.08	0.10	0.08
C8	0.01	0.01	0.06	0.23	0.00	0.13	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.25	0.12	0.07	0.09	0.08	0.15	0.08
N1	0.02	0.00	0.04	0.05	0.01	0.10	0.01	0.15	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.06	0.23	0.13	0.09	0.07	0.10	0.07
N3	0.02	0.00	0.06	0.04	0.00	0.13	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.06	0.33	0.15	0.11	0.06	0.14	0.08
N6	0.02	0.01	0.03	0.15	0.01	0.04	0.01	0.11	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.16	0.06	0.08	0.09	0.10	0.11	0.09
N7	0.01	0.01	0.04	0.22	0.00	0.09	0.00	0.08	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.24	0.10	0.04	0.10	0.09	0.11	0.09
N9	0.00	0.01	0.02	0.11	0.00	0.04	0.00	0.07	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.09	0.01	0.09	0.07	0.17	0.09
O2'	0.02	0.06	0.00	0.02	0.08	0.16	0.15	0.03	0.12	0.25	0.06	0.06	0.16	0.24	0.12	0.00	0.05	0.13	0.30	0.31	0.58	0.38
O3'	0.20	0.33	0.02	0.01	0.18	0.01	0.07	0.14	0.12	0.12	0.23	0.33	0.06	0.10	0.09	0.05	0.00	0.16	0.10	0.13	0.17	0.12
O4'	0.00	0.16	0.01	0.01	0.08	0.00	0.05	0.01	0.09	0.07	0.13	0.15	0.08	0.04	0.01	0.13	0.16	0.00	0.05	0.08	0.06	0.06
O5'	0.13	0.11	0.34	0.04	0.09	0.01	0.08	0.01	0.09	0.09	0.09	0.11	0.09	0.10	0.09	0.30	0.10	0.05	0.00	0.02	0.02	0.00
OP1	0.09	0.06	0.36	0.13	0.06	0.04	0.08	0.04	0.08	0.08	0.07	0.06	0.10	0.09	0.07	0.31	0.13	0.08	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.22	0.12	0.47	0.07	0.13	0.03	0.11	0.04	0.10	0.15	0.10	0.14	0.11	0.11	0.17	0.58	0.17	0.06	0.02	0.01	0.00	0.01
P	0.13	0.07	0.38	0.07	0.07	0.01	0.07	0.01	0.08	0.08	0.07	0.08	0.09	0.09	0.09	0.38	0.12	0.06	0.00	0.01	0.01	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.08	0.64	0.09	0.09	0.28	0.09	0.19	0.14	0.32	0.10	0.53	0.87	0.53	0.06	0.09	0.08	0.07	0.08	0.10	0.28	0.08	0.14	0.07
C2	0.09	0.95	0.09	0.10	0.29	0.09	0.18	0.09	0.42	0.28	0.80	1.34	0.67	0.20	0.09	0.11	0.10	0.12	0.10	0.36	0.09	0.29	0.08
C2'	0.24	0.69	0.25	0.28	0.39	0.28	0.30	0.29	0.40	0.09	0.58	0.88	0.61	0.12	0.23	0.23	0.28	0.27	0.19	0.35	0.08	0.07	0.15
C3'	0.07	0.57	0.05	0.06	0.24	0.07	0.17	0.11	0.28	0.11	0.47	0.77	0.46	0.06	0.07	0.12	0.05	0.05	0.18	0.25	0.29	0.27	0.20
C4	0.05	0.86	0.05	0.07	0.34	0.06	0.23	0.10	0.43	0.18	0.72	1.14	0.67	0.09	0.07	0.09	0.08	0.06	0.08	0.37	0.08	0.21	0.06
C4'	0.13	0.56	0.12	0.06	0.30	0.06	0.24	0.06	0.33	0.06	0.48	0.73	0.48	0.10	0.15	0.18	0.06	0.10	0.06	0.30	0.11	0.17	0.07
C5	0.06	0.94	0.06	0.08	0.42	0.07	0.32	0.10	0.54	0.17	0.83	1.17	0.75	0.07	0.10	0.10	0.09	0.08	0.08	0.49	0.09	0.20	0.06
