Doublet Group distance statistics: 54103

back

Distances from reference structure (by RMSD)

1, 7, 19, 9, 8, 7, 1, 0, 1, 2, 1, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0, 0,

RMS Distances matrix

Distances from reference structure (by atoms)

Atom	Chain	Distances
C6	A	0, 0.004, 0.008, 0.012, 0.019 max_d=0.019 avg_d=0.008 std_dev=0.004
C2	A	0, 0.003, 0.011, 0.019, 0.041 max_d=0.041 avg_d=0.011 std_dev=0.008
C5	A	0, 0.004, 0.013, 0.021, 0.034 max_d=0.034 avg_d=0.013 std_dev=0.009
N1	A	0, 0.007, 0.016, 0.026, 0.045 max_d=0.045 avg_d=0.016 std_dev=0.009
N3	A	0, 0.007, 0.017, 0.026, 0.042 max_d=0.042 avg_d=0.017 std_dev=0.010
C1'	A	0, 0.004, 0.015, 0.026, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.015 std_dev=0.011
C4	A	0, 0.007, 0.018, 0.030, 0.047 max_d=0.047 avg_d=0.018 std_dev=0.011
N9	A	0, 0.007, 0.020, 0.033, 0.052 max_d=0.052 avg_d=0.020 std_dev=0.013
N6	A	0, 0.014, 0.029, 0.045, 0.065 max_d=0.065 avg_d=0.029 std_dev=0.015
N7	A	0, 0.009, 0.025, 0.042, 0.069 max_d=0.069 avg_d=0.025 std_dev=0.017
C8	A	0, 0.010, 0.030, 0.050, 0.077 max_d=0.077 avg_d=0.030 std_dev=0.020
O4'	A	0, 0.016, 0.138, 0.260, 0.755 max_d=0.755 avg_d=0.138 std_dev=0.122
C2'	A	0, 0.028, 0.157, 0.285, 0.789 max_d=0.789 avg_d=0.157 std_dev=0.129
O2'	A	0, 0.058, 0.225, 0.393, 1.024 max_d=1.024 avg_d=0.225 std_dev=0.168
P	B	0, 0.164, 0.333, 0.503, 0.957 max_d=0.957 avg_d=0.333 std_dev=0.169
OP2	B	0, 0.112, 0.308, 0.505, 0.994 max_d=0.994 avg_d=0.308 std_dev=0.197
C3'	A	0, 0.037, 0.236, 0.435, 1.226 max_d=1.226 avg_d=0.236 std_dev=0.199
C4'	A	0, 0.017, 0.230, 0.444, 1.294 max_d=1.294 avg_d=0.230 std_dev=0.214
O3'	A	0, 0.093, 0.322, 0.550, 1.432 max_d=1.432 avg_d=0.322 std_dev=0.229
OP1	B	0, 0.164, 0.472, 0.779, 1.753 max_d=1.753 avg_d=0.472 std_dev=0.308
OP1	A	0, 0.025, 0.416, 0.806, 2.296 max_d=2.296 avg_d=0.416 std_dev=0.391
C5'	A	0, -0.063, 0.354, 0.772, 2.497 max_d=2.497 avg_d=0.354 std_dev=0.418
O5'	A	0, -0.217, 0.308, 0.832, 3.102 max_d=3.102 avg_d=0.308 std_dev=0.525
P	A	0, -0.175, 0.386, 0.948, 3.263 max_d=3.263 avg_d=0.386 std_dev=0.562
O5'	B	0, -0.154, 0.440, 1.034, 3.497 max_d=3.497 avg_d=0.440 std_dev=0.594
OP2	A	0, -0.365, 0.416, 1.197, 4.456 max_d=4.456 avg_d=0.416 std_dev=0.781
C5'	B	0, -0.448, 0.471, 1.390, 5.276 max_d=5.276 avg_d=0.471 std_dev=0.919
C4'	B	0, -0.818, 0.598, 2.014, 8.007 max_d=8.007 avg_d=0.598 std_dev=1.416
O4'	B	0, -0.866, 0.682, 2.230, 8.742 max_d=8.742 avg_d=0.682 std_dev=1.548
C3'	B	0, -0.942, 0.626, 2.193, 8.851 max_d=8.851 avg_d=0.626 std_dev=1.568
C8	B	0, -0.884, 0.816, 2.515, 9.595 max_d=9.595 avg_d=0.816 std_dev=1.700
C2'	B	0, -1.082, 0.732, 2.547, 10.243 max_d=10.243 avg_d=0.732 std_dev=1.814
C1'	B	0, -1.134, 0.761, 2.656, 10.642 max_d=10.642 avg_d=0.761 std_dev=1.895
O3'	B	0, -1.217, 0.712, 2.641, 10.808 max_d=10.808 avg_d=0.712 std_dev=1.929
N9	B	0, -1.141, 0.819, 2.779, 10.999 max_d=10.999 avg_d=0.819 std_dev=1.960
N7	B	0, -1.105, 0.930, 2.966, 11.439 max_d=11.439 avg_d=0.930 std_dev=2.035
O2'	B	0, -1.339, 0.859, 3.058, 12.367 max_d=12.367 avg_d=0.859 std_dev=2.198
C4	B	0, -1.492, 0.932, 3.357, 13.518 max_d=13.518 avg_d=0.932 std_dev=2.424
C5	B	0, -1.459, 0.993, 3.444, 13.678 max_d=13.678 avg_d=0.993 std_dev=2.452
N3	B	0, -1.831, 1.002, 3.834, 15.730 max_d=15.730 avg_d=1.002 std_dev=2.832
C6	B	0, -1.802, 1.130, 4.062, 16.300 max_d=16.300 avg_d=1.130 std_dev=2.932
O6	B	0, -1.886, 1.232, 4.349, 17.379 max_d=17.379 avg_d=1.232 std_dev=3.118
C2	B	0, -2.102, 1.119, 4.340, 17.849 max_d=17.849 avg_d=1.119 std_dev=3.221
N1	B	0, -2.094, 1.173, 4.440, 18.110 max_d=18.110 avg_d=1.173 std_dev=3.267
N2	B	0, -2.437, 1.217, 4.870, 20.207 max_d=20.207 avg_d=1.217 std_dev=3.654