C5'	0.21	0.49	0.20	0.10	0.32	0.08	0.28	0.06	0.34	0.15	0.44	0.58	0.44	0.19	0.22	0.28	0.08	0.18	0.06	0.32	0.07	0.11	0.06
C6	0.09	1.05	0.09	0.11	0.44	0.10	0.35	0.10	0.63	0.23	0.96	1.28	0.79	0.11	0.11	0.11	0.11	0.12	0.10	0.56	0.09	0.26	0.09
C8	0.09	0.75	0.08	0.07	0.38	0.09	0.30	0.14	0.46	0.08	0.66	0.93	0.63	0.08	0.14	0.09	0.07	0.08	0.09	0.42	0.10	0.11	0.07
N1	0.10	1.05	0.11	0.11	0.37	0.11	0.26	0.09	0.55	0.29	0.95	1.37	0.74	0.18	0.10	0.12	0.11	0.14	0.11	0.48	0.10	0.30	0.10
N3	0.07	0.85	0.07	0.08	0.27	0.07	0.17	0.09	0.37	0.24	0.69	1.21	0.63	0.16	0.07	0.10	0.08	0.08	0.09	0.31	0.08	0.25	0.06
N6	0.11	1.06	0.10	0.12	0.51	0.12	0.46	0.11	0.75	0.21	1.04	1.23	0.80	0.12	0.16	0.11	0.11	0.14	0.12	0.70	0.11	0.26	0.11
N7	0.08	0.85	0.07	0.07	0.44	0.08	0.36	0.12	0.55	0.09	0.77	1.02	0.71	0.09	0.15	0.10	0.09	0.07	0.08	0.51	0.10	0.13	0.06
N9	0.06	0.75	0.06	0.06	0.33	0.07	0.24	0.13	0.40	0.12	0.63	0.98	0.62	0.05	0.09	0.07	0.06	0.06	0.09	0.35	0.09	0.15	0.06
O2'	0.22	0.61	0.25	0.32	0.34	0.35	0.27	0.43	0.37	0.10	0.53	0.78	0.53	0.13	0.21	0.16	0.26	0.29	0.34	0.33	0.20	0.21	0.34
O3'	0.09	0.74	0.08	0.09	0.35	0.11	0.29	0.15	0.45	0.06	0.66	0.97	0.59	0.10	0.14	0.17	0.10	0.05	0.19	0.43	0.22	0.25	0.17
O4'	0.08	0.59	0.09	0.10	0.27	0.09	0.20	0.10	0.32	0.08	0.49	0.80	0.49	0.06	0.10	0.10	0.12	0.08	0.09	0.29	0.08	0.19	0.07
O5'	0.09	0.40	0.11	0.03	0.22	0.03	0.18	0.05	0.25	0.08	0.35	0.50	0.35	0.09	0.11	0.18	0.01	0.06	0.09	0.23	0.14	0.17	0.09
OP1	0.05	0.09	0.04	0.02	0.06	0.05	0.06	0.08	0.07	0.05	0.08	0.10	0.08	0.05	0.05	0.09	0.02	0.05	0.09	0.07	0.11	0.16	0.09
OP2	0.03	0.27	0.07	0.04	0.14	0.08	0.13	0.13	0.19	0.06	0.25	0.34	0.22	0.07	0.06	0.12	0.02	0.06	0.19	0.18	0.18	0.17	0.13
P	0.03	0.19	0.06	0.02	0.09	0.04	0.08	0.07	0.12	0.04	0.16	0.23	0.16	0.04	0.04	0.11	0.00	0.03	0.10	0.11	0.13	0.16	0.09

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.07	0.01	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.00	0.01	0.03	0.00	0.21	0.01	0.16	0.19	0.07
C2	0.02	0.00	0.28	0.22	0.01	0.12	0.01	0.34	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.27	0.09	0.03	0.67	0.01	0.92	0.17	0.60
C2'	0.00	0.28	0.00	0.00	0.15	0.01	0.08	0.07	0.14	0.10	0.22	0.33	0.27	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.13	0.11	0.08	0.22	0.05
C3'	0.01	0.22	0.00	0.00	0.12	0.00	0.09	0.02	0.13	0.06	0.19	0.26	0.20	0.04	0.03	0.02	0.01	0.01	0.03	0.12	0.08	0.17	0.06
C4	0.01	0.01	0.15	0.12	0.00	0.09	0.00	0.25	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.10	0.04	0.02	0.53	0.01	0.64	0.07	0.41
C4'	0.00	0.12	0.01	0.00	0.09	0.00	0.09	0.01	0.11	0.06	0.13	0.13	0.10	0.08	0.05	0.02	0.01	0.00	0.02	0.12	0.04	0.13	0.04
C5	0.01	0.01	0.08	0.09	0.00	0.09	0.00	0.27	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.06	0.04	0.01	0.53	0.01	0.69	0.10	0.43
C5'	0.07	0.34	0.07	0.02	0.25	0.01	0.27	0.00	0.32	0.14	0.35	0.36	0.29	0.20	0.16	0.06	0.01	0.02	0.01	0.32	0.01	0.05	0.01
C6	0.01	0.00	0.14	0.13	0.01	0.11	0.01	0.32	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.10	0.06	0.02	0.61	0.01	0.87	0.18	0.55
C8	0.01	0.01	0.10	0.06	0.00	0.06	0.00	0.14	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.12	0.04	0.04	0.26	0.01	0.20	0.18	0.09
N1	0.02	0.00	0.22	0.19	0.01	0.13	0.01	0.35	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.19	0.08	0.02	0.68	0.01	0.97	0.20	0.63
N2	0.02	0.00	0.33	0.26	0.01	0.13	0.01	0.36	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.35	0.10	0.04	0.70	0.01	0.98	0.19	0.65
N3	0.02	0.00	0.27	0.20	0.00	0.10	0.00	0.29	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.26	0.07	0.03	0.60	0.01	0.76	0.11	0.50
N7	0.01	0.01	0.05	0.04	0.00	0.08	0.00	0.20	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.10	0.03	0.03	0.37	0.01	0.42	0.08	0.25
N9	0.00	0.01	0.02	0.03	0.00	0.05	0.00	0.16	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.00	0.04	0.03	0.01	0.36	0.01	0.34	0.11	0.20
O2'	0.01	0.27	0.00	0.02	0.10	0.02	0.06	0.06	0.10	0.12	0.19	0.35	0.26	0.10	0.04	0.00	0.04	0.02	0.12	0.08	0.09	0.23	0.06
O3'	0.03	0.09	0.02	0.01	0.04	0.01	0.04	0.01	0.06	0.04	0.08	0.10	0.07	0.03	0.03	0.04	0.00	0.05	0.03	0.06	0.08	0.15	0.06
O4'	0.00	0.03	0.01	0.01	0.02	0.00	0.01	0.02	0.02	0.04	0.02	0.04	0.03	0.03	0.01	0.02	0.05	0.00	0.12	0.02	0.10	0.21	0.08
O5'	0.21	0.67	0.13	0.03	0.53	0.02	0.53	0.01	0.61	0.26	0.68	0.70	0.60	0.37	0.36	0.12	0.03	0.12	0.00	0.60	0.01	0.02	0.01
O6	0.01	0.01	0.11	0.12	0.01	0.12	0.01	0.32	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.08	0.06	0.02	0.60	0.00	0.88	0.21	0.56
OP1	0.16	0.92	0.08	0.08	0.64	0.04	0.69	0.01	0.87	0.20	0.97	0.98	0.76	0.42	0.34	0.09	0.08	0.10	0.01	0.88	0.00	0.01	0.01
OP2	0.19	0.17	0.22	0.17	0.07	0.13	0.10	0.05	0.18	0.18	0.20	0.19	0.11	0.08	0.11	0.23	0.15	0.21	0.02	0.21	0.01	0.00	0.00
P	0.07	0.60	0.05	0.06	0.41	0.04	0.43	0.01	0.55	0.09	0.63	0.65	0.50	0.25	0.20	0.06	0.06	0.08	0.01	0.56	0.01	0.00	0.00