Atoms distances (summary)

Atoms distances Chain-A - Chain-A

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N3	N6	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.00	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.02	0.01	0.01	0.00	0.02	0.02	0.00	0.07	0.16	0.07	0.04
C2	0.02	0.00	0.09	0.16	0.01	0.09	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.07	0.16	0.02	0.29	0.08	0.43	0.30
C2'	0.00	0.09	0.00	0.00	0.05	0.01	0.03	0.02	0.04	0.05	0.07	0.09	0.04	0.05	0.02	0.00	0.02	0.01	0.06	0.26	0.07	0.06
C3'	0.01	0.16	0.00	0.00	0.09	0.00	0.07	0.01	0.09	0.06	0.13	0.15	0.08	0.05	0.04	0.01	0.00	0.01	0.04	0.26	0.05	0.09
C4	0.01	0.01	0.05	0.09	0.00	0.07	0.00	0.16	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.09	0.01	0.23	0.06	0.29	0.21
C4'	0.00	0.09	0.01	0.00	0.07	0.00	0.07	0.00	0.08	0.04	0.09	0.08	0.08	0.05	0.04	0.03	0.01	0.00	0.01	0.11	0.03	0.05
C5	0.01	0.00	0.03	0.07	0.00	0.07	0.00	0.17	0.00	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.04	0.06	0.01	0.23	0.06	0.30	0.24
C5'	0.04	0.19	0.02	0.01	0.16	0.00	0.17	0.00	0.19	0.11	0.20	0.16	0.20	0.15	0.11	0.03	0.03	0.01	0.01	0.05	0.01	0.01
C6	0.01	0.00	0.04	0.09	0.00	0.08	0.00	0.19	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.01	0.01	0.05	0.09	0.01	0.27	0.08	0.39	0.30
C8	0.01	0.01	0.05	0.06	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.06	0.02	0.12	0.14	0.10	0.11
N1	0.02	0.00	0.07	0.13	0.01	0.09	0.01	0.20	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.01	0.01	0.06	0.14	0.01	0.30	0.10	0.45	0.32
N3	0.02	0.00	0.09	0.15	0.00	0.08	0.00	0.16	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.06	0.15	0.02	0.26	0.06	0.35	0.24
N6	0.01	0.01	0.04	0.08	0.01	0.08	0.01	0.20	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.05	0.08	0.02	0.26	0.11	0.39	0.31
N7	0.01	0.01	0.05	0.05	0.00	0.05	0.00	0.15	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.03	0.05	0.02	0.17	0.09	0.18	0.18
N9	0.00	0.01	0.02	0.04	0.00	0.04	0.00	0.11	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.02	0.03	0.01	0.15	0.11	0.14	0.11
O2'	0.02	0.07	0.00	0.01	0.04	0.03	0.04	0.03	0.05	0.03	0.06	0.06	0.05	0.03	0.02	0.00	0.03	0.05	0.05	0.24	0.06	0.06
O3'	0.02	0.16	0.02	0.00	0.09	0.01	0.06	0.03	0.09	0.06	0.14	0.15	0.08	0.05	0.03	0.03	0.00	0.02	0.04	0.28	0.06	0.14
O4'	0.00	0.02	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.02	0.01	0.02	0.02	0.02	0.01	0.05	0.02	0.00	0.05	0.13	0.08	0.06
O5'	0.07	0.29	0.06	0.04	0.23	0.01	0.23	0.01	0.27	0.12	0.30	0.26	0.26	0.17	0.15	0.05	0.04	0.05	0.00	0.02	0.01	0.00
OP1	0.16	0.08	0.26	0.26	0.06	0.11	0.06	0.05	0.08	0.14	0.10	0.06	0.11	0.09	0.11	0.24	0.28	0.13	0.02	0.00	0.01	0.01
OP2	0.07	0.43	0.07	0.05	0.29	0.03	0.30	0.01	0.39	0.10	0.45	0.35	0.39	0.18	0.14	0.06	0.06	0.08	0.01	0.01	0.00	0.00
P	0.04	0.30	0.06	0.09	0.21	0.05	0.24	0.01	0.30	0.11	0.32	0.24	0.31	0.18	0.11	0.06	0.14	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00

Atoms distances Chain-A - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.79	0.35	1.05	1.02	0.30	0.84	0.10	0.61	0.24	0.08	0.07	0.50	0.52	0.25	0.40	1.41	1.17	0.67	0.34	0.53	0.12	0.15	0.08
C2	0.13	0.90	0.19	0.29	0.77	0.27	1.13	0.29	1.37	0.77	1.22	0.82	0.66	1.15	0.54	0.40	0.38	0.09	0.12	1.66	0.10	0.10	0.09
C2'	0.72	0.26	1.00	1.01	0.20	0.84	0.22	0.59	0.39	0.09	0.13	0.42	0.44	0.40	0.30	1.35	1.22	0.62	0.29	0.72	0.16	0.17	0.05
C3'	0.96	0.59	1.21	1.22	0.48	1.03	0.07	0.73	0.09	0.15	0.22	0.78	0.75	0.17	0.55	1.55	1.47	0.84	0.39	0.41	0.14	0.15	0.05
C4	0.35	0.25	0.63	0.66	0.22	0.56	0.56	0.46	0.74	0.35	0.55	0.16	0.09	0.66	0.08	0.89	0.75	0.32	0.21	1.01	0.11	0.12	0.07
C4'	1.21	0.93	1.42	1.37	0.79	1.17	0.39	0.83	0.28	0.42	0.57	1.13	1.07	0.15	0.82	1.79	1.61	1.05	0.52	0.06	0.08	0.12	0.13
C5	0.26	0.31	0.54	0.55	0.28	0.47	0.58	0.41	0.73	0.39	0.56	0.22	0.15	0.68	0.14	0.75	0.58	0.24	0.18	0.96	0.10	0.11	0.07
C5'	1.49	1.28	1.66	1.60	1.11	1.41	0.72	1.01	0.63	0.70	0.93	1.49	1.41	0.46	1.12	2.00	1.88	1.32	0.68	0.33	0.07	0.10	0.23
C6	0.14	0.75	0.18	0.22	0.68	0.21	0.97	0.25	1.13	0.72	0.99	0.67	0.57	1.03	0.50	0.35	0.24	0.11	0.13	1.34	0.10	0.10	0.09
C8	0.78	0.38	1.07	1.00	0.35	0.82	0.06	0.60	0.11	0.14	0.12	0.50	0.53	0.15	0.44	1.35	1.06	0.65	0.36	0.35	0.13	0.16	0.08
N1	0.28	1.04	0.08	0.13	0.92	0.14	1.25	0.21	1.47	0.90	1.33	0.97	0.82	1.26	0.69	0.21	0.18	0.20	0.14	1.71	0.11	0.11	0.10
N3	0.18	0.53	0.46	0.53	0.45	0.46	0.82	0.40	1.04	0.53	0.86	0.44	0.31	0.89	0.26	0.72	0.64	0.20	0.16	1.34	0.10	0.11	0.07
N6	0.33	0.87	0.11	0.10	0.82	0.10	1.06	0.15	1.18	0.85	1.06	0.81	0.73	1.11	0.66	0.13	0.09	0.28	0.19	1.32	0.11	0.11	0.11
N7	0.55	0.14	0.84	0.79	0.13	0.65	0.19	0.51	0.30	0.09	0.14	0.22	0.27	0.31	0.23	1.05	0.78	0.47	0.29	0.51	0.12	0.15	0.07
N9	0.65	0.18	0.93	0.91	0.16	0.75	0.21	0.56	0.36	0.08	0.15	0.30	0.35	0.35	0.27	1.24	1.02	0.56	0.30	0.63	0.12	0.14	0.07
O2'	0.72	0.25	0.99	0.99	0.19	0.82	0.25	0.58	0.43	0.10	0.17	0.42	0.43	0.41	0.30	1.37	1.21	0.61	0.29	0.77	0.14	0.17	0.06
O3'	0.99	0.64	1.23	1.24	0.51	1.06	0.09	0.74	0.09	0.15	0.25	0.86	0.81	0.17	0.57	1.58	1.54	0.87	0.38	0.42	0.15	0.17	0.05
O4'	1.05	0.75	1.29	1.20	0.64	1.00	0.28	0.70	0.16	0.33	0.42	0.92	0.89	0.09	0.69	1.67	1.37	0.89	0.43	0.15	0.14	0.16	0.11
O5'	1.40	1.13	1.58	1.57	0.99	1.38	0.62	1.00	0.53	0.62	0.81	1.30	1.26	0.39	1.02	1.85	1.80	1.25	0.66	0.26	0.06	0.10	0.21
OP1	1.48	1.31	1.59	1.60	1.11	1.49	0.71	1.04	0.64	0.65	0.96	1.52	1.43	0.42	1.10	1.80	1.95	1.37	0.63	0.35	0.08	0.11	0.14
OP2	1.31	1.04	1.45	1.50	0.93	1.42	0.61	1.06	0.54	0.60	0.77	1.19	1.16	0.39	0.96	1.56	1.63	1.24	0.67	0.30	0.08	0.14	0.20
P	1.57	1.32	1.71	1.74	1.18	1.59	0.81	1.16	0.73	0.78	1.01	1.49	1.44	0.56	1.19	1.89	2.01	1.45	0.78	0.46	0.12	0.15	0.28

Atoms distances Chain-B - Chain-B

Atom	C1'	C2	C2'	C3'	C4	C4'	C5	C5'	C6	C8	N1	N2	N3	N7	N9	O2'	O3'	O4'	O5'	O6	OP1	OP2	P
C1'	0.00	0.02	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.04	0.01	0.01	0.02	0.03	0.02	0.00	0.00	0.01	0.14	0.00	0.10	0.01	0.15	0.08	0.10
C2	0.02	0.00	0.11	0.08	0.01	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.00	0.01	0.07	0.15	0.09	0.07	0.01	0.21	0.21	0.07
C2'	0.00	0.11	0.00	0.00	0.06	0.01	0.04	0.10	0.06	0.06	0.09	0.14	0.11	0.03	0.01	0.00	0.02	0.01	0.21	0.06	0.17	0.23	0.24
C3'	0.01	0.08	0.00	0.00	0.10	0.00	0.14	0.01	0.14	0.14	0.11	0.06	0.06	0.16	0.09	0.02	0.01	0.01	0.04	0.16	0.11	0.12	0.05
C4	0.01	0.01	0.06	0.10	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.08	0.08	0.04	0.07	0.01	0.21	0.21	0.07
C4'	0.01	0.04	0.01	0.00	0.02	0.00	0.04	0.01	0.03	0.08	0.03	0.07	0.04	0.07	0.03	0.12	0.01	0.00	0.01	0.04	0.07	0.12	0.02
C5	0.01	0.00	0.04	0.14	0.00	0.04	0.00	0.04	0.01	0.00	0.00	0.01	0.00	0.00	0.00	0.12	0.03	0.03	0.08	0.01	0.24	0.32	0.07
C5'	0.04	0.06	0.10	0.01	0.04	0.01	0.04	0.00	0.04	0.06	0.05	0.08	0.06	0.06	0.03	0.03	0.10	0.02	0.01	0.05	0.08	0.16	0.01
C6	0.01	0.00	0.06	0.14	0.01	0.03	0.01	0.04	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.11	0.03	0.04	0.08	0.00	0.24	0.36	0.08
C8	0.01	0.01	0.06	0.14	0.00	0.08	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.01	0.00	0.00	0.15	0.05	0.05	0.08	0.01	0.23	0.27	0.07
N1	0.02	0.00	0.09	0.11	0.01	0.03	0.00	0.05	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.01	0.01	0.08	0.09	0.07	0.07	0.01	0.23	0.30	0.07
N2	0.03	0.00	0.14	0.06	0.01	0.07	0.01	0.08	0.01	0.01	0.01	0.00	0.01	0.01	0.02	0.09	0.20	0.11	0.08	0.01	0.20	0.18	0.08
N3	0.02	0.00	0.11	0.06	0.00	0.04	0.00	0.06	0.00	0.01	0.00	0.01	0.00	0.00	0.01	0.06	0.16	0.08	0.07	0.01	0.20	0.16	0.08
N7	0.00	0.00	0.03	0.16	0.00	0.07	0.00	0.06	0.01	0.00	0.01	0.01	0.00	0.00	0.00	0.16	0.06	0.03	0.09	0.01	0.25	0.37	0.09
N9	0.00	0.01	0.01	0.09	0.00	0.03	0.00	0.03	0.01	0.00	0.01	0.02	0.01	0.00	0.00	0.09	0.05	0.01	0.07	0.01	0.20	0.16	0.08
O2'	0.01	0.07	0.00	0.02	0.08	0.12	0.12	0.03	0.11	0.15	0.08	0.09	0.06	0.16	0.09	0.00	0.05	0.08	0.16	0.13	0.11	0.26	0.22
O3'	0.14	0.15	0.02	0.01	0.08	0.01	0.03	0.10	0.03	0.05	0.09	0.20	0.16	0.06	0.05	0.05	0.00	0.10	0.11	0.03	0.32	0.09	0.14
O4'	0.00	0.09	0.01	0.01	0.04	0.00	0.03	0.02	0.04	0.05	0.07	0.11	0.08	0.03	0.01	0.08	0.10	0.00	0.06	0.04	0.11	0.07	0.05
O5'	0.10	0.07	0.21	0.04	0.07	0.01	0.08	0.01	0.08	0.08	0.07	0.08	0.07	0.09	0.07	0.16	0.11	0.06	0.00	0.09	0.01	0.02	0.00
O6	0.01	0.01	0.06	0.16	0.01	0.04	0.01	0.05	0.00	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.01	0.13	0.03	0.04	0.09	0.00	0.25	0.44	0.10
OP1	0.15	0.21	0.17	0.11	0.21	0.07	0.24	0.08	0.24	0.23	0.23	0.20	0.20	0.25	0.20	0.11	0.32	0.11	0.01	0.25	0.00	0.01	0.00
OP2	0.08	0.21	0.23	0.12	0.21	0.12	0.32	0.16	0.36	0.27	0.30	0.18	0.16	0.37	0.16	0.26	0.09	0.07	0.02	0.44	0.01	0.00	0.01
P	0.10	0.07	0.24	0.05	0.07	0.02	0.07	0.01	0.08	0.07	0.07	0.08	0.08	0.09	0.08	0.22	0.14	0.05	0.00	0.10	0.00	0.01	0.